FuNGI

A0A1Y2MGB6

Protein Details

Accession

A0A1Y2MGB6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-126	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAREAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
416-450	KKRKEVTDRQAAKRAQREAHQNRGRGGGRGGRGGH

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_pero 7.5, nucl 7, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPAMFRWLSQKYPKIVSNVVEDRPKKVGDEVIPVDRTKPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDGPAPKTEADMMVAIFAYTDRVVGMVRPRKLLYMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAREAAEKDEERAEFVKMLNSQKASRGEDINSIEEVVEKTWDSNAITPGTPFMHLLAESLQYWCAYKFTTDPSWKDMKVIISDASVPGEGEHKIMNFVRSQRAMPTHDPNTSHVIYGLDADLIMLSLATHEPRFRVLREDVFADSLKDKVCTRCGRKGHIRNNCEFPDDGKKLTEEEADEEWASSEQRIKPYIWLHTGILREYLAVEMDTPKRKFSYDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRDQGIDLLISIWRDLAAEMDDYVTKDGFPDMRRVQQILSALAGKEAGIFKKRKEVTDRQAAKRAQREAHQNRGRGGGRGGRGGHNDGAPPFKRVKEDTSTYMNSGVLFFAPEDAQSSEVRSAHKDVLHNRDAQTNKSAAARLKELMKAKAEGTAPPTDESTPASESASGADTPVHLGKRKADEVDDADSATPGRTTPVVPDDPVQAEKKADGPDEDTIMLWEPGYEERYYQQKFHVAPDDIAFRNKVARQYAEGLCWVLAYYMQGCPSWTWYFPHHYAPFAADFVGLEDMEPRELFEKGQPFHPYEQLMGVLPAASNHAIPEPFRVLMEDPESPIYDFYPVDFPIDLNGKKFAWQGVAVLPFIDEKRLLEAMATKYPELSPDEKQRNEFGKETLMFSTEGKLFGDANTALYRTAVKKHTIDHTKSGALHGEIEPHDLFVPDSQLVPPFDADGATDFEIVQDGSMRVYYEMPPLTAANAHKSVLLKGVKLPPSVLSEGEKAAVKRNQDRGGYRGGRGGGRGGYDRGGRGGGSYNNGGYNDRNNGGYNNHNNNNNNGYAAGPPGFSAPPFVPGAQAWPPPMGMSGIPPPPPGWVPPPGFGAPGGFAPQGPPGFAPPGAQQGQRQQWGGQQQPRGPPPAHSGGNGYGGANRDGYSGGGYGGGRDSYQGGGGGGRNGGGYQGNSPYNDRPRNDRGGGRGRGGYRGGYGGGGNDGRWKEGSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.55
3	0.55
4	0.56
5	0.52
6	0.52
7	0.51
8	0.51
9	0.53
10	0.51
11	0.49
12	0.49
13	0.46
14	0.39
15	0.36
16	0.38
17	0.32
18	0.4
19	0.4
20	0.43
21	0.45
22	0.43
23	0.44
24	0.42
25	0.42
26	0.41
27	0.44
28	0.44
29	0.47
30	0.51
31	0.52
32	0.5
33	0.53
34	0.47
35	0.42
36	0.36
37	0.3
38	0.27
39	0.22
40	0.19
41	0.13
42	0.1
43	0.08
44	0.09
45	0.09
46	0.09
47	0.1
48	0.13
49	0.17
50	0.19
51	0.19
52	0.22
53	0.29
54	0.35
55	0.38
56	0.38
57	0.36
58	0.34
59	0.35
60	0.32
61	0.25
62	0.2
63	0.17
64	0.14
65	0.12
66	0.12
67	0.1
68	0.08
69	0.08
70	0.08
71	0.07
72	0.07
73	0.06
74	0.06
75	0.07
76	0.1
77	0.2
78	0.26
79	0.29
80	0.33
81	0.34
82	0.35
83	0.37
84	0.38
85	0.32
86	0.32
87	0.3
88	0.27
89	0.27
90	0.25
91	0.25
92	0.23
93	0.19
94	0.12
95	0.15
96	0.21
97	0.29
98	0.39
99	0.47
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.84
105	0.82
106	0.8
107	0.8
108	0.79
109	0.78
110	0.79
111	0.72
112	0.67
113	0.69
114	0.63
115	0.55
116	0.5
117	0.41
118	0.34
119	0.32
120	0.29
121	0.21
122	0.2
123	0.23
124	0.23
125	0.28
126	0.3
127	0.32
128	0.32
129	0.37
130	0.43
131	0.42
132	0.41
133	0.39
134	0.36
135	0.39
136	0.41
137	0.36
138	0.3
139	0.26
140	0.22
141	0.2
142	0.19
143	0.13
144	0.12
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.13
149	0.13
150	0.15
151	0.18
152	0.18
153	0.19
154	0.18
155	0.2
156	0.19
157	0.18
158	0.15
159	0.13
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.13
167	0.12
168	0.11
169	0.12
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.11
174	0.12
175	0.18
176	0.26
177	0.32
178	0.34
179	0.39
180	0.45
181	0.43
182	0.43
183	0.4
184	0.34
185	0.3
186	0.3
187	0.24
188	0.19
189	0.2
190	0.19
191	0.17
192	0.13
193	0.11
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.13
201	0.15
202	0.16
203	0.18
204	0.21
205	0.27
206	0.28
207	0.29
208	0.3
209	0.34
210	0.38
211	0.4
212	0.44
213	0.42
214	0.44
215	0.45
216	0.42
217	0.44
218	0.39
219	0.34
220	0.26
221	0.22
222	0.18
223	0.18
224	0.15
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.05
230	0.04
231	0.03
232	0.02
233	0.03
234	0.05
235	0.06
236	0.07
237	0.08
238	0.09
239	0.14
240	0.17
241	0.17
242	0.23
243	0.25
244	0.29
245	0.3
246	0.32
247	0.28
248	0.28
249	0.27
250	0.23
251	0.19
252	0.17
253	0.16
254	0.15
255	0.17
256	0.18
257	0.26
258	0.33
259	0.39
260	0.47
261	0.51
262	0.58
263	0.66
264	0.73
265	0.75
266	0.76
267	0.76
268	0.72
269	0.74
270	0.67
271	0.59
272	0.49
273	0.42
274	0.42
275	0.38
276	0.34
277	0.27
278	0.27
279	0.25
280	0.26
281	0.24
282	0.16
283	0.17
284	0.17
285	0.17
286	0.17
287	0.16
288	0.15
289	0.13
290	0.12
291	0.1
292	0.14
293	0.15
294	0.18
295	0.21
296	0.21
297	0.25
298	0.29
299	0.33
300	0.31
301	0.3
302	0.28
303	0.3
304	0.3
305	0.25
306	0.23
307	0.18
308	0.14
309	0.12
310	0.12
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.09
315	0.15
316	0.22
317	0.22
318	0.24
319	0.25
320	0.25
321	0.28
322	0.29
323	0.35
324	0.36
325	0.42
326	0.42
327	0.42
328	0.42
329	0.41
330	0.35
331	0.24
332	0.16
333	0.1
334	0.08
335	0.07
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.08
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.08
350	0.12
351	0.14
352	0.15
353	0.14
354	0.15
355	0.14
356	0.14
357	0.13
358	0.08
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.1
381	0.11
382	0.17
383	0.19
384	0.25
385	0.26
386	0.27
387	0.26
388	0.25
389	0.26
390	0.19
391	0.18
392	0.14
393	0.12
394	0.11
395	0.11
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.1
400	0.15
401	0.16
402	0.17
403	0.26
404	0.29
405	0.31
406	0.38
407	0.45
408	0.47
409	0.57
410	0.64
411	0.59
412	0.66
413	0.64
414	0.62
415	0.59
416	0.56
417	0.48
418	0.45
419	0.52
420	0.5
421	0.58
422	0.57
423	0.53
424	0.49
425	0.54
426	0.5
427	0.4
428	0.36
429	0.3
430	0.26
431	0.27
432	0.27
433	0.23
434	0.24
435	0.25
436	0.23
437	0.19
438	0.19
439	0.16
440	0.2
441	0.18
442	0.19
443	0.19
444	0.19
445	0.22
446	0.23
447	0.27
448	0.27
449	0.3
450	0.31
451	0.34
452	0.34
453	0.31
454	0.3
455	0.26
456	0.2
457	0.17
458	0.13
459	0.07
460	0.06
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.06
466	0.06
467	0.08
468	0.08
469	0.09
470	0.11
471	0.12
472	0.13
473	0.13
474	0.15
475	0.16
476	0.19
477	0.21
478	0.25
479	0.31
480	0.33
481	0.33
482	0.32
483	0.35
484	0.34
485	0.32
486	0.29
487	0.22
488	0.21
489	0.2
490	0.21
491	0.17
492	0.18
493	0.18
494	0.16
495	0.18
496	0.21
497	0.22
498	0.23
499	0.22
500	0.21
501	0.2
502	0.23
503	0.21
504	0.18
505	0.18
506	0.18
507	0.17
508	0.17
509	0.17
510	0.13
511	0.13
512	0.13
513	0.12
514	0.11
515	0.1
516	0.1
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.07
522	0.06
523	0.06
524	0.05
525	0.06
526	0.09
527	0.09
528	0.1
529	0.11
530	0.14
531	0.18
532	0.19
533	0.19
534	0.18
535	0.19
536	0.2
537	0.22
538	0.19
539	0.15
540	0.13
541	0.13
542	0.12
543	0.1
544	0.07
545	0.04
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.07
550	0.11
551	0.12
552	0.12
553	0.14
554	0.14
555	0.15
556	0.17
557	0.17
558	0.13
559	0.13
560	0.13
561	0.15
562	0.15
563	0.14
564	0.12
565	0.14
566	0.14
567	0.15
568	0.14
569	0.11
570	0.1
571	0.1
572	0.09
573	0.06
574	0.05
575	0.05
576	0.06
577	0.08
578	0.07
579	0.07
580	0.09
581	0.17
582	0.18
583	0.18
584	0.19
585	0.23
586	0.24
587	0.27
588	0.31
589	0.25
590	0.24
591	0.25
592	0.27
593	0.22
594	0.23
595	0.2
596	0.14
597	0.16
598	0.17
599	0.2
600	0.18
601	0.18
602	0.2
603	0.25
604	0.26
605	0.23
606	0.22
607	0.18
608	0.16
609	0.14
610	0.12
611	0.06
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.06
616	0.07
617	0.07
618	0.08
619	0.08
620	0.12
621	0.13
622	0.13
623	0.14
624	0.16
625	0.22
626	0.24
627	0.31
628	0.27
629	0.27
630	0.26
631	0.26
632	0.24
633	0.18
634	0.16
635	0.09
636	0.08
637	0.08
638	0.08
639	0.06
640	0.05
641	0.06
642	0.06
643	0.07
644	0.07
645	0.06
646	0.07
647	0.07
648	0.08
649	0.11
650	0.16
651	0.17
652	0.22
653	0.24
654	0.25
655	0.27
656	0.29
657	0.26
658	0.21
659	0.21
660	0.17
661	0.14
662	0.11
663	0.09
664	0.07
665	0.06
666	0.05
667	0.06
668	0.06
669	0.05
670	0.06
671	0.07
672	0.07
673	0.08
674	0.11
675	0.11
676	0.11
677	0.11
678	0.12
679	0.12
680	0.13
681	0.16
682	0.14
683	0.13
684	0.14
685	0.14
686	0.13
687	0.13
688	0.11
689	0.1
690	0.09
691	0.09
692	0.11
693	0.1
694	0.11
695	0.11
696	0.11
697	0.12
698	0.17
699	0.17
700	0.15
701	0.17
702	0.16
703	0.18
704	0.19
705	0.17
706	0.14
707	0.13
708	0.14
709	0.15
710	0.16
711	0.14
712	0.13
713	0.13
714	0.12
715	0.12
716	0.12
717	0.08
718	0.07
719	0.1
720	0.11
721	0.1
722	0.1
723	0.14
724	0.16
725	0.2
726	0.21
727	0.18
728	0.18
729	0.18
730	0.2
731	0.19
732	0.19
733	0.21
734	0.3
735	0.38
736	0.39
737	0.41
738	0.45
739	0.46
740	0.47
741	0.43
742	0.35
743	0.34
744	0.33
745	0.33
746	0.27
747	0.23
748	0.2
749	0.18
750	0.2
751	0.15
752	0.14
753	0.12
754	0.13
755	0.12
756	0.11
757	0.14
758	0.1
759	0.11
760	0.12
761	0.12
762	0.11
763	0.11
764	0.13
765	0.12
766	0.18
767	0.19
768	0.23
769	0.24
770	0.28
771	0.37
772	0.44
773	0.46
774	0.45
775	0.46
776	0.45
777	0.43
778	0.41
779	0.34
780	0.25
781	0.24
782	0.18
783	0.19
784	0.17
785	0.2
786	0.18
787	0.16
788	0.16
789	0.14
790	0.14
791	0.1
792	0.12
793	0.09
794	0.1
795	0.1
796	0.13
797	0.13
798	0.14
799	0.13
800	0.11
801	0.11
802	0.1
803	0.1
804	0.08
805	0.1
806	0.1
807	0.1
808	0.09
809	0.09
810	0.1
811	0.09
812	0.07
813	0.06
814	0.06
815	0.06
816	0.07
817	0.07
818	0.08
819	0.09
820	0.11
821	0.14
822	0.14
823	0.14
824	0.15
825	0.15
826	0.15
827	0.17
828	0.17
829	0.18
830	0.19
831	0.19
832	0.2
833	0.2
834	0.21
835	0.24
836	0.24
837	0.2
838	0.24
839	0.31
840	0.33
841	0.33
842	0.33
843	0.28
844	0.31
845	0.32
846	0.28
847	0.23
848	0.21
849	0.21
850	0.22
851	0.22
852	0.17
853	0.24
854	0.25
855	0.28
856	0.34
857	0.42
858	0.46
859	0.49
860	0.52
861	0.47
862	0.54
863	0.52
864	0.45
865	0.41
866	0.38
867	0.33
868	0.31
869	0.3
870	0.22
871	0.21
872	0.22
873	0.19
874	0.2
875	0.2
876	0.2
877	0.18
878	0.17
879	0.15
880	0.14
881	0.17
882	0.16
883	0.17
884	0.18
885	0.18
886	0.19
887	0.21
888	0.21
889	0.19
890	0.21
891	0.22
892	0.22
893	0.23
894	0.22
895	0.23
896	0.25
897	0.32
898	0.36
899	0.4
900	0.44
901	0.5
902	0.5
903	0.53
904	0.53
905	0.45
906	0.36
907	0.28
908	0.24
909	0.18
910	0.19
911	0.15
912	0.11
913	0.11
914	0.13
915	0.13
916	0.11
917	0.14
918	0.12
919	0.15
920	0.17
921	0.17
922	0.16
923	0.15
924	0.2
925	0.21
926	0.23
927	0.21
928	0.2
929	0.2
930	0.19
931	0.2
932	0.16
933	0.12
934	0.13
935	0.17
936	0.2
937	0.22
938	0.22
939	0.22
940	0.23
941	0.25
942	0.25
943	0.23
944	0.27
945	0.29
946	0.31
947	0.36
948	0.33
949	0.33
950	0.3
951	0.26
952	0.19
953	0.17
954	0.18
955	0.13
956	0.12
957	0.13
958	0.17
959	0.16
960	0.16
961	0.16
962	0.15
963	0.18
964	0.18
965	0.19
966	0.17
967	0.24
968	0.26
969	0.28
970	0.29
971	0.36
972	0.43
973	0.45
974	0.45
975	0.38
976	0.41
977	0.48
978	0.52
979	0.5
980	0.49
981	0.51
982	0.57
983	0.6
984	0.6
985	0.53
986	0.48
987	0.48
988	0.49
989	0.45
990	0.38
991	0.38
992	0.35
993	0.38
994	0.34
995	0.27
996	0.22
997	0.22
998	0.22
999	0.19
1000	0.17
1001	0.13
1002	0.13
1003	0.13
1004	0.12
1005	0.1
1006	0.09
1007	0.11
1008	0.1
1009	0.1
1010	0.12
1011	0.12
1012	0.1
1013	0.11
1014	0.12
1015	0.1
1016	0.11
1017	0.11
1018	0.1
1019	0.11
1020	0.13
1021	0.13
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.11
1025	0.1
1026	0.12
1027	0.12
1028	0.12
1029	0.13
1030	0.19
1031	0.21
1032	0.23
1033	0.27
1034	0.34
1035	0.42
1036	0.49
1037	0.5
1038	0.52
1039	0.57
1040	0.64
1041	0.66
1042	0.62
1043	0.61
1044	0.64
1045	0.65
1046	0.61
1047	0.6
1048	0.53
1049	0.52
1050	0.48
1051	0.41
1052	0.32
1053	0.29
1054	0.25
1055	0.2
1056	0.19
1057	0.15
1058	0.18
1059	0.17
1060	0.15
1061	0.2
1062	0.2
1063	0.21

A0A1Y2MGB6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer