Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2LNB4

Protein Details
Accession A0A1Y2LNB4    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-32SSLCRDISPPRASKRRKTSEAPDKPSQSHydrophilic
248-276NDNLPHRPAIRRRRNRHVARNKPRSHTSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-271RPAIRRRRNRHVARNKPR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MDLPSSLCRDISPPRASKRRKTSEAPDKPSQSESSYDAGDYPTLAAVEAGRGKIDDHLTYFKHRLTSVSRNKLKGVPRLSIDDFATLCKSNRHQHGHHFVIHQHNHPRAGVHYDLRLQFSASSSVSWAFPKGLPGNPNSRQLGRMAIETRVHNLWKNLIESASMKTGSLLIWDIGTYSVLPSKKSHTEMPSSQTTDDEFEADKDTVREPRYDNDKLIEAFQSRHIRLRLHGTRLPKDYTITLRLLSNNDNLPHRPAIRRRRNRHVARNKPRSHTSDSDSAPIASKDVNDDHDNQVDDLDTDLEEDSLIRAQNAYPGSTNSIGSVHQRRWFVLLDRPNSGFEQNGAKWARRLLPDGGLGGFDSFVVRGRDHERSVVTGRLAREVESDEGCVGYIGRGGWKSIED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.65
3 0.72
4 0.78
5 0.81
6 0.83
7 0.82
8 0.82
9 0.84
10 0.85
11 0.87
12 0.85
13 0.83
14 0.78
15 0.73
16 0.68
17 0.6
18 0.51
19 0.43
20 0.39
21 0.32
22 0.28
23 0.25
24 0.22
25 0.2
26 0.17
27 0.14
28 0.11
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.07
34 0.1
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.16
41 0.19
42 0.17
43 0.18
44 0.23
45 0.25
46 0.31
47 0.34
48 0.32
49 0.32
50 0.31
51 0.32
52 0.35
53 0.43
54 0.48
55 0.55
56 0.6
57 0.59
58 0.62
59 0.64
60 0.63
61 0.61
62 0.55
63 0.49
64 0.46
65 0.5
66 0.49
67 0.45
68 0.39
69 0.33
70 0.28
71 0.25
72 0.25
73 0.2
74 0.18
75 0.2
76 0.25
77 0.3
78 0.39
79 0.45
80 0.46
81 0.54
82 0.63
83 0.62
84 0.61
85 0.56
86 0.51
87 0.54
88 0.54
89 0.5
90 0.48
91 0.47
92 0.45
93 0.43
94 0.39
95 0.31
96 0.32
97 0.29
98 0.24
99 0.23
100 0.26
101 0.28
102 0.29
103 0.27
104 0.23
105 0.2
106 0.19
107 0.19
108 0.14
109 0.13
110 0.11
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.15
118 0.17
119 0.2
120 0.21
121 0.24
122 0.32
123 0.34
124 0.39
125 0.37
126 0.35
127 0.33
128 0.31
129 0.32
130 0.25
131 0.25
132 0.2
133 0.21
134 0.23
135 0.23
136 0.24
137 0.22
138 0.22
139 0.2
140 0.2
141 0.2
142 0.2
143 0.2
144 0.18
145 0.16
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.11
169 0.15
170 0.19
171 0.22
172 0.26
173 0.26
174 0.31
175 0.32
176 0.36
177 0.36
178 0.33
179 0.31
180 0.26
181 0.24
182 0.2
183 0.17
184 0.14
185 0.1
186 0.09
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.1
192 0.13
193 0.14
194 0.16
195 0.15
196 0.21
197 0.28
198 0.29
199 0.28
200 0.25
201 0.26
202 0.25
203 0.24
204 0.21
205 0.15
206 0.14
207 0.2
208 0.24
209 0.23
210 0.27
211 0.28
212 0.27
213 0.28
214 0.37
215 0.35
216 0.36
217 0.38
218 0.39
219 0.43
220 0.46
221 0.46
222 0.37
223 0.33
224 0.29
225 0.3
226 0.28
227 0.23
228 0.21
229 0.2
230 0.21
231 0.21
232 0.21
233 0.2
234 0.19
235 0.2
236 0.22
237 0.21
238 0.23
239 0.24
240 0.25
241 0.29
242 0.35
243 0.44
244 0.53
245 0.63
246 0.68
247 0.76
248 0.84
249 0.87
250 0.88
251 0.89
252 0.89
253 0.89
254 0.92
255 0.88
256 0.84
257 0.81
258 0.75
259 0.71
260 0.65
261 0.58
262 0.55
263 0.5
264 0.46
265 0.4
266 0.35
267 0.28
268 0.23
269 0.19
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.15
275 0.17
276 0.2
277 0.22
278 0.24
279 0.25
280 0.22
281 0.2
282 0.17
283 0.14
284 0.12
285 0.1
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.15
303 0.19
304 0.19
305 0.19
306 0.16
307 0.16
308 0.15
309 0.21
310 0.26
311 0.27
312 0.31
313 0.32
314 0.32
315 0.34
316 0.36
317 0.32
318 0.35
319 0.38
320 0.37
321 0.4
322 0.41
323 0.4
324 0.38
325 0.36
326 0.28
327 0.22
328 0.26
329 0.22
330 0.28
331 0.29
332 0.29
333 0.3
334 0.34
335 0.37
336 0.33
337 0.37
338 0.32
339 0.34
340 0.34
341 0.34
342 0.29
343 0.24
344 0.21
345 0.17
346 0.14
347 0.09
348 0.08
349 0.06
350 0.1
351 0.12
352 0.12
353 0.16
354 0.22
355 0.28
356 0.29
357 0.34
358 0.31
359 0.34
360 0.38
361 0.38
362 0.35
363 0.33
364 0.32
365 0.34
366 0.33
367 0.29
368 0.28
369 0.27
370 0.27
371 0.24
372 0.24
373 0.18
374 0.18
375 0.17
376 0.15
377 0.11
378 0.08
379 0.09
380 0.08
381 0.13
382 0.14
383 0.15