FuNGI

A0A1Y2M522

Protein Details

Accession

A0A1Y2M522

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
15-44	PAAPNGQQPVKKRRPRPKEGPLRAPRRPLA	Hydrophilic
489-536	PSGAHKPVDKLKSKKRPNSEMSEASGNESSRIKKKKKNKLNVVLGNGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-45	VKKRRPRPKEGPLRAPRRPLAK
498-505	KLKSKKRP
517-527	SSRIKKKKKNK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNNLPVGPPQQAAPPAAPNGQQPVKKRRPRPKEGPLRAPRRPLAKITRPLVSLAEMNETSKPAEVAAQGVATQAALRHEFQQAGATSFPLVVTRRDLKELRHHVMRLQNKTLLDVQDPKQFAPPIRLHRRDPRAPPSGAGSHFEEEDTKEDLEEIKERERIEQQREERRKIREENQAKIAPTGKSKPQAFQKKTEQKYRPDDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDFENKQTWVGTYESELSETHVMLSQNSQGSIQMAPIERWYRFNVKGKVKITSDDTDKVMFKIERVPGFLRNIEQKAERREQEAHLLRTHNRMSTRVGGGADDEGRIRQTQDQEGFIKREADADDIDFNLEEDFADDEEGLNGLFEGDDAEVKEASEKLKRDQLKAQLWDRNDEKVLKEEEREEMEAEMAKELEKGLRKTLVKRGKLYDYAESDDSDDPETDSETERQRAKEEEEKKAAEAKAAETGNAPSGVSSKGTNTPLGSSTPSGAHKPVDKLKSKKRPNSEMSEASGNESSRIKKKKKNKLNVVLGNGSPTASANTSRAGSPVPGSPAPSQPKLPTAKEIYESLPPQGMGIQALIGLFKGRVDKDNSKVFISIVKAVSSFDNQRKWLTPLPQLPSEEIINEKLNRKQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.27
3	0.29
4	0.3
5	0.28
6	0.33
7	0.38
8	0.4
9	0.44
10	0.52
11	0.6
12	0.68
13	0.76
14	0.79
15	0.83
16	0.88
17	0.91
18	0.91
19	0.91
20	0.92
21	0.93
22	0.92
23	0.91
24	0.87
25	0.85
26	0.8
27	0.76
28	0.71
29	0.69
30	0.69
31	0.69
32	0.71
33	0.67
34	0.66
35	0.59
36	0.56
37	0.48
38	0.4
39	0.33
40	0.25
41	0.27
42	0.22
43	0.22
44	0.22
45	0.21
46	0.19
47	0.18
48	0.16
49	0.11
50	0.13
51	0.12
52	0.12
53	0.12
54	0.12
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.08
59	0.08
60	0.08
61	0.1
62	0.12
63	0.13
64	0.15
65	0.18
66	0.19
67	0.19
68	0.23
69	0.21
70	0.21
71	0.2
72	0.18
73	0.16
74	0.15
75	0.15
76	0.12
77	0.13
78	0.12
79	0.18
80	0.25
81	0.27
82	0.33
83	0.35
84	0.37
85	0.47
86	0.54
87	0.54
88	0.54
89	0.52
90	0.52
91	0.58
92	0.61
93	0.58
94	0.54
95	0.52
96	0.46
97	0.48
98	0.47
99	0.4
100	0.35
101	0.35
102	0.33
103	0.36
104	0.36
105	0.34
106	0.35
107	0.36
108	0.33
109	0.35
110	0.38
111	0.42
112	0.52
113	0.57
114	0.58
115	0.65
116	0.73
117	0.74
118	0.75
119	0.73
120	0.7
121	0.65
122	0.6
123	0.55
124	0.51
125	0.44
126	0.39
127	0.34
128	0.28
129	0.27
130	0.26
131	0.21
132	0.17
133	0.19
134	0.18
135	0.14
136	0.13
137	0.13
138	0.14
139	0.15
140	0.18
141	0.18
142	0.19
143	0.22
144	0.23
145	0.26
146	0.33
147	0.38
148	0.41
149	0.48
150	0.52
151	0.6
152	0.67
153	0.71
154	0.69
155	0.69
156	0.7
157	0.68
158	0.68
159	0.68
160	0.67
161	0.65
162	0.66
163	0.64
164	0.56
165	0.51
166	0.47
167	0.38
168	0.36
169	0.35
170	0.33
171	0.37
172	0.38
173	0.41
174	0.48
175	0.57
176	0.56
177	0.59
178	0.65
179	0.67
180	0.72
181	0.77
182	0.73
183	0.71
184	0.76
185	0.73
186	0.67
187	0.63
188	0.62
189	0.58
190	0.63
191	0.62
192	0.6
193	0.57
194	0.57
195	0.57
196	0.59
197	0.61
198	0.55
199	0.52
200	0.51
201	0.54
202	0.51
203	0.48
204	0.42
205	0.35
206	0.3
207	0.25
208	0.2
209	0.15
210	0.17
211	0.18
212	0.21
213	0.21
214	0.2
215	0.2
216	0.2
217	0.19
218	0.19
219	0.15
220	0.1
221	0.1
222	0.12
223	0.12
224	0.13
225	0.12
226	0.12
227	0.12
228	0.11
229	0.1
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.11
234	0.12
235	0.12
236	0.12
237	0.12
238	0.09
239	0.1
240	0.1
241	0.1
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.13
246	0.15
247	0.14
248	0.17
249	0.2
250	0.23
251	0.27
252	0.36
