FuNGI

A0A1Y2ED20

Protein Details

Accession

A0A1Y2ED20

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
242-264	IIKAAEERRKKRQDKRIKDEAKP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
5-29	PKGRGRGRGRGKAAPSEEPAPPRRS
247-263	EERRKKRQDKRIKDEAK
494-509	KRAEARAKSVKKEKKE

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSSAPKGRGRGRGRGKAAPSEEPAPPRRSPSPPPPADDDETMQDADEDQLASSSPPKSKTRARVGTKASTSAAGGSKSRPVGGLLGESEYAKKPAAAPAAGKLKFVPNMKRKTRVVQDDEDYDDDVKMEDDFKSKRAPRPRAPRVEMEMTATGPMAQGPGGAPKGFGARTFQGAAGAGVMNASREGRLRGQYEEQLYDPDASDYEGSDAGDGGGLRIMAQELDLIGDEDEMAPITLPRDPSIIKAAEERRKKRQDKRIKDEAKPLVKPEPEDDAASAMLSSAAGTPALEVESKTVTSGSDSKEVTMEPEDSKDLKPELDADLSADFNLEYGAREQIYMFQFPRRFPNLVNESQLEAETAVKVENPDAAGTQGPRKKQPPEWGRFGPRANKAARWAGEEGQIGELVVRRSGKVELRINNDLTYEILPAARPSFLQEIAVLDHDPATVPRAPGVPSIPSDPSRAMVMMGQTGKKFMVVPEINGLLEKVDEQLKEEKRAEARAKSVKKEKKET

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.74
2	0.73
3	0.72
4	0.7
5	0.65
6	0.6
7	0.54
8	0.53
9	0.52
10	0.54
11	0.51
12	0.48
13	0.49
14	0.51
15	0.53
16	0.57
17	0.6
18	0.64
19	0.64
20	0.66
21	0.67
22	0.67
23	0.64
24	0.58
25	0.51
26	0.43
27	0.41
28	0.36
29	0.28
30	0.21
31	0.18
32	0.15
33	0.13
34	0.1
35	0.07
36	0.08
37	0.08
38	0.09
39	0.12
40	0.15
41	0.18
42	0.24
43	0.28
44	0.34
45	0.43
46	0.52
47	0.6
48	0.66
49	0.69
50	0.72
51	0.76
52	0.78
53	0.72
54	0.65
55	0.55
56	0.46
57	0.39
58	0.33
59	0.29
60	0.22
61	0.2
62	0.19
63	0.23
64	0.23
65	0.23
66	0.2
67	0.19
68	0.18
69	0.18
70	0.18
71	0.14
72	0.15
73	0.15
74	0.15
75	0.16
76	0.15
77	0.16
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.17
82	0.21
83	0.2
84	0.2
85	0.26
86	0.35
87	0.35
88	0.34
89	0.3
90	0.3
91	0.34
92	0.38
93	0.42
94	0.42
95	0.52
96	0.58
97	0.65
98	0.64
99	0.67
100	0.71
101	0.7
102	0.68
103	0.63
104	0.61
105	0.56
106	0.56
107	0.48
108	0.4
109	0.31
110	0.24
111	0.18
112	0.14
113	0.11
114	0.08
115	0.08
116	0.08
117	0.13
118	0.14
119	0.16
120	0.25
121	0.3
122	0.38
123	0.47
124	0.55
125	0.6
126	0.7
127	0.79
128	0.8
129	0.79
130	0.77
131	0.73
132	0.69
133	0.6
134	0.52
135	0.43
136	0.33
137	0.28
138	0.22
139	0.15
140	0.1
141	0.09
142	0.06
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.08
147	0.09
148	0.09
149	0.09
150	0.09
151	0.12
152	0.12
153	0.12
154	0.13
155	0.14
156	0.16
157	0.17
158	0.16
159	0.15
160	0.14
161	0.14
162	0.1
163	0.09
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.04
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.09
173	0.12
174	0.16
175	0.18
176	0.2
177	0.23
178	0.26
179	0.28
180	0.27
181	0.24
182	0.21
183	0.2
184	0.18
185	0.15
186	0.11
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.04
212	0.04
213	0.03
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.04
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.08
226	0.08
227	0.1
228	0.14
229	0.14
230	0.13
231	0.18
232	0.25
233	0.31
234	0.4
235	0.43
236	0.49
237	0.58
238	0.66
239	0.7
240	0.74
241	0.78
242	0.8
243	0.84
244	0.85
245	0.82
246	0.77
247	0.77
248	0.74
249	0.69
250	0.59
251	0.53
252	0.47
253	0.41
254	0.38
255	0.31
256	0.28
257	0.23
258	0.22
259	0.2
260	0.15
261	0.14
262	0.13
263	0.11
264	0.06
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.08
284	0.11
285	0.12
286	0.16
287	0.16
288	0.16
289	0.17
290	0.17
291	0.16
292	0.15
293	0.14
294	0.11
295	0.12
296	0.14
297	0.15
298	0.15
299	0.16
300	0.15
301	0.13
302	0.13
303	0.13
304	0.13
305	0.12
306	0.12
307	0.1
308	0.11
309	0.11
310	0.1
311	0.09
312	0.06
313	0.05
314	0.06
315	0.05
316	0.04
317	0.05
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.08
322	0.13
323	0.15
324	0.17
325	0.17
326	0.22
327	0.25
328	0.26
329	0.33
330	0.32
331	0.31
332	0.3
333	0.39
334	0.39
335	0.4
336	0.41
337	0.36
338	0.32
339	0.31
340	0.3
341	0.2
342	0.14
343	0.12
344	0.09
345	0.08
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.11
357	0.18
358	0.21
359	0.23
360	0.29
361	0.34
362	0.4
363	0.45
364	0.54
365	0.57
366	0.6
367	0.66
368	0.67
369	0.68
370	0.68
371	0.67
372	0.64
373	0.6
374	0.59
375	0.54
376	0.49
377	0.48
378	0.5
379	0.45
380	0.42
381	0.38
382	0.33
383	0.35
384	0.33
385	0.28
386	0.22
387	0.2
388	0.16
389	0.13
390	0.14
391	0.1
392	0.12
393	0.12
394	0.11
395	0.13
396	0.18
397	0.21
398	0.27
399	0.34
400	0.38
401	0.45
402	0.5
403	0.5
404	0.46
405	0.42
406	0.34
407	0.28
408	0.23
409	0.16
410	0.12
411	0.1
412	0.1
413	0.11
414	0.12
415	0.11
416	0.1
417	0.13
418	0.16
419	0.16
420	0.16
421	0.15
422	0.15
423	0.17
424	0.18
425	0.14
426	0.11
427	0.11
428	0.1
429	0.1
430	0.09
431	0.12
432	0.13
433	0.13
434	0.15
435	0.17
436	0.18
437	0.2
438	0.23
439	0.22
440	0.21
441	0.25
442	0.27
443	0.27
444	0.29
445	0.27
446	0.26
447	0.24
448	0.22
449	0.19
450	0.17
451	0.16
452	0.19
453	0.22
454	0.23
455	0.22
456	0.23
457	0.22
458	0.21
459	0.21
460	0.16
461	0.23
462	0.21
463	0.23
464	0.27
465	0.28
466	0.27
467	0.26
468	0.26
469	0.16
470	0.14
471	0.13
472	0.1
473	0.13
474	0.13
475	0.16
476	0.25
477	0.3
478	0.37
479	0.39
480	0.43
481	0.43
482	0.52
483	0.56
484	0.53
485	0.57
486	0.6
487	0.66
488	0.69
489	0.75
490	0.75

A0A1Y2ED20

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer