FuNGI

A0A1Y2LUP4

Protein Details

Accession

A0A1Y2LUP4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
182-202	STPHGTPKPKRRTSGTKRGVP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
189-193	KPKRR

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 6, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54

Amino Acid Sequences

MSSSPRSPRKSTESFEFLSPNLQQSQYPFPQHDWTNRPNSTGGRYQPRRGSTASSIHSVGGALDSSFKSTMGAVRERGNNAISTLLTPPIMRTGMLPYTSAQAPSGHRPPSTRDIPPVTLTNIPHVEPSSFNAYLSQIGNLYDAFQRAKAEAEAQQPRKESLKKNDRSESVERVSAASSPASTPHGTPKPKRRTSGTKRGVPAVTPLSTIPNVYFEESFRLENPRTFDIVSERSEVVRPARTTSTDDVNSVNGISEAPQPGRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLITAISTASTSFFAALGSLRELQTEAAESVSKIKELREDLKRLDEQMAIGGLEVVNMKRRRENLRRLTDAVDQLQAVIYGVSQCDESVEKGELETSAARLEIIERLITGVLDTSDSNVTSWLQNTRLPPILIDLRGLRALDGIFEGMDEMKYRIGRGFEVRFLDTLLADLRDHVKNVPNYDTLERWVAASQKARGVSGSSKPKSMPAYMSTSTEFRQKLRANLHGLNDAQFTNQAAATFREAIVKEMKIIIRKYLPSSSDDDAESMTSVSTRGGRGQSQQDKNSILARNLRAMDAGDAEDFFANIFTDIGEALRRLSTQVKVLLDVTSGVSTPPASAGGLRSPPRSPYMDMPRSPYMENIDSFMSAGANGSSDLQMELMQALDLSSLLGQAVDAAQTQITKLLRVRSAVTAELPLERFLRYFKLCRLFADECEAVSGRSGSALKSAVNDHINAFVQKFSDLEKQDLAKAMDSDRWEPKDFDASDTEVLARILKSMESDPPTWAESGDILIPIVEPTTTNGTNGTADTAPKEKSKNTTPAIVDEERYTISASSTFVLRGIERHLILLSHIPSMTSEISVGLCEYIKLFNSRLCQLILGAGAMATAGLKNINTKHLAIASQTLSFIIATVPYIRECARRRASTPAPGAKPVATEFDNTKRLLQDQQASIHDKLTDILSGRATVHMRALKKVEWDNEAEVKKDVSAAMESLTKDTVTMHKVINKYLNEMQVRMIMGPVFESYREQVGKVIKEAAVKTPGGKARLIREAKLFDAKLGPIDGVGNVGRFLMQLAEGKPVAQPAPAPAAEPQPDKSGEKADANGEKAGEQA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.58
3	0.52
4	0.43
5	0.41
6	0.36
7	0.31
8	0.28
9	0.27
10	0.25
11	0.27
12	0.36
13	0.37
14	0.4
15	0.39
16	0.39
17	0.46
18	0.5
19	0.55
20	0.54
21	0.55
22	0.6
23	0.58
24	0.58
25	0.54
26	0.53
27	0.5
28	0.5
29	0.5
30	0.52
31	0.57
32	0.62
33	0.66
34	0.66
35	0.64
36	0.58
37	0.57
38	0.52
39	0.55
40	0.5
41	0.46
42	0.42
43	0.38
44	0.36
45	0.29
46	0.22
47	0.14
48	0.11
49	0.08
50	0.1
51	0.1
52	0.13
53	0.13
54	0.13
55	0.12
56	0.13
57	0.17
58	0.2
59	0.24
60	0.24
61	0.3
62	0.35
63	0.37
64	0.39
65	0.36
66	0.31
67	0.27
68	0.27
69	0.21
70	0.17
71	0.17
72	0.16
73	0.15
74	0.14
75	0.14
76	0.16
77	0.16
78	0.15
79	0.14
80	0.18
81	0.22
82	0.22
83	0.22
84	0.19
85	0.23
86	0.24
87	0.23
88	0.19
89	0.18
90	0.22
91	0.29
92	0.35
93	0.34
94	0.35
95	0.37
96	0.43
97	0.48
98	0.5
99	0.46
100	0.47
101	0.49
102	0.51
103	0.52
104	0.48
105	0.43
106	0.41
107	0.38
108	0.37
109	0.33
110	0.3
111	0.29
112	0.27
113	0.25
114	0.22
115	0.24
116	0.25
117	0.23
118	0.22
119	0.22
120	0.21
121	0.23
122	0.22
123	0.2
124	0.13
125	0.13
126	0.14
127	0.13
128	0.14
129	0.12
130	0.14
131	0.14
132	0.14
133	0.15
134	0.15
135	0.17
136	0.16
137	0.18
138	0.21
139	0.29
140	0.38
141	0.41
142	0.45
143	0.45
144	0.46
145	0.5
146	0.53
147	0.53
148	0.54
149	0.61
150	0.65
151	0.72
152	0.77
153	0.74
154	0.73
155	0.7
156	0.67
157	0.6
158	0.53
159	0.45
160	0.38
161	0.35
162	0.28
163	0.24
164	0.16
165	0.13
166	0.11
167	0.12
168	0.15
169	0.15
170	0.15
171	0.24
172	0.31
173	0.38
174	0.47
175	0.56
176	0.64
177	0.7
178	0.75
179	0.74
180	0.77
181	0.79
182	0.82
183	0.81
184	0.78
185	0.73
186	0.74
187	0.67
188	0.56
189	0.51
190	0.45
191	0.36
192	0.29
193	0.26
194	0.24
195	0.23
196	0.23
197	0.17
198	0.15
199	0.16
200	0.17
201	0.17
202	0.14
203	0.19
204	0.2
205	0.21
206	0.19
207	0.23
208	0.23
209	0.26
210	0.29
211	0.28
212	0.28
213	0.27
214	0.27
215	0.26
216	0.28
217	0.28
218	0.26
219	0.24
220	0.23
221	0.24
222	0.25
223	0.23
224	0.26
225	0.24
226	0.25
227	0.27
228	0.28
229	0.32
230	0.33
231	0.36
232	0.31
233	0.31
234	0.28
235	0.26
236	0.24
237	0.19
238	0.16
239	0.09
240	0.08
241	0.08
242	0.11
243	0.13
244	0.14
245	0.18
246	0.18
247	0.19
248	0.21
249	0.2
250	0.19
251	0.18
252	0.25
253	0.24
254	0.27
255	0.3
256	0.29
257	0.28
258	0.26
259	0.25
260	0.18
261	0.19
262	0.16
263	0.11
264	0.11
265	0.13
266	0.15
267	0.14
268	0.14
269	0.14
270	0.13
271	0.12
272	0.12
273	0.1
274	0.08
275	0.08
276	0.06
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.05
281	0.06
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.08
290	0.1
291	0.09
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.09
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.12
302	0.12
303	0.13
304	0.12
305	0.13
306	0.17
307	0.21
308	0.29
309	0.31
310	0.35
311	0.37
312	0.43
313	0.43
314	0.4
315	0.38
316	0.31
317	0.24
318	0.2
319	0.18
320	0.12
321	0.1
322	0.09
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.06
327	0.13
328	0.16
329	0.18
330	0.22
331	0.27
332	0.37
333	0.46
334	0.56
335	0.59
336	0.65
337	0.68
338	0.67
339	0.65
340	0.6
341	0.53
342	0.44
343	0.35
344	0.26
345	0.21
346	0.18
347	0.14
348	0.1
349	0.06
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.05
357	0.06
358	0.07
359	0.08
360	0.1
361	0.09
362	0.09
363	0.1
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.04
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.1
393	0.11
394	0.12
395	0.15
396	0.16
397	0.19
398	0.21
399	0.2
400	0.19
401	0.2
402	0.22
403	0.19
404	0.19
405	0.16
406	0.15
407	0.16
408	0.16
409	0.12
410	0.09
411	0.09
412	0.08
413	0.07
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.04
419	0.04
420	0.05
421	0.05
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.1
426	0.1
427	0.12
428	0.16
429	0.18
430	0.19
431	0.22
432	0.22
433	0.2
434	0.2
435	0.18
436	0.13
437	0.12
438	0.09
439	0.07
440	0.06
441	0.07
442	0.1
443	0.11
444	0.11
445	0.12
446	0.17
447	0.19
448	0.21
449	0.23
450	0.21
451	0.23
452	0.24
453	0.23
454	0.19
455	0.19
456	0.16
457	0.14
458	0.14
459	0.13
460	0.15
461	0.17
462	0.17
463	0.18
464	0.19
465	0.18
466	0.17
467	0.17
468	0.18
469	0.22
470	0.3
471	0.28
472	0.29
473	0.3
474	0.33
475	0.33
476	0.31
477	0.26
478	0.2
479	0.25
480	0.24
481	0.26
482	0.24
483	0.23
484	0.22
485	0.25
486	0.23
487	0.17
488	0.25
489	0.25
490	0.3
491	0.33
492	0.38
493	0.37
494	0.4
495	0.41
496	0.36
497	0.34
498	0.29
499	0.26
500	0.2
501	0.15
502	0.12
503	0.1
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.07
509	0.09
510	0.09
511	0.09
512	0.11
513	0.11
514	0.13
515	0.14
516	0.13
517	0.12
518	0.14
519	0.16
520	0.17
521	0.17
522	0.18
523	0.18
524	0.19
525	0.21
526	0.22
527	0.22
528	0.2
529	0.24
530	0.22
531	0.21
532	0.2
533	0.17
534	0.14
535	0.13
536	0.11
537	0.07
538	0.06
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.05
543	0.06
544	0.08
545	0.09
546	0.11
547	0.14
548	0.23
549	0.31
550	0.35
551	0.36
552	0.37
553	0.36
554	0.36
555	0.38
556	0.31
557	0.24
558	0.24
559	0.23
560	0.25
561	0.24
562	0.23
563	0.18
564	0.17
565	0.15
566	0.11
567	0.1
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.05
573	0.05
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.09
589	0.1
590	0.12
591	0.15
592	0.15
593	0.16
594	0.16
595	0.15
596	0.13
597	0.12
598	0.1
599	0.07
600	0.06
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.04
607	0.04
608	0.05
609	0.06
610	0.08
611	0.12
612	0.14
613	0.16
614	0.16
615	0.18
616	0.21
617	0.22
618	0.22
619	0.25
620	0.34
621	0.38
622	0.39
623	0.43
624	0.42
625	0.42
626	0.4
627	0.34
628	0.28
629	0.23
630	0.22
631	0.18
632	0.16
633	0.14
634	0.14
635	0.12
636	0.08
637	0.06
638	0.06
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.05
643	0.04
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.03
657	0.03
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.03
662	0.03
663	0.03
664	0.03
665	0.03
666	0.03
667	0.04
668	0.04
669	0.04
670	0.08
671	0.08
672	0.1
673	0.12
674	0.16
675	0.17
676	0.19
677	0.21
678	0.19
679	0.21
680	0.2
681	0.18
682	0.16
683	0.15
684	0.15
685	0.14
686	0.12
687	0.11
688	0.11
689	0.11
690	0.11
691	0.15
692	0.16
693	0.19
694	0.23
695	0.3
696	0.3
697	0.31
698	0.38
699	0.35
700	0.33
701	0.36
702	0.3
703	0.23
704	0.24
705	0.23
706	0.15
707	0.14
708	0.13
709	0.06
710	0.08
711	0.08
712	0.07
713	0.09
714	0.09
715	0.09
716	0.11
717	0.12
718	0.14
719	0.15
720	0.16
721	0.14
722	0.16
723	0.17
724	0.16
725	0.15
726	0.12
727	0.11
728	0.1
729	0.1
730	0.11
731	0.17
732	0.18
733	0.19
734	0.21
735	0.22
736	0.23
737	0.26
738	0.23
739	0.18
740	0.17
741	0.17
742	0.17
743	0.19
744	0.22
745	0.24
746	0.27
747	0.28
748	0.28
749	0.28
750	0.33
751	0.31
752	0.3
753	0.26
754	0.25
755	0.23
756	0.23
757	0.21
758	0.14
759	0.13
760	0.12
761	0.09
762	0.07
763	0.07
764	0.07
765	0.09
766	0.1
767	0.15
768	0.17
769	0.18
770	0.19
771	0.2
772	0.21
773	0.2
774	0.18
775	0.13
776	0.1
777	0.1
778	0.09
779	0.07
780	0.06
781	0.06
782	0.06
783	0.05
784	0.05
785	0.04
786	0.04
787	0.06
788	0.12
789	0.12
790	0.12
791	0.13
792	0.13
793	0.14
794	0.14
795	0.15
796	0.1
797	0.11
798	0.13
799	0.15
800	0.16
801	0.19
802	0.22
803	0.22
804	0.27
805	0.34
806	0.41
807	0.4
808	0.45
809	0.43
810	0.44
811	0.47
812	0.42
813	0.36
814	0.29
815	0.27
816	0.21
817	0.2
818	0.17
819	0.11
820	0.1
821	0.1
822	0.1
823	0.09
824	0.09
825	0.09
826	0.09
827	0.1
828	0.1
829	0.1
830	0.13
831	0.16
832	0.15
833	0.16
834	0.16
835	0.15
836	0.15
837	0.19
838	0.16
839	0.14
840	0.14
841	0.13
842	0.13
843	0.16
844	0.15
845	0.11
846	0.1
847	0.09
848	0.09
849	0.09
850	0.09
851	0.07
852	0.06
853	0.06
854	0.07
855	0.08
856	0.09
857	0.12
858	0.13
859	0.15
860	0.19
861	0.21
862	0.22
863	0.21
864	0.2
865	0.18
866	0.18
867	0.15
868	0.11
869	0.09
870	0.07
871	0.06
872	0.05
873	0.05
874	0.03
875	0.03
876	0.03
877	0.04
878	0.04
879	0.08
880	0.1
881	0.15
882	0.17
883	0.18
884	0.19
885	0.21
886	0.21
887	0.19
888	0.22
889	0.19
890	0.18
891	0.17
892	0.15
893	0.13
894	0.12
895	0.11
896	0.07
897	0.06
898	0.06
899	0.08
900	0.09
901	0.09
902	0.11
903	0.13
904	0.21
905	0.25
906	0.34
907	0.41
908	0.44
909	0.46
910	0.53
911	0.58
912	0.59
913	0.64
914	0.63
915	0.57
916	0.55
917	0.55
918	0.46
919	0.42
920	0.34
921	0.29
922	0.21
923	0.21
924	0.23
925	0.28
926	0.32
927	0.31
928	0.32
929	0.3
930	0.31
931	0.34
932	0.36
933	0.35
934	0.35
935	0.39
936	0.41
937	0.45
938	0.43
939	0.39
940	0.33
941	0.26
942	0.24
943	0.2
944	0.17
945	0.14
946	0.15
947	0.14
948	0.15
949	0.15
950	0.19
951	0.19
952	0.17
953	0.22
954	0.25
955	0.26
956	0.3
957	0.33
958	0.31
959	0.37
960	0.42
961	0.4
962	0.39
963	0.4
964	0.4
965	0.45
966	0.44
967	0.38
968	0.33
969	0.3
970	0.26
971	0.24
972	0.19
973	0.13
974	0.13
975	0.12
976	0.12
977	0.15
978	0.16
979	0.16
980	0.16
981	0.14
982	0.13
983	0.14
984	0.18
985	0.18
986	0.2
987	0.22
988	0.27
989	0.29
990	0.34
991	0.4
992	0.36
993	0.39
994	0.41
995	0.46
996	0.42
997	0.41
998	0.38
999	0.33
1000	0.33
1001	0.27
1002	0.23
1003	0.15
1004	0.13
1005	0.13
1006	0.13
1007	0.11
1008	0.11
1009	0.13
1010	0.14
1011	0.2
1012	0.21
1013	0.2
1014	0.24
1015	0.29
1016	0.31
1017	0.31
1018	0.33
1019	0.28
1020	0.32
1021	0.34
1022	0.34
1023	0.32
1024	0.3
1025	0.3
1026	0.33
1027	0.36
1028	0.34
1029	0.35
1030	0.34
1031	0.36
1032	0.46
1033	0.48
1034	0.43
1035	0.45
1036	0.46
1037	0.47
1038	0.51
1039	0.44
1040	0.37
1041	0.37
1042	0.34
1043	0.3
1044	0.27
1045	0.23
1046	0.15
1047	0.16
1048	0.13
1049	0.13
1050	0.13
1051	0.11
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.1
1055	0.09
1056	0.09
1057	0.07
1058	0.09
1059	0.13
1060	0.13
1061	0.18
1062	0.18
1063	0.19
1064	0.19
1065	0.21
1066	0.2
1067	0.17
1068	0.17
1069	0.15
1070	0.22
1071	0.22
1072	0.22
1073	0.22
1074	0.28
1075	0.32
1076	0.34
1077	0.33
1078	0.32
1079	0.35
1080	0.36
1081	0.36
1082	0.35
1083	0.35
1084	0.35
1085	0.35
1086	0.38
1087	0.4
1088	0.4
1089	0.39
1090	0.34

A0A1Y2LUP4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer