Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2FIP6

Protein Details
Accession A0A1Y2FIP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-44TTIPPYGQRRSWRPKTVQDFGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-216PKFKGKKIPRGPGSPPPPILRSPPR
550-557DPARKRAR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12.5, cyto 9, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MAALLSSLPAPRHTAPVDEDEETTIPPYGQRRSWRPKTVQDFGDGGAYPECHVAQYPLEMGRKNKSSSGNTLALQVDSDGNVRYDAIAQQGHRDGKTVQSQFKDLVPMAHRTDIKDQLMERPSEEEVQSTAERTKAALEKLVNGKIKAAQPKNVPNTQGDVSYMRYTPSTGDGTKQRIIKMVEVVEDPLEPPKFKGKKIPRGPGSPPPPILRSPPRKVTAQEQKDWMIPPCVSNWKNNKGYTIPLDKRLAADGRGLQDIQINDRFAQFSEALYVADRHAREEVRQRSLMQQKIAQKEKEAKEENLRMLAQRAREERSGIASGSGPSRVAAGEVGGAAMPSALAGYGSDSDSEAASEDEGERSEEDEEAARQRDIIRKERNAENKRKMGMANMGTERRAKEMAKAQGRDISEKIALGLAKPTMSKDSMLDSRLFNQEQLSGSFGDDDSYGLYDKPLFSGSSAAAAIYKPRGANIDDEGNDVNLEEGISKSMQNDRFGLGVAGRGFEGADSSEVRDGPVAFEKDTLDPFGVDAFLETAKAGAKRGLDDRKDDPARKRARD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.34
4 0.37
5 0.33
6 0.33
7 0.29
8 0.29
9 0.26
10 0.24
11 0.18
12 0.14
13 0.16
14 0.21
15 0.24
16 0.29
17 0.38
18 0.47
19 0.57
20 0.67
21 0.74
22 0.76
23 0.8
24 0.83
25 0.82
26 0.74
27 0.68
28 0.6
29 0.5
30 0.47
31 0.36
32 0.29
33 0.22
34 0.2
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.16
44 0.19
45 0.23
46 0.26
47 0.29
48 0.35
49 0.39
50 0.39
51 0.42
52 0.45
53 0.46
54 0.5
55 0.54
56 0.5
57 0.45
58 0.47
59 0.42
60 0.34
61 0.29
62 0.23
63 0.16
64 0.13
65 0.14
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.13
74 0.15
75 0.15
76 0.19
77 0.26
78 0.29
79 0.27
80 0.28
81 0.25
82 0.29
83 0.38
84 0.39
85 0.39
86 0.38
87 0.4
88 0.39
89 0.4
90 0.38
91 0.29
92 0.29
93 0.26
94 0.28
95 0.29
96 0.33
97 0.33
98 0.32
99 0.38
100 0.39
101 0.37
102 0.35
103 0.34
104 0.36
105 0.39
106 0.36
107 0.31
108 0.27
109 0.27
110 0.27
111 0.26
112 0.19
113 0.15
114 0.18
115 0.18
116 0.17
117 0.16
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.18
122 0.18
123 0.19
124 0.22
125 0.21
126 0.26
127 0.31
128 0.38
129 0.36
130 0.32
131 0.33
132 0.33
133 0.37
134 0.41
135 0.39
136 0.38
137 0.42
138 0.51
139 0.56
140 0.55
141 0.52
142 0.44
143 0.45
144 0.4
145 0.33
146 0.26
147 0.21
148 0.21
149 0.21
150 0.2
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.16
156 0.16
157 0.15
158 0.19
159 0.23
160 0.28
161 0.32
162 0.33
163 0.31
164 0.32
165 0.33
166 0.31
167 0.3
168 0.26
169 0.23
170 0.21
171 0.21
172 0.16
173 0.15
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.13
179 0.22
180 0.25
181 0.26
182 0.36
183 0.42
184 0.52
185 0.61
186 0.7
187 0.66
188 0.69
189 0.73
190 0.72
191 0.68
192 0.62
193 0.55
194 0.48
195 0.45
196 0.4
197 0.42
198 0.42
199 0.45
200 0.46
201 0.51
202 0.51
203 0.51
204 0.51
205 0.54
206 0.55
207 0.52
208 0.49
209 0.45
210 0.44
211 0.43
212 0.42
213 0.34
214 0.26
215 0.21
216 0.18
217 0.18
218 0.25
219 0.24
220 0.3
221 0.36
222 0.41
223 0.47
224 0.47
225 0.46
226 0.39
227 0.41
228 0.39
229 0.41
230 0.34
231 0.34
232 0.35
233 0.33
234 0.32
235 0.31
236 0.27
237 0.18
238 0.18
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.15
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.11
253 0.14
254 0.11
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.07
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.11
266 0.12
267 0.14
268 0.22
269 0.27
270 0.28
271 0.29
272 0.29
273 0.35
274 0.42
275 0.42
276 0.35
277 0.35
278 0.37
279 0.43
280 0.48
281 0.4
282 0.36
283 0.42
284 0.43
285 0.46
286 0.44
287 0.39
288 0.4
289 0.44
290 0.42
291 0.36
292 0.33
293 0.25
294 0.25
295 0.25
296 0.2
297 0.2
298 0.22
299 0.23
300 0.23
301 0.24
302 0.22
303 0.23
304 0.21
305 0.17
306 0.15
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.02
326 0.02
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.03
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.07
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.15
359 0.2
360 0.25
361 0.33
362 0.38
363 0.41
364 0.47
365 0.54
366 0.62
367 0.66
368 0.71
369 0.7
370 0.68
371 0.65
372 0.62
373 0.54
374 0.47
375 0.45
376 0.38
377 0.34
378 0.33
379 0.32
380 0.31
381 0.33
382 0.31
383 0.26
384 0.26
385 0.21
386 0.22
387 0.29
388 0.37
389 0.42
390 0.43
391 0.42
392 0.44
393 0.45
394 0.42
395 0.35
396 0.29
397 0.22
398 0.2
399 0.19
400 0.16
401 0.15
402 0.12
403 0.13
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.15
411 0.14
412 0.19
413 0.21
414 0.23
415 0.23
416 0.22
417 0.25
418 0.29
419 0.29
420 0.24
421 0.21
422 0.22
423 0.22
424 0.21
425 0.19
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.13
430 0.11
431 0.09
432 0.09
433 0.07
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.12
445 0.12
446 0.13
447 0.12
448 0.11
449 0.11
450 0.1
451 0.13
452 0.13
453 0.15
454 0.13
455 0.14
456 0.17
457 0.18
458 0.2
459 0.22
460 0.27
461 0.25
462 0.27
463 0.26
464 0.24
465 0.22
466 0.19
467 0.15
468 0.08
469 0.08
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.09
475 0.11
476 0.19
477 0.23
478 0.25
479 0.26
480 0.25
481 0.25
482 0.25
483 0.24
484 0.17
485 0.17
486 0.15
487 0.14
488 0.12
489 0.12
490 0.11
491 0.1
492 0.1
493 0.07
494 0.09
495 0.09
496 0.11
497 0.14
498 0.14
499 0.14
500 0.15
501 0.15
502 0.16
503 0.23
504 0.23
505 0.21
506 0.23
507 0.24
508 0.25
509 0.26
510 0.25
511 0.18
512 0.16
513 0.16
514 0.15
515 0.13
516 0.11
517 0.09
518 0.09
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.11
524 0.12
525 0.13
526 0.15
527 0.17
528 0.21
529 0.3
530 0.39
531 0.39
532 0.44
533 0.47
534 0.55
535 0.62
536 0.65
537 0.65
538 0.65