Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2LJE2

Protein Details
Accession A0A1Y2LJE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-110TSTPPPPHPPPSCRRPPRSPFATMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1123-1130EKPKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 9.999, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029149  Creatin/AminoP/Spt16_NTD  
IPR036005  Creatinase/aminopeptidase-like  
IPR029148  FACT-Spt16_Nlobe  
IPR013953  FACT_Spt16  
IPR000994  Pept_M24  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040258  Spt16  
Gene Ontology GO:0035101  C:FACT complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF14826  FACT-Spt16_Nlob  
PF00557  Peptidase_M24  
PF08512  Rtt106  
PF08644  SPT16  
Amino Acid Sequences MVEVDKKGLRRQQRSTASVPSESLRVRVRYAQAASRDPSERWVFRAGKLGLFRRSCFCLGAKRGRVDQLSTSSGLFCFSHRRPRLLTSTPPPPHPPPSCRRPPRSPFATMADDIVIDKQLFHDRLGSLVAKWKADKRSGDAVFQGANSIATVVGKASEPGSYLKPAAFQLWLLGYEFPATLFILTPDLLQIVTTKKKASYLEPLKGGKVPIEILVRGKDPEENKKQFQTCIDTLKNAGKKVAVLKKDNSTGGFADEWKAAFAEAGIKEEDQVDLAPILSQAALSVKDEKELRTIRDASRASSALMTNYFVEEMSDILDSEKKITHRALADKVANKIDDTKFFEKQKVSKNFDAMQLDWCLQPTIQSGGAYDLKFAAEPDENNLHAGVIISVLGLRYQTYGAMVGRTYMVGPNKEQETAYKLLLAIHDLVIKSIKDGVVAKDVYNKALSHLKSKKPEWEKHFPKNVGYGVGVENKDNSLLLSGKNVRVLKDGMTIVVQTGLQDLENTKPQDKKSKTYSLVLVDTIRVGQGDASVFTKDTTSDLDAVSFFFDDEEEEAKPKVKKEQRTQAIAQTNITKTRTRHERTTNQDAEKEEQRRQHQRELHQKKQQEGLEQYSEGAKSLNGTEEKKFKRFESYKRDNQIPKNVANLEIVVDKKAQTVILPIMGRPVPFHIHTIKNASHTPEADVTSLRINFLSPGQGVGRKEDQPFEDPNAHFIRSLTFRSHDIDRIDQITKDITELKKEVVRRDQEKKQLEDVVEQDKLIPVKARKPFSLDLIFIRPALDGKRIPGSIEIHQNGLRYVHGGGSAKIDVLFSNMKHLFFQPSQHELIVIIHVHLKNPIMLGKKKTKDVQFVREATEMQFDDTGNRKRRHKFGDEEEFEQEQEERRRRAALDKEFKNFAEKIADAARNENVSVDIPYRELGFNGVPARSSVLIQPTTDCLVQLTEPPFTCLTLSEIEIVHLERVQFGLRNFDMVVVFKDYNRPPVHINTIPVESLDPVKDWLDSVDIPFSEGPLNLNWATIMKTVTADPHQFFADGGWSFLSTESDDEDGEEEEEESAFEVSESELAISDESSEESDFDENASDEMSDEGSEDEFSEGEDWDELEKKAAKKDKESTLEDEEEKPKKRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.73
3 0.74
4 0.68
5 0.61
6 0.55
7 0.46
8 0.43
9 0.37
10 0.38
11 0.35
12 0.33
13 0.34
14 0.39
15 0.42
16 0.43
17 0.47
18 0.48
19 0.47
20 0.51
21 0.5
22 0.49
23 0.47
24 0.4
25 0.44
26 0.45
27 0.41
28 0.38
29 0.45
30 0.42
31 0.41
32 0.5
33 0.44
34 0.42
35 0.47
36 0.51
37 0.5
38 0.52
39 0.52
40 0.47
41 0.51
42 0.46
43 0.42
44 0.39
45 0.4
46 0.45
47 0.53
48 0.56
49 0.56
50 0.59
51 0.62
52 0.61
53 0.55
54 0.51
55 0.47
56 0.42
57 0.39
58 0.35
59 0.29
60 0.26
61 0.25
62 0.2
63 0.16
64 0.22
65 0.26
66 0.36
67 0.4
68 0.45
69 0.46
70 0.53
71 0.6
72 0.57
73 0.61
74 0.58
75 0.64
76 0.63
77 0.65
78 0.64
79 0.62
80 0.64
81 0.63
82 0.65
83 0.63
84 0.69
85 0.75
86 0.78
87 0.82
88 0.83
89 0.84
90 0.85
91 0.82
92 0.78
93 0.71
94 0.67
95 0.64
96 0.54
97 0.46
98 0.36
99 0.3
100 0.25
101 0.21
102 0.17
103 0.11
104 0.1
105 0.12
106 0.19
107 0.2
108 0.2
109 0.23
110 0.21
111 0.22
112 0.26
113 0.24
114 0.18
115 0.25
116 0.27
