FuNGI

A0A1Y2M190

Protein Details

Accession

A0A1Y2M190

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
634-667	SQPQHSPPAKSKNKNRKQRQREKREREAQERLQS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
515-584	RGMMRGRGGWGDRGRGFRGRGNFGGRGDFGGGRGDFGGGRGGRGDAHGGRGDRGGGRGDRGGGSGGRGGR
641-659	PAKSKNKNRKQRQREKRER

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR007964 MIC19/MIC25 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0061617 C:MICOS complex GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1 PF05300 MIC19_MIC25

Amino Acid Sequences

MSDSHEPPAKRARLEADAPFSRVSVSSFDAPDSPVDDLDDDYFYDNAPVHPAAAAQAAPHDGSAASLTATAPAPSGFSLPGLGSLADTTVTVTQPQALTQANADTVMSNADAVHDEGELVDEEALHHETSAVEPPAANQLQALVEAPQHDAPATTATLSPAHDAKAHVTDVASPVNAHTKQEHSAAAAPAEGAPEPTADESKAEFLRIGEANKGNEEAEWQLDSDASSSSSDSSSSDESSDDEADDGELMDPEEMVRLLMAESADDAGASGNAKVKTLNEEEEKYEKPDIKVENETQITELGKVEAVVDNLVLVKATLSGDDKVLESGSALCLRDFTIVGKISEQIGRVEEPRYSVGFNDPAEVTALGIAKDTLIYYVDAHSTFVFTEPLRKQKHTDASNLHDEETNEVEFSDDEAEAEYKRQQKQAKKARQEAKHEPEPTPVPEQKPIPTGPRGHVNKPVSYFSPATEYQGGGLKYSDDEDEDLGMYKPLARPSHFEEIVGQGAPLEDRSHVRRGMMRGRGGWGDRGRGFRGRGNFGGRGDFGGGRGDFGGGRGGRGDAHGGRGDRGGGRGDRGGGSGGRGGRGANTQADQGRPQNQQQNQQQNSRQMSVPRPDHRSAASASPARQQEGQSPSQPQHSPPAKSKNKNRKQRQREKREREAQERLQSQQQQAQQPSQQQPQQQAQKQQHQQQQQKAHASPVPSGPSNATSYANNSAAGWPTQFPQPTAPAAAYPPPPPPAATASYANPAQYAQQPTAPAQPNQQANWAAWAQWLQVVAMSQQGAQTQQAQAPPPPPQPQPQQYVQPPVQVPTPPQTQVQYGYQQQQWQYPQNAAPAPNPNAPQGNTQAGAQSLQDILRALGGGGGGQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.51
3	0.5
4	0.48
5	0.48
6	0.44
7	0.38
8	0.33
9	0.28
10	0.23
11	0.18
12	0.19
13	0.21
14	0.21
15	0.23
16	0.23
17	0.23
18	0.23
19	0.22
20	0.19
21	0.14
22	0.15
23	0.14
24	0.14
25	0.15
26	0.14
27	0.13
28	0.13
29	0.13
30	0.12
31	0.13
32	0.12
33	0.11
34	0.14
35	0.14
36	0.13
37	0.13
38	0.13
39	0.12
40	0.13
41	0.13
42	0.09
43	0.1
44	0.11
45	0.11
46	0.11
47	0.1
48	0.08
49	0.09
50	0.1
51	0.08
52	0.07
53	0.07
54	0.08
55	0.09
56	0.1
57	0.09
58	0.09
59	0.09
60	0.1
61	0.1
62	0.11
63	0.09
64	0.09
65	0.1
66	0.1
67	0.11
68	0.1
69	0.1
70	0.09
71	0.09
72	0.08
73	0.07
74	0.07
75	0.08
76	0.08
77	0.09
78	0.09
79	0.1
80	0.13
81	0.13
82	0.13
83	0.15
84	0.15
85	0.15
86	0.16
87	0.17
88	0.14
89	0.14
90	0.14
91	0.1
92	0.1
93	0.1
94	0.09
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.08
99	0.08
100	0.09
101	0.07
102	0.07
103	0.07
104	0.08
105	0.08
106	0.07
107	0.06
108	0.06
109	0.06
110	0.09
111	0.11
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.09
116	0.11
117	0.15
118	0.14
119	0.13
120	0.13
121	0.14
122	0.21
123	0.21
124	0.19
125	0.14
126	0.15
127	0.15
128	0.15
129	0.15
130	0.08
131	0.09
132	0.1
133	0.13
134	0.12
135	0.12
136	0.11
137	0.11
138	0.11
139	0.12
140	0.12
141	0.1
142	0.1
143	0.11
144	0.13
145	0.13
146	0.15
147	0.14
148	0.14
149	0.15
150	0.16
151	0.17
152	0.19
153	0.19
154	0.17
155	0.16
156	0.17
157	0.17
158	0.17
159	0.14
160	0.11
161	0.12
162	0.19
163	0.2
164	0.2
165	0.2
166	0.22
167	0.24
168	0.26
169	0.26
170	0.2
171	0.24
172	0.23
173	0.21
174	0.18
175	0.16
176	0.13
177	0.13
178	0.11
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.09
184	0.1
185	0.09
186	0.1
187	0.1
188	0.14
189	0.15
190	0.14
191	0.13
192	0.12
193	0.17
194	0.18
195	0.18
196	0.19
197	0.22
198	0.23
199	0.23
200	0.24
201	0.19
202	0.17
203	0.18
204	0.13
205	0.12
206	0.11
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.08
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.1
221	0.11
222	0.11
223	0.12
224	0.11
225	0.12
226	0.14
227	0.14
228	0.11
229	0.1
230	0.09
231	0.08
232	0.08
233	0.07
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.05
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.05
248	0.04
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.04
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.11
262	0.12
263	0.16
264	0.18
265	0.22
266	0.21
267	0.23
268	0.26
269	0.3
270	0.3
271	0.29
272	0.3
273	0.29
274	0.26
275	0.3
276	0.29
277	0.29
278	0.33
279	0.32
280	0.35
281	0.32
282	0.32
283	0.26
284	0.25
285	0.21
286	0.17
287	0.15
288	0.09
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.05
300	0.03
301	0.03
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.07
306	0.07
307	0.08
308	0.09
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.07
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.1
322	0.09
323	0.09
324	0.12
325	0.13
326	0.13
327	0.13
328	0.14
329	0.14
330	0.15
331	0.15
332	0.11
333	0.11
334	0.12
335	0.13
336	0.13
337	0.12
338	0.12
339	0.13
340	0.13
341	0.12
342	0.12
343	0.13
344	0.15
345	0.15
346	0.15
347	0.13
348	0.12
349	0.13
350	0.12
351	0.09
352	0.08
353	0.08
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.07
366	0.07
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.07
374	0.14
375	0.16
376	0.25
377	0.28
378	0.29
379	0.32
380	0.38
381	0.46
382	0.41
383	0.45
384	0.41
385	0.43
386	0.48
387	0.46
388	0.39
389	0.32
390	0.3
391	0.25
392	0.22
393	0.17
394	0.1
395	0.09
396	0.09
397	0.07
398	0.08
399	0.07
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.07
406	0.11
407	0.15
408	0.17
409	0.23
410	0.29
411	0.35
412	0.46
413	0.56
414	0.62
415	0.64
416	0.72
417	0.75
418	0.76
419	0.77
420	0.76
421	0.73
422	0.7
423	0.64
424	0.55
425	0.5
426	0.45
427	0.4
428	0.36
429	0.31
430	0.26
431	0.27
432	0.28
433	0.26
434	0.27
435	0.26
436	0.24
437	0.25
438	0.25
439	0.24
440	0.32
441	0.34
442	0.33
443	0.4
444	0.38
445	0.37
446	0.37
447	0.37
448	0.29
449	0.29
450	0.27
451	0.19
452	0.22
453	0.19
454	0.19
455	0.18
456	0.17
457	0.14
458	0.17
459	0.17
460	0.12
461	0.12
462	0.1
463	0.09
464	0.1
465	0.09
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.07
476	0.08
477	0.13
478	0.15
479	0.15
480	0.18
481	0.24
482	0.32
483	0.3
484	0.29
485	0.25
486	0.25
487	0.25
488	0.22
489	0.16
490	0.08
491	0.08
492	0.07
493	0.07
494	0.06
495	0.06
496	0.08
497	0.12
498	0.15
499	0.16
500	0.18
501	0.21
502	0.25
503	0.32
504	0.35
505	0.34
506	0.31
507	0.33
508	0.34
509	0.31
510	0.32
511	0.25
512	0.25
513	0.25
514	0.27
515	0.28
516	0.29
517	0.3
518	0.28
519	0.31
520	0.31
521	0.31
522	0.33
523	0.33
524	0.3
525	0.3
526	0.26
527	0.22
528	0.19
529	0.16
530	0.12
531	0.13
532	0.12
533	0.1
534	0.1
535	0.1
536	0.08
537	0.08
538	0.12
539	0.09
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.09
544	0.1
545	0.13
546	0.09
547	0.11
548	0.14
549	0.14
550	0.14
551	0.15
552	0.15
553	0.13
554	0.14
555	0.14
556	0.12
557	0.13
558	0.13
559	0.14
560	0.13
561	0.13
562	0.13
563	0.1
564	0.1
565	0.12
566	0.11
567	0.11
568	0.11
569	0.1
570	0.1
571	0.12
572	0.13
573	0.12
574	0.12
575	0.14
576	0.16
577	0.18
578	0.19
579	0.21
580	0.26
581	0.27
582	0.32
583	0.38
584	0.4
585	0.48
586	0.54
587	0.61
588	0.59
589	0.63
590	0.63
591	0.63
592	0.62
593	0.55
594	0.49
595	0.43
596	0.45
597	0.46
598	0.49
599	0.47
600	0.51
601	0.5
602	0.5
603	0.46
604	0.43
605	0.36
606	0.31
607	0.31
608	0.28
609	0.27
610	0.31
611	0.31
612	0.3
613	0.3
614	0.28
615	0.29
616	0.32
617	0.34
618	0.31
619	0.34
620	0.33
621	0.38
622	0.38
623	0.32
624	0.36
625	0.39
626	0.41
627	0.45
628	0.54
629	0.58
630	0.66
631	0.75
632	0.76
633	0.8
634	0.86
635	0.9
636	0.9
637	0.92
638	0.93
639	0.94
640	0.94
641	0.96
642	0.94
643	0.94
644	0.93
645	0.9
646	0.88
647	0.86
648	0.83
649	0.8
650	0.73
651	0.66
652	0.63
653	0.59
654	0.53
655	0.5
656	0.48
657	0.46
658	0.46
659	0.48
660	0.44
661	0.47
662	0.51
663	0.52
664	0.49
665	0.46
666	0.49
667	0.54
668	0.59
669	0.57
670	0.6
671	0.61
672	0.67
673	0.72
674	0.74
675	0.73
676	0.73
677	0.76
678	0.75
679	0.76
680	0.73
681	0.73
682	0.65
683	0.62
684	0.54
685	0.48
686	0.42
687	0.38
688	0.35
689	0.28
690	0.28
691	0.25
692	0.25
693	0.25
694	0.25
695	0.22
696	0.18
697	0.21
698	0.25
699	0.24
700	0.21
701	0.2
702	0.19
703	0.2
704	0.2
705	0.17
706	0.13
707	0.14
708	0.19
709	0.2
710	0.19
711	0.21
712	0.23
713	0.24
714	0.24
715	0.23
716	0.19
717	0.2
718	0.23
719	0.23
720	0.22
721	0.23
722	0.24
723	0.24
724	0.24
725	0.24
726	0.24
727	0.25
728	0.26
729	0.26
730	0.25
731	0.29
732	0.29
733	0.27
734	0.23
735	0.19
736	0.19
737	0.22
738	0.24
739	0.21
740	0.23
741	0.25
742	0.27
743	0.35
744	0.37
745	0.32
746	0.34
747	0.39
748	0.41
749	0.41
750	0.44
751	0.37
752	0.33
753	0.37
754	0.31
755	0.24
756	0.21
757	0.21
758	0.16
759	0.15
760	0.15
761	0.1
762	0.11
763	0.11
764	0.1
765	0.11
766	0.11
767	0.1
768	0.11
769	0.12
770	0.12
771	0.13
772	0.16
773	0.16
774	0.19
775	0.21
776	0.23
777	0.26
778	0.29
779	0.34
780	0.37
781	0.41
782	0.42
783	0.47
784	0.54
785	0.58
786	0.6
787	0.59
788	0.62
789	0.62
790	0.67
791	0.61
792	0.58
793	0.52
794	0.48
795	0.46
796	0.39
797	0.37
798	0.35
799	0.38
800	0.33
801	0.35
802	0.35
803	0.34
804	0.36
805	0.38
806	0.38
807	0.38
808	0.42
809	0.43
810	0.45
811	0.45
812	0.47
813	0.49
814	0.5
815	0.47
816	0.46
817	0.45
818	0.46
819	0.48
820	0.43
821	0.42
822	0.43
823	0.45
824	0.46
825	0.45
826	0.43
827	0.44
828	0.43
829	0.43
830	0.4
831	0.39
832	0.34
833	0.32
834	0.3
835	0.26
836	0.25
837	0.2
838	0.17
839	0.14
840	0.13
841	0.14
842	0.12
843	0.11
844	0.11
845	0.11
846	0.09
847	0.08
848	0.08

A0A1Y2M190

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer