Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2LSU2

Protein Details
Accession A0A1Y2LSU2    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
662-683LLQRCRPSPRSHSRTQHKTNLSHydrophilic
832-854AAAAAERRKARREKHRSPAEALLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
782-798GRGKGGERTRPSVPRKK
838-847RRKARREKHR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007259  GCP  
IPR040457  GCP_C  
IPR042241  GCP_C_sf  
IPR041470  GCP_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000930  C:gamma-tubulin complex  
GO:0005874  C:microtubule  
GO:0000922  C:spindle pole  
GO:0005816  C:spindle pole body  
GO:0043015  F:gamma-tubulin binding  
GO:0007020  P:microtubule nucleation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04130  GCP_C_terminal  
PF17681  GCP_N_terminal  
CDD cd22572  GCP5_NTD  
Amino Acid Sequences MAQNAKIAGLTDELVQSILQFDPATNRQAYKRAKDLAARGLRGYQYARTNQFDVRSKFAGFDEKCRVKGRDDLADALQLRLQELQGHTNKFKPEFLSLLLQLADRPLENTRVEALDLLRPPSPPPQLTWNEILEEDPYSDDEIWKDIDYAVESSGDEQVDQGRKKQKKEPSTPATSIDEDDTYDPEACVESIDTSLVPAVEEAQFWTSQSAEDGVKSEITELQAMRETLFMLAGLQTSLYLIDKERCNVRVNTRFNLSHAIPSTVDHLLSQFATIGTKLLRLRKWTRRPSTLPLVQTFEAAVRERLLDYDRQLSTLQRRYLVPDSPIPVSLVALSSEFRHVSEQILCLSQVVSDVEPRLLVNPFSHLEELFNQTTVAQMALQKANFDFFSTMLFDCLRTYLKPIRRWMESGELGANDETFFVFENDSGSDVASMWHDRYVLRRDAQNELRSPSFLQPAASKIFNTGKSVVFLKELGYGHTLLDNLEAEPPLDHRSVCGESDGVPLSPFPELFNAGFEKWIRSKYSLASTSLRTHLFDGQGLMRVLETFQALYLGSNGAVFSNFANAIFERMDSGHRGWNDRYMLTELARIIYSDVFPAQDAERIVVRSSKPKDQGRSVRGLAAVTIDYSLHWSLTNILQRSSMPLYQQLHAALLQSYRAKYLLQRCRPSPRSHSRTQHKTNLSTSRLVYKLHHRLTWFTDLLRSYYTETVIAFTTGDMVAAMQKAQDIDQMADVHVRYVARLQERALLSPDLKPINRAVVEVLDLSVLLAQTIGEMDGEVRGRGKGGERTRPSVPRKKSSANLLDKAQLEHLDTDTEDEGEHGDDDDDDDDAAAAAERRKARREKHRSPAEALLSIDNELARLLPFITAGLRSVGRVGAEPLWEQFAERLEWEGKRDRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.1
4 0.1
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.16
10 0.19
11 0.24
12 0.25
13 0.28
14 0.31
15 0.4
16 0.48
17 0.48
18 0.53
19 0.55
20 0.58
21 0.61
22 0.63
23 0.64
24 0.64
25 0.59
26 0.52
27 0.5
28 0.46
29 0.43
30 0.4
31 0.35
32 0.35
33 0.41
34 0.45
35 0.45
36 0.47
37 0.47
38 0.52
39 0.55
40 0.51
41 0.5
42 0.47
43 0.43
44 0.41
45 0.4
46 0.42
47 0.35
48 0.39
49 0.43
50 0.45
51 0.49
52 0.54
53 0.54
54 0.47
55 0.53
56 0.51
57 0.5
58 0.48
59 0.47
60 0.42
61 0.46
62 0.43
63 0.36
64 0.31
65 0.22
66 0.2
67 0.18
68 0.16
69 0.15
70 0.16
71 0.25
72 0.29
73 0.35
74 0.37
75 0.4
76 0.45
77 0.43
78 0.44
79 0.39
80 0.36
81 0.33
82 0.34
83 0.35
84 0.3
85 0.3
86 0.27
87 0.24
88 0.2
89 0.19
90 0.16
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.17
95 0.17
96 0.18
97 0.19
98 0.19
99 0.19
100 0.19
101 0.18
102 0.2
103 0.21
104 0.22
105 0.21
106 0.21
107 0.23
108 0.28
109 0.33
110 0.28
111 0.3
112 0.36
113 0.39
114 0.43
115 0.45
116 0.4
117 0.35
118 0.34
119 0.31
120 0.23
121 0.2
122 0.16
123 0.12
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.11
141 0.13
142 0.12
143 0.1
144 0.1
145 0.15
146 0.21
147 0.23
148 0.29
149 0.36
150 0.42
151 0.48
152 0.56
153 0.6
154 0.63
155 0.72
156 0.76
157 0.75
158 0.78
159 0.74
160 0.7
161 0.65
162 0.55
163 0.46
164 0.38
165 0.29
166 0.22
167 0.2
168 0.17
169 0.15
170 0.14
171 0.13
172 0.11
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.14
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.07
229 0.12
230 0.14
231 0.17
232 0.21
233 0.23
234 0.27
235 0.31
236 0.39
237 0.43
238 0.47
239 0.48
240 0.5
241 0.48
242 0.45
243 0.46
244 0.37
245 0.33
246 0.3
247 0.28
248 0.22
249 0.22
250 0.24
251 0.19
252 0.18
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.07
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.11
265 0.14
266 0.2
267 0.22
268 0.29
269 0.39
270 0.48
271 0.58
272 0.65
273 0.7
274 0.72
275 0.75
276 0.75
277 0.75
278 0.71
279 0.64
280 0.57
281 0.53
282 0.44
283 0.39
284 0.32
285 0.23
286 0.19
287 0.16
288 0.14
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.19
297 0.18
298 0.2
299 0.2
300 0.23
301 0.29
302 0.33
303 0.33
304 0.29
305 0.3
306 0.33
307 0.36
308 0.35
309 0.3
310 0.27
311 0.28
312 0.26
313 0.26
314 0.21
315 0.18
316 0.15
317 0.12
318 0.09
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.12
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.12
334 0.11
335 0.1
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.08
349 0.1
350 0.11
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.13
356 0.18
357 0.15
358 0.14
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.05
365 0.07
366 0.09
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.11
374 0.09
375 0.07
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.13
387 0.19
388 0.26
389 0.31
390 0.37
391 0.4
392 0.41
393 0.42
394 0.4
395 0.4
396 0.34
397 0.29
398 0.24
399 0.2
400 0.18
401 0.17
402 0.14
403 0.07
404 0.06
405 0.05
406 0.04
407 0.05
408 0.04
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.11
426 0.16
427 0.18
428 0.19
429 0.22
430 0.23
431 0.3
432 0.35
433 0.35
434 0.32
435 0.31
436 0.3
437 0.28
438 0.27
439 0.22
440 0.19
441 0.16
442 0.15
443 0.13
444 0.15
445 0.17
446 0.15
447 0.13
448 0.14
449 0.18
450 0.18
451 0.19
452 0.19
453 0.17
454 0.18
455 0.19
456 0.17
457 0.14
458 0.13
459 0.11
460 0.14
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.13
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.07
469 0.08
470 0.07
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.12
482 0.13
483 0.13
484 0.12
485 0.1
486 0.1
487 0.13
488 0.13
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.08
498 0.08
499 0.1
500 0.11
501 0.1
502 0.12
503 0.12
504 0.14
505 0.14
506 0.17
507 0.17
508 0.18
509 0.19
510 0.2
511 0.27
512 0.26
513 0.28
514 0.27
515 0.28
516 0.29
517 0.31
518 0.29
519 0.23
520 0.22
521 0.21
522 0.2
523 0.17
524 0.16
525 0.13
526 0.16
527 0.15
528 0.13
529 0.1
530 0.09
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.04
545 0.05
546 0.05
547 0.04
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.07
557 0.08
558 0.1
559 0.11
560 0.12
561 0.15
562 0.16
563 0.2
564 0.2
565 0.25
566 0.25
567 0.23
568 0.23
569 0.22
570 0.22
571 0.19
572 0.2
573 0.15
574 0.14
575 0.14
576 0.12
577 0.1
578 0.09
579 0.09
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.08
585 0.08
586 0.1
587 0.1
588 0.1
589 0.11
590 0.12
591 0.12
592 0.15
593 0.16
594 0.22
595 0.26
596 0.32
597 0.39
598 0.45
599 0.5
600 0.56
601 0.64
602 0.6
603 0.63
604 0.57
605 0.51
606 0.45
607 0.39
608 0.3
609 0.22
610 0.16
611 0.1
612 0.09
613 0.07
614 0.06
615 0.08
616 0.09
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.09
621 0.14
622 0.2
623 0.18
624 0.18
625 0.19
626 0.19
627 0.23
628 0.24
629 0.21
630 0.17
631 0.22
632 0.24
633 0.24
634 0.26
635 0.22
636 0.2
637 0.18
638 0.18
639 0.13
640 0.1
641 0.13
642 0.14
643 0.14
644 0.14
645 0.14
646 0.14
647 0.19
648 0.29
649 0.37
650 0.43
651 0.49
652 0.53
653 0.63
654 0.68
655 0.69
656 0.69
657 0.7
658 0.68
659 0.71
660 0.77
661 0.77
662 0.82
663 0.83
664 0.82
665 0.77
666 0.74
667 0.72
668 0.71
669 0.64
670 0.57
671 0.5
672 0.47
673 0.43
674 0.39
675 0.36
676 0.37
677 0.44
678 0.44
679 0.45
680 0.4
681 0.42
682 0.46
683 0.49
684 0.4
685 0.31
686 0.31
687 0.29
688 0.29
689 0.27
690 0.23
691 0.19
692 0.19
693 0.19
694 0.16
695 0.15
696 0.15
697 0.14
698 0.13
699 0.1
700 0.08
701 0.09
702 0.08
703 0.07
704 0.06
705 0.06
706 0.07
707 0.07
708 0.07
709 0.05
710 0.06
711 0.07
712 0.07
713 0.1
714 0.1
715 0.1
716 0.13
717 0.14
718 0.14
719 0.15
720 0.15
721 0.13
722 0.14
723 0.13
724 0.1
725 0.13
726 0.18
727 0.2
728 0.22
729 0.22
730 0.27
731 0.28
732 0.3
733 0.29
734 0.27
735 0.24
736 0.25
737 0.3
738 0.28
739 0.27
740 0.27
741 0.26
742 0.3
743 0.3
744 0.27
745 0.24
746 0.19
747 0.2
748 0.19
749 0.17
750 0.1
751 0.09
752 0.08
753 0.08
754 0.06
755 0.05
756 0.04
757 0.04
758 0.04
759 0.05
760 0.05
761 0.04
762 0.04
763 0.04
764 0.07
765 0.08
766 0.08
767 0.09
768 0.09
769 0.1
770 0.12
771 0.16
772 0.23
773 0.3
774 0.4
775 0.44
776 0.49
777 0.56
778 0.64
779 0.68
780 0.69
781 0.7
782 0.69
783 0.72
784 0.74
785 0.73
786 0.74
787 0.75
788 0.74
789 0.7
790 0.64
791 0.62
792 0.56
793 0.51
794 0.44
795 0.35
796 0.28
797 0.25
798 0.22
799 0.18
800 0.17
801 0.18
802 0.16
803 0.15
804 0.12
805 0.11
806 0.11
807 0.1
808 0.1
809 0.08
810 0.08
811 0.07
812 0.09
813 0.09
814 0.09
815 0.08
816 0.07
817 0.07
818 0.06
819 0.06
820 0.06
821 0.08
822 0.09
823 0.16
824 0.22
825 0.26
826 0.35
827 0.43
828 0.53
829 0.62
830 0.71
831 0.75
832 0.8
833 0.87
834 0.84
835 0.81
836 0.8
837 0.73
838 0.66
839 0.57
840 0.49
841 0.39
842 0.34
843 0.29
844 0.2
845 0.15
846 0.12
847 0.11
848 0.08
849 0.08
850 0.08
851 0.07
852 0.07
853 0.08
854 0.1
855 0.1
856 0.1
857 0.13
858 0.13
859 0.13
860 0.14
861 0.15
862 0.14
863 0.14
864 0.16
865 0.16
866 0.18
867 0.18
868 0.18
869 0.2
870 0.19
871 0.19
872 0.18
873 0.18
874 0.18
875 0.17
876 0.2
877 0.22
878 0.24
879 0.29