Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2F539

Protein Details
Accession A0A1Y2F539    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
68-98DEKKPVKVAKKATTPRKPKPFQEKLDKAHPEBasic
324-350LLCPSAKKVAPRKEKLKKEQSPKIEIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-102KKPVKVAKKATTPRKPKPFQEKLDKAHPEPKRW
330-341KKVAPRKEKLKK
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 11.833, mito_nucl 11.666, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR030841  NTH1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000703  F:oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MAPRARRSEFNSRVTIYEPAAAGAVDPASATSPSTTPLKRTRVTRSTASSPAAGSSTAATAKEEDEEDEKKPVKVAKKATTPRKPKPFQEKLDKAHPEPKRWREQYEAIRKQRETIVAPVDTMGCEQGGRDRDEAPTNEKDNRLSILVSLMLSSQTKDPVTHQATMNLRQGLRGGLSLEGLLNATVDEIDALICKVGFHATKAANLAKLAVRLRDLHDGDVPSDLPSLLAINGVGPKMSILYLQAIGINAGIGVDTHVHRISNRLGWHKPATNTPEQTRLNLESWLPKELHPKINLMLVGFGQKICLPVGPRCDLCSLASASPLLCPSAKKVAPRKEKLKKEQSPKIEIEIEGEIKPSVEDTPSAAEMVQAVQKVEVEVKEEEGGSVVVKEEQVLSSVKAEVASPVKHRLGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.48
3 0.38
4 0.33
5 0.26
6 0.2
7 0.19
8 0.17
9 0.14
10 0.12
11 0.1
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.07
16 0.08
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.12
21 0.19
22 0.2
23 0.26
24 0.35
25 0.42
26 0.46
27 0.52
28 0.6
29 0.61
30 0.65
31 0.65
32 0.64
33 0.62
34 0.62
35 0.57
36 0.48
37 0.41
38 0.37
39 0.3
40 0.23
41 0.17
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.14
52 0.16
53 0.19
54 0.2
55 0.25
56 0.27
57 0.25
58 0.28
59 0.32
60 0.35
61 0.4
62 0.48
63 0.5
64 0.58
65 0.68
66 0.75
67 0.8
68 0.82
69 0.85
70 0.86
71 0.84
72 0.84
73 0.85
74 0.84
75 0.83
76 0.84
77 0.83
78 0.78
79 0.81
80 0.77
81 0.7
82 0.68
83 0.65
84 0.63
85 0.64
86 0.67
87 0.68
88 0.67
89 0.67
90 0.65
91 0.69
92 0.7
93 0.71
94 0.72
95 0.69
96 0.72
97 0.68
98 0.64
99 0.59
100 0.53
101 0.44
102 0.39
103 0.36
104 0.3
105 0.29
106 0.27
107 0.23
108 0.19
109 0.16
110 0.11
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.1
115 0.13
116 0.15
117 0.16
118 0.17
119 0.2
120 0.25
121 0.26
122 0.27
123 0.29
124 0.3
125 0.32
126 0.32
127 0.31
128 0.28
129 0.27
130 0.23
131 0.18
132 0.15
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.12
146 0.21
147 0.24
148 0.26
149 0.26
150 0.3
151 0.33
152 0.36
153 0.38
154 0.32
155 0.28
156 0.25
157 0.25
158 0.2
159 0.17
160 0.13
161 0.1
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.02
175 0.02
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.14
193 0.15
194 0.11
195 0.14
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.16
201 0.21
202 0.21
203 0.19
204 0.2
205 0.2
206 0.19
207 0.19
208 0.16
209 0.1
210 0.1
211 0.08
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.02
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.12
248 0.14
249 0.17
250 0.21
251 0.26
252 0.27
253 0.32
254 0.36
255 0.38
256 0.37
257 0.39
258 0.41
259 0.42
260 0.45
261 0.42
262 0.47
263 0.43
264 0.42
265 0.4
266 0.37
267 0.31
268 0.28
269 0.27
270 0.24
271 0.25
272 0.27
273 0.24
274 0.22
275 0.3
276 0.34
277 0.4
278 0.35
279 0.35
280 0.33
281 0.36
282 0.34
283 0.26
284 0.21
285 0.15
286 0.16
287 0.14
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.12
294 0.12
295 0.15
296 0.21
297 0.25
298 0.25
299 0.26
300 0.27
301 0.26
302 0.24
303 0.24
304 0.21
305 0.17
306 0.18
307 0.16
308 0.15
309 0.15
310 0.14
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.14
315 0.23
316 0.25
317 0.32
318 0.41
319 0.5
320 0.6
321 0.68
322 0.75
323 0.76
324 0.85
325 0.87
326 0.89
327 0.88
328 0.88
329 0.88
330 0.85
331 0.83
332 0.74
333 0.69
334 0.61
335 0.52
336 0.45
337 0.39
338 0.33
339 0.26
340 0.24
341 0.18
342 0.15
343 0.15
344 0.13
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.14
353 0.13
354 0.12
355 0.13
356 0.14
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.16
363 0.14
364 0.16
365 0.16
366 0.17
367 0.18
368 0.18
369 0.17
370 0.14
371 0.14
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.15
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.17
389 0.21
390 0.24
391 0.26
392 0.32