Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y2FN39

Protein Details
Accession A0A1Y2FN39    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-140QSAGKKRKAPQPGKPKGPKPRFQSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-27PKRAGNAKGKGGGGQRYKSKR
120-137GKKRKAPQPGKPKGPKPR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 8, cyto_nucl 7.5, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MSAQGAPKRAGNAKGKGGGGQRYKSKRTVGGRGIFVTCIRGKEQRSQAEFMDLLDEVADRIYPADRLAELALLRAHRTAQPDAQTANPEGMDEDEASSEEEDESIEASIARELAELQSAGKKRKAPQPGKPKGPKPRFQSVETSTECMLFIATAWPYDPVELTEAIVREIQETAVSHTRYTQRLSPIAISCHALNSEQVDREAAAYIEKYFAEYSERTGKTEITYQIEPTIRCHEKPLSRSTLLASLGASVRALSEPPSPSSPFPTRPALTLSANLTTPDLVLLPTVFRSCFGLSIVEGKDWSGKTGRKFNLDQVAAEARKIRMEREGETMVRGMEGVEKKVVEPVVEKVQEEKLEVQADV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.53
3 0.52
4 0.52
5 0.53
6 0.51
7 0.51
8 0.54
9 0.57
10 0.62
11 0.62
12 0.62
13 0.62
14 0.63
15 0.66
16 0.66
17 0.64
18 0.63
19 0.61
20 0.56
21 0.49
22 0.41
23 0.37
24 0.3
25 0.25
26 0.25
27 0.28
28 0.31
29 0.39
30 0.47
31 0.51
32 0.54
33 0.54
34 0.52
35 0.5
36 0.47
37 0.37
38 0.3
39 0.21
40 0.16
41 0.13
42 0.12
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.04
47 0.05
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.11
57 0.12
58 0.14
59 0.13
60 0.14
61 0.13
62 0.14
63 0.15
64 0.2
65 0.22
66 0.24
67 0.27
68 0.29
69 0.3
70 0.3
71 0.3
72 0.26
73 0.24
74 0.19
75 0.15
76 0.13
77 0.13
78 0.12
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.12
105 0.15
106 0.19
107 0.22
108 0.26
109 0.31
110 0.39
111 0.49
112 0.52
113 0.58
114 0.66
115 0.72
116 0.78
117 0.8
118 0.81
119 0.82
120 0.83
121 0.81
122 0.77
123 0.78
124 0.71
125 0.66
126 0.65
127 0.58
128 0.57
129 0.5
130 0.45
131 0.35
132 0.31
133 0.28
134 0.2
135 0.16
136 0.08
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.05
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.09
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.16
165 0.2
166 0.21
167 0.23
168 0.23
169 0.22
170 0.23
171 0.24
172 0.24
173 0.22
174 0.21
175 0.2
176 0.18
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.1
181 0.08
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.1
200 0.1
201 0.13
202 0.21
203 0.22
204 0.22
205 0.23
206 0.23
207 0.21
208 0.26
209 0.26
210 0.21
211 0.21
212 0.21
213 0.24
214 0.27
215 0.25
216 0.23
217 0.29
218 0.27
219 0.26
220 0.3
221 0.32
222 0.35
223 0.39
224 0.43
225 0.41
226 0.4
227 0.4
228 0.38
229 0.35
230 0.3
231 0.26
232 0.19
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.11
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.11
243 0.13
244 0.16
245 0.19
246 0.21
247 0.22
248 0.29
249 0.32
250 0.32
251 0.34
252 0.38
253 0.36
254 0.35
255 0.38
256 0.34
257 0.31
258 0.3
259 0.28
260 0.22
261 0.22
262 0.21
263 0.18
264 0.14
265 0.12
266 0.1
267 0.08
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.09
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.12
282 0.18
283 0.18
284 0.16
285 0.15
286 0.15
287 0.19
288 0.18
289 0.2
290 0.21
291 0.24
292 0.3
293 0.4
294 0.44
295 0.46
296 0.48
297 0.52
298 0.56
299 0.53
300 0.47
301 0.42
302 0.46
303 0.39
304 0.38
305 0.35
306 0.26
307 0.3
308 0.3
309 0.27
310 0.26
311 0.3
312 0.31
313 0.34
314 0.39
315 0.34
316 0.35
317 0.34
318 0.27
319 0.23
320 0.2
321 0.14
322 0.16
323 0.18
324 0.18
325 0.2
326 0.2
327 0.21
328 0.25
329 0.25
330 0.19
331 0.19
332 0.22
333 0.28
334 0.3
335 0.3
336 0.29
337 0.34
338 0.34
339 0.35
340 0.32
341 0.28