Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2M6M6

Protein Details
Accession A0A1Y2M6M6    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-94APAAKPTKATKGKKKAEPAPEANHydrophilic
118-139APAPKAKAAKAKKSKKEPVAEVHydrophilic
355-378RPVWEKRVEKENKRRTARAKDLKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-59KKRKVASETAPKAKKPRKSDDIAAPAPAKPAKSPKAAKAAPAPAAKKSARK
75-87AKPTKATKGKKKA
110-134KKETPKKEAPAPKAKAAKAKKSKKE
155-161KAKKGKK
341-374RNKKAGLAMERGAERPVWEKRVEKENKRRTARAK
424-431AKKSKKAA
487-502AAAEKPKAKKAKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAAADVASKKRKVASETAPKAKKPRKSDDIAAPAPAKPAKSPKAAKAAPAPAAKKSARKTAEDFMSEDEAPAPAAKPTKATKGKKKAEPAPEANGDEDESMLDFDVIEAKKETPKKEAPAPKAKAAKAKKSKKEPVAEVEVVEEVVEVPVAKATKAKKGKKAQEEPVEEAVEIDAVVTEDGDVEDAVEDDQTAALLAGFSSDDSDTDNDIDFPEDSAVVPKLTKSQKKAIARAKDTPKATEPGVIYVGRVPRGFFEPQMKKYFSQFGRVLNLRLSRNKKTGASKHYAFVEFASAEVADIVARTMNNYLMFGHILRVALIPKEQVNANLFKGANTRFKVDPRNKKAGLAMERGAERPVWEKRVEKENKRRTARAKDLKDSMDYEFTTPGVKSVDTVKANKALEPAPNSAEQQLLTEAAADSSTKAKKSKKAAAAAAAKAAPAPVVEETVVAQTVVEDVPASSEAPAKRATRKRTSTTTTTEVVAEKPAAAEKPKAKKAKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.56
3 0.64
4 0.72
5 0.73
6 0.72
7 0.77
8 0.77
9 0.75
10 0.73
11 0.74
12 0.73
13 0.74
14 0.78
15 0.78
16 0.79
17 0.72
18 0.68
19 0.59
20 0.51
21 0.48
22 0.42
23 0.33
24 0.29
25 0.36
26 0.38
27 0.45
28 0.51
29 0.53
30 0.61
31 0.61
32 0.61
33 0.61
34 0.61
35 0.58
36 0.59
37 0.54
38 0.47
39 0.52
40 0.51
41 0.5
42 0.49
43 0.51
44 0.49
45 0.52
46 0.54
47 0.55
48 0.58
49 0.52
50 0.49
51 0.43
52 0.43
53 0.37
54 0.32
55 0.24
56 0.18
57 0.16
58 0.15
59 0.12
60 0.1
61 0.13
62 0.13
63 0.18
64 0.22
65 0.32
66 0.41
67 0.5
68 0.58
69 0.66
70 0.75
71 0.78
72 0.84
73 0.83
74 0.82
75 0.82
76 0.76
77 0.72
78 0.68
79 0.61
80 0.53
81 0.45
82 0.35
83 0.26
84 0.21
85 0.14
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.11
93 0.1
94 0.12
95 0.13
96 0.14
97 0.21
98 0.26
99 0.29
100 0.31
101 0.37
102 0.4
103 0.49
104 0.57
105 0.59
106 0.65
107 0.67
108 0.67
109 0.68
110 0.66
111 0.65
112 0.64
113 0.66
114 0.66
115 0.72
116 0.74
117 0.77
118 0.84
119 0.83
120 0.83
121 0.77
122 0.73
123 0.71
124 0.62
125 0.52
126 0.43
127 0.35
128 0.26
129 0.21
130 0.14
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.03
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.1
140 0.12
141 0.22
142 0.32
143 0.39
144 0.47
145 0.57
146 0.66
147 0.72
148 0.79
149 0.79
150 0.79
151 0.76
152 0.71
153 0.65
154 0.56
155 0.45
156 0.37
157 0.27
158 0.18
159 0.12
160 0.07
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.14
209 0.2
210 0.25
211 0.28
212 0.35
213 0.43
214 0.48
215 0.57
216 0.58
217 0.6
218 0.59
219 0.63
220 0.62
221 0.61
222 0.56
223 0.5
224 0.44
225 0.38
226 0.34
227 0.29
228 0.23
229 0.18
230 0.2
231 0.17
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.11
239 0.14
240 0.15
241 0.14
242 0.22
243 0.27
244 0.31
245 0.36
246 0.36
247 0.34
248 0.35
249 0.42
250 0.33
251 0.34
252 0.32
253 0.3
254 0.34
255 0.34
256 0.33
257 0.28
258 0.32
259 0.28
260 0.33
261 0.37
262 0.36
263 0.38
264 0.4
265 0.41
266 0.45
267 0.5
268 0.49
269 0.5
270 0.47
271 0.46
272 0.46
273 0.42
274 0.34
275 0.26
276 0.21
277 0.14
278 0.13
279 0.11
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.09
297 0.08
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.12
311 0.14
312 0.16
313 0.16
314 0.2
315 0.19
316 0.18
317 0.22
318 0.23
319 0.27
320 0.26
321 0.3
322 0.27
323 0.32
324 0.42
325 0.48
326 0.55
327 0.56
328 0.64
329 0.61
330 0.6
331 0.59
332 0.57
333 0.53
334 0.46
335 0.39
336 0.33
337 0.34
338 0.32
339 0.29
340 0.21
341 0.17
342 0.18
343 0.21
344 0.22
345 0.24
346 0.28
347 0.32
348 0.42
349 0.5
350 0.55
351 0.62
352 0.68
353 0.75
354 0.78
355 0.8
356 0.79
357 0.8
358 0.81
359 0.8
360 0.77
361 0.74
362 0.73
363 0.68
364 0.62
365 0.54
366 0.45
367 0.39
368 0.32
369 0.27
370 0.22
371 0.19
372 0.18
373 0.16
374 0.14
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.14
379 0.22
380 0.24
381 0.27
382 0.28
383 0.34
384 0.34
385 0.35
386 0.33
387 0.28
388 0.3
389 0.31
390 0.31
391 0.27
392 0.28
393 0.28
394 0.26
395 0.25
396 0.2
397 0.17
398 0.15
399 0.13
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.13
408 0.16
409 0.19
410 0.25
411 0.32
412 0.39
413 0.48
414 0.57
415 0.59
416 0.64
417 0.66
418 0.68
419 0.69
420 0.62
421 0.57
422 0.47
423 0.38
424 0.3
425 0.26
426 0.17
427 0.1
428 0.11
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.11
435 0.11
436 0.09
437 0.08
438 0.06
439 0.08
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.05
444 0.07
445 0.08
446 0.09
447 0.08
448 0.14
449 0.14
450 0.17
451 0.23
452 0.25
453 0.35
454 0.43
455 0.52
456 0.57
457 0.65
458 0.7
459 0.74
460 0.77
461 0.75
462 0.73
463 0.69
464 0.6
465 0.53
466 0.48
467 0.4
468 0.33
469 0.29
470 0.22
471 0.17
472 0.16
473 0.18
474 0.19
475 0.21
476 0.28
477 0.34
478 0.44
479 0.53
480 0.62
481 0.64
482 0.71