Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2LXL4

Protein Details
Accession A0A1Y2LXL4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-37QHSATLRASRYRKKRKTSHHHDLSSAHydrophilic
270-289VCEKSKQARKRNAEETRRSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-26RKKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MQYFAPQLHPEQHSATLRASRYRKKRKTSHHHDLSSADSDSGQDERPPSPRPDAHSLPSFASPELAQLRVAGLLPEEEPRVPTSPFPHAPATLSKPYLGTAGIQKELAGPPSRLFTVDGTARRQPTSSHAESSNLRRTHLNVLSTLMHRCLLEADYDRAGRAWGMILRTQATHGNTVDLRNHGRWAIGAEILLHRKPQAAGNAQPAGVVQATSEDPTITNNDMFSEQGFELAREYYERLIVQHPTRKQNPTAVDQRSFYPAMFSLWVQEVCEKSKQARKRNAEETRRSRSRSMSMDSNNGDSTSDVHGKSTTSPQALEDAVQVEELARAMEIAERLDDLVKSPPFDKQASLLQLRGNVALWISDLIVGNTPATSVDEWYAYPISKAVPAAEQIANFSNCQRELLTAQSYLARVEENGGPRQYGALMKIEGRIKELRKQMERLEAGVEEEDTNVSMDDSW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.39
3 0.38
4 0.39
5 0.45
6 0.51
7 0.53
8 0.61
9 0.7
10 0.75
11 0.8
12 0.87
13 0.89
14 0.92
15 0.92
16 0.93
17 0.92
18 0.86
19 0.79
20 0.71
21 0.65
22 0.57
23 0.47
24 0.36
25 0.26
26 0.22
27 0.2
28 0.2
29 0.16
30 0.14
31 0.16
32 0.19
33 0.24
34 0.28
35 0.31
36 0.38
37 0.41
38 0.45
39 0.51
40 0.53
41 0.54
42 0.55
43 0.53
44 0.47
45 0.46
46 0.4
47 0.31
48 0.28
49 0.21
50 0.21
51 0.21
52 0.19
53 0.16
54 0.15
55 0.16
56 0.15
57 0.15
58 0.1
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.1
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.15
67 0.17
68 0.17
69 0.19
70 0.22
71 0.28
72 0.31
73 0.33
74 0.33
75 0.32
76 0.33
77 0.36
78 0.38
79 0.35
80 0.34
81 0.3
82 0.28
83 0.28
84 0.26
85 0.21
86 0.16
87 0.16
88 0.18
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.19
93 0.2
94 0.22
95 0.19
96 0.17
97 0.16
98 0.19
99 0.19
100 0.18
101 0.18
102 0.15
103 0.17
104 0.22
105 0.24
106 0.26
107 0.31
108 0.32
109 0.31
110 0.31
111 0.27
112 0.28
113 0.33
114 0.32
115 0.3
116 0.29
117 0.32
118 0.35
119 0.41
120 0.44
121 0.36
122 0.35
123 0.33
124 0.34
125 0.4
126 0.4
127 0.34
128 0.26
129 0.28
130 0.29
131 0.29
132 0.28
133 0.2
134 0.17
135 0.15
136 0.15
137 0.13
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.15
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.15
146 0.14
147 0.11
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.16
158 0.16
159 0.17
160 0.16
161 0.17
162 0.17
163 0.19
164 0.19
165 0.19
166 0.2
167 0.18
168 0.19
169 0.17
170 0.16
171 0.15
172 0.14
173 0.12
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.1
178 0.13
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.18
186 0.19
187 0.22
188 0.27
189 0.27
190 0.26
191 0.25
192 0.22
193 0.17
194 0.13
195 0.1
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.07
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.1
227 0.14
228 0.17
229 0.23
230 0.27
231 0.33
232 0.38
233 0.4
234 0.4
235 0.42
236 0.42
237 0.42
238 0.46
239 0.43
240 0.4
241 0.37
242 0.37
243 0.34
244 0.31
245 0.25
246 0.18
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.11
251 0.09
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.12
256 0.12
257 0.14
258 0.16
259 0.15
260 0.19
261 0.26
262 0.34
263 0.41
264 0.5
265 0.56
266 0.61
267 0.71
268 0.76
269 0.78
270 0.8
271 0.79
272 0.79
273 0.77
274 0.73
275 0.65
276 0.59
277 0.56
278 0.51
279 0.47
280 0.45
281 0.42
282 0.44
283 0.42
284 0.4
285 0.33
286 0.29
287 0.24
288 0.16
289 0.16
290 0.14
291 0.17
292 0.15
293 0.15
294 0.16
295 0.16
296 0.18
297 0.21
298 0.21
299 0.18
300 0.19
301 0.19
302 0.2
303 0.2
304 0.18
305 0.14
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.14
327 0.14
328 0.16
329 0.16
330 0.2
331 0.23
332 0.24
333 0.24
334 0.2
335 0.26
336 0.31
337 0.32
338 0.3
339 0.27
340 0.29
341 0.29
342 0.27
343 0.21
344 0.15
345 0.13
346 0.11
347 0.1
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.13
366 0.14
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.13
372 0.13
373 0.12
374 0.12
375 0.14
376 0.18
377 0.19
378 0.18
379 0.18
380 0.22
381 0.22
382 0.21
383 0.22
384 0.22
385 0.21
386 0.22
387 0.2
388 0.18
389 0.19
390 0.24
391 0.25
392 0.21
393 0.21
394 0.23
395 0.23
396 0.2
397 0.19
398 0.14
399 0.11
400 0.14
401 0.18
402 0.2
403 0.25
404 0.26
405 0.25
406 0.25
407 0.25
408 0.24
409 0.22
410 0.2
411 0.18
412 0.19
413 0.2
414 0.25
415 0.29
416 0.28
417 0.3
418 0.35
419 0.35
420 0.41
421 0.48
422 0.52
423 0.54
424 0.59
425 0.6
426 0.63
427 0.61
428 0.55
429 0.5
430 0.41
431 0.36
432 0.31
433 0.27
434 0.17
435 0.16
436 0.14
437 0.12
438 0.12
439 0.09