Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2MEF3

Protein Details
Accession A0A1Y2MEF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-53IESIAGEQRPPKRQRKTKEAIKKELEHEFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-45PPKRQRKTKEAI
531-596KVKAPPAAKDTPTGRGGGGRGGPPARGGQNQRGRGQQGGGRGGAGGRGAGPPAARGRGNIARTGRG
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 11.5, nucl 6.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MDLLSGELEKLRLGHGAAHGDGGCIESIAGEQRPPKRQRKTKEAIKKELEHEFLTPSRSFNTQWLNKLQQRWETPTNYRGLFQIAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSLLRKPANRAEFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAAIEDEAITRQEGAGAKKARGLDRVINFSAEGGLLEIPPGFTRGLDFKQKPATDGKTAKEVEDTLGEAAVPTKDIDADEEEAEDAAEVSGGEVADAEGQTPGEEEIDALLPVEFPALAPHTQLAMANRKGGREWAHMVDVNRDITNFKELVPEMAREYPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAISLAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQTFDDVGILTGDVQIRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTHEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPIPLEHYLWAGKGMHKIVSADKKFIDNGWKDANDALSGKDKVKAPPAAKDTPTGRGGGGRGGPPARGGQNQRGRGQQGGGRGGAGGRGAGPPAARGRGNIARTGRGGGRTTAAQDRNIWVHLIQHLRQKELLPACIFVFSKKRCEENADALSNIDYCTAAEKSAIHMTIEKSLARLSPEDRDLPQIKKLRELLSRGIAVHHGGMLPIVKEVVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGREFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGTVIICAPGSDEAPPAARLRQMMLGEPTKLRSQFRLTYNMMLNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKKVKLSEADLDKVKREPCKICDIDLEACHQACEDYKRLTNETHLSLLGNPLGRRVLSKNRLIVYKKDNMRTVGMLLQDGPSKGHEPTVKVLEIAQNLERKPDDLLPYVAELARLFRNLPTNPKDMILKTAYIPLNDVECFTKTTIDIPETVQNLTKKKDLLKLAQNQFVPLCTSWNYEDWDEYDYSRIKNLQFRETQDARRKRGQDAVHKECLQCPHFLKHLSMEHDQWVIKENILAIRQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLRELGFIDEGSRVELKGKVACEIHSADELVLTELVLENVLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTDTEPTLTASLDRGIAKIVEISERVNKVQTEYQVILSADDSNDFVSKPRFGMVEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPTLFQKMSTCQELIKRDICNCASLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.21
4 0.21
5 0.23
6 0.22
7 0.2
8 0.2
9 0.17
10 0.13
11 0.09
12 0.08
13 0.06
14 0.07
15 0.1
16 0.11
17 0.13
18 0.2
19 0.28
20 0.39
21 0.48
22 0.58
23 0.65
24 0.74
25 0.81
26 0.85
27 0.88
28 0.89
29 0.91
30 0.91
31 0.9
32 0.89
33 0.86
34 0.8
35 0.77
36 0.7
37 0.61
38 0.52
39 0.47
40 0.4
41 0.38
42 0.33
43 0.27
44 0.26
45 0.27
46 0.27
47 0.28
48 0.37
49 0.38
50 0.44
51 0.5
52 0.57
53 0.6
54 0.66
55 0.65
56 0.63
57 0.64
58 0.65
59 0.65
60 0.63
61 0.63
62 0.62
63 0.61
64 0.54
65 0.48
66 0.41
67 0.38
68 0.33
69 0.28
70 0.31
71 0.29
72 0.31
73 0.33
74 0.33
75 0.32
76 0.35
77 0.35
78 0.33
79 0.35
80 0.36
81 0.37
82 0.38
83 0.39
84 0.39
85 0.39
86 0.35
87 0.34
88 0.3
89 0.29
90 0.31
91 0.27
92 0.24
93 0.23
94 0.21
95 0.17
96 0.19
97 0.2
98 0.16
99 0.17
100 0.16
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.19
107 0.19
108 0.2
109 0.21
110 0.26
111 0.29
112 0.35
113 0.4
114 0.45
115 0.51
116 0.59
117 0.6
118 0.59
119 0.59
120 0.58
121 0.54
122 0.5
123 0.46
124 0.37
125 0.32
126 0.27
127 0.24
128 0.18
129 0.14
130 0.14
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.04
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.1
155 0.13
156 0.16
157 0.24
158 0.26
159 0.27
160 0.3
161 0.35
162 0.34
163 0.34
164 0.36
165 0.36
166 0.38
167 0.45
168 0.42
169 0.38
170 0.35
171 0.32
172 0.27
173 0.19
174 0.13
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.1
186 0.14
187 0.19
188 0.29
189 0.3
190 0.34
191 0.43
192 0.43
193 0.43
194 0.46
195 0.46
196 0.45
197 0.49
198 0.46
199 0.46
200 0.46
201 0.44
202 0.39
203 0.34
204 0.27
205 0.23
206 0.22
207 0.13
208 0.13
209 0.12
210 0.09
211 0.1
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.1
227 0.07
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.06
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.13
266 0.15
267 0.21
268 0.22
269 0.28
270 0.28
271 0.29
272 0.29
273 0.32
274 0.32
275 0.29
276 0.32
277 0.29
278 0.31
279 0.33
280 0.34
281 0.33
282 0.31
283 0.28
284 0.24
285 0.21
286 0.18
287 0.17
288 0.2
289 0.16
290 0.14
291 0.16
292 0.16
293 0.2
294 0.21
295 0.21
296 0.2
297 0.25
298 0.25
299 0.21
300 0.22
301 0.19
302 0.18
303 0.17
304 0.16
305 0.14
306 0.16
307 0.18
308 0.16
309 0.16
310 0.15
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.17
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.15
319 0.14
320 0.1
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.13
350 0.15
351 0.2
352 0.21
353 0.23
354 0.23
355 0.26
356 0.26
357 0.3
358 0.38
359 0.38
360 0.47
361 0.47
362 0.52
363 0.53
364 0.55
365 0.61
366 0.52
367 0.46
368 0.43
369 0.44
370 0.37
371 0.33
372 0.32
373 0.2
374 0.19
375 0.17
376 0.1
377 0.07
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.07
399 0.08
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.1
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.09
415 0.07
416 0.06
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.07
423 0.09
424 0.09
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.07
452 0.07
453 0.08
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.1
458 0.13
459 0.13
460 0.19
461 0.24
462 0.28
463 0.31
464 0.36
465 0.4
466 0.39
467 0.44
468 0.4
469 0.41
470 0.46
471 0.52
472 0.51
473 0.51
474 0.49
475 0.45
476 0.46
477 0.4
478 0.33
479 0.31
480 0.35
481 0.33
482 0.33
483 0.34
484 0.3
485 0.3
486 0.29
487 0.22
488 0.16
489 0.16
490 0.16
491 0.14
492 0.14
493 0.15
494 0.19
495 0.28
496 0.27
497 0.26
498 0.26
499 0.26
500 0.26
501 0.26
502 0.29
503 0.21
504 0.23
505 0.26
506 0.25
507 0.24
508 0.24
509 0.23
510 0.16
511 0.15
512 0.13
513 0.13
514 0.14
515 0.15
516 0.18
517 0.2
518 0.2
519 0.26
520 0.3
521 0.27
522 0.33
523 0.38
524 0.39
525 0.37
526 0.4
527 0.36
528 0.34
529 0.34
530 0.28
531 0.22
532 0.19
533 0.19
534 0.16
535 0.16
536 0.12
537 0.14
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.14
542 0.14
543 0.17
544 0.19
545 0.26
546 0.34
547 0.38
548 0.4
549 0.41
550 0.4
551 0.37
552 0.35
553 0.28
554 0.24
555 0.22
556 0.19
557 0.16
558 0.15
559 0.14
560 0.12
561 0.1
562 0.06
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.08
570 0.1
571 0.09
572 0.09
573 0.14
574 0.19
575 0.2
576 0.23
577 0.23
578 0.23
579 0.23
580 0.25
581 0.21
582 0.18
583 0.18
584 0.14
585 0.14
586 0.13
587 0.15
588 0.19
589 0.19
590 0.18
591 0.18
592 0.19
593 0.19
594 0.19
595 0.17
596 0.11
597 0.11
598 0.14
599 0.16
600 0.17
601 0.21
602 0.22
603 0.22
604 0.23
605 0.23
606 0.24
607 0.22
608 0.23
609 0.18
610 0.18
611 0.17
612 0.18
613 0.17
614 0.14
615 0.2
616 0.18
617 0.24
618 0.25
619 0.28
620 0.26
621 0.32
622 0.34
623 0.34
624 0.38
625 0.32
626 0.3
627 0.27
628 0.27
629 0.21
630 0.17
631 0.1
632 0.05
633 0.04
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.08
640 0.1
641 0.11
642 0.09
643 0.11
644 0.11
645 0.14
646 0.15
647 0.12
648 0.11
649 0.11
650 0.12
651 0.11
652 0.12
653 0.1
654 0.12
655 0.15
656 0.16
657 0.16
658 0.21
659 0.23
660 0.23
661 0.29
662 0.32
663 0.3
664 0.33
665 0.36
666 0.35
667 0.35
668 0.37
669 0.33
670 0.3
671 0.31
672 0.26
673 0.24
674 0.19
675 0.16
676 0.13
677 0.1
678 0.06
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.06
693 0.06
694 0.07
695 0.06
696 0.08
697 0.07
698 0.07
699 0.06
700 0.06
701 0.08
702 0.08
703 0.09
704 0.08
705 0.08
706 0.07
707 0.08
708 0.07
709 0.06
710 0.07
711 0.07
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.07
716 0.07
717 0.07
718 0.08
719 0.1
720 0.12
721 0.18
722 0.19
723 0.23
724 0.24
725 0.25
726 0.3
727 0.34
728 0.37
729 0.39
730 0.4
731 0.37
732 0.41
733 0.4
734 0.35
735 0.3
736 0.25
737 0.18
738 0.15
739 0.15
740 0.09
741 0.1
742 0.09
743 0.08
744 0.09
745 0.11
746 0.11
747 0.12
748 0.12
749 0.12
750 0.12
751 0.12
752 0.11
753 0.09
754 0.1
755 0.08
756 0.07
757 0.07
758 0.06
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.04
763 0.05
764 0.06
765 0.06
766 0.06
767 0.07
768 0.09
769 0.09
770 0.09
771 0.1
772 0.1
773 0.11
774 0.15
775 0.14
776 0.15
777 0.18
778 0.18
779 0.19
780 0.19
781 0.2
782 0.19
783 0.21
784 0.2
785 0.2
786 0.24
787 0.29
788 0.32
789 0.37
790 0.36
791 0.38
792 0.38
793 0.36
794 0.32
795 0.25
796 0.22
797 0.15
798 0.13
799 0.09
800 0.07
801 0.06
802 0.05
803 0.06
804 0.06
805 0.07
806 0.09
807 0.11
808 0.13
809 0.14
810 0.14
811 0.15
812 0.16
813 0.18
814 0.17
815 0.2
816 0.2
817 0.2
818 0.21
819 0.2
820 0.19
821 0.17
822 0.17
823 0.15
824 0.17
825 0.18
826 0.2
827 0.21
828 0.22
829 0.25
830 0.27
831 0.25
832 0.22
833 0.26
834 0.26
835 0.29
836 0.33
837 0.3
838 0.28
839 0.31
840 0.33
841 0.31
842 0.33
843 0.34
844 0.34
845 0.43
846 0.42
847 0.4
848 0.39
849 0.39
850 0.36
851 0.32
852 0.31
853 0.23
854 0.22
855 0.2
856 0.17
857 0.14
858 0.12
859 0.16
860 0.16
861 0.17
862 0.21
863 0.24
864 0.26
865 0.27
866 0.29
867 0.29
868 0.28
869 0.26
870 0.23
871 0.21
872 0.19
873 0.19
874 0.16
875 0.15
876 0.13
877 0.13
878 0.13
879 0.13
880 0.15
881 0.18
882 0.26
883 0.3
884 0.35
885 0.39
886 0.41
887 0.48
888 0.48
889 0.5
890 0.46
891 0.49
892 0.5
893 0.5
894 0.51
895 0.46
896 0.46
897 0.4
898 0.35
899 0.29
900 0.24
901 0.19
902 0.16
903 0.15
904 0.14
905 0.14
906 0.12
907 0.11
908 0.13
909 0.12
910 0.17
911 0.18
912 0.19
913 0.23
914 0.26
915 0.25
916 0.23
917 0.24
918 0.23
919 0.22
920 0.22
921 0.21
922 0.22
923 0.21
924 0.24
925 0.23
926 0.2
927 0.21
928 0.23
929 0.23
930 0.21
931 0.22
932 0.2
933 0.21
934 0.22
935 0.19
936 0.15
937 0.12
938 0.12
939 0.12
940 0.12
941 0.12
942 0.13
943 0.19
944 0.21
945 0.29
946 0.31
947 0.34
948 0.34
949 0.35
950 0.36
951 0.3
952 0.34
953 0.27
954 0.24
955 0.21
956 0.27
957 0.27
958 0.23
959 0.24
960 0.19
961 0.2
962 0.19
963 0.19
964 0.13
965 0.13
966 0.15
967 0.14
968 0.15
969 0.12
970 0.15
971 0.17
972 0.16
973 0.16
974 0.17
975 0.21
976 0.21
977 0.22
978 0.24
979 0.25
980 0.28
981 0.3
982 0.31
983 0.29
984 0.32
985 0.39
986 0.4
987 0.44
988 0.49
989 0.56
990 0.59
991 0.62
992 0.57
993 0.52
994 0.46
995 0.39
996 0.33
997 0.23
998 0.2
999 0.15
1000 0.18
1001 0.18
1002 0.21
1003 0.23
1004 0.21
1005 0.22
1006 0.2
1007 0.21
1008 0.19
1009 0.17
1010 0.2
1011 0.19
1012 0.19
1013 0.2
1014 0.23
1015 0.23
1016 0.29
1017 0.32
1018 0.36
1019 0.38
1020 0.43
1021 0.49
1022 0.51
1023 0.57
1024 0.61
1025 0.66
1026 0.64
1027 0.68
1028 0.66
1029 0.61
1030 0.63
1031 0.62
1032 0.62
1033 0.64
1034 0.65
1035 0.65
1036 0.65
1037 0.62
1038 0.58
1039 0.57
1040 0.48
1041 0.44
1042 0.4
1043 0.37
1044 0.39
1045 0.4
1046 0.38
1047 0.37
1048 0.41
1049 0.41
1050 0.4
1051 0.37
1052 0.35
1053 0.36
1054 0.34
1055 0.28
1056 0.27
1057 0.22
1058 0.19
1059 0.18
1060 0.17
1061 0.18
1062 0.19
1063 0.19
1064 0.15
1065 0.15
1066 0.15
1067 0.16
1068 0.16
1069 0.14
1070 0.16
1071 0.16
1072 0.19
1073 0.17
1074 0.17
1075 0.17
1076 0.17
1077 0.16
1078 0.19
1079 0.23
1080 0.21
1081 0.23
1082 0.24
1083 0.25
1084 0.25
1085 0.26
1086 0.24
1087 0.2
1088 0.21
1089 0.2
1090 0.19
1091 0.17
1092 0.16
1093 0.14
1094 0.11
1095 0.11
1096 0.12
1097 0.11
1098 0.11
1099 0.13
1100 0.15
1101 0.17
1102 0.19
1103 0.2
1104 0.22
1105 0.22
1106 0.23
1107 0.25
1108 0.25
1109 0.24
1110 0.22
1111 0.22
1112 0.17
1113 0.17
1114 0.16
1115 0.13
1116 0.11
1117 0.09
1118 0.07
1119 0.07
1120 0.07
1121 0.06
1122 0.05
1123 0.04
1124 0.04
1125 0.05
1126 0.04
1127 0.04
1128 0.05
1129 0.06
1130 0.06
1131 0.06
1132 0.06
1133 0.06
1134 0.06
1135 0.06
1136 0.06
1137 0.04
1138 0.04
1139 0.05
1140 0.05
1141 0.05
1142 0.06
1143 0.05
1144 0.08
1145 0.09
1146 0.13
1147 0.16
1148 0.18
1149 0.19
1150 0.19
1151 0.22
1152 0.21
1153 0.21
1154 0.17
1155 0.15
1156 0.15
1157 0.17
1158 0.16
1159 0.14
1160 0.14
1161 0.13
1162 0.13
1163 0.14
1164 0.14
1165 0.13
1166 0.14
1167 0.17
1168 0.22
1169 0.25
1170 0.26
1171 0.27
1172 0.27
1173 0.29
1174 0.33
1175 0.33
1176 0.33
1177 0.32
1178 0.32
1179 0.33
1180 0.32
1181 0.28
1182 0.24
1183 0.22
1184 0.16
1185 0.15
1186 0.14
1187 0.11
1188 0.12
1189 0.11
1190 0.14
1191 0.16
1192 0.17
1193 0.17
1194 0.19
1195 0.18
1196 0.19
1197 0.25
1198 0.23
1199 0.24
1200 0.23
1201 0.26
1202 0.23
1203 0.23
1204 0.22
1205 0.16
1206 0.14
1207 0.1
1208 0.11
1209 0.17
1210 0.22
1211 0.23
1212 0.26
1213 0.26
1214 0.28
1215 0.28
1216 0.28
1217 0.21
1218 0.17
1219 0.16
1220 0.13
1221 0.14
1222 0.12
1223 0.11
1224 0.12
1225 0.1
1226 0.09
1227 0.1
1228 0.1
1229 0.11
1230 0.16
1231 0.17
1232 0.19
1233 0.24
1234 0.29
1235 0.35
1236 0.38
1237 0.38
1238 0.36
1239 0.39
1240 0.43
1241 0.44
1242 0.42
1243 0.37
1244 0.36
1245 0.38
1246 0.4
1247 0.36
1248 0.28
1249 0.26
1250 0.3
1251 0.28
1252 0.27
1253 0.25
1254 0.25
1255 0.3
1256 0.34
1257 0.32
1258 0.29
1259 0.36
1260 0.42
1261 0.45
1262 0.45
1263 0.44
1264 0.42
1265 0.5
1266 0.47
1267 0.43