Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3B7M8

Protein Details
Accession G3B7M8    Localization Confidence Low Confidence Score 5.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-29RVARRVRTLEQLKQRQSRRTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 24, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023076  HMG_CoA_Rdtase_CS  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004420  F:hydroxymethylglutaryl-CoA reductase (NADPH) activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG cten:CANTEDRAFT_135592  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00318  HMG_COA_REDUCTASE_2  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MDNIRTAIVRVARRVRTLEQLKQRQSRRTDVGTVGGGTPTVPKSRNQMAGLKVTNELLTQAKPFLQDFEKAKFKEFLAPLEMSGLKLLGDKRPFDARKAVNMWQLKRSTSNLVMHQKFTDSQALLEQTLGLLKRLTPPQVLGPKTDAATLQILEEYEREISKFKFEVPRYFFGEVPKVDASMSSDQFEQYIYFLTHSQVLYRGSSKLNGVVNDILLYTHKLDNHEFKSKRSVTTYNHMIKWYGYNKNQSLFARSLLVAMEKDGIEPDIHTINNLLKMVRVTGRIRSVSEPLKLVNKYLRLCGHYKLQANLVTWTRVYQVLTNVYLKEMFLNRVSMEQVPIPREMVYSVMDDYMVGCSGVTELVQFVERELRMPEQVWQEDSKIFNKVNYMAAKCATSAGEIASGAAGRCHDSHTNEHVIRGLRQNQNLSEPDKINAILWVYKGDSPAVIRYVVDSLSRIEFDIDGMHKATNKLVYDFQQLSSYEKTGDVISSMKSHISSFDAVMAKLQYFKRRIEPKDWEIPVQLDGTNTFVVPEKYLRRRHMGVIKAINRSKLVAATSLGERLREREVVARQPRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.54
4 0.58
5 0.6
6 0.62
7 0.68
8 0.73
9 0.77
10 0.81
11 0.79
12 0.77
13 0.77
14 0.74
15 0.69
16 0.66
17 0.59
18 0.56
19 0.49
20 0.44
21 0.35
22 0.28
23 0.22
24 0.16
25 0.17
26 0.16
27 0.19
28 0.19
29 0.21
30 0.28
31 0.36
32 0.43
33 0.43
34 0.47
35 0.47
36 0.54
37 0.54
38 0.48
39 0.41
40 0.35
41 0.32
42 0.25
43 0.23
44 0.17
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.17
49 0.18
50 0.19
51 0.21
52 0.21
53 0.26
54 0.29
55 0.34
56 0.41
57 0.4
58 0.43
59 0.42
60 0.4
61 0.43
62 0.4
63 0.37
64 0.33
65 0.33
66 0.29
67 0.3
68 0.29
69 0.2
70 0.19
71 0.15
72 0.1
73 0.13
74 0.15
75 0.18
76 0.22
77 0.23
78 0.26
79 0.36
80 0.38
81 0.38
82 0.46
83 0.42
84 0.46
85 0.5
86 0.51
87 0.49
88 0.55
89 0.54
90 0.52
91 0.51
92 0.45
93 0.44
94 0.42
95 0.4
96 0.39
97 0.42
98 0.43
99 0.5
100 0.5
101 0.49
102 0.46
103 0.42
104 0.37
105 0.35
106 0.32
107 0.22
108 0.21
109 0.22
110 0.23
111 0.21
112 0.2
113 0.17
114 0.11
115 0.13
116 0.13
117 0.1
118 0.08
119 0.09
120 0.15
121 0.19
122 0.21
123 0.2
124 0.21
125 0.28
126 0.36
127 0.36
128 0.33
129 0.32
130 0.32
131 0.31
132 0.3
133 0.22
134 0.17
135 0.17
136 0.15
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.11
147 0.12
148 0.15
149 0.16
150 0.19
151 0.27
152 0.3
153 0.38
154 0.42
155 0.46
156 0.47
157 0.48
158 0.45
159 0.39
160 0.42
161 0.33
162 0.31
163 0.27
164 0.22
165 0.2
166 0.19
167 0.2
168 0.19
169 0.2
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.16
174 0.16
175 0.12
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.15
191 0.17
192 0.16
193 0.18
194 0.2
195 0.18
196 0.19
197 0.17
198 0.16
199 0.15
200 0.14
201 0.1
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.13
208 0.16
209 0.23
210 0.27
211 0.36
212 0.34
213 0.35
214 0.43
215 0.43
216 0.43
217 0.4
218 0.42
219 0.36
220 0.43
221 0.5
222 0.46
223 0.45
224 0.43
225 0.39
226 0.33
227 0.35
228 0.34
229 0.32
230 0.31
231 0.36
232 0.37
233 0.38
234 0.42
235 0.37
236 0.35
237 0.29
238 0.25
239 0.21
240 0.19
241 0.18
242 0.13
243 0.13
244 0.09
245 0.08
246 0.09
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.14
267 0.13
268 0.16
269 0.2
270 0.2
271 0.21
272 0.22
273 0.24
274 0.23
275 0.23
276 0.2
277 0.18
278 0.22
279 0.21
280 0.21
281 0.2
282 0.22
283 0.22
284 0.25
285 0.26
286 0.24
287 0.26
288 0.27
289 0.28
290 0.29
291 0.3
292 0.27
293 0.28
294 0.28
295 0.27
296 0.28
297 0.24
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.14
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.15
308 0.16
309 0.15
310 0.14
311 0.14
312 0.12
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.12
320 0.14
321 0.12
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.18
361 0.19
362 0.2
363 0.21
364 0.21
365 0.21
366 0.23
367 0.24
368 0.22
369 0.2
370 0.2
371 0.19
372 0.2
373 0.2
374 0.23
375 0.25
376 0.25
377 0.23
378 0.23
379 0.23
380 0.21
381 0.2
382 0.14
383 0.1
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.07
396 0.11
397 0.14
398 0.17
399 0.22
400 0.27
401 0.35
402 0.34
403 0.34
404 0.34
405 0.33
406 0.33
407 0.35
408 0.38
409 0.35
410 0.39
411 0.42
412 0.4
413 0.43
414 0.43
415 0.39
416 0.35
417 0.31
418 0.28
419 0.26
420 0.25
421 0.19
422 0.18
423 0.17
424 0.13
425 0.12
426 0.13
427 0.13
428 0.14
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.13
433 0.15
434 0.15
435 0.13
436 0.12
437 0.13
438 0.13
439 0.13
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.12
444 0.13
445 0.12
446 0.12
447 0.11
448 0.11
449 0.13
450 0.13
451 0.13
452 0.13
453 0.14
454 0.15
455 0.16
456 0.18
457 0.19
458 0.2
459 0.21
460 0.23
461 0.25
462 0.3
463 0.31
464 0.3
465 0.29
466 0.28
467 0.3
468 0.29
469 0.27
470 0.21
471 0.19
472 0.19
473 0.16
474 0.15
475 0.13
476 0.11
477 0.12
478 0.13
479 0.14
480 0.14
481 0.14
482 0.14
483 0.14
484 0.16
485 0.16
486 0.15
487 0.2
488 0.2
489 0.2
490 0.21
491 0.21
492 0.18
493 0.23
494 0.26
495 0.28
496 0.31
497 0.35
498 0.43
499 0.51
500 0.56
501 0.6
502 0.65
503 0.64
504 0.7
505 0.69
506 0.62
507 0.55
508 0.51
509 0.44
510 0.36
511 0.29
512 0.2
513 0.18
514 0.18
515 0.15
516 0.14
517 0.13
518 0.14
519 0.14
520 0.15
521 0.22
522 0.28
523 0.37
524 0.46
525 0.5
526 0.55
527 0.58
528 0.64
529 0.66
530 0.64
531 0.64
532 0.66
533 0.67
534 0.69
535 0.69
536 0.63
537 0.56
538 0.51
539 0.43
540 0.36
541 0.32
542 0.25
543 0.23
544 0.23
545 0.23
546 0.27
547 0.25
548 0.25
549 0.24
550 0.25
551 0.28
552 0.26
553 0.26
554 0.28
555 0.35
556 0.42