117 0.25
118 0.29
119 0.34
120 0.37
121 0.43
122 0.46
123 0.44
124 0.51
125 0.51
126 0.5
127 0.45
128 0.41
129 0.35
130 0.31
131 0.26
132 0.16
133 0.14
134 0.11
135 0.09
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.12
147 0.14
148 0.16
149 0.17
150 0.16
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.17
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.09
178 0.13
179 0.18
180 0.2
181 0.22
182 0.23
183 0.27
184 0.3
185 0.33
186 0.38
187 0.41
188 0.46
189 0.51
190 0.51
191 0.49
192 0.48
193 0.44
194 0.35
195 0.28
196 0.22
197 0.2
198 0.21
199 0.2
200 0.2
201 0.22
202 0.22
203 0.21
204 0.21
205 0.22
206 0.24
207 0.33
208 0.41
209 0.45
210 0.48
211 0.56
212 0.57
213 0.55
214 0.55
215 0.53
216 0.46
217 0.48
218 0.45
219 0.38
220 0.39
221 0.44
222 0.43
223 0.36
224 0.34
225 0.26
226 0.27
227 0.35
228 0.39
229 0.38
230 0.39
231 0.43
232 0.47
233 0.5
234 0.5
235 0.42
236 0.37
237 0.31
238 0.28
239 0.25
240 0.19
241 0.17
242 0.16
243 0.15
244 0.13
245 0.12
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.12
250 0.11
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.04
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.12
272 0.12
273 0.16
274 0.18
275 0.18
276 0.25
277 0.28
278 0.29
279 0.31
280 0.35
281 0.33
282 0.41
283 0.4
284 0.34
285 0.35
286 0.33
287 0.28
288 0.26
289 0.24
290 0.17
291 0.17
292 0.17
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.09
297 0.09
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.13
308 0.13
309 0.16
310 0.17
311 0.21
312 0.23
313 0.28
314 0.31
315 0.34
316 0.39
317 0.38
318 0.41
319 0.39
320 0.34
321 0.3
322 0.32
323 0.28
324 0.28
325 0.32
326 0.34
327 0.37
328 0.39
329 0.43
330 0.42
331 0.46
332 0.51
333 0.53
334 0.56
335 0.53
336 0.56
337 0.54
338 0.55
339 0.51
340 0.42
341 0.35
342 0.29
343 0.27
344 0.22
345 0.2
346 0.15
347 0.11
348 0.12
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.14
355 0.18
356 0.17
357 0.16
358 0.14
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.09
365 0.13
366 0.16
367 0.16
368 0.16
369 0.16
370 0.13
371 0.11
372 0.11
373 0.07
374 0.04
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.09
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.16
399 0.17
400 0.18
401 0.18
402 0.16
403 0.18
404 0.19
405 0.18
406 0.16
407 0.15
408 0.15
409 0.15
410 0.15
411 0.1
412 0.09
413 0.1
414 0.09
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.09
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.12
424 0.15
425 0.16
426 0.16
427 0.21
428 0.21
429 0.21
430 0.21
431 0.2
432 0.17
433 0.23
434 0.24
435 0.26
436 0.33
437 0.38
438 0.43
439 0.46
440 0.52
441 0.55
442 0.62
443 0.61
444 0.65
445 0.67
446 0.7
447 0.76
448 0.69
449 0.61
450 0.57
451 0.5
452 0.4
453 0.32
454 0.24
455 0.18
456 0.21
457 0.2
458 0.15
459 0.15
460 0.13
461 0.13
462 0.11
463 0.09
464 0.06
465 0.07
466 0.07
467 0.11
468 0.13
469 0.14
470 0.19
471 0.2
472 0.19
473 0.21
474 0.21
475 0.18
476 0.19
477 0.18
478 0.14
479 0.13
480 0.12
481 0.1
482 0.1
483 0.08
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.04
488 0.05
489 0.06
490 0.07
491 0.12
492 0.14
493 0.16
494 0.19
495 0.22
496 0.32
497 0.34
498 0.38
499 0.4
500 0.48
501 0.47
502 0.47
503 0.48
504 0.41
505 0.39
506 0.34
507 0.27
508 0.19
509 0.16
510 0.13
511 0.09
512 0.06
513 0.05
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.06
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.05
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.07
543 0.11
544 0.13
545 0.13
546 0.22
547 0.27
548 0.35
549 0.43
550 0.53
551 0.55
552 0.6
553 0.61
554 0.59
555 0.57
556 0.49
557 0.41
558 0.35
559 0.3
560 0.27
561 0.28
562 0.24
563 0.2
564 0.27
565 0.36
566 0.36
567 0.42
568 0.48
569 0.55
570 0.59
571 0.68
572 0.66
573 0.58
574 0.57
575 0.51
576 0.46
577 0.44
578 0.4
579 0.34
580 0.34
581 0.4
582 0.47
583 0.49
584 0.53
585 0.52
586 0.57
587 0.65
588 0.68
589 0.7
590 0.67
591 0.66
592 0.61
593 0.62
594 0.55
595 0.49
596 0.42
597 0.38
598 0.33
599 0.3
600 0.28
601 0.22
602 0.2
603 0.14
604 0.11
605 0.07
606 0.06
607 0.06
608 0.09
609 0.11
610 0.13
611 0.16
612 0.24
613 0.28
614 0.31
615 0.33
616 0.3
617 0.38
618 0.42
619 0.49
620 0.51
621 0.57
622 0.61
623 0.64
624 0.71
625 0.67
626 0.66
627 0.66
628 0.59
629 0.51
630 0.48
631 0.43
632 0.37
633 0.31
634 0.26
635 0.17
636 0.15
637 0.14
638 0.11
639 0.1
640 0.09
641 0.1
642 0.1
643 0.09
644 0.07
645 0.08
646 0.08
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.13
651 0.14
652 0.14
653 0.12
654 0.14
655 0.13
656 0.13
657 0.17
658 0.18
659 0.2
660 0.22
661 0.26
662 0.25
663 0.26
664 0.27
665 0.27
666 0.25
667 0.23
668 0.23
669 0.21
670 0.2
671 0.18
672 0.16
673 0.14
674 0.15
675 0.15
676 0.13
677 0.1
678 0.09
679 0.09
680 0.1
681 0.11
682 0.07
683 0.09
684 0.1
685 0.13
686 0.14
687 0.17
688 0.2
689 0.21
690 0.23
691 0.24
692 0.25
693 0.25
694 0.27
695 0.27
696 0.3
697 0.26
698 0.3
699 0.29
700 0.28
701 0.24
702 0.22
703 0.22
704 0.18
705 0.21
706 0.18
707 0.18
708 0.19
709 0.22
710 0.24
711 0.24
712 0.24
713 0.24
714 0.24
715 0.25
716 0.25
717 0.22
718 0.2
719 0.18
720 0.15
721 0.14
722 0.18
723 0.15
724 0.17
725 0.18
726 0.2
727 0.22
728 0.24
729 0.29
730 0.32
731 0.38
732 0.42
733 0.49
734 0.54
735 0.6
736 0.64
737 0.62
738 0.57
739 0.54
740 0.48
741 0.43
742 0.38
743 0.33
744 0.28
745 0.24
746 0.2
747 0.18
748 0.17
749 0.15
750 0.17
751 0.15
752 0.23
753 0.3
754 0.33
755 0.32
756 0.38
757 0.39
758 0.4
759 0.41
760 0.35
761 0.31
762 0.32
763 0.31
764 0.25
765 0.24
766 0.18
767 0.15
768 0.16
769 0.17
770 0.13
771 0.15
772 0.2
773 0.19
774 0.2
775 0.22
776 0.23
777 0.23
778 0.31
779 0.29
780 0.27
781 0.29
782 0.28
783 0.25
784 0.23
785 0.19
786 0.12
787 0.11
788 0.09
789 0.11
790 0.12
791 0.12
792 0.14
793 0.14
794 0.13
795 0.12
796 0.12
797 0.09
798 0.11
799 0.13
