FuNGI

A0A1Y2LNU8

Protein Details

Accession

A0A1Y2LNU8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
41-63	KTAQSKLKLKKPTRVFVKQTGQE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 16.5, cyto_mito 10.833, extr 6, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001233 RtcB IPR036025 RtcB-like_sf
Gene Ontology	GO:0005525 F:GTP binding GO:0046872 F:metal ion binding GO:0008452 F:RNA ligase activity GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01139 RtcB

Amino Acid Sequences

MATRVTVANNAKQSQKAPLVLPAAAITDPAAAGSMQSLVFKTAQSKLKLKKPTRVFVKQTGQELINEKDWKDNIRSDAVLLVSTGEEYVGVKKEIIIHEDINPSCPVEILASNAPIESLSVTQLTTTTRTLPGIIHAVGQPDLHPGTKFPIGAVFASYKWIHPPLIGGDIGCGMAWFQLSLSRSQVDGDKGKKVAEKLRGLEGPWRTQELRELWLQDKDGSCSAGEQWDSSLGTIGAGNHFAEIQVVEESASDLDNGLREGDVVLLVHSGSRGYGGSVLKKYAVESQTSLEEGTTEAAEYLKEHDKACRWAKANRDLIALRFLACLEPGNEVWQLGASDVDHVDSASIERCKSALQARRVVDIWHNNVERVSWPPSPPSAMGLDKAVDSLSLNGSKYPQEHVYVHRKGAAPTCDPESHQPLTLLPLPGSRGTPTLILQPSFSAATSWGLKNALSLAHGAGRSMSRAKALSSLSQKYKGQNILQPRGGDEGTWVICDEKDLVFEEAPDAYKDVQAVGQDLVDAGVATIVGWCRARVSYKVRNENH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.45
3	0.42
4	0.38
5	0.41
6	0.4
7	0.36
8	0.35
9	0.27
10	0.23
11	0.19
12	0.18
13	0.12
14	0.09
15	0.08
16	0.08
17	0.08
18	0.05
19	0.06
20	0.06
21	0.07
22	0.07
23	0.08
24	0.09
25	0.1
26	0.11
27	0.13
28	0.16
29	0.22
30	0.29
31	0.34
32	0.42
33	0.48
34	0.56
35	0.66
36	0.69
37	0.71
38	0.73
39	0.77
40	0.78
41	0.8
42	0.79
43	0.78
44	0.81
45	0.76
46	0.72
47	0.66
48	0.57
49	0.51
50	0.48
51	0.42
52	0.39
53	0.37
54	0.33
55	0.34
56	0.36
57	0.36
58	0.36
59	0.37
60	0.34
61	0.36
62	0.36
63	0.3
64	0.31
65	0.27
66	0.22
67	0.17
68	0.14
69	0.09
70	0.09
71	0.08
72	0.05
73	0.05
74	0.06
75	0.09
76	0.1
77	0.11
78	0.11
79	0.12
80	0.17
81	0.19
82	0.21
83	0.22
84	0.21
85	0.25
86	0.31
87	0.3
88	0.28
89	0.26
90	0.24
91	0.2
92	0.19
93	0.15
94	0.11
95	0.11
96	0.12
97	0.13
98	0.14
99	0.14
100	0.14
101	0.13
102	0.11
103	0.11
104	0.08
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.09
111	0.1
112	0.11
113	0.12
114	0.13
115	0.14
116	0.15
117	0.16
118	0.15
119	0.16
120	0.17
121	0.16
122	0.15
123	0.14
124	0.15
125	0.15
126	0.15
127	0.13
128	0.12
129	0.13
130	0.13
131	0.12
132	0.11
133	0.15
134	0.17
135	0.17
136	0.14
137	0.15
138	0.16
139	0.16
140	0.17
141	0.14
142	0.12
143	0.16
144	0.16
145	0.14
146	0.16
147	0.17
148	0.16
149	0.14
150	0.16
151	0.14
152	0.16
153	0.16
154	0.13
155	0.11
156	0.11
157	0.11
158	0.09
159	0.07
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.03
165	0.07
166	0.08
167	0.09
168	0.11
169	0.11
170	0.12
171	0.13
172	0.15
173	0.16
174	0.21
175	0.23
176	0.25
177	0.25
178	0.27
179	0.28
180	0.29
181	0.32
182	0.34
183	0.37
184	0.35
185	0.39
186	0.39
187	0.37
188	0.39
189	0.36
190	0.32
191	0.28
192	0.29
193	0.25
194	0.24
195	0.28
196	0.24
197	0.24
198	0.22
199	0.23
200	0.22
201	0.23
202	0.24
203	0.21
204	0.2
205	0.19
206	0.18
207	0.15
208	0.13
209	0.12
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.09
214	0.08
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.06
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.04
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.07
262	0.08
263	0.12
264	0.12
265	0.13
266	0.13
267	0.13
268	0.14
269	0.16
270	0.16
271	0.14
272	0.15
273	0.16
274	0.16
275	0.16
276	0.15
277	0.09
278	0.08
279	0.07
280	0.06
281	0.05
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.05
287	0.08
288	0.11
289	0.13
290	0.13
291	0.16
292	0.19
293	0.27
294	0.31
295	0.34
296	0.33
297	0.35
298	0.42
299	0.49
300	0.52
301	0.46
302	0.45
303	0.39
304	0.37
305	0.36
306	0.29
307	0.2
308	0.15
309	0.13
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.07
314	0.09
315	0.08
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.06
323	0.06
324	0.04
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.08
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.1
338	0.1
339	0.13
340	0.2
341	0.25
342	0.29
343	0.36
344	0.38
345	0.4
346	0.4
347	0.39
348	0.37
349	0.36
350	0.34
351	0.34
352	0.34
353	0.31
354	0.31
355	0.3
356	0.25
357	0.22
358	0.23
359	0.19
360	0.19
361	0.21
362	0.23
363	0.24
364	0.23
365	0.21
366	0.2
367	0.18
368	0.18
369	0.17
370	0.16
371	0.14
372	0.14
373	0.11
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.09
378	0.1
379	0.11
380	0.11
381	0.13
382	0.14
383	0.15
384	0.18
385	0.18
386	0.2
387	0.22
388	0.29
389	0.38
390	0.39
391	0.39
392	0.4
393	0.4
394	0.38
395	0.42
396	0.39
397	0.33
398	0.32
399	0.36
400	0.32
401	0.33
402	0.36
403	0.35
404	0.32
405	0.3
406	0.28
407	0.23
408	0.26
409	0.29
410	0.25
411	0.19
412	0.19
413	0.2
414	0.2
415	0.21
416	0.18
417	0.15
418	0.15
419	0.16
420	0.15
421	0.21
422	0.22
423	0.21
424	0.21
425	0.2
426	0.2
427	0.19
428	0.19
429	0.12
430	0.1
431	0.13
432	0.16
433	0.16
434	0.16
435	0.16
436	0.16
437	0.16
438	0.16
439	0.13
440	0.1
441	0.11
442	0.1
443	0.13
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.15
449	0.17
450	0.17
451	0.16
452	0.17
453	0.18
454	0.21
455	0.23
456	0.28
457	0.33
458	0.39
459	0.41
460	0.46
461	0.49
462	0.48
463	0.53
464	0.53
465	0.51
466	0.49
467	0.54
468	0.57
469	0.58
470	0.54
471	0.48
472	0.45
473	0.4
474	0.34
475	0.26
476	0.23
477	0.19
478	0.19
479	0.17
480	0.14
481	0.14
482	0.15
483	0.15
484	0.11
485	0.12
486	0.14
487	0.16
488	0.15
489	0.16
490	0.16
491	0.15
492	0.16
493	0.15
494	0.15
495	0.13
496	0.14
497	0.14
498	0.14
499	0.14
500	0.13
501	0.14
502	0.13
503	0.12
504	0.11
505	0.1
506	0.1
507	0.08
508	0.07
509	0.05
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.06
514	0.06
515	0.1
516	0.1
517	0.11
518	0.13
519	0.16
520	0.2
521	0.26
522	0.35
523	0.42
524	0.51

A0A1Y2LNU8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer