Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2MFK1

Protein Details
Accession A0A1Y2MFK1    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-281DSTSDQPSKKRNHVENRFQRIKAHydrophilic
309-331VTKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-103PKKATKAKKA
313-325KGFTKEKNKGKRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKSDKNITAPANVQSDLDLVQAFLKQNGHESAASSLKDFAAWATKQAAKPDEKSDEKSDDSSDASSDSDSDSSSGSSSDSDSSSDEEEAAPAPKKATKAKKAKSVSSSSSDSSDDSSAASSDSDSSSSSDSDSDSDSDSSSSESEDEKPAKAKKVKQAASVASSSASSSSDSDSDSDSDSDSDSDSSSDSSSDSDSDDEPTKKDSSSSDSDSSSDSSDSSDSSDDETKEPASAASSDSSATLSATSPPLPSNKRKADDSTSDQPSKKRNHVENRFQRIKADVEVRPELASNAYVSYDYADRAHAKLIVTKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGLIDTSGGKGFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.24
4 0.19
5 0.17
6 0.12
7 0.09
8 0.09
9 0.12
10 0.12
11 0.14
12 0.15
13 0.15
14 0.19
15 0.21
16 0.23
17 0.21
18 0.22
19 0.23
20 0.26
21 0.26
22 0.22
23 0.21
24 0.18
25 0.18
26 0.16
27 0.13
28 0.16
29 0.16
30 0.17
31 0.21
32 0.27
33 0.29
34 0.34
35 0.39
36 0.37
37 0.4
38 0.45
39 0.48
40 0.47
41 0.51
42 0.51
43 0.49
44 0.47
45 0.45
46 0.4
47 0.33
48 0.3
49 0.25
50 0.2
51 0.16
52 0.14
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.12
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.12
81 0.14
82 0.18
83 0.27
84 0.36
85 0.43
86 0.53
87 0.59
88 0.67
89 0.71
90 0.73
91 0.71
92 0.67
93 0.62
94 0.56
95 0.52
96 0.44
97 0.4
98 0.34
99 0.28
100 0.23
101 0.2
102 0.14
103 0.11
104 0.1
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.19
137 0.22
138 0.28
139 0.33
140 0.37
141 0.41
142 0.49
143 0.51
144 0.52
145 0.54
146 0.49
147 0.46
148 0.4
149 0.32
150 0.23
151 0.2
152 0.15
153 0.1
154 0.09
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.1
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.17
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.17
194 0.21
195 0.25
196 0.25
197 0.24
198 0.25
199 0.25
200 0.25
201 0.2
202 0.15
203 0.11
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.15
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.18
237 0.23
238 0.3
239 0.38
240 0.45
241 0.48
242 0.51
243 0.55
244 0.55
245 0.57
246 0.58
247 0.56
248 0.56
249 0.57
250 0.56
251 0.55
252 0.56
253 0.56
254 0.57
255 0.58
256 0.6
257 0.66
258 0.74
259 0.81
260 0.84
261 0.87
262 0.85
263 0.76
264 0.68
265 0.61
266 0.53
267 0.47
268 0.44
269 0.36
270 0.35
271 0.37
272 0.36
273 0.33
274 0.31
275 0.26
276 0.2
277 0.18
278 0.12
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.11
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.18
291 0.18
292 0.18
293 0.22
294 0.28
295 0.32
296 0.32
297 0.35
298 0.38
299 0.41
300 0.48
301 0.47
302 0.51
303 0.54
304 0.63
305 0.69
306 0.75
307 0.78
308 0.79
309 0.83
310 0.84
311 0.81
312 0.8
313 0.76
314 0.72
315 0.67
316 0.61
317 0.53
318 0.43
319 0.39
320 0.3
321 0.27
322 0.23
323 0.19
324 0.16