800 0.1
801 0.18
802 0.19
803 0.2
804 0.21
805 0.22
806 0.25
807 0.23
808 0.29
809 0.26
810 0.29
811 0.3
812 0.29
813 0.27
814 0.22
815 0.22
816 0.19
817 0.14
818 0.1
819 0.14
820 0.14
821 0.14
822 0.15
823 0.15
824 0.13
825 0.14
826 0.18
827 0.19
828 0.24
829 0.3
830 0.39
831 0.42
832 0.47
833 0.54
834 0.55
835 0.59
836 0.62
837 0.63
838 0.62
839 0.6
840 0.58
841 0.52
842 0.47
843 0.38
844 0.36
845 0.27
846 0.2
847 0.19
848 0.15
849 0.18
850 0.24
851 0.32
852 0.36
853 0.42
854 0.49
855 0.55
856 0.63
857 0.68
858 0.68
859 0.68
860 0.69
861 0.74
862 0.7
863 0.67
864 0.63
865 0.55
866 0.47
867 0.39
868 0.3
869 0.25
870 0.3
871 0.33
872 0.31
873 0.32
874 0.35
875 0.36
876 0.43
877 0.47
878 0.49
879 0.52
880 0.56
881 0.59
882 0.59
883 0.58
884 0.54
885 0.45
886 0.36
887 0.3
888 0.25
889 0.23
890 0.27
891 0.3
892 0.25
893 0.28
894 0.28
895 0.24
896 0.24
897 0.21
898 0.16
899 0.13
900 0.15
901 0.14
902 0.12
903 0.12
904 0.12
905 0.14
906 0.13
907 0.12
908 0.13
909 0.11
910 0.15
911 0.16
912 0.16
913 0.14
914 0.15
915 0.17
916 0.15
917 0.16
918 0.15
919 0.18
920 0.19
921 0.19
922 0.2
923 0.2
924 0.22
925 0.21
926 0.18
927 0.13
928 0.13
929 0.13
930 0.17
931 0.17
932 0.19
933 0.19
934 0.22
935 0.22
936 0.21
937 0.21
938 0.16
939 0.17
940 0.14
941 0.15
942 0.14
943 0.14
944 0.14
945 0.14
946 0.14
947 0.12
948 0.12
949 0.11
950 0.1
951 0.1
952 0.12
953 0.14
954 0.13
955 0.2
956 0.19
957 0.2
958 0.2
959 0.21
960 0.2
961 0.18
962 0.2
963 0.18
964 0.18
965 0.17
966 0.25
967 0.25
968 0.33
969 0.34
970 0.34
971 0.33
972 0.38
973 0.45
974 0.41
975 0.43
976 0.37
977 0.38
978 0.35
979 0.32
980 0.27
981 0.2
982 0.19
983 0.17
984 0.14
985 0.14
986 0.14
987 0.14
988 0.14
989 0.13
990 0.14
991 0.13
992 0.14
993 0.16
994 0.15
995 0.17
996 0.17
997 0.17
998 0.15
999 0.15
1000 0.15
1001 0.12
1002 0.16
1003 0.14
1004 0.15
1005 0.14
1006 0.13
1007 0.15
1008 0.15
1009 0.15
1010 0.11
1011 0.12
1012 0.13
1013 0.17
1014 0.22
1015 0.25
1016 0.24
1017 0.26
1018 0.26
1019 0.25
1020 0.24
1021 0.2
1022 0.21
1023 0.16
1024 0.15
1025 0.14
1026 0.13
1027 0.13
1028 0.14
1029 0.15
1030 0.1
1031 0.1
1032 0.12
1033 0.12
1034 0.12
1035 0.12
1036 0.13
1037 0.12
1038 0.12
1039 0.11
1040 0.1
1041 0.09
1042 0.09
1043 0.08
1044 0.08
1045 0.07
1046 0.06
1047 0.06
1048 0.06
1049 0.06
1050 0.06
1051 0.07
1052 0.06
1053 0.07
1054 0.07
1055 0.07
1056 0.07
1057 0.07
1058 0.07
1059 0.08
1060 0.09
1061 0.09
1062 0.09
1063 0.1
1064 0.11
1065 0.11
1066 0.1
1067 0.11
1068 0.1
1069 0.1
1070 0.1
1071 0.09
1072 0.08
1073 0.09
1074 0.09
1075 0.07
1076 0.07
1077 0.08
1078 0.08
1079 0.08
1080 0.09
1081 0.08
1082 0.08
1083 0.09
1084 0.09
1085 0.08
1086 0.09
1087 0.09
1088 0.09
1089 0.11
1090 0.14
1091 0.13
1092 0.18
1093 0.23
1094 0.25
1095 0.34
1096 0.42
1097 0.45
1098 0.51
1099 0.6
1100 0.64
1101 0.67
1102 0.69
1103 0.67
1104 0.66
1105 0.65
1106 0.59
1107 0.57
1108 0.55
1109 0.55
1110 0.58