253	0.41
254	0.45
255	0.52
256	0.51
257	0.53
258	0.49
259	0.45
260	0.41
261	0.37
262	0.34
263	0.28
264	0.28
265	0.25
266	0.24
267	0.22
268	0.21
269	0.18
270	0.14
271	0.18
272	0.21
273	0.19
274	0.22
275	0.24
276	0.23
277	0.25
278	0.26
279	0.22
280	0.23
281	0.23
282	0.22
283	0.24
284	0.25
285	0.29
286	0.34
287	0.32
288	0.31
289	0.32
290	0.32
291	0.38
292	0.39
293	0.35
294	0.32
295	0.33
296	0.31
297	0.34
298	0.34
299	0.27
300	0.23
301	0.22
302	0.22
303	0.24
304	0.23
305	0.2
306	0.19
307	0.16
308	0.15
309	0.14
310	0.12
311	0.08
312	0.07
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.09
318	0.11
319	0.16
320	0.17
321	0.2
322	0.22
323	0.24
324	0.24
325	0.22
326	0.21
327	0.16
328	0.17
329	0.15
330	0.14
331	0.12
332	0.11
333	0.11
334	0.1
335	0.1
336	0.08
337	0.07
338	0.05
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.05
348	0.05
349	0.04
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.02
355	0.03
356	0.03
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.07
364	0.09
365	0.13
366	0.14
367	0.16
368	0.23
369	0.26
370	0.29
371	0.34
372	0.41
373	0.44
374	0.49
375	0.52
376	0.5
377	0.48
378	0.5
379	0.45
380	0.39
381	0.34
382	0.3
383	0.25
384	0.25
385	0.28
386	0.24
387	0.24
388	0.22
389	0.23
390	0.24
391	0.24
392	0.19
393	0.16
394	0.15
395	0.15
396	0.14
397	0.11
398	0.08
399	0.08
400	0.07
401	0.07
402	0.1
403	0.14
404	0.15
405	0.17
406	0.23
407	0.26
408	0.3
409	0.4
410	0.45
411	0.46
412	0.49
413	0.52
414	0.51
415	0.53
416	0.52
417	0.48
418	0.42
419	0.4
420	0.36
421	0.31
422	0.29
423	0.25
424	0.23
425	0.18
426	0.15
427	0.12
428	0.11
429	0.12
430	0.1
431	0.11
432	0.14
433	0.16
434	0.21
435	0.24
436	0.25
437	0.26
438	0.28
439	0.31
440	0.37
441	0.4
442	0.44
443	0.46
444	0.46
445	0.45
446	0.49
447	0.43
448	0.37
449	0.31
450	0.24
451	0.25
452	0.24
453	0.23
454	0.17
455	0.18
456	0.17
457	0.16
458	0.15
459	0.08
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.11
465	0.16
466	0.18
467	0.2
468	0.19
469	0.2
470	0.2
471	0.22
472	0.21
473	0.17
474	0.16
475	0.18
476	0.2
477	0.2
478	0.2
479	0.22
480	0.24
481	0.29
482	0.35
483	0.41
484	0.47
485	0.54
486	0.63
487	0.71
488	0.78
489	0.8
490	0.82
491	0.83
492	0.82
493	0.82
494	0.79
495	0.72
496	0.66
497	0.62
498	0.52
499	0.45
500	0.41
501	0.32
502	0.27
503	0.26
504	0.27
505	0.3
506	0.4
507	0.45
508	0.52
509	0.62
510	0.71
511	0.79
512	0.85
513	0.88
514	0.89
515	0.91
516	0.89
517	0.85
518	0.78
519	0.67
520	0.58
521	0.47
522	0.36
523	0.26
524	0.18
525	0.14
526	0.11
527	0.13
528	0.12
529	0.14
530	0.15
531	0.15
532	0.16
533	0.15
534	0.15
535	0.15
536	0.18
537	0.21
538	0.2
539	0.24
540	0.26
541	0.33
542	0.38
543	0.39
544	0.4
545	0.37
546	0.44
547	0.46
548	0.46
549	0.45
550	0.45
551	0.45
552	0.44
553	0.44
554	0.39
555	0.4
556	0.38
557	0.33
558	0.3
559	0.26
560	0.23
561	0.22
562	0.2
563	0.13
564	0.12
565	0.1
566	0.08
567	0.08
568	0.08
569	0.07
570	0.07
571	0.06
572	0.07
573	0.12
574	0.14
575	0.19
576	0.28
577	0.35
578	0.41
579	0.5
580	0.51
581	0.48
582	0.47
583	0.42
584	0.39
585	0.35
586	0.34
587	0.26
588	0.25
589	0.23
590	0.24
591	0.26
592	0.27
593	0.31
594	0.33
595	0.38
596	0.39
597	0.44
598	0.46
599	0.49
600	0.51
601	0.49
602	0.51
603	0.53
604	0.57
605	0.58
606	0.57
607	0.54
608	0.5
609	0.44
610	0.37
611	0.31
612	0.29
613	0.29
614	0.32

A0A1Y2M522

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer