FuNGI

A0A1Y2MDH1

Protein Details

Accession

A0A1Y2MDH1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
43-68	FLLPAGKQDKKKHQQFVRRWQKRLLG	Hydrophilic
517-538	VEMHRSRPTKRDERVKIGQEKV	Basic
544-564	WERGLTTKRGRAKGKRVDVPI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
552-558	RGRAKGK

Subcellular Location(s)

mito 24.5, cyto_mito 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR018305 Ribosomal_L50_mt
Gene Ontology	GO:0005739 C:mitochondrion GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0005840 C:ribosome
Pfam	View protein in Pfam PF10501 Ribosomal_L50

Amino Acid Sequences

MRRIPRPSRAIDVSSAFQCSVRQRAASPCTHLRAFSSTPSAAFLLPAGKQDKKKHQQFVRRWQKRLLGESEPIGAHVDPYDPTSPVRIAPEDQGEEIEVLEEDAVAFPQYREAQHGYRLKHVGGEEWLAKNEEANMAKEFEKLTLRTYTPLSLNMADQIEEWTGTPYTLRDENLLMAQTVHQVTERPYTKFNFGMNKRTTDPNKLRKAFAQAVAEIYTLKQAGMDLDLSKLPNRGVYRCPSWAKNIKLYNTPNGELALAFPEYRSAEQFVKIVQDTPEWESYEPETLEEDELLVEDVVAPVVPDAAAALPVMDPATPEYKKAAVVKQDPEKVFDFMSNRPVPRAKPAETPVETSAGAVVEEVVQVEEVVPVEAPSPATPSRHVELETRAQTLSDAVTALRQEAHLNAANTASQVNEIMWRHVPLTDNDVKFALFKRLLQLTGTRIADADLTSSRTLGDIYGHLRDAAKPNPPSLFAKLHTEGQILREKAKTHVTMSDAPAQQKKKADLGDLLVLGNVEMHRSRPTKRDERVKIGQEKVVEYALWERGLTTKRGRAKGKRVDVPIGMPLSEKSAKLLAGKAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.4
3	0.31
4	0.27
5	0.27
6	0.28
7	0.31
8	0.3
9	0.3
10	0.31
11	0.4
12	0.46
13	0.47
14	0.49
15	0.5
16	0.52
17	0.52
18	0.49
19	0.43
20	0.43
21	0.4
22	0.37
23	0.36
24	0.31
25	0.3
26	0.31
27	0.29
28	0.23
29	0.21
30	0.17
31	0.14
32	0.14
33	0.19
34	0.22
35	0.27
36	0.35
37	0.44
38	0.54
39	0.62
40	0.7
41	0.75
42	0.8
43	0.84
44	0.87
45	0.89
46	0.9
47	0.88
48	0.83
49	0.81
50	0.79
51	0.76
52	0.72
53	0.67
54	0.61
55	0.55
56	0.52
57	0.48
58	0.4
59	0.33
60	0.28
61	0.21
62	0.16
63	0.13
64	0.13
65	0.1
66	0.14
67	0.15
68	0.14
69	0.15
70	0.17
71	0.18
72	0.18
73	0.22
74	0.2
75	0.21
76	0.24
77	0.29
78	0.27
79	0.27
80	0.25
81	0.22
82	0.2
83	0.17
84	0.14
85	0.08
86	0.06
87	0.06
88	0.05
89	0.04
90	0.04
91	0.05
92	0.05
93	0.05
94	0.05
95	0.1
96	0.13
97	0.13
98	0.17
99	0.22
100	0.23
101	0.32
102	0.38
103	0.35
104	0.4
105	0.42
106	0.38
107	0.37
108	0.35
109	0.29
110	0.25
111	0.26
112	0.23
113	0.22
114	0.24
115	0.22
116	0.21
117	0.19
118	0.18
119	0.19
120	0.17
121	0.18
122	0.18
123	0.19
124	0.19
125	0.2
126	0.2
127	0.17
128	0.19
129	0.18
130	0.2
131	0.22
132	0.23
133	0.24
134	0.25
135	0.25
136	0.23
137	0.24
138	0.23
139	0.19
140	0.19
141	0.2
142	0.18
143	0.15
144	0.14
145	0.14
146	0.11
147	0.11
148	0.1
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.08
154	0.11
155	0.13
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.14
160	0.15
161	0.15
162	0.12
163	0.1
164	0.1
165	0.12
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.1
170	0.12
171	0.2
172	0.23
173	0.22
174	0.25
175	0.28
176	0.3
177	0.32
178	0.34
179	0.35
180	0.36
181	0.43
182	0.43
183	0.44
184	0.44
185	0.49
186	0.48
187	0.49
188	0.55
189	0.55
190	0.62
191	0.61
192	0.6
193	0.55
194	0.6
195	0.54
196	0.49
197	0.42
198	0.32
199	0.31
200	0.3
201	0.27
202	0.19
203	0.15
204	0.11
205	0.08
206	0.07
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.07
212	0.06
213	0.07
214	0.08
215	0.09
216	0.1
217	0.11
218	0.1
219	0.13
220	0.15
221	0.17
222	0.2
223	0.24
224	0.27
225	0.32
226	0.35
227	0.32
228	0.38
229	0.44
230	0.43
231	0.46
232	0.47
233	0.43
234	0.47
235	0.48
236	0.47
237	0.42
238	0.4
239	0.32
240	0.28
241	0.26
242	0.18
243	0.16
244	0.11
245	0.08
246	0.07
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.09
251	0.09
252	0.1
253	0.11
254	0.12
255	0.13
256	0.11
257	0.13
258	0.12
259	0.13
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.14
264	0.16
265	0.14
266	0.14
267	0.14
268	0.14
269	0.16
270	0.14
271	0.11
272	0.1
273	0.1
274	0.1
275	0.08
276	0.07
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.04
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.02
287	0.02
288	0.02
289	0.02
290	0.02
291	0.02
292	0.02
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.05
302	0.1
303	0.1
304	0.11
305	0.12
306	0.13
307	0.15
308	0.18
309	0.2
310	0.22
311	0.26
312	0.31
313	0.36
314	0.42
315	0.4
316	0.4
317	0.38
318	0.33
319	0.29
320	0.26
321	0.22
322	0.17
323	0.25
324	0.25
325	0.24
326	0.25
327	0.28
328	0.26
329	0.32
330	0.36
331	0.31
332	0.34
333	0.36
334	0.42
335	0.41
336	0.43
337	0.36
338	0.32
339	0.29
340	0.23
341	0.2
342	0.12
343	0.11
344	0.07
345	0.06
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.09
363	0.1
364	0.12
365	0.14
366	0.17
367	0.19
368	0.2
369	0.21
370	0.2
371	0.23
372	0.3
373	0.3
374	0.27
375	0.25
376	0.23
377	0.22
378	0.2
379	0.16
380	0.09
381	0.07
382	0.05
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.08
389	0.08
390	0.12
391	0.14
392	0.14
393	0.14
394	0.14
395	0.14
396	0.14
397	0.13
398	0.1
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.11
403	0.11
404	0.14
405	0.15
406	0.15
407	0.16
408	0.17
409	0.19
410	0.15
411	0.22
412	0.27
413	0.26
414	0.27
415	0.26
416	0.25
417	0.24
418	0.25
419	0.24
420	0.17
421	0.18
422	0.22
423	0.24
424	0.25
425	0.25
426	0.26
427	0.23
428	0.28
429	0.28
430	0.23
431	0.2
432	0.2
433	0.19
434	0.16
435	0.15
436	0.09
437	0.12
438	0.12
439	0.12
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.09
444	0.09
445	0.09
446	0.12
447	0.14
448	0.14
449	0.15
450	0.16
451	0.19
452	0.22
453	0.24
454	0.29
455	0.29
456	0.31
457	0.32
458	0.35
459	0.36
460	0.36
461	0.36
462	0.3
463	0.36
464	0.36
465	0.38
466	0.36
467	0.34
468	0.3
469	0.3
470	0.36
471	0.29
472	0.3
473	0.29
474	0.29
475	0.31
476	0.38
477	0.36
478	0.3
479	0.33
480	0.35
481	0.37
482	0.4
483	0.44
484	0.4
485	0.42
486	0.47
487	0.46
488	0.46
489	0.46
490	0.46
491	0.44
492	0.43
493	0.42
494	0.38
495	0.39
496	0.38
497	0.33
498	0.3
499	0.23
500	0.21
501	0.17
502	0.15
503	0.1
504	0.09
505	0.09
506	0.11
507	0.18
508	0.22
509	0.26
510	0.33
511	0.43
512	0.5
513	0.59
514	0.68
515	0.7
516	0.75
517	0.81
518	0.82
519	0.81
520	0.76
521	0.7
522	0.62
523	0.55
524	0.48
525	0.4
526	0.3
527	0.23
528	0.23
529	0.22
530	0.2
531	0.18
532	0.16
533	0.21
534	0.25
535	0.28
536	0.31
537	0.36
538	0.44
539	0.53
540	0.62
541	0.66
542	0.74
543	0.79
544	0.82
545	0.83
546	0.8
547	0.78
548	0.71
549	0.64
550	0.59
551	0.5
552	0.4
553	0.33
554	0.27
555	0.27
556	0.27
557	0.24
558	0.21
559	0.22
560	0.23
561	0.25

A0A1Y2MDH1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer