Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2M4D8

Protein Details
Accession A0A1Y2M4D8    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
389-411GFFAKNPRTRRRNQAESRRHSDRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 9, cyto 7.5, cyto_nucl 6, nucl 3.5, mito 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
cd02672  Peptidase_C19P  
Amino Acid Sequences MEADWDELAFVQLPPPGPHHPPTPVATFAFDTSQELLWAGNNLGRITSFYGATLERYTSYRAHAATEGPVRQFLFTEKGVLSISKQSVHYAHRRGITQWHLTSIEFKDLKCMNFTSKGTREILVAGCQDSMFKIDVEKGVITETLTAEAHYTIMKRAGQYICAATKNGGIHILDSNSLSNIKSFDGHTGSISDMDAKGDFLATCGWSPRQQNAYMLDPFTHVFSLKTLKQLPPIPFHTGAAFVRMHPRMSTTAIIASHNGQMQVIDLMNPDAANLRQINLYDSYLHGFEMAPSGEAFALSDSNGQVHLWGSPSKVHFPEYSNPTEFADHPIPPPVMDWSLDTPLNTVGMPYYKENLLSGWPSHLVYEVGAPSPKIDATIMANMTRAEMGFFAKNPRTRRRNQAESRRHSDRTTDSLSAPKFLSEQSRAIQSSNNDTDGKAAETMESLTDLHLEDVTRKEVPSMYGNVEIKYSKFGVDDFDFAYYNQTPYSGLETHIANSYANPLLQLFRFTPLIRNIALQHTASACLFESCILCELGFLIDMLEKAAGLNCQASNFLKTFSSLSNAASLNLLEEFAPNVALTSMVQNLNRFLLDKMSDEVRQMLPPNSGPSPIDQILETQARASMRCAQCANETARGGKNFVNELVYPAKHVMKNTRIPRPTFSQILKASVERQDQTRGWCTKCNRYQQMVQRKTIQTIPGVLMLNAAIQSHEAKLLWSIPNWLPQEIGIIVDQGQFYCFEGQDLKLHLQRGVFDIMVFELVGVVADINSGDHQKPHLVATINTAPSSREATTDDKWHLFNDFLVRPIPKEEALRFEPGWKLPSVLTYQVKAARNKIDDTWKDNLDTSILFRWWSSNPTPPESKFKLLEAQSEAPKPGYAVAIDAEFIRLQAEEIEMKADGTRQTIRPDRKGLARVSVCRGSGEMAGLPFIDDYIAVSEPVVDHLTAWSGISPGDLNRETSPHALVSLKHAYKKLWLLLNLGCVFVGHSLANDFRTINMHVPKNQVVDTSNLFFLPEYKRKLNLKFLAWCVLKESIQQDTHDSIEDATTALKLWRKYEEFVDAGVLEQMLNDIYATGSQYRFKAPGSEGAILGQGGIGLVSGIGTGRNTPEPMTTPKKGGMFGTIGFRSPMR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.21
3 0.26
4 0.3
5 0.34
6 0.37
7 0.39
8 0.42
9 0.44
10 0.44
11 0.42
12 0.38
13 0.37
14 0.34
15 0.31
16 0.28
17 0.24
18 0.22
19 0.21
20 0.19
21 0.17
22 0.15
23 0.14
24 0.13
25 0.14
26 0.12
27 0.11
28 0.13
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.16
34 0.17
35 0.16
36 0.14
37 0.16
38 0.17
39 0.19
40 0.19
41 0.16
42 0.16
43 0.18
44 0.21
45 0.2
46 0.24
47 0.26
48 0.25
49 0.27
50 0.27
51 0.27
52 0.3
53 0.35
54 0.35
55 0.31
56 0.33
57 0.31
58 0.3
59 0.29
60 0.25
61 0.24
62 0.2
63 0.23
64 0.2
65 0.21
66 0.21
67 0.21
68 0.2
69 0.23
70 0.25
71 0.24
72 0.25
73 0.27
74 0.31
75 0.37
76 0.44
77 0.42
78 0.46
79 0.47
80 0.48
81 0.47
82 0.5
83 0.51
84 0.5
85 0.45
86 0.44
87 0.41
88 0.39
89 0.43
90 0.36
91 0.39
92 0.32
93 0.3
94 0.34
95 0.36
96 0.37
97 0.35
98 0.35
99 0.31
100 0.37
101 0.4
102 0.4
103 0.41
104 0.45
105 0.44
106 0.42
107 0.37
108 0.33
109 0.32
110 0.27
111 0.24
112 0.2
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.14
117 0.14
118 0.11
119 0.1
120 0.11
121 0.13
122 0.15
123 0.17
124 0.16
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.15
141 0.17
142 0.17
143 0.23
144 0.24
145 0.24
146 0.26
147 0.29
148 0.29
149 0.29
150 0.29
151 0.23
152 0.25
153 0.24
154 0.22
155 0.2
156 0.16
157 0.17
158 0.18
159 0.18
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.13
164 0.14
165 0.13
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.16
172 0.18
173 0.19
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.17
178 0.16
179 0.13
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.15
193 0.19
194 0.22
195 0.28
196 0.31
197 0.32
198 0.35
199 0.36
200 0.39
201 0.37
202 0.35
203 0.29
204 0.25
205 0.24
206 0.21
207 0.18
208 0.13
209 0.11
210 0.12
211 0.18
212 0.18
213 0.24
214 0.27
215 0.28
216 0.35
217 0.41
218 0.43
219 0.44
220 0.46
221 0.47
222 0.43
223 0.42
224 0.36
225 0.33
226 0.29
227 0.26
228 0.22
229 0.17
230 0.23
231 0.24
232 0.24
233 0.21
234 0.23
235 0.22
236 0.24
237 0.25
238 0.18
239 0.2
240 0.2
241 0.2
242 0.19
243 0.18
244 0.18
245 0.18
246 0.16
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.08
259 0.07
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.15
266 0.15
267 0.16
268 0.13
269 0.14
270 0.15
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.05
285 0.06
286 0.05
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.09
297 0.1
298 0.14
299 0.16
300 0.2
301 0.21
302 0.23
303 0.23
304 0.26
305 0.33
306 0.35
307 0.38
308 0.36
309 0.36
310 0.34
311 0.34
312 0.3
313 0.28
314 0.26
315 0.22
316 0.21
317 0.23
318 0.22
319 0.2
320 0.2
321 0.17
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.14
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.11
333 0.09
334 0.07
335 0.08
336 0.1
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.13
342 0.12
343 0.13
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.11
352 0.09
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.09
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.1
373 0.06
374 0.06
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.14
379 0.19
380 0.25
381 0.31
382 0.41
383 0.46
384 0.51
385 0.61
386 0.65
387 0.71
388 0.76
389 0.8
390 0.81
391 0.82
392 0.83
393 0.79
394 0.72
395 0.62
396 0.57
397 0.5
398 0.45
399 0.42
400 0.36
401 0.31
402 0.34
403 0.33
404 0.31
405 0.26
406 0.21
407 0.16
408 0.16
409 0.2
410 0.17
411 0.19
412 0.18
413 0.22
414 0.23
415 0.23
416 0.24
417 0.21
418 0.25
419 0.24
420 0.26
421 0.22
422 0.21
423 0.22
424 0.2
425 0.19
426 0.12
427 0.1
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.09
442 0.11
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.11
447 0.13
448 0.15
449 0.15
450 0.15
451 0.2
452 0.21
453 0.2
454 0.2
455 0.19
456 0.16
457 0.16
458 0.15
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.12
463 0.13
464 0.14
465 0.12
466 0.13
467 0.13
468 0.12
469 0.15
470 0.12
471 0.11
472 0.1
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.13
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.13
481 0.13
482 0.14
483 0.14
484 0.1
485 0.09
486 0.11
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.07
491 0.08
492 0.08
493 0.11
494 0.09
495 0.1
496 0.12
497 0.12
498 0.16
499 0.17
500 0.19
501 0.17
502 0.18
503 0.17
504 0.18
505 0.2
506 0.15
507 0.14
508 0.12
509 0.12
510 0.11
511 0.1
512 0.08
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.07
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.04
526 0.03
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.03
532 0.03
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.07
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.09
545 0.09
546 0.11
547 0.1
548 0.12
549 0.11
550 0.11
551 0.13
552 0.13
553 0.12
554 0.11
555 0.11
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.03
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.07
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.08
579 0.09
580 0.09
581 0.1
582 0.11
583 0.12
584 0.13
585 0.12
586 0.14
587 0.13
588 0.13
589 0.14
590 0.14
591 0.13
592 0.13
593 0.16
594 0.14
595 0.14
596 0.13
597 0.13
598 0.16
599 0.15
600 0.15
601 0.12
602 0.12
603 0.15
604 0.15
605 0.14
606 0.09
607 0.11
608 0.1
609 0.11
610 0.12
611 0.18
612 0.17
613 0.2
614 0.21
615 0.2
616 0.22
617 0.26
618 0.27
619 0.22
620 0.22
621 0.22
622 0.24
623 0.24
624 0.24
625 0.21
626 0.2
627 0.17
628 0.17
629 0.16
630 0.13
631 0.15
632 0.17
633 0.15
634 0.14
635 0.15
636 0.18
637 0.17
638 0.19
639 0.23
640 0.26
641 0.35
642 0.4
643 0.47
644 0.48
645 0.48
646 0.51
647 0.51
648 0.48
649 0.45
650 0.4
651 0.39
652 0.36
653 0.37
654 0.34
655 0.29
656 0.27
657 0.27
658 0.29
659 0.22
660 0.23
661 0.25
662 0.25
663 0.28
664 0.33
665 0.32
666 0.31
667 0.37
668 0.4
669 0.45
670 0.5
671 0.56
672 0.55
673 0.55
674 0.6
675 0.63
676 0.7
677 0.66
678 0.62
679 0.6
680 0.55
681 0.52
682 0.48
683 0.4
684 0.3
685 0.26
686 0.24
687 0.2
688 0.19
689 0.16
690 0.14
691 0.12
692 0.11
693 0.09
694 0.08
695 0.04
696 0.05
697 0.06
698 0.06
699 0.07
700 0.06
701 0.06
702 0.07
703 0.11
704 0.11
705 0.1
706 0.15
707 0.15
708 0.22
709 0.23
710 0.22
711 0.19
712 0.18
713 0.2
714 0.15
715 0.15
716 0.08
717 0.07
718 0.07
719 0.09
720 0.09
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.08
725 0.09
726 0.08
727 0.08
728 0.09
729 0.1
730 0.12
731 0.14
732 0.16
733 0.18
734 0.19
735 0.2
736 0.19
737 0.19
738 0.19
739 0.18
740 0.15
741 0.12
742 0.12
743 0.1
744 0.1
745 0.08
746 0.06
747 0.04
748 0.03
749 0.03
750 0.03
751 0.03
752 0.02
753 0.02
754 0.02
755 0.03
756 0.04
757 0.06
758 0.07
759 0.08
760 0.09
761 0.1
762 0.11
763 0.12
764 0.16
765 0.15
766 0.15
767 0.21
768 0.26
769 0.25
770 0.24
771 0.23
772 0.2
773 0.2
774 0.23
775 0.17
776 0.13
777 0.15
778 0.2
779 0.22
780 0.27
781 0.28
782 0.27
783 0.27
784 0.26
785 0.24
786 0.2
787 0.19
788 0.2
789 0.18
790 0.17
791 0.19
792 0.19
793 0.19
794 0.21
795 0.21
796 0.17
797 0.21
798 0.21
799 0.25
800 0.27
801 0.31
802 0.28
803 0.29
804 0.3
805 0.28
806 0.29
807 0.22
808 0.21
809 0.17
810 0.19
811 0.19
812 0.22
813 0.23
814 0.21
815 0.24
816 0.3
817 0.35
818 0.35
819 0.38
820 0.38
821 0.38
822 0.39
823 0.4
824 0.43
825 0.41
826 0.44
827 0.44
828 0.39
829 0.38
830 0.36
831 0.32
832 0.24
833 0.21
834 0.18
835 0.16
836 0.15
837 0.14
838 0.13
839 0.15
840 0.16
841 0.2
842 0.21
843 0.26
844 0.29
845 0.34
846 0.4
847 0.4
848 0.47
849 0.47
850 0.49
851 0.42
852 0.41
853 0.43
854 0.39
855 0.41
856 0.38
857 0.38
858 0.37
859 0.37
860 0.36
861 0.29
862 0.28
863 0.23
864 0.18
865 0.14
866 0.1
867 0.09
868 0.09
869 0.09
870 0.09
871 0.09
872 0.09
873 0.08
874 0.07
875 0.07
876 0.06
877 0.06
878 0.06
879 0.08
880 0.08
881 0.08
882 0.09
883 0.09
884 0.09
885 0.09
886 0.11
887 0.1
888 0.13
889 0.17
890 0.18
891 0.26
892 0.35
893 0.42
894 0.46
895 0.5
896 0.51
897 0.54
898 0.58
899 0.53
900 0.54
901 0.52
902 0.5
903 0.51
904 0.5
905 0.44
906 0.38
907 0.36
908 0.28
909 0.23
910 0.2
911 0.15
912 0.11
913 0.11
914 0.1
915 0.1
916 0.08
917 0.07
918 0.06
919 0.04
920 0.05
921 0.07
922 0.07
923 0.07
924 0.07
925 0.07
926 0.08
927 0.1
928 0.1
929 0.08
930 0.07
931 0.08
932 0.1
933 0.09
934 0.09
935 0.08
936 0.07
937 0.07
938 0.08
939 0.08
940 0.07
941 0.14
942 0.14
943 0.17
944 0.18
945 0.2
946 0.22
947 0.23
948 0.23
949 0.17
950 0.18
951 0.17
952 0.17
953 0.22
954 0.29
955 0.3
956 0.33
957 0.34
958 0.34
959 0.38
960 0.43
961 0.42
962 0.38
963 0.37
964 0.37
965 0.37
966 0.43
967 0.38
968 0.32
969 0.26
970 0.2
971 0.19
972 0.15
973 0.15
974 0.07
975 0.07
976 0.09
977 0.11
978 0.12
979 0.12
980 0.12
981 0.11
982 0.15
983 0.17
984 0.22
985 0.28
986 0.32
987 0.35
988 0.4
989 0.43
990 0.43
991 0.41
992 0.37
993 0.3
994 0.3
995 0.3
996 0.27
997 0.24
998 0.21
999 0.2
1000 0.18
1001 0.21
1002 0.25
1003 0.29
1004 0.33
1005 0.36
1006 0.44
1007 0.51
1008 0.57
1009 0.63
1010 0.61
1011 0.61
1012 0.61
1013 0.61
1014 0.62
1015 0.56
1016 0.5
1017 0.44
1018 0.41
1019 0.34
1020 0.32
1021 0.31
1022 0.29
1023 0.31
1024 0.32
1025 0.31
1026 0.3
1027 0.31
1028 0.28
1029 0.26
1030 0.19
1031 0.17
1032 0.16
1033 0.12
1034 0.1
1035 0.09
1036 0.08
1037 0.11
1038 0.15
1039 0.17
1040 0.2
1041 0.28
1042 0.31
1043 0.34
1044 0.37
1045 0.4
1046 0.36
1047 0.35
1048 0.34
1049 0.26
1050 0.23
1051 0.2
1052 0.16
1053 0.1
1054 0.08
1055 0.08
1056 0.06
1057 0.06
1058 0.05
1059 0.05
1060 0.05
1061 0.06
1062 0.08
1063 0.11
1064 0.13
1065 0.16
1066 0.18
1067 0.22
1068 0.24
1069 0.24
1070 0.28
1071 0.27
1072 0.33
1073 0.36
1074 0.36
1075 0.32
1076 0.31
1077 0.31
1078 0.25
1079 0.23
1080 0.14
1081 0.08
1082 0.05
1083 0.05
1084 0.04
1085 0.03
1086 0.03
1087 0.03
1088 0.03
1089 0.03
1090 0.04
1091 0.05
1092 0.07
1093 0.1
1094 0.14
1095 0.15
1096 0.16
1097 0.2
1098 0.24
1099 0.32
1100 0.39
1101 0.39
1102 0.4
1103 0.44
1104 0.45
1105 0.44
1106 0.41
1107 0.37
1108 0.32
1109 0.31
1110 0.35
1111 0.3
1112 0.29