Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2M6Y5

Protein Details
Accession A0A1Y2M6Y5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-50SPSAPAARSPHKRPGRQQMPSRTPSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1220-1231ARGGGGGRARGR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 4, cyto 4, pero 4, cyto_mito 4, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MDINSLLSPSDSPAQTPPPPPSHASPSAPAARSPHKRPGRQQMPSRTPSGLSQQITSSPQIHLAHQKVPSPSYGHLTNGARATHSTTSTPQPLGSPHDAVMTPPSHQYRQASTPGMDALADLATMQHQQQIVRQSSLGHQRPVTLQHLGQHLSGDSVTSAAMSEHSPRPRSFATKSLDQQHIDYLEQLDRDLTENPFNYYSHLALVTTLHQGFQSHLESIEASPHDYELIRILRDAYRVMSEKYPLGETLWHYRLNDEKMLAGNSEERMGVLELHKQATHEEPYSAKLWAAYGEYVSYLVACSWEQVPPEEWSEEDRLIGRELFQPQLLVEALQQGAERVKYNLQESNLVWDRYLQVLEEDLERTGLSQEKVTTIASIYNERLGQPHATWSHTRSRYISFIQRYNLGDPEQVNEQVTQKNTHIIQQCANREDYEFKVLQAIQQGDQTAEYHAVTRYLKWEKKTMGVYSFPLVNALYERATLRFPVDPSLWEDHVEFLIWQNDRSVDLLNVLERATRHCPWSGSLWSHRILTLEVENKAFAEIEHVKHTATGTGLLEHSDIEEIIKVQIAWCGYLRRRAFDDPKATDDDADIAEVGIRSALEFVREVGMKKHGRDWAGDPKYRLERIHMKYWLQRGNVDEARLIWESLVKHQADSYDFWYRWYIFEMVFWSQHAIRTEQNAGQQLLTPTRATAVLERAMERLQTIDSPEPIMNMYMSHCEQHETVLKVRSAAIEKRRATRRISMRRQKEQEAVEAAAAAAQPQADYFTEGSSKRKRDDTSIGDDAATKKSRQAISENVSPAAVPVNGEPMRASEAPSETQASGAKRDREHTSVIVKKLPADTTQTRIRQFFTDAGTVRNLVLKPEQDSLTAIVEFETPEEADYALSKEAKGFEGHTISIERGDSTTLYVTNYPPHADEAYLRKHFESFGEIIGFRFPSLKFDTHRRFCYVQYANAAQAVAAIQLDGTDVEGLKLNVKISNPQAKKKRDGATAEGREVYIWHLNFKIKKQEVHEAFSQFGHIDRINFPTLKNGNNKGFCFVVFDTKESADAAVAEMDKKDFWGLELHVEIANDRNETKPKIKSTLENATSPAPHDVTPGAAQDASTSAVPSAVPAADFKAAPLNDRSIAILNLPDTVPDVRIRPLVEAYGFKKIKLEPQHGGATIEFTSVEGAGKAEIALQGLDFEGRKLRIGTVKDLRQQKGEWKAGNSFLQPNRVQRPAARGGGGGRARGRTGFGARPVVPRAAAPANGEAVKSNSDFRNMILNRAPKEEKEAKEIEAGNDKMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.34
3 0.38
4 0.43
5 0.42
6 0.46
7 0.49
8 0.5
9 0.52
10 0.53
11 0.52
12 0.49
13 0.5
14 0.54
15 0.51
16 0.47
17 0.45
18 0.48
19 0.53
20 0.56
21 0.59
22 0.61
23 0.69
24 0.76
25 0.81
26 0.82
27 0.83
28 0.86
29 0.87
30 0.87
31 0.82
32 0.77
33 0.67
34 0.58
35 0.52
36 0.5
37 0.47
38 0.39
39 0.36
40 0.34
41 0.36
42 0.37
43 0.37
44 0.31
45 0.24
46 0.29
47 0.29
48 0.31
49 0.37
50 0.37
51 0.4
52 0.41
53 0.46
54 0.42
55 0.42
56 0.41
57 0.36
58 0.34
59 0.34
60 0.33
61 0.3
62 0.34
63 0.34
64 0.36
65 0.36
66 0.34
67 0.3
68 0.29
69 0.32
70 0.29
71 0.28
72 0.27
73 0.26
74 0.33
75 0.36
76 0.36
77 0.31
78 0.29
79 0.3
80 0.35
81 0.35
82 0.31
83 0.26
84 0.29
85 0.28
86 0.27
87 0.29
88 0.23
89 0.2
90 0.25
91 0.29
92 0.28
93 0.33
94 0.36
95 0.37
96 0.41
97 0.46
98 0.43
99 0.39
100 0.39
101 0.35
102 0.31
103 0.25
104 0.19
105 0.14
106 0.09
107 0.08
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.08
112 0.08
113 0.1
114 0.12
115 0.13
116 0.18
117 0.26
118 0.29
119 0.29
120 0.29
121 0.28
122 0.33
123 0.43
124 0.44
125 0.4
126 0.37
127 0.38
128 0.4
129 0.44
130 0.41
131 0.34
132 0.3
133 0.31
134 0.35
135 0.34
136 0.31
137 0.27
138 0.23
139 0.2
140 0.19
141 0.14
142 0.1
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.12
151 0.19
152 0.25
153 0.3
154 0.3
155 0.36
156 0.39
157 0.44
158 0.43
159 0.45
160 0.45
161 0.49
162 0.55
163 0.57
164 0.58
165 0.53
166 0.5
167 0.47
168 0.43
169 0.35
170 0.3
171 0.25
172 0.21
173 0.2
174 0.19
175 0.15
176 0.13
177 0.15
178 0.16
179 0.16
180 0.19
181 0.2
182 0.23
183 0.24
184 0.23
185 0.24
186 0.24
187 0.22
188 0.18
189 0.18
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.16
195 0.15
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.15
200 0.18
201 0.18
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.15
206 0.15
207 0.19
208 0.15
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.16
217 0.15
218 0.15
219 0.18
220 0.18
221 0.2
222 0.2
223 0.16
224 0.19
225 0.21
226 0.23
227 0.23
228 0.23
229 0.24
230 0.25
231 0.24
232 0.2
233 0.18
234 0.19
235 0.2
236 0.26
237 0.27
238 0.28
239 0.27
240 0.29
241 0.34
242 0.35
243 0.34
244 0.26
245 0.25
246 0.24
247 0.25
248 0.23
249 0.18
250 0.17
251 0.15
252 0.15
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.11
259 0.15
260 0.16
261 0.18
262 0.19
263 0.18
264 0.19
265 0.22
266 0.25
267 0.2
268 0.2
269 0.2
270 0.22
271 0.23
272 0.22
273 0.18
274 0.14
275 0.13
276 0.12
277 0.13
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.05
289 0.07
290 0.08
291 0.1
292 0.1
293 0.12
294 0.15
295 0.16
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.19
300 0.21
301 0.19
302 0.18
303 0.17
304 0.15
305 0.17
306 0.16
307 0.14
308 0.16
309 0.18
310 0.19
311 0.17
312 0.17
313 0.15
314 0.17
315 0.15
316 0.11
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.1
324 0.11
325 0.12
326 0.11
327 0.14
328 0.16
329 0.19
330 0.22
331 0.22
332 0.25
333 0.24
334 0.31
335 0.33
336 0.3
337 0.27
338 0.25
339 0.25
340 0.22
341 0.22
342 0.13
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.09
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.12
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.13
361 0.1
362 0.12
363 0.12
364 0.14
365 0.14
366 0.15
367 0.16
368 0.15
369 0.16
370 0.16
371 0.16
372 0.14
373 0.19
374 0.18
375 0.21
376 0.23
377 0.25
378 0.33
379 0.34
380 0.36
381 0.33
382 0.34
383 0.35
384 0.38
385 0.43
386 0.38
387 0.4
388 0.39
389 0.41
390 0.39
391 0.37
392 0.35
393 0.27
394 0.24
395 0.21
396 0.21
397 0.19
398 0.17
399 0.16
400 0.15
401 0.16
402 0.18
403 0.19
404 0.19
405 0.18
406 0.21
407 0.21
408 0.26
409 0.28
410 0.27
