Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2MBM0

Protein Details
Accession A0A1Y2MBM0    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
434-455QLKASSKKSKRAFKIGGKNKYSHydrophilic
508-539SEEKAERKRAELKRRNEEMAKKQAQRKKKKRFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
385-405PSKAKAKSFRIGGKAKKEPPK
440-447KKSKRAFK
512-539AERKRAELKRRNEEMAKKQAQRKKKKRF
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSSWRVLELSEQPDGEPIPQLLVKPAFNPDSYTVFLTCLTNIWSEDLDLHAIVGRAAEQQSPIEISQHDVTQLSILLDNLSKSLAGSEDAECRLTRSGADGITLHTTIRLPEPLDSLTWTFHLQRRSPVTLKNELILPLLVSSRIQYERINDLITTIENKDSAITRLVDTFESNNLDLAAAFPSIGGLKTGRKLIKREQAARHLPALRTFQHHVWQEETAQLADAHVTTQGLFQEALVQSTPVVPSDLQAEEGAQDWLAAVPSRLAFAKPAVKIKAREVAPPFQLSKRGHESSPVDLDTEDEFEVHDNFKTRQQVSESGAPLVTGTDDGTEDEGPTEDDDDLDAPSQSQGRGLKPIDTHGVKPQYSRQRTESPSLPAEPATSPPPSKAKAKSFRIGGKAKKEPPKSPEPQGTAIDPSHEHAQVSILPDPEFDLQLKASSKKSKRAFKIGGKNKYSQDAASSQLGVTNSAAAHKFRDACSPTPKSSPPLLLQESQEQTTPAEPISEETSEEKAERKRAELKRRNEEMAKKQAQRKKKKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.24
3 0.19
4 0.15
5 0.16
6 0.16
7 0.17
8 0.21
9 0.24
10 0.24
11 0.23
12 0.29
13 0.28
14 0.28
15 0.31
16 0.29
17 0.29
18 0.31
19 0.31
20 0.25
21 0.23
22 0.24
23 0.21
24 0.18
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.09
41 0.08
42 0.1
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.16
49 0.16
50 0.15
51 0.14
52 0.17
53 0.18
54 0.18
55 0.18
56 0.16
57 0.16
58 0.14
59 0.15
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.08
71 0.07
72 0.08
73 0.1
74 0.11
75 0.15
76 0.16
77 0.18
78 0.17
79 0.18
80 0.19
81 0.17
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.17
87 0.15
88 0.16
89 0.18
90 0.18
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.15
96 0.15
97 0.13
98 0.15
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.16
106 0.17
107 0.18
108 0.21
109 0.27
110 0.27
111 0.33
112 0.39
113 0.44
114 0.45
115 0.48
116 0.5
117 0.52
118 0.5
119 0.45
120 0.4
121 0.34
122 0.32
123 0.25
124 0.19
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.11
131 0.12
132 0.14
133 0.14
134 0.17
135 0.21
136 0.23
137 0.23
138 0.19
139 0.18
140 0.17
141 0.16
142 0.15
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.13
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.08
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.08
176 0.1
177 0.16
178 0.2
179 0.24
180 0.28
181 0.36
182 0.43
183 0.49
184 0.56
185 0.56
186 0.62
187 0.64
188 0.61
189 0.58
190 0.54
191 0.47
192 0.43
193 0.4
194 0.33
195 0.31
196 0.32
197 0.28
198 0.31
199 0.33
200 0.31
201 0.29
202 0.28
203 0.24
204 0.22
205 0.21
206 0.14
207 0.11
208 0.1
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.06
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.08
255 0.13
256 0.15
257 0.19
258 0.21
259 0.24
260 0.26
261 0.27
262 0.32
263 0.28
264 0.31
265 0.31
266 0.32
267 0.31
268 0.32
269 0.31
270 0.25
271 0.31
272 0.27
273 0.29
274 0.32
275 0.32
276 0.29
277 0.33
278 0.34
279 0.3
280 0.32
281 0.27
282 0.2
283 0.18
284 0.2
285 0.15
286 0.14
287 0.1
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.14
297 0.2
298 0.2
299 0.22
300 0.24
301 0.27
302 0.29
303 0.34
304 0.31
305 0.26
306 0.25
307 0.22
308 0.19
309 0.15
310 0.11
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.05
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.1
336 0.13
337 0.13
338 0.19
339 0.2
340 0.23
341 0.22
342 0.25
343 0.28
344 0.27
345 0.28
346 0.29
347 0.35
348 0.32
349 0.33
350 0.39
351 0.43
352 0.46
353 0.48
354 0.47
355 0.49
356 0.53
357 0.56
358 0.52
359 0.47
360 0.45
361 0.43
362 0.38
363 0.3
364 0.28
365 0.23
366 0.2
367 0.18
368 0.18
369 0.17
370 0.19
371 0.24
372 0.25
373 0.31
374 0.36
375 0.43
376 0.5
377 0.57
378 0.59
379 0.61
380 0.64
381 0.66
382 0.66
383 0.63
384 0.62
385 0.64
386 0.67
387 0.7
388 0.7
389 0.69
390 0.68
391 0.71
392 0.67
393 0.67
394 0.67
395 0.62
396 0.6
397 0.56
398 0.51
399 0.44
400 0.39
401 0.33
402 0.25
403 0.23
404 0.22
405 0.2
406 0.18
407 0.15
408 0.16
409 0.16
410 0.19
411 0.19
412 0.17
413 0.16
414 0.16
415 0.18
416 0.18
417 0.17
418 0.14
419 0.13
420 0.12
421 0.16
422 0.19
423 0.2
424 0.25
425 0.34
426 0.38
427 0.47
428 0.55
429 0.61
430 0.66
431 0.73
432 0.76
433 0.76
434 0.82
435 0.83
436 0.84
437 0.79
438 0.77
439 0.7
440 0.66
441 0.57
442 0.46
443 0.41
444 0.33
445 0.31
446 0.28
447 0.25
448 0.2
449 0.21
450 0.21
451 0.18
452 0.15
453 0.14
454 0.12
455 0.14
456 0.16
457 0.14
458 0.16
459 0.2
460 0.23
461 0.22
462 0.31
463 0.33
464 0.37
465 0.45
466 0.49
467 0.48
468 0.52
469 0.54
470 0.5
471 0.5
472 0.5
473 0.45
474 0.47
475 0.48
476 0.45
477 0.45
478 0.48
479 0.46
480 0.42
481 0.38
482 0.3
483 0.27
484 0.25
485 0.23
486 0.15
487 0.13
488 0.12
489 0.14
490 0.17
491 0.17
492 0.17
493 0.18
494 0.21
495 0.21
496 0.22
497 0.25
498 0.27
499 0.35
500 0.35
501 0.39
502 0.47
503 0.55
504 0.66
505 0.69
506 0.74
507 0.76
508 0.81
509 0.83
510 0.81
511 0.81
512 0.79
513 0.8
514 0.8
515 0.77
516 0.8
517 0.81
518 0.83
519 0.85