Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2LWS5

Protein Details
Accession A0A1Y2LWS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-29FISYRQSYSHHPQKKARYGGPHydrophilic
359-390RTRRPPSALRTSRNWHRRKRRLWKGLGEDTLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
361-381RRPPSALRTSRNWHRRKRRLW
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 1, plas 1, pero 1, E.R. 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010989  SNARE  
IPR045242  Syntaxin  
IPR006012  Syntaxin/epimorphin_CS  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005484  F:SNAP receptor activity  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF05739  SNARE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00914  SYNTAXIN  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd15845  SNARE_syntaxin16  
Amino Acid Sequences MWRDRTNLFISYRQSYSHHPQKKARYGGPGSNGFGDSRRMSEERQGLMAGGAFEDDGDAVIEMDLLPPRWLDVQDEITDHLAEIAKQTRKLDQMHQKHVLPGFDDEDVKKREEREIEQLTQEITRGFQRCQQAIKRIETMVREAKQQGNINQGEEVMAQNLKISLATRVGEVSAMFRKKQSAYLKKLKDLGGFASPFRSATPVQNPYNDPAMQESDADRSFAQSTSLQTKQQRMRHDPNESMIAQREREIEDIAQGIIELANIFQELQTMVIDQGSMLDRIDYNVENMSRDVKEADKELKVASGYQRKTIKRKIMLLLAILIAGVFILLSLKLGTRSSSPPAPAAPAVPDEEPPMVALRTRRPPSALRTSRNWHRRKRRLWKGLGEDTLDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.47
4 0.52
5 0.56
6 0.59
7 0.66
8 0.74
9 0.81
10 0.82
11 0.77
12 0.76
13 0.73
14 0.72
15 0.72
16 0.66
17 0.58
18 0.51
19 0.47
20 0.38
21 0.33
22 0.31
23 0.24
24 0.21
25 0.25
26 0.24
27 0.26
28 0.33
29 0.38
30 0.35
31 0.35
32 0.33
33 0.28
34 0.26
35 0.25
36 0.17
37 0.1
38 0.08
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.05
49 0.04
50 0.06
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.16
60 0.19
61 0.2
62 0.21
63 0.21
64 0.21
65 0.2
66 0.17
67 0.15
68 0.11
69 0.1
70 0.12
71 0.18
72 0.21
73 0.23
74 0.25
75 0.28
76 0.33
77 0.36
78 0.43
79 0.46
80 0.52
81 0.57
82 0.62
83 0.58
84 0.57
85 0.57
86 0.48
87 0.39
88 0.32
89 0.26
90 0.22
91 0.23
92 0.19
93 0.23
94 0.24
95 0.24
96 0.24
97 0.24
98 0.28
99 0.31
100 0.33
101 0.36
102 0.4
103 0.4
104 0.39
105 0.38
106 0.33
107 0.29
108 0.25
109 0.16
110 0.11
111 0.15
112 0.16
113 0.16
114 0.2
115 0.26
116 0.28
117 0.34
118 0.39
119 0.42
120 0.45
121 0.48
122 0.46
123 0.41
124 0.41
125 0.36
126 0.36
127 0.35
128 0.3
129 0.29
130 0.29
131 0.31
132 0.34
133 0.36
134 0.34
135 0.34
136 0.34
137 0.32
138 0.29
139 0.26
140 0.2
141 0.17
142 0.14
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.15
164 0.17
165 0.18
166 0.25
167 0.33
168 0.37
169 0.44
170 0.53
171 0.55
172 0.56
173 0.59
174 0.54
175 0.46
176 0.37
177 0.31
178 0.25
179 0.23
180 0.2
181 0.17
182 0.15
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.1
187 0.13
188 0.2
189 0.25
190 0.26
191 0.29
192 0.3
193 0.29
194 0.32
195 0.28
196 0.22
197 0.17
198 0.18
199 0.15
200 0.15
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.1
211 0.13
212 0.17
213 0.19
214 0.22
215 0.25
216 0.33
217 0.39
218 0.42
219 0.48
220 0.51
221 0.58
222 0.61
223 0.63
224 0.57
225 0.52
226 0.52
227 0.44
228 0.37
229 0.32
230 0.27
231 0.22
232 0.22
233 0.21
234 0.18
235 0.18
236 0.18
237 0.13
238 0.12
239 0.13
240 0.11
241 0.09
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.11
269 0.09
270 0.09
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.14
275 0.17
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.15
280 0.16
281 0.19
282 0.23
283 0.21
284 0.21
285 0.21
286 0.21
287 0.2
288 0.21
289 0.25
290 0.29
291 0.29
292 0.36
293 0.44
294 0.48
295 0.57
296 0.63
297 0.64
298 0.62
299 0.68
300 0.66
301 0.64
302 0.6
303 0.52
304 0.45
305 0.35
306 0.27
307 0.2
308 0.15
309 0.08
310 0.05
311 0.04
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.05
319 0.07
320 0.08
321 0.1
322 0.13
323 0.17
324 0.22
325 0.26
326 0.27
327 0.28
328 0.29
329 0.31
330 0.28
331 0.26
332 0.22
333 0.2
334 0.21
335 0.2
336 0.19
337 0.19
338 0.18
339 0.17
340 0.16
341 0.16
342 0.13
343 0.15
344 0.19
345 0.25
346 0.34
347 0.38
348 0.4
349 0.43
350 0.48
351 0.54
352 0.6
353 0.62
354 0.57
355 0.62
356 0.68
357 0.75
358 0.79
359 0.8
360 0.8
361 0.82
362 0.87
363 0.9
364 0.92
365 0.93
366 0.93
367 0.93
368 0.93
369 0.91
370 0.89
371 0.83