Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2MDZ9

Protein Details
Accession A0A1Y2MDZ9    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-366QPNRSESMRNRPREKPRRRGSEEDIBasic
421-442EMMSRNSKSRRRSPARSTRSGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
350-360RNRPREKPRRR
428-451KSRRRSPARSTRSGGSGGARGVAG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000270  PB1_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF00515  TPR_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51745  PB1  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSLKQEIETWVAALGSYDNNEFDEALKVFDSISDTSKILFNCGVIHATLGEHEKAVDCYQRAVRLDQYLAVAYFQQGVSNFLMGDFEEALANFNDTLLYLRGNNNIDYEQLGLKFKLYSCEVLFNRGLCYIYLQQRDAGLQDLSFAAKEKVVPDHDVIDEAIREEAEGYTVFSIPVGIVYRPNEAKVKNLKTKDYLGKARLVAASDRNNAFTGFTGAEIKKMGNTATDDRPEEKLSFAATNLVKPELQSRARQQSEPPLNRNMFPPTPPPEGDGRGSSKGSSNEPMSRAQSVRGGGPKPQPLNLGRAAFDQKEQRDQRNDDPRRPLQRSMSERPPQMSERQQPNRSESMRNRPREKPRRRGSEEDIIDDYNDDIYDSYQSRSSRGQYGRGSKQGGSRRPAYIEEEDEDDYDGSDLDDAEFEMMSRNSKSRRRSPARSTRSGGSGGARGVAGKIRVKVHGNDIRYVFVTGDMTMREFSQSIREKFGMRQNFKVEIKDDGDMITMADQDDLDMAIDTAKDNARRTGESPKMEVWIREV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.16
11 0.14
12 0.15
13 0.15
14 0.14
15 0.13
16 0.14
17 0.16
18 0.13
19 0.16
20 0.17
21 0.17
22 0.18
23 0.22
24 0.21
25 0.2
26 0.2
27 0.17
28 0.16
29 0.18
30 0.18
31 0.14
32 0.15
33 0.12
34 0.11
35 0.13
36 0.15
37 0.14
38 0.12
39 0.13
40 0.14
41 0.16
42 0.18
43 0.21
44 0.18
45 0.23
46 0.26
47 0.32
48 0.33
49 0.33
50 0.35
51 0.34
52 0.34
53 0.31
54 0.29
55 0.24
56 0.22
57 0.2
58 0.16
59 0.12
60 0.14
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.12
70 0.1
71 0.11
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.13
88 0.18
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.18
96 0.15
97 0.15
98 0.16
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.19
104 0.19
105 0.21
106 0.2
107 0.29
108 0.28
109 0.31
110 0.32
111 0.28
112 0.28
113 0.25
114 0.24
115 0.15
116 0.19
117 0.21
118 0.26
119 0.29
120 0.28
121 0.28
122 0.28
123 0.29
124 0.25
125 0.21
126 0.14
127 0.1
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.1
137 0.14
138 0.16
139 0.19
140 0.18
141 0.2
142 0.2
143 0.2
144 0.18
145 0.15
146 0.12
147 0.1
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.09
166 0.11
167 0.15
168 0.16
169 0.18
170 0.21
171 0.2
172 0.27
173 0.34
174 0.41
175 0.45
176 0.47
177 0.49
178 0.48
179 0.55
180 0.54
181 0.52
182 0.5
183 0.45
184 0.45
185 0.42
186 0.41
187 0.35
188 0.29
189 0.24
190 0.23
191 0.25
192 0.25
193 0.25
194 0.24
195 0.23
196 0.22
197 0.21
198 0.16
199 0.13
200 0.09
201 0.09
202 0.13
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.08
211 0.12
212 0.15
213 0.18
214 0.21
215 0.22
216 0.23
217 0.25
218 0.25
219 0.22
220 0.19
221 0.16
222 0.14
223 0.13
224 0.11
225 0.15
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.16
233 0.17
234 0.19
235 0.21
236 0.27
237 0.35
238 0.37
239 0.37
240 0.36
241 0.39
242 0.47
243 0.48
244 0.45
245 0.43
246 0.42
247 0.42
248 0.43
249 0.37
250 0.28
251 0.25
252 0.27
253 0.26
254 0.28
255 0.27
256 0.27
257 0.25
258 0.26
259 0.26
260 0.23
261 0.21
262 0.2
263 0.2
264 0.18
265 0.19
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.19
270 0.2
271 0.21
272 0.23
273 0.22
274 0.22
275 0.21
276 0.19
277 0.19
278 0.17
279 0.18
280 0.2
281 0.19
282 0.21
283 0.26
284 0.3
285 0.28
286 0.29
287 0.3
288 0.28
289 0.31
290 0.31
291 0.27
292 0.22
293 0.24
294 0.25
295 0.21
296 0.22
297 0.24
298 0.21
299 0.29
300 0.32
301 0.36
302 0.4
303 0.44
304 0.5
305 0.56
306 0.6
307 0.57
308 0.62
309 0.63
310 0.65
311 0.65
312 0.6
313 0.56
314 0.6
315 0.61
316 0.6
317 0.62
318 0.59
319 0.57
320 0.54
321 0.51
322 0.45
323 0.43
324 0.44
325 0.43
326 0.48
327 0.55
328 0.59
329 0.58
330 0.61
331 0.62
332 0.57
333 0.57
334 0.53
335 0.56
336 0.59
337 0.63
338 0.65
339 0.66
340 0.75
341 0.77
342 0.81
343 0.8
344 0.81
345 0.84
346 0.85
347 0.84
348 0.8
349 0.79
350 0.7
351 0.63
352 0.55
353 0.44
354 0.37
355 0.29
356 0.22
357 0.13
358 0.1
359 0.07
360 0.05
361 0.05
362 0.08
363 0.09
364 0.1
365 0.14
366 0.15
367 0.17
368 0.2
369 0.23
370 0.29
371 0.3
372 0.37
373 0.39
374 0.48
375 0.51
376 0.53
377 0.53
378 0.47
379 0.52
380 0.53
381 0.53
382 0.49
383 0.47
384 0.44
385 0.44
386 0.44
387 0.42
388 0.37
389 0.33
390 0.29
391 0.28
392 0.27
393 0.24
394 0.23
395 0.17
396 0.14
397 0.11
398 0.09
399 0.06
400 0.06
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.08
409 0.08
410 0.1
411 0.12
412 0.17
413 0.24
414 0.31
415 0.39
416 0.46
417 0.57
418 0.64
419 0.72
420 0.79
421 0.82
422 0.85
423 0.84
424 0.79
425 0.72
426 0.65
427 0.57
428 0.48
429 0.4
430 0.33
431 0.26
432 0.22
433 0.18
434 0.15
435 0.14
436 0.15
437 0.16
438 0.17
439 0.21
440 0.23
441 0.27
442 0.31
443 0.33
444 0.4
445 0.43
446 0.42
447 0.43
448 0.42
449 0.4
450 0.37
451 0.35
452 0.25
453 0.2
454 0.18
455 0.13
456 0.14
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.2
465 0.28
466 0.29
467 0.35
468 0.36
469 0.37
470 0.43
471 0.51
472 0.52
473 0.48
474 0.53
475 0.52
476 0.59
477 0.59
478 0.58
479 0.5
480 0.45
481 0.44
482 0.38
483 0.33
484 0.25
485 0.23
486 0.19
487 0.17
488 0.12
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.1
503 0.14
504 0.18
505 0.21
506 0.27
507 0.3
508 0.33
509 0.36
510 0.44
511 0.48
512 0.48
513 0.5
514 0.46
515 0.47
516 0.47