411 0.31
412 0.35
413 0.39
414 0.36
415 0.37
416 0.31
417 0.28
418 0.29
419 0.26
420 0.24
421 0.2
422 0.18
423 0.2
424 0.2
425 0.19
426 0.21
427 0.2
428 0.16
429 0.17
430 0.17
431 0.14
432 0.15
433 0.14
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.11
440 0.11
441 0.11
442 0.18
443 0.25
444 0.28
445 0.3
446 0.36
447 0.34
448 0.4
449 0.43
450 0.39
451 0.34
452 0.33
453 0.32
454 0.27
455 0.26
456 0.2
457 0.17
458 0.14
459 0.11
460 0.1
461 0.09
462 0.08
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.11
469 0.12
470 0.12
471 0.15
472 0.15
473 0.15
474 0.18
475 0.22
476 0.2
477 0.19
478 0.19
479 0.16
480 0.16
481 0.15
482 0.1
483 0.08
484 0.12
485 0.11
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.13
491 0.12
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.09
497 0.08
498 0.09
499 0.08
500 0.12
501 0.16
502 0.16
503 0.18
504 0.19
505 0.2
506 0.21
507 0.25
508 0.25
509 0.24
510 0.27
511 0.28
512 0.27
513 0.27
514 0.26
515 0.22
516 0.18
517 0.16
518 0.16
519 0.16
520 0.16
521 0.16
522 0.16
523 0.15
524 0.15
525 0.13
526 0.08
527 0.11
528 0.13
529 0.14
530 0.17
531 0.17
532 0.16
533 0.17
534 0.17
535 0.12
536 0.1
537 0.1
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.05
546 0.05
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.05
552 0.04
553 0.04
554 0.06
555 0.06
556 0.07
557 0.07
558 0.12
559 0.13
560 0.21
561 0.22
562 0.22
563 0.26
564 0.31
565 0.35
566 0.37
567 0.44
568 0.38
569 0.4
570 0.42
571 0.38
572 0.32
573 0.27
574 0.21
575 0.14
576 0.11
577 0.09
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.05
589 0.05
590 0.07
591 0.08
592 0.08
593 0.09
594 0.17
595 0.19
596 0.19
597 0.24
598 0.25
599 0.25
600 0.27
601 0.3
602 0.33
603 0.37
604 0.39
605 0.35
606 0.36
607 0.39
608 0.39
609 0.34
610 0.29
611 0.33
612 0.35
613 0.41
614 0.39
615 0.38
616 0.4
617 0.46
618 0.46
619 0.37
620 0.34
621 0.29
622 0.33
623 0.32
624 0.28
625 0.22
626 0.17
627 0.19
628 0.18
629 0.16
630 0.09
631 0.1
632 0.1
633 0.12
634 0.17
635 0.14
636 0.14
637 0.14
638 0.15
639 0.15
640 0.16
641 0.17
642 0.18
643 0.18
644 0.19
645 0.2
646 0.2
647 0.18
648 0.19
649 0.16
650 0.11
651 0.12
652 0.13
653 0.12
654 0.12
655 0.12
656 0.11
657 0.1
658 0.13
659 0.13
660 0.13
661 0.12
662 0.15
663 0.17
664 0.17
665 0.2
666 0.19
667 0.19
668 0.17
669 0.18
670 0.16
671 0.15
672 0.14
673 0.12
674 0.09
675 0.09
676 0.09
677 0.08
678 0.09
679 0.1
680 0.11
681 0.12
682 0.13
683 0.13
684 0.13
685 0.12
686 0.11
687 0.09
688 0.07
689 0.07
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.11
694 0.11
695 0.11
696 0.11
697 0.1
698 0.08
699 0.07
700 0.07
701 0.08
702 0.09
703 0.09
704 0.09
705 0.1
706 0.1
707 0.12
708 0.16
709 0.16
710 0.19
711 0.22
712 0.22
713 0.21
714 0.21
715 0.21
716 0.2
717 0.23
718 0.27
719 0.31
720 0.33
721 0.41
722 0.47
723 0.49
724 0.49
725 0.52
726 0.56
727 0.58
728 0.67
729 0.69
730 0.71
731 0.77
732 0.78
733 0.74
734 0.69
735 0.6
736 0.53
737 0.46
738 0.37
739 0.27
740 0.22
741 0.18
742 0.12
743 0.11
744 0.07
745 0.04
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.05
750 0.05
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.11
755 0.12
756 0.18
757 0.24
758 0.27
759 0.28
760 0.33
761 0.34
762 0.37
763 0.44
764 0.43
765 0.44
766 0.43
767 0.4
768 0.35
769 0.35
770 0.31
771 0.28
772 0.24
773 0.16
774 0.16
775 0.22
776 0.24
777 0.24
778 0.26
779 0.29
780 0.32
781 0.38
782 0.37
783 0.31
784 0.29
785 0.27
786 0.23
787 0.17
788 0.12
789 0.07
790 0.06
791 0.13
792 0.13
793 0.13
794 0.13
795 0.13
796 0.17
797 0.16
798 0.18
799 0.13
800 0.15
801 0.15
802 0.17
803 0.18
804 0.13
805 0.14
806 0.16
807 0.15
808 0.19
809 0.23
810 0.26
811 0.25
812 0.29
813 0.32
814 0.32
815 0.34
816 0.31
817 0.35
818 0.36
819 0.37
820 0.37
821 0.33
822 0.32
823 0.32
824 0.3
825 0.23
826 0.24
827 0.24
828 0.26
829 0.34
830 0.36
831 0.37
832 0.37
833 0.37
834 0.32
835 0.32
836 0.3
837 0.25
838 0.25
839 0.23
840 0.23
841 0.22
842 0.21
843 0.19
844 0.2
845 0.17
846 0.14
847 0.16
848 0.16
849 0.18
850 0.2
851 0.21
852 0.17
853 0.18
854 0.18
855 0.17
856 0.15
857 0.12
858 0.1
859 0.09
860 0.09
861 0.08
862 0.07
863 0.05
864 0.06
865 0.06
866 0.06
867 0.06
868 0.06
869 0.07
870 0.08
871 0.09
872 0.08
873 0.09
874 0.11
875 0.12
876 0.12
877 0.12
878 0.14
879 0.15
880 0.15
881 0.15
882 0.15
883 0.14
884 0.15
885 0.13
886 0.1
887 0.09
888 0.09
889 0.08
890 0.08
891 0.09
892 0.09
893 0.1
894 0.11
895 0.11
896 0.14
897 0.15
898 0.14
899 0.14
900 0.16
901 0.15
902 0.14
903 0.17
904 0.2
905 0.27
906 0.29
907 0.29
908 0.27
909 0.27
910 0.27
911 0.25
912 0.24
913 0.17
914 0.16
915 0.17
916 0.17
917 0.16
918 0.17
919 0.16
920 0.11
921 0.13
922 0.11
923 0.14
924 0.18
925 0.21
926 0.23
927 0.33
928 0.43
929 0.48
930 0.51
931 0.52
932 0.5
933 0.47
934 0.54
935 0.48
936 0.42
937 0.4
938 0.38
939 0.33
940 0.32
941 0.31
942 0.2
943 0.17
944 0.13
945 0.08
946 0.06
947 0.05
948 0.04
949 0.04
950 0.04
951 0.04
952 0.04
953 0.04
954 0.04
955 0.05
956 0.07
957 0.07
958 0.09
959 0.1
960 0.11
961 0.13
962 0.13
963 0.18
964 0.23
965 0.33
966 0.36
967 0.44
968 0.53
969 0.57
970 0.63
971 0.67
972 0.67
973 0.64
974 0.65
975 0.63
976 0.65
977 0.63
978 0.58
979 0.5
980 0.43
981 0.35
982 0.31
983 0.26
984 0.21
985 0.17
986 0.17
987 0.19
988 0.24
989 0.28
990 0.32
991 0.39
992 0.38
993 0.42
994 0.45
995 0.53
996 0.52
997 0.53
998 0.53
999 0.45
1000 0.42
1001 0.37
1002 0.33
1003 0.23
1004 0.19
1005 0.18
1006 0.14
1007 0.15
1008 0.15
1009 0.19
1010 0.22
1011 0.23
1012 0.22
1013 0.28
1014 0.3
1015 0.33
1016 0.39
1017 0.42
1018 0.47
1019 0.52
1020 0.53
1021 0.46
1022 0.44
1023 0.38
1024 0.36
1025 0.3
1026 0.3
1027 0.26
1028 0.26
1029 0.26
1030 0.25
1031 0.26
1032 0.21
1033 0.2
1034 0.11
1035 0.1
1036 0.09
1037 0.09
1038 0.09
1039 0.09
1040 0.09
1041 0.1
1042 0.09
1043 0.1
1044 0.1
1045 0.08
1046 0.09
1047 0.12
1048 0.12
1049 0.15
1050 0.16
1051 0.16
1052 0.16
1053 0.17
1054 0.16
1055 0.16
1056 0.17
1057 0.14
1058 0.15
1059 0.18
1060 0.22
1061 0.27
1062 0.33
1063 0.37
1064 0.4
1065 0.46
1066 0.49
1067 0.52
1068 0.55
1069 0.6
1070 0.57
1071 0.51
1072 0.48
1073 0.44
1074 0.41
1075 0.36
1076 0.32
1077 0.22
1078 0.19
1079 0.19
1080 0.17
1081 0.17
1082 0.18
1083 0.17
1084 0.15
1085 0.13
1086 0.13
1087 0.12
1088 0.12
1089 0.11
1090 0.1
1091 0.09
1092 0.08
1093 0.08
1094 0.08
1095 0.08
1096 0.09
1097 0.07
1098 0.08
1099 0.08
1100 0.1
1101 0.12
1102 0.12
1103 0.12
1104 0.17
1105 0.17
1106 0.2
1107 0.22
1108 0.23
1109 0.23
1110 0.23
1111 0.25
1112 0.19
1113 0.2
1114 0.18
1115 0.17
1116 0.13
1117 0.14
1118 0.13
1119 0.12
1120 0.12
1121 0.13
1122 0.13
1123 0.14
1124 0.16
1125 0.16
1126 0.2
1127 0.2
1128 0.21
1129 0.21
1130 0.22
1131 0.22
1132 0.26
1133 0.26
1134 0.34
1135 0.33
1136 0.31
1137 0.34
1138 0.33
1139 0.39
1140 0.43
1141 0.47
1142 0.41
1143 0.46
1144 0.51
1145 0.48
1146 0.47
1147 0.39
1148 0.32
1149 0.25
1150 0.21
1151 0.16
1152 0.11
1153 0.11
1154 0.09
1155 0.1
1156 0.07
1157 0.07
1158 0.07
1159 0.07
1160 0.07
1161 0.07
1162 0.07
1163 0.07
1164 0.07
1165 0.07
1166 0.07
1167 0.07
1168 0.09
1169 0.08
1170 0.09
1171 0.14
1172 0.14
1173 0.17
1174 0.18
1175 0.22
1176 0.26
1177 0.3
1178 0.38
1179 0.42
1180 0.49
1181 0.54
1182 0.62
1183 0.61
1184 0.58
1185 0.58
1186 0.57
1187 0.58
1188 0.58
1189 0.55
1190 0.51
1191 0.53
1192 0.54
1193 0.55
1194 0.5
1195 0.48
1196 0.44
1197 0.48
1198 0.47
1199 0.51
1200 0.53
1201 0.52
1202 0.51
1203 0.47
1204 0.51
1205 0.51
1206 0.51
1207 0.44
1208 0.38
1209 0.36
1210 0.43
1211 0.41
1212 0.37
1213 0.33
1214 0.31
1215 0.32
1216 0.31
1217 0.32
1218 0.28
1219 0.32
1220 0.33
1221 0.34
1222 0.39
1223 0.4
1224 0.44
1225 0.45
1226 0.42
1227 0.37
1228 0.32
1229 0.32
1230 0.29
1231 0.29
1232 0.26
1233 0.25
1234 0.27
1235 0.27
1236 0.27
1237 0.23
1238 0.21
1239 0.22
1240 0.21
1241 0.24
1242 0.22
1243 0.26
1244 0.26
1245 0.25
1246 0.34
1247 0.31
1248 0.36
1249 0.38
1250 0.43
1251 0.41
1252 0.49
1253 0.51
1254 0.42
1255 0.5
1256 0.54
1257 0.49
1258 0.5
1259 0.5
1260 0.44
1261 0.48
1262 0.49
1263 0.44
1264 0.44
1265 0.41