Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2M6X0

Protein Details
Accession A0A1Y2M6X0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-136QRLAERKRKRTASPDRPQKQTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-124ERKRKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
IPR003903  UIM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
PF02809  UIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
CDD cd09122  PLDc_Tdp1_1  
Amino Acid Sequences MASSDDDEDLKLALALSMQHSPANTSTNKTVVDLTSDDEGEDSDKELKQAIALSLQEATQPMTGAAPATTDQQLSSVDTTSLAELTAQNVLTSALPSKSTPFVMDRKAMEAERLQRLAERKRKRTASPDRPQKQTLKATESVIAGRSTSSPSQPDSVLQFPDGTIKRTYAAGYPRTDDITIDEVLQAPTVRIAVISSFQWDAEWMSRKLSHLKVKQHWVMNVRDAETQARYRRDLAASGTPNLRMHFPPMNPAVGIAHSKYMLLVGEQKMRVVVSTANMEPVYWGEMVNNWQPGVLENTVFLIDLPRRPDGAVGSVEDLPPFGQELVHFLEAQQLDPLIIKGVLKFDFSRTAHLAFVHSIGVPSDTASHPTGLPSLAKAIQTLSLSQPAHIQLDYATSSLGALSPTFLQRIHSAARGVPFTPQTPTAPTPHAPRNLRIHYPTAATIAASTGGPRCAGVVSLRKAHYASPSFPAACLRDHVSTRRGIISHNKLLFARGRREDGQPFAWVYVGSANASEAAWGAQKVLKNGQLGKLAVRNWECGVVMAVPGGRLAGLGEGEGEAPPMSVFEGTVEVPFRCPGEKYEGRMPWVQDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.11
4 0.13
5 0.14
6 0.15
7 0.15
8 0.18
9 0.19
10 0.24
11 0.23
12 0.25
13 0.27
14 0.3
15 0.31
16 0.29
17 0.3
18 0.25
19 0.27
20 0.23
21 0.22
22 0.21
23 0.2
24 0.19
25 0.16
26 0.16
27 0.13
28 0.13
29 0.12
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.16
34 0.16
35 0.16
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.17
41 0.16
42 0.16
43 0.16
44 0.14
45 0.14
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.09
55 0.11
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.14
61 0.15
62 0.15
63 0.13
64 0.12
65 0.12
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.09
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.1
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.1
82 0.12
83 0.12
84 0.15
85 0.17
86 0.17
87 0.19
88 0.22
89 0.26
90 0.29
91 0.34
92 0.32
93 0.33
94 0.36
95 0.33
96 0.31
97 0.31
98 0.33
99 0.34
100 0.34
101 0.31
102 0.31
103 0.38
104 0.45
105 0.5
106 0.54
107 0.56
108 0.64
109 0.71
110 0.73
111 0.77
112 0.78
113 0.79
114 0.8
115 0.83
116 0.8
117 0.8
118 0.8
119 0.75
120 0.72
121 0.7
122 0.65
123 0.6
124 0.56
125 0.51
126 0.49
127 0.44
128 0.36
129 0.29
130 0.23
131 0.17
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.16
137 0.17
138 0.19
139 0.21
140 0.2
141 0.22
142 0.22
143 0.23
144 0.21
145 0.2
146 0.18
147 0.16
148 0.23
149 0.22
150 0.21
151 0.19
152 0.19
153 0.19
154 0.2
155 0.21
156 0.18
157 0.23
158 0.25
159 0.26
160 0.28
161 0.28
162 0.29
163 0.28
164 0.23
165 0.2
166 0.18
167 0.16
168 0.14
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.1
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.13
190 0.17
191 0.16
192 0.18
193 0.19
194 0.21
195 0.27
196 0.32
197 0.36
198 0.39
199 0.47
200 0.51
201 0.58
202 0.63
203 0.6
204 0.58
205 0.54
206 0.49
207 0.46
208 0.41
209 0.35
210 0.3
211 0.27
212 0.25
213 0.23
214 0.26
215 0.26
216 0.26
217 0.26
218 0.27
219 0.29
220 0.28
221 0.27
222 0.24
223 0.26
224 0.25
225 0.26
226 0.25
227 0.24
228 0.24
229 0.23
230 0.22
231 0.15
232 0.18
233 0.2
234 0.19
235 0.23
236 0.23
237 0.23
238 0.21
239 0.2
240 0.17
241 0.13
242 0.14
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.06
251 0.1
252 0.11
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.11
260 0.09
261 0.07
262 0.09
263 0.09
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.05
273 0.06
274 0.09
275 0.11
276 0.11
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.12
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.07
291 0.09
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.13
297 0.12
298 0.13
299 0.12
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.07
307 0.06
308 0.06
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.07
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.12
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.12
334 0.19
335 0.19
336 0.23
337 0.22
338 0.23
339 0.22
340 0.22
341 0.21
342 0.14
343 0.15
344 0.11
345 0.09
346 0.08
347 0.07
348 0.08
349 0.06
350 0.06
351 0.08
352 0.07
353 0.1
354 0.11
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.08
362 0.1
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.1
367 0.12
368 0.12
369 0.14
370 0.12
371 0.17
372 0.17
373 0.17
374 0.19
375 0.17
376 0.18
377 0.17
378 0.15
379 0.09
380 0.12
381 0.12
382 0.1
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.05
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.1
396 0.11
397 0.14
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.17
402 0.2
403 0.2
404 0.19
405 0.19
406 0.19
407 0.18
408 0.19
409 0.19
410 0.18
411 0.21
412 0.23
413 0.24
414 0.26
415 0.27
416 0.31
417 0.36
418 0.43
419 0.41
420 0.45
421 0.51
422 0.52
423 0.55
424 0.52
425 0.49
426 0.42
427 0.41
428 0.36
429 0.29
430 0.24
431 0.18
432 0.15
433 0.12
434 0.1
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.12
445 0.19
446 0.22
447 0.28
448 0.29
449 0.3
450 0.3
451 0.31
452 0.35
453 0.31
454 0.3
455 0.28
456 0.32
457 0.3
458 0.3
459 0.32
460 0.26
461 0.23
462 0.23
463 0.23
464 0.23
465 0.26
466 0.3
467 0.3
468 0.31
469 0.32
470 0.33
471 0.3
472 0.3
473 0.36
474 0.41
475 0.46
476 0.45
477 0.45
478 0.41
479 0.44
480 0.47
481 0.44
482 0.44
483 0.39
484 0.43
485 0.44
486 0.5
487 0.51
488 0.49
489 0.45
490 0.39
491 0.36
492 0.3
493 0.28
494 0.21
495 0.17
496 0.15
497 0.13
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.08
504 0.06
505 0.06
506 0.08
507 0.08
508 0.09
509 0.11
510 0.13
511 0.17
512 0.22
513 0.25
514 0.28
515 0.31
516 0.35
517 0.38
518 0.36
519 0.37
520 0.37
521 0.35
522 0.38
523 0.37
524 0.35
525 0.3
526 0.31
527 0.27
528 0.23
529 0.23
530 0.16
531 0.14
532 0.13
533 0.12
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.09
557 0.09
558 0.12
559 0.14
560 0.14
561 0.15
562 0.17
563 0.17
564 0.17
565 0.18
566 0.2
567 0.28
568 0.33
569 0.38
570 0.46
571 0.49
572 0.52
573 0.55