Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2LVN3

Protein Details
Accession A0A1Y2LVN3    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-51TGGERRNRSRSPRQDRDSRRDGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-111RSNTGGERRNRSRSPRQDRDSRRDGGRYRSRSPFRRDERDGDRGRGDRGRGDRSDRGRNDRGPPTSLRSGAGNRGAPPAATRPPPK
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDNDTPREYHRERDGRGGRDRDNERSNTGGERRNRSRSPRQDRDSRRDGGRYRSRSPFRRDERDGDRGRGDRGRGDRSDRGRNDRGPPTSLRSGAGNRGAPPAATRPPPKISKSEPLDEEESKDVVMKEERVRPEGMDDETWEMAQLMGFAGFKSTKNTKVPGNDKNYGVRRDKQMEARQYMNRQGGFNRPLSPGRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.64
3 0.62
4 0.69
5 0.68
6 0.62
7 0.63
8 0.66
9 0.64
10 0.63
11 0.58
12 0.52
13 0.48
14 0.45
15 0.42
16 0.43
17 0.42
18 0.42
19 0.49
20 0.53
21 0.59
22 0.64
23 0.66
24 0.72
25 0.75
26 0.79
27 0.8
28 0.8
29 0.81
30 0.84
31 0.84
32 0.8
33 0.75
34 0.68
35 0.65
36 0.62
37 0.62
38 0.63
39 0.61
40 0.6
41 0.64
42 0.68
43 0.69
44 0.72
45 0.72
46 0.71
47 0.73
48 0.72
49 0.7
50 0.68
51 0.7
52 0.65
53 0.58
54 0.55
55 0.47
56 0.45
57 0.41
58 0.35
59 0.31
60 0.32
61 0.34
62 0.32
63 0.36
64 0.39
65 0.42
66 0.5
67 0.48
68 0.51
69 0.51
70 0.53
71 0.53
72 0.53
73 0.49
74 0.43
75 0.41
76 0.39
77 0.37
78 0.33
79 0.27
80 0.23
81 0.22
82 0.22
83 0.24
84 0.19
85 0.17
86 0.18
87 0.17
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.17
93 0.19
94 0.21
95 0.27
96 0.32
97 0.33
98 0.35
99 0.36
100 0.41
101 0.43
102 0.44
103 0.4
104 0.4
105 0.42
106 0.37
107 0.34
108 0.27
109 0.23
110 0.18
111 0.18
112 0.14
113 0.12
114 0.13
115 0.14
116 0.17
117 0.23
118 0.25
119 0.26
120 0.26
121 0.25
122 0.26
123 0.25
124 0.23
125 0.18
126 0.17
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.14
131 0.11
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.15
143 0.18
144 0.24
145 0.28
146 0.31
147 0.35
148 0.44
149 0.51
150 0.54
151 0.58
152 0.57
153 0.56
154 0.62
155 0.63
156 0.61
157 0.59
158 0.56
159 0.56
160 0.57
161 0.61
162 0.62
163 0.64
164 0.65
165 0.64
166 0.65
167 0.64
168 0.63
169 0.65
170 0.62
171 0.55
172 0.48
173 0.47
174 0.49
175 0.47
176 0.44
177 0.4
178 0.38