Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2M1Z9

Protein Details
Accession A0A1Y2M1Z9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-136GAPPEAPPKKGVKRKKQAKTNGVPAEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-129APPKKGVKRKKQAKT
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 8.833, cyto_mito 7.833, extr 6, nucl 4.5, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045183  Ebi-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
Amino Acid Sequences MALSSNVVNYLVWRYLQEAGFGNAALQLSRCWLRDPDSLPFAKNVSAHTLIRILQDGIEFDKLRAEASKTSTKYNFGTDHGRPYSTRNGELLTLDRGIPAHELAAEAANGAPPEAPPKKGVKRKKQAKTNGVPAEPRPERSEPELNGDAMDIDHNGAVQAPTSANSTRAESEPAPSEAESASVTDIPISTLRIGADALIQTDDITDLTTHTTFVPTPKDTQRIVEHTSWGPEEAPLLLAAGKSVLQLHNVARPSNTEVEASVVTMDLPIPVNNFDITALCWQSEGEVIVSAREECVNEVGEKMTMDKLIKVVGDTSHAISSTAGLVTTLRWNPGKELLMSISTDGEKGSIKIWKNDSDSIPAWTDFTSTQIYDAYWISDSAFVVCGTELFKVYEVAEESLTTQRTLDTNVTWETIKYDTSSGIIAALGVREQQYYLGILHPNDSINLQVHEYPDRYPNDLDFRVKAAANSLTNGTSLPNTLLATCSLSGHARIWDANEPFNCVRRLSTTDSSQAFKTAFSPDGTLLAAAGPDAVTVWDIEKREVPVACWRAKQHPVSKWNPSIDGEFNLGWDHDSSRLSIALGNQIAVIPVPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.22
3 0.23
4 0.24
5 0.22
6 0.22
7 0.22
8 0.21
9 0.19
10 0.15
11 0.15
12 0.12
13 0.11
14 0.09
15 0.13
16 0.17
17 0.18
18 0.2
19 0.22
20 0.28
21 0.34
22 0.38
23 0.4
24 0.44
25 0.45
26 0.43
27 0.42
28 0.38
29 0.34
30 0.31
31 0.26
32 0.25
33 0.28
34 0.27
35 0.27
36 0.29
37 0.27
38 0.27
39 0.27
40 0.21
41 0.17
42 0.18
43 0.17
44 0.16
45 0.2
46 0.19
47 0.17
48 0.2
49 0.19
50 0.2
51 0.21
52 0.22
53 0.21
54 0.27
55 0.36
56 0.34
57 0.41
58 0.42
59 0.44
60 0.42
61 0.44
62 0.4
63 0.35
64 0.41
65 0.37
66 0.43
67 0.42
68 0.42
69 0.36
70 0.39
71 0.46
72 0.42
73 0.42
74 0.34
75 0.33
76 0.32
77 0.33
78 0.31
79 0.23
80 0.2
81 0.17
82 0.17
83 0.15
84 0.15
85 0.14
86 0.12
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.14
101 0.17
102 0.18
103 0.21
104 0.3
105 0.4
106 0.49
107 0.6
108 0.63
109 0.72
110 0.81
111 0.87
112 0.88
113 0.89
114 0.9
115 0.88
116 0.87
117 0.84
118 0.76
119 0.69
120 0.61
121 0.61
122 0.52
123 0.46
124 0.42
125 0.37
126 0.37
127 0.41
128 0.46
129 0.37
130 0.42
131 0.41
132 0.35
133 0.33
134 0.29
135 0.23
136 0.16
137 0.14
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.05
148 0.06
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.13
153 0.15
154 0.16
155 0.17
156 0.2
157 0.18
158 0.2
159 0.21
160 0.21
161 0.2
162 0.18
163 0.18
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.09
168 0.09
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.12
201 0.16
202 0.16
203 0.2
204 0.24
205 0.29
206 0.28
207 0.32
208 0.34
209 0.34
210 0.37
211 0.34
212 0.32
213 0.28
214 0.29
215 0.25
216 0.21
217 0.17
218 0.12
219 0.11
220 0.08
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.09
234 0.1
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.14
239 0.16
240 0.18
241 0.18
242 0.18
243 0.14
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.12
248 0.09
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.08
299 0.07
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.07
309 0.06
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.09
315 0.09
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.14
320 0.18
321 0.19
322 0.15
323 0.16
324 0.15
325 0.15
326 0.14
327 0.13
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.07
335 0.08
336 0.12
337 0.14
338 0.19
339 0.22
340 0.26
341 0.29
342 0.33
343 0.32
344 0.32
345 0.32
346 0.29
347 0.27
348 0.23
349 0.2
350 0.16
351 0.16
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.09
385 0.11
386 0.13
387 0.14
388 0.12
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.14
393 0.14
394 0.11
395 0.14
396 0.15
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.14
401 0.13
402 0.13
403 0.11
404 0.11
405 0.1
406 0.11
407 0.11
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.08
422 0.08
423 0.1
424 0.12
425 0.12
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.13
430 0.13
431 0.12
432 0.11
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.14
437 0.17
438 0.18
439 0.18
440 0.23
441 0.25
442 0.26
443 0.26
444 0.27
445 0.31
446 0.33
447 0.34
448 0.29
449 0.29
450 0.29
451 0.28
452 0.25
453 0.21
454 0.23
455 0.2
456 0.21
457 0.2
458 0.17
459 0.17
460 0.17
461 0.15
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.11
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.12
473 0.12
474 0.13
475 0.14
476 0.15
477 0.15
478 0.14
479 0.15
480 0.17
481 0.23
482 0.23
483 0.28
484 0.27
485 0.32
486 0.32
487 0.36
488 0.35
489 0.29
490 0.28
491 0.27
492 0.32
493 0.33
494 0.37
495 0.36
496 0.42
497 0.43
498 0.44
499 0.4
500 0.37
501 0.3
502 0.25
503 0.23
504 0.19
505 0.19
506 0.18
507 0.2
508 0.17
509 0.19
510 0.18
511 0.16
512 0.12
513 0.1
514 0.09
515 0.06
516 0.06
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.05
523 0.07
524 0.11
525 0.12
526 0.14
527 0.17
528 0.2
529 0.24
530 0.24
531 0.25
532 0.32
533 0.38
534 0.4
535 0.43
536 0.44
537 0.48
538 0.56
539 0.62
540 0.61
541 0.63
542 0.68
543 0.71
544 0.76
545 0.75
546 0.71
547 0.66
548 0.59
549 0.55
550 0.48
551 0.43
552 0.37
553 0.3
554 0.26
555 0.24
556 0.21
557 0.17
558 0.16
559 0.14
560 0.14
561 0.15
562 0.16
563 0.16
564 0.17
565 0.16
566 0.17
567 0.17
568 0.21
569 0.21
570 0.2
571 0.18
572 0.18
573 0.18