FuNGI

A0A1Y2MHA6

Protein Details

Accession

A0A1Y2MHA6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
407-426	LPPPLTSRKQEKKPPPLLRT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 6, pero 3, mito 1, golg 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019313 Mediator_Med17
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF10156 Med17

Amino Acid Sequences

MSEFESLRDVALRPWPVNRTDDLSKDAMLQQVEQLARERGHLRNITEQSLQADIDAGKDVPDDLKEISEEDEEEKEPLTLDERKAEIAKMQMEMASHLDWARFAASNALDLISMVLSADPNKRLPASFSHTFREAGLNQGLPFGSIGVARENHEYDELKAAERSRREEQERRQDLVAKAARMEALDTATDEILKAAKSLEKEVRRETKYWQEIVSISDKGWPIHRMGRNVRHAPFGVRFGASEANNHFKARGSAPLRMDKDGSIILDPNLALKPKTLRVRISENGEITGSAQLPAESLLDGLAVEKSIRLARDSLLEEELFHEMSLETQQLLPYGVRLQDSIITVDATVADSSASSRQILIDCIPRDSKGPDKQGYTHDWLAHHIGEALRLLLTHEHSMRLYRRTQLPPPLTSRKQEKKPPPLLRTLLAMMHHLQNADSLFAYLEGVSSTLESAGLEAPVETSREESWVKLRDSLAKSTRKDLTAADQLLEIFNKPFTGKASMTLPSSVGSQTEQLIIAIRTVIGAPTFGTEYKLTLPPSLATDLGLSIENNFQSTADVTSYLDWILALQLTHRVLKNEYAERAAVKDSEDGVAVTIKSDKKGTSANWDVSVELTEGKLVLQVTDTSSQVPSQRSQSWPGKGDNLPLKEQIKAWVE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.36
3	0.37
4	0.4
5	0.4
6	0.4
7	0.4
8	0.42
9	0.41
10	0.38
11	0.35
12	0.34
13	0.34
14	0.3
15	0.26
16	0.23
17	0.2
18	0.24
19	0.24
20	0.22
21	0.23
22	0.24
23	0.23
24	0.27
25	0.3
26	0.27
27	0.36
28	0.39
29	0.4
30	0.45
31	0.48
32	0.48
33	0.45
34	0.43
35	0.37
36	0.34
37	0.3
38	0.2
39	0.19
40	0.15
41	0.14
42	0.14
43	0.12
44	0.1
45	0.1
46	0.11
47	0.1
48	0.11
49	0.12
50	0.11
51	0.12
52	0.12
53	0.13
54	0.15
55	0.14
56	0.15
57	0.15
58	0.17
59	0.16
60	0.17
61	0.16
62	0.14
63	0.13
64	0.13
65	0.15
66	0.18
67	0.19
68	0.23
69	0.24
70	0.26
71	0.27
72	0.27
73	0.25
74	0.25
75	0.25
76	0.22
77	0.21
78	0.19
79	0.18
80	0.19
81	0.19
82	0.14
83	0.13
84	0.13
85	0.12
86	0.11
87	0.12
88	0.12
89	0.1
90	0.1
91	0.14
92	0.13
93	0.14
94	0.14
95	0.14
96	0.11
97	0.11
98	0.11
99	0.06
100	0.06
101	0.05
102	0.05
103	0.05
104	0.08
105	0.12
106	0.14
107	0.15
108	0.18
109	0.19
110	0.19
111	0.21
112	0.25
113	0.29
114	0.34
115	0.36
116	0.39
117	0.39
118	0.39
119	0.38
120	0.37
121	0.29
122	0.27
123	0.26
124	0.23
125	0.21
126	0.22
127	0.21
128	0.15
129	0.15
130	0.1
131	0.08
132	0.07
133	0.08
134	0.1
135	0.11
136	0.12
137	0.15
138	0.16
139	0.16
140	0.19
141	0.19
142	0.17
143	0.22
144	0.21
145	0.2
146	0.21
147	0.23
148	0.26
149	0.28
150	0.33
151	0.33
152	0.41
153	0.48
154	0.54
155	0.61
156	0.67
157	0.69
158	0.66
159	0.61
160	0.6
161	0.53
162	0.54
163	0.48
164	0.37
165	0.32
166	0.29
167	0.28
168	0.21
169	0.21
170	0.12
171	0.09
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.08
176	0.08
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.06
182	0.06
183	0.09
184	0.1
185	0.16
186	0.23
187	0.28
188	0.32
189	0.4
190	0.48
191	0.49
192	0.49
193	0.49
194	0.51
195	0.51
196	0.49
197	0.42
198	0.35
199	0.33
200	0.34
201	0.32
202	0.22
203	0.17
204	0.19
205	0.19
206	0.17
207	0.2
208	0.18
209	0.18
210	0.26
211	0.3
212	0.33
213	0.4
214	0.48
215	0.54
216	0.58
217	0.57
218	0.52
219	0.48
220	0.45
221	0.39
222	0.33
223	0.26
224	0.2
225	0.19
226	0.17
227	0.21
228	0.17
229	0.18
230	0.17
231	0.21
232	0.22
233	0.22
234	0.21
235	0.18
236	0.2
237	0.18
238	0.24
239	0.22
240	0.26
241	0.3
242	0.37
243	0.38
244	0.37
245	0.37
246	0.28
247	0.27
248	0.22
249	0.19
250	0.12
251	0.1
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.08
259	0.09
260	0.12
261	0.18
262	0.24
263	0.26
264	0.28
265	0.32
266	0.39
267	0.41
268	0.44
269	0.41
270	0.35
271	0.32
272	0.29
273	0.25
274	0.18
275	0.16
276	0.11
277	0.08
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.07
282	0.06
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.04
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.08
298	0.08
299	0.12
300	0.14
301	0.14
302	0.14
303	0.13
304	0.13
305	0.13
306	0.13
307	0.09
308	0.08
309	0.07
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.09
327	0.1
328	0.1
329	0.09
330	0.08
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.03
338	0.03
339	0.04
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.08
346	0.09
347	0.1
348	0.14
349	0.14
350	0.16
351	0.17
352	0.17
353	0.18
354	0.19
355	0.25
356	0.26
357	0.32
358	0.33
359	0.35
360	0.37
361	0.4
362	0.42
363	0.4
364	0.36
365	0.31
366	0.28
367	0.28
368	0.27
369	0.23
370	0.18
371	0.14
372	0.11
373	0.1
374	0.1
375	0.08
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.08
381	0.1
382	0.1
383	0.11
384	0.11
385	0.16
386	0.19
387	0.21
388	0.22
389	0.24
390	0.32
391	0.36
392	0.41
393	0.46
394	0.47
395	0.47
396	0.53
397	0.57
398	0.52
399	0.52
400	0.57
401	0.57
402	0.61
403	0.67
404	0.69
405	0.71
406	0.79
407	0.83
408	0.77
409	0.75
410	0.7
411	0.61
412	0.54
413	0.45
414	0.36
415	0.27
416	0.24
417	0.18
418	0.18
419	0.17
420	0.14
421	0.13
422	0.12
423	0.12
424	0.11
425	0.09
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.04
445	0.05
446	0.06
447	0.07
448	0.06
449	0.08
450	0.08
451	0.12
452	0.12
453	0.13
454	0.18
455	0.24
456	0.25
457	0.26
458	0.28
459	0.33
460	0.36
461	0.42
462	0.44
463	0.46
464	0.47
465	0.49
466	0.52
467	0.44
468	0.42
469	0.36
470	0.35
471	0.35
472	0.34
473	0.28
474	0.24
475	0.23
476	0.23
477	0.22
478	0.16
479	0.09
480	0.08
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.11
485	0.16
486	0.16
487	0.18
488	0.21
489	0.22
490	0.23
491	0.23
492	0.21
493	0.16
494	0.17
495	0.15
496	0.12
497	0.11
498	0.11
499	0.11
500	0.11
501	0.11
502	0.09
503	0.11
504	0.11
505	0.1
506	0.09
507	0.08
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.07
515	0.08
516	0.08
517	0.11
518	0.11
519	0.12
520	0.16
521	0.2
522	0.19
523	0.19
524	0.2
525	0.18
526	0.21
527	0.22
528	0.18
529	0.14
530	0.14
531	0.13
532	0.13
533	0.12
534	0.09
535	0.09
536	0.11
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.1
541	0.1
542	0.12
543	0.12
544	0.1
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.12
549	0.11
550	0.09
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.06
556	0.06
557	0.11
558	0.13
559	0.18
560	0.19
561	0.21
562	0.22
563	0.28
564	0.35
565	0.36
566	0.37
567	0.35
568	0.35
569	0.33
570	0.33
571	0.3
572	0.23
573	0.19
574	0.19
575	0.17
576	0.16
577	0.16
578	0.14
579	0.13
580	0.14
581	0.12
582	0.11
583	0.15
584	0.16
585	0.18
586	0.21
587	0.2
588	0.22
589	0.28
590	0.29
591	0.33
592	0.39
593	0.4
594	0.41
595	0.41
596	0.38
597	0.33
598	0.32
599	0.23
600	0.16
601	0.13
602	0.1
603	0.09
604	0.09
605	0.1
606	0.09
607	0.08
608	0.09
609	0.1
610	0.14
611	0.16
612	0.17
613	0.16
614	0.17
615	0.19
616	0.23
617	0.25
618	0.25
619	0.29
620	0.35
621	0.37
622	0.45
623	0.51
624	0.54
625	0.56
626	0.56
627	0.57
628	0.53
629	0.58
630	0.58
631	0.54
632	0.5
633	0.52
634	0.49
635	0.44
636	0.44

A0A1Y2MHA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer