FuNGI

A0A1Y2LJQ0

Protein Details

Accession

A0A1Y2LJQ0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
107-128	GFSRPAPQQHQQHQQQHQQQQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 9, cyto 8, nucl 4, pero 3, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039900 Pat1-like IPR019167 PAT1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000290 P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA
Pfam	View protein in Pfam PF09770 PAT1

Amino Acid Sequences

MSFFGFDTSLPRDRGHQTNAPGFGQHDAFAGFSGGAADDDVIDFDDTHQGLGGALDDTDDAFNDDTFGADGPATQQNVGRDFDFAGQTSKIAGTIQEEQMLYQARQGFSRPAPQQHQQHQQQHQQQQQQQQQYQQQSSYQASKPARTGYESYKDPDYIPQLEARADIWGLKPKQPAAQRQQQQQPEYQPSPVQYSSSPAQQSAASRKVMSLDEVEAMLRNQSITNEHRGTPPVQPPPGMGYPQQHQQQQFYQGQPPFPGMPGMPGMQGMQGMPPGMPPGFPGPHGPQVLQRPQQHQFQQPPQQQQQQFQQRQAPPQQQQQFHAELPGQSAQTPTPQQPTILQRQKPESTAQQQRGASPATQPQGPPSQPRQILQNPNRLSGQGQPMVPTGPAQRQMAGSAPGQHARGPSFPIITHPEQLLNLSEAERAAFLEEDAKRAKRNHKIAQLAKDNGLMTPQDKNFITRIQLQQLMTATGNIDERGPEAAIAEDFYYQVFSQIRGAPRQNPQQPANQFAQTYLFQTNNRFGNRRHGRGGDNHMQRMEQQIQRAVEAAKARPKAKQLVVEGSLGKIAFSNSKTPRPLLNIKRPETSDKPKPKTSIADRKDALRNIESVYLTLMQMEDHERTMPPPVNENSDPEAIQAHMEWRSKIEALHQKLWQATKIMEPINPHAQAPHPFIQILSHAKGKKVIPRLFRHIDEQERITVVTMIVVHLDGLNVVGHAIATPEEPLSAATREEVELFSQTVMPPLFAHISESPLNIIIGLLGLILDRTNLHIVARTKIGLSLLTILISRAELLKQSAPEIDAGDWDQWTILYNRLFDTIEPVLPYLFPGSINDTDDMYIWQFLAAMGVGASPEQQQRLVIGVKDRVMETVSVSKALPVEMAGARLGNVNLFMRAIGLDVELLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.46
3	0.47
4	0.48
5	0.53
6	0.56
7	0.52
8	0.47
9	0.41
10	0.37
11	0.31
12	0.24
13	0.18
14	0.15
15	0.14
16	0.13
17	0.13
18	0.09
19	0.07
20	0.08
21	0.07
22	0.06
23	0.06
24	0.06
25	0.06
26	0.06
27	0.06
28	0.07
29	0.07
30	0.07
31	0.08
32	0.14
33	0.13
34	0.13
35	0.13
36	0.12
37	0.11
38	0.11
39	0.11
40	0.06
41	0.06
42	0.06
43	0.06
44	0.07
45	0.07
46	0.07
47	0.08
48	0.08
49	0.08
50	0.09
51	0.09
52	0.09
53	0.09
54	0.09
55	0.08
56	0.07
57	0.07
58	0.1
59	0.15
60	0.15
61	0.15
62	0.18
63	0.21
64	0.24
65	0.26
66	0.23
67	0.2
68	0.2
69	0.23
70	0.22
71	0.19
72	0.19
73	0.17
74	0.17
75	0.17
76	0.16
77	0.13
78	0.11
79	0.11
80	0.13
81	0.18
82	0.19
83	0.21
84	0.21
85	0.2
86	0.24
87	0.26
88	0.22
89	0.21
90	0.24
91	0.21
92	0.23
93	0.25
94	0.28
95	0.27
96	0.37
97	0.38
98	0.41
99	0.47
100	0.54
101	0.62
102	0.64
103	0.72
104	0.72
105	0.77
106	0.77
107	0.8
108	0.81
109	0.81
110	0.8
111	0.78
112	0.75
113	0.75
114	0.75
115	0.74
116	0.68
117	0.67
118	0.67
119	0.66
120	0.63
121	0.55
122	0.49
123	0.45
124	0.45
125	0.44
126	0.38
127	0.39
128	0.39
129	0.4
130	0.41
131	0.41
132	0.38
133	0.36
134	0.39
135	0.38
136	0.42
137	0.41
138	0.41
139	0.39
140	0.38
141	0.35
142	0.36
143	0.34
144	0.29
145	0.27
146	0.27
147	0.25
148	0.24
149	0.24
150	0.19
151	0.16
152	0.13
153	0.13
154	0.13
155	0.21
156	0.23
157	0.27
158	0.3
159	0.31
160	0.37
161	0.43
162	0.5
163	0.5
164	0.58
165	0.6
166	0.66
167	0.73
168	0.73
169	0.69
170	0.65
171	0.64
172	0.62
173	0.57
174	0.5
175	0.44
176	0.39
177	0.41
178	0.36
179	0.3
180	0.22
181	0.25
182	0.25
183	0.28
184	0.27
185	0.22
186	0.22
187	0.23
188	0.27
189	0.29
190	0.31
191	0.27
192	0.26
193	0.26
194	0.28
195	0.27
196	0.24
197	0.18
198	0.15
199	0.14
200	0.14
201	0.14
202	0.12
203	0.11
204	0.1
205	0.08
206	0.07
207	0.07
208	0.08
209	0.13
210	0.15
211	0.23
212	0.25
213	0.26
214	0.28
215	0.3
216	0.32
217	0.34
218	0.38
219	0.37
220	0.36
221	0.35
222	0.34
223	0.37
224	0.37
225	0.32
226	0.28
227	0.24
228	0.26
229	0.33
230	0.37
231	0.35
232	0.34
233	0.36
234	0.38
235	0.41
236	0.43
237	0.39
238	0.41
239	0.39
240	0.39
241	0.36
242	0.34
243	0.27
244	0.23
245	0.21
246	0.14
247	0.13
248	0.14
249	0.13
250	0.11
251	0.1
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.08
265	0.12
266	0.12
267	0.13
268	0.18
269	0.2
270	0.26
271	0.27
272	0.26
273	0.27
274	0.33
275	0.4
276	0.43
277	0.44
278	0.44
279	0.47
280	0.54
281	0.54
282	0.54
283	0.54
284	0.55
285	0.6
286	0.61
287	0.65
288	0.64
289	0.68
290	0.63
291	0.6
292	0.62
293	0.63
294	0.6
295	0.56
296	0.59
297	0.53
298	0.58
299	0.6
300	0.59
301	0.53
302	0.58
303	0.61
304	0.55
305	0.55
306	0.53
307	0.48
308	0.4
309	0.36
310	0.28
311	0.21
312	0.21
313	0.2
314	0.15
315	0.12
316	0.13
317	0.12
318	0.14
319	0.16
320	0.16
321	0.18
322	0.18
323	0.19
324	0.23
325	0.28
326	0.35
327	0.41
328	0.42
329	0.42
330	0.48
331	0.49
332	0.46
333	0.43
334	0.4
335	0.4
336	0.46
337	0.47
338	0.47
339	0.45
340	0.44
341	0.43
342	0.37
343	0.29
344	0.22
345	0.23
346	0.19
347	0.19
348	0.19
349	0.2
350	0.24
351	0.25
352	0.28
353	0.28
354	0.34
355	0.34
356	0.35
357	0.39
358	0.4
359	0.5
360	0.5
361	0.55
362	0.48
363	0.49
364	0.49
365	0.42
366	0.36
367	0.3
368	0.29
369	0.23
370	0.22
371	0.2
372	0.2
373	0.21
374	0.19
375	0.16
376	0.13
377	0.12
378	0.16
379	0.15
380	0.16
381	0.15
382	0.16
383	0.16
384	0.16
385	0.14
386	0.14
387	0.15
388	0.15
389	0.16
390	0.16
391	0.16
392	0.15
393	0.15
394	0.14
395	0.14
396	0.13
397	0.12
398	0.14
399	0.19
400	0.19
401	0.19
402	0.17
403	0.17
404	0.16
405	0.17
406	0.15
407	0.1
408	0.09
409	0.08
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.06
414	0.05
415	0.05
416	0.04
417	0.04
418	0.09
419	0.1
420	0.12
421	0.14
422	0.15
423	0.18
424	0.23
425	0.31
426	0.34
427	0.43
428	0.48
429	0.53
430	0.61
431	0.62
432	0.66
433	0.64
434	0.57
435	0.49
436	0.43
437	0.36
438	0.27
439	0.23
440	0.15
441	0.1
442	0.13
443	0.12
444	0.13
445	0.13
446	0.15
447	0.16
448	0.17
449	0.18
450	0.19
451	0.21
452	0.21
453	0.24
454	0.23
455	0.23
456	0.22
457	0.21
458	0.16
459	0.14
460	0.11
461	0.08
462	0.08
463	0.07
464	0.07
465	0.05
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.07
481	0.07
482	0.08
483	0.1
484	0.14
485	0.16
486	0.19
487	0.21
488	0.24
489	0.3
490	0.38
491	0.41
492	0.43
493	0.43
494	0.47
495	0.46
496	0.45
497	0.42
498	0.35
499	0.3
500	0.25
501	0.25
502	0.18
503	0.19
504	0.16
505	0.15
506	0.15
507	0.17
508	0.21
509	0.23
510	0.26
511	0.26
512	0.26
513	0.35
514	0.41
515	0.43
516	0.42
517	0.41
518	0.41
519	0.44
520	0.51
521	0.49
522	0.46
523	0.43
524	0.4
525	0.37
526	0.34
527	0.34
528	0.32
529	0.25
530	0.23
531	0.25
532	0.25
533	0.25
534	0.26
535	0.21
536	0.18
537	0.18
538	0.19
539	0.21
540	0.25
541	0.26
542	0.27
543	0.31
544	0.34
545	0.35
546	0.38
547	0.35
548	0.36
549	0.37
550	0.36
551	0.32
552	0.26
553	0.24
554	0.17
555	0.14
556	0.09
557	0.08
558	0.09
559	0.11
560	0.19
561	0.21
562	0.27
563	0.29
564	0.3
565	0.32
566	0.36
567	0.44
568	0.45
569	0.52
570	0.55
571	0.57
572	0.59
573	0.59
574	0.59
575	0.57
576	0.56
577	0.56
578	0.58
579	0.61
580	0.62
581	0.63
582	0.6
583	0.61
584	0.62
585	0.63
586	0.56
587	0.58
588	0.54
589	0.56
590	0.59
591	0.52
592	0.46
593	0.36
594	0.34
595	0.27
596	0.3
597	0.24
598	0.18
599	0.17
600	0.14
601	0.13
602	0.12
603	0.1
604	0.06
605	0.07
606	0.1
607	0.09
608	0.09
609	0.1
610	0.1
611	0.11
612	0.16
613	0.19
614	0.17
615	0.22
616	0.23
617	0.29
618	0.3
619	0.33
620	0.32
621	0.29
622	0.29
623	0.23
624	0.22
625	0.15
626	0.15
627	0.11
628	0.1
629	0.14
630	0.15
631	0.15
632	0.16
633	0.18
634	0.18
635	0.18
636	0.24
637	0.28
638	0.33
639	0.38
640	0.38
641	0.39
642	0.41
643	0.43
644	0.36
645	0.28
646	0.23
647	0.21
648	0.25
649	0.24
650	0.22
651	0.23
652	0.27
653	0.32
654	0.32
655	0.28
656	0.25
657	0.27
658	0.3
659	0.33
660	0.32
661	0.27
662	0.26
663	0.26
664	0.26
665	0.26
666	0.26
667	0.23
668	0.25
669	0.25
670	0.26
671	0.32
672	0.34
673	0.36
674	0.42
675	0.45
676	0.48
677	0.53
678	0.61
679	0.62
680	0.61
681	0.6
682	0.57
683	0.57
684	0.52
685	0.47
686	0.4
687	0.35
688	0.33
689	0.27
690	0.21
691	0.14
692	0.12
693	0.1
694	0.08
695	0.08
696	0.07
697	0.07
698	0.06
699	0.06
700	0.04
701	0.05
702	0.05
703	0.04
704	0.04
705	0.04
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.05
711	0.05
712	0.06
713	0.06
714	0.06
715	0.07
716	0.09
717	0.09
718	0.09
719	0.1
720	0.11
721	0.11
722	0.12
723	0.12
724	0.11
725	0.11
726	0.11
727	0.11
728	0.11
729	0.11
730	0.14
731	0.13
732	0.12
733	0.11
734	0.13
735	0.14
736	0.13
737	0.17
738	0.14
739	0.18
740	0.19
741	0.19
742	0.17
743	0.17
744	0.16
745	0.12
746	0.11
747	0.07
748	0.06
749	0.05
750	0.04
751	0.03
752	0.03
753	0.03
754	0.03
755	0.04
756	0.04
757	0.07
758	0.08
759	0.09
760	0.09
761	0.15
762	0.17
763	0.2
764	0.22
765	0.21
766	0.19
767	0.2
768	0.21
769	0.15
770	0.14
771	0.14
772	0.12
773	0.12
774	0.12
775	0.11
776	0.1
777	0.1
778	0.09
779	0.08
780	0.08
781	0.09
782	0.12
783	0.16
784	0.16
785	0.18
786	0.19
787	0.18
788	0.18
789	0.19
790	0.16
791	0.14
792	0.15
793	0.14
794	0.13
795	0.12
796	0.11
797	0.09
798	0.11
799	0.11
800	0.15
801	0.16
802	0.17
803	0.18
804	0.21
805	0.21
806	0.19
807	0.24
808	0.21
809	0.2
810	0.2
811	0.19
812	0.17
813	0.17
814	0.18
815	0.13
816	0.11
817	0.1
818	0.11
819	0.16
820	0.18
821	0.21
822	0.21
823	0.2
824	0.2
825	0.2
826	0.19
827	0.15
828	0.13
829	0.11
830	0.1
831	0.09
832	0.08
833	0.09
834	0.07
835	0.05
836	0.05
837	0.05
838	0.05
839	0.05
840	0.06
841	0.09
842	0.12
843	0.13
844	0.14
845	0.14
846	0.15
847	0.19
848	0.22
849	0.21
850	0.24
851	0.27
852	0.29
853	0.3
854	0.3
855	0.27
856	0.25
857	0.23
858	0.21
859	0.23
860	0.22
861	0.21
862	0.21
863	0.22
864	0.21
865	0.21
866	0.17
867	0.1
868	0.14
869	0.13
870	0.14
871	0.13
872	0.13
873	0.13
874	0.15
875	0.14
876	0.11
877	0.13
878	0.12
879	0.13
880	0.13
881	0.12
882	0.11
883	0.1
884	0.11
885	0.08
886	0.08

A0A1Y2LJQ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer