Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2LQM6

Protein Details
Accession A0A1Y2LQM6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-226EARGREKGKGKGKEREKARKGILKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-227ARGREKGKGKGKEREKARKGILKA
Subcellular Location(s) cyto_mito 13.666, mito 13.5, cyto 12.5, cyto_nucl 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
IPR005576  Rpb7-like_N  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
PF03876  SHS2_Rpb7-N  
Amino Acid Sequences MAPLPSTNLFTERISQYVSLPPSALNTPLPALCANVFSPLLLSYFAPARGIVLAYEDVKLSSRAPTSSKTGSTEDVESDDDEVMLRHVDEYAMPFIWATATFLVFRPTKNSHITARIVHSSKTHITLSYLNIFPVSVLAAQLPSGWSFEAGAAGEGEGVWKDAQGEAVEGDLSVRVVDFDGRTDGKSKGKGVRLEGSLVGEEEARGREKGKGKGKEREKARKGILKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.23
4 0.27
5 0.28
6 0.22
7 0.21
8 0.2
9 0.21
10 0.21
11 0.21
12 0.16
13 0.15
14 0.16
15 0.16
16 0.17
17 0.14
18 0.15
19 0.13
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.14
24 0.12
25 0.13
26 0.11
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.08
31 0.1
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.1
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.11
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.14
51 0.16
52 0.18
53 0.23
54 0.25
55 0.26
56 0.26
57 0.27
58 0.28
59 0.27
60 0.26
61 0.21
62 0.19
63 0.18
64 0.15
65 0.14
66 0.11
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.07
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.15
94 0.18
95 0.21
96 0.24
97 0.26
98 0.25
99 0.29
100 0.3
101 0.27
102 0.27
103 0.28
104 0.26
105 0.24
106 0.22
107 0.21
108 0.2
109 0.21
110 0.19
111 0.14
112 0.15
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.18
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.12
121 0.1
122 0.08
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.07
151 0.06
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.06
165 0.06
166 0.08
167 0.11
168 0.13
169 0.14
170 0.16
171 0.19
172 0.23
173 0.27
174 0.31
175 0.34
176 0.4
177 0.44
178 0.46
179 0.5
180 0.46
181 0.45
182 0.4
183 0.35
184 0.29
185 0.25
186 0.2
187 0.13
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.21
195 0.28
196 0.37
197 0.45
198 0.53
199 0.59
200 0.69
201 0.76
202 0.78
203 0.82
204 0.84
205 0.81
206 0.8
207 0.81