Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UQM4

Protein Details
Accession A0A1Y1UQM4    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-342SSKKSTSRIHSPDKRNRSRRNGSVQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-248KGGKRKIRRL
269-279PSGAKKDKKRV
315-335RPSSKKSTSRIHSPDKRNRSR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045183  Ebi-like  
IPR006594  LisH  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSHTAIWDMANDPKLTSVDFDPATYDPTRDVDEDEEEDIGVLGPKCELSSVEINILIYLYLVESNLSHTAFALLSESQLASTSLFRYFNPHYPSPSAPINSKGKGVATNGTPGPSKSPTDSLFGKSDRRIPRGELIRKLWKAIRWEAVERHVQPNGDPYPNQCPNPFHLLIPHVCPSSYASSASNPPLPLPSALTLSPLPSKAPEPFPPLPEDEEDDQQAIAGPSSSKSKQEEGASSVKGGKRKIRRLSIGSERNDESTRSASPAVPPPSGAKKDKKRVRVSEGSEVESLRATRGRNGKEFTYDGMDRQTNGTKRPSSKKSTSRIHSPDKRNRSRRNGSVQADEEMDVDGEDKVKNAVKKQGPLWLSQEDISVHTDHRDMVTALAWNPRNLDVLATGSGDGSGRMWDFHSDAEPRPRTLSNPQKSLVLSHKSIDAGRKSVTCLAWHPDGTVVATGSQDGVGRLFTPSGHLQGIMSYGRGIINALKFSPSGSTILVAKTDFTVCLFLVGNNYNQDMKASFESHTKEVNDIDWLDDHVFASGGNDHTIFVFRTNDRRPRYTLKGHTDDVTKIAWSPVAKDGQADSTDRLLASVSDDGNCMIWKLPAYPEDRGTSSRSISPVKPSASARDGKEGKEDDDYFAGNASLPGIDHCIQKLVVVANSENRRMDTLQWSPSCKEGRMILAAGGQDSTVKLFNALTGECLHTLNGFESGTGSIAFSPLAQGLIAVGGWDGRLGIYNVGSGVLVKEYEIEEDPGRQSSREKPMMLTMAWREDGDQLAVGLYNKTLMTVNVGDLGQANIEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.22
4 0.18
5 0.21
6 0.21
7 0.21
8 0.21
9 0.21
10 0.25
11 0.23
12 0.22
13 0.17
14 0.19
15 0.22
16 0.2
17 0.22
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.24
22 0.22
23 0.18
24 0.18
25 0.15
26 0.13
27 0.13
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.11
35 0.13
36 0.18
37 0.19
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.21
42 0.2
43 0.14
44 0.09
45 0.07
46 0.06
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.09
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.12
70 0.14
71 0.15
72 0.15
73 0.21
74 0.26
75 0.33
76 0.38
77 0.4
78 0.41
79 0.45
80 0.47
81 0.45
82 0.47
83 0.42
84 0.37
85 0.42
86 0.44
87 0.41
88 0.4
89 0.37
90 0.32
91 0.33
92 0.32
93 0.29
94 0.24
95 0.28
96 0.27
97 0.28
98 0.27
99 0.24
100 0.26
101 0.25
102 0.26
103 0.24
104 0.29
105 0.28
106 0.32
107 0.34
108 0.33
109 0.36
110 0.36
111 0.38
112 0.36
113 0.43
114 0.46
115 0.47
116 0.46
117 0.45
118 0.51
119 0.56
120 0.6
121 0.59
122 0.58
123 0.64
124 0.62
125 0.63
126 0.58
127 0.52
128 0.51
129 0.5
130 0.5
131 0.45
132 0.49
133 0.48
134 0.48
135 0.52
136 0.48
137 0.46
138 0.41
139 0.37
140 0.32
141 0.36
142 0.36
143 0.32
144 0.29
145 0.28
146 0.36
147 0.41
148 0.43
149 0.38
150 0.37
151 0.38
152 0.45
153 0.43
154 0.33
155 0.31
156 0.33
157 0.32
158 0.33
159 0.32
160 0.24
161 0.23
162 0.23
163 0.23
164 0.23
165 0.22
166 0.19
167 0.17
168 0.2
169 0.23
170 0.26
171 0.26
172 0.22
173 0.21
174 0.21
175 0.21
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.17
182 0.16
183 0.17
184 0.18
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.17
189 0.19
190 0.23
191 0.26
192 0.32
193 0.34
194 0.36
195 0.37
196 0.37
197 0.35
198 0.32
199 0.32
200 0.26
201 0.25
202 0.24
203 0.21
204 0.19
205 0.16
206 0.16
207 0.11
208 0.08
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.13
213 0.14
214 0.17
215 0.19
216 0.22
217 0.26
218 0.29
219 0.3
220 0.3
221 0.33
222 0.3
223 0.28
224 0.31
225 0.29
226 0.29
227 0.3
228 0.34
229 0.39
230 0.48
231 0.56
232 0.59
233 0.64
234 0.64
235 0.68
236 0.7
237 0.69
238 0.63
239 0.58
240 0.51
241 0.47
242 0.43
243 0.36
244 0.28
245 0.22
246 0.2
247 0.18
248 0.18
249 0.16
250 0.18
251 0.25
252 0.27
253 0.24
254 0.24
255 0.26
256 0.32
257 0.37
258 0.39
259 0.41
260 0.47
261 0.58
262 0.64
263 0.7
264 0.73
265 0.75
266 0.77
267 0.76
268 0.72
269 0.71
270 0.66
271 0.59
272 0.51
273 0.43
274 0.35
275 0.27
276 0.22
277 0.13
278 0.14
279 0.11
280 0.16
281 0.24
282 0.28
283 0.31
284 0.34
285 0.34
286 0.35
287 0.35
288 0.31
289 0.29
290 0.25
291 0.21
292 0.22
293 0.21
294 0.18
295 0.2
296 0.24
297 0.21
298 0.24
299 0.29
300 0.3
301 0.36
302 0.44
303 0.49
304 0.51
305 0.58
306 0.63
307 0.66
308 0.7
309 0.68
310 0.69
311 0.7
312 0.72
313 0.72
314 0.74
315 0.75
316 0.77
317 0.82
318 0.83
319 0.85
320 0.85
321 0.84
322 0.81
323 0.81
324 0.79
325 0.71
326 0.67
327 0.59
328 0.5
329 0.42
330 0.35
331 0.26
332 0.17
333 0.14
334 0.08
335 0.07
336 0.05
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.09
342 0.11
343 0.13
344 0.22
345 0.24
346 0.27
347 0.28
348 0.33
349 0.32
350 0.32
351 0.34
352 0.26
353 0.24
354 0.21
355 0.21
356 0.15
357 0.15
358 0.14
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.14
375 0.14
376 0.15
377 0.14
378 0.13
379 0.08
380 0.08
381 0.09
382 0.08
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.09
397 0.11
398 0.13
399 0.21
400 0.21
401 0.21
402 0.23
403 0.23
404 0.24
405 0.31
406 0.4
407 0.37
408 0.4
409 0.4
410 0.4
411 0.39
412 0.39
413 0.36
414 0.3
415 0.25
416 0.22
417 0.22
418 0.21
419 0.22
420 0.24
421 0.19
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.18
426 0.2
427 0.2
428 0.16
429 0.17
430 0.18
431 0.19
432 0.19
433 0.18
434 0.15
435 0.14
436 0.13
437 0.12
438 0.08
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.08
453 0.09
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.12
460 0.09
461 0.08
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.09
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.11
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.1
480 0.1
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.08
485 0.09
486 0.08
487 0.07
488 0.08
489 0.07
490 0.09
491 0.09
492 0.08
493 0.11
494 0.12
495 0.13
496 0.12
497 0.14
498 0.13
499 0.12
500 0.13
501 0.1
502 0.12
503 0.13
504 0.13
505 0.13
506 0.17
507 0.2
508 0.21
509 0.24
510 0.22
511 0.21
512 0.2
513 0.2
514 0.18
515 0.15
516 0.14
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.1
521 0.1
522 0.08
523 0.07
524 0.06
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.12
536 0.13
537 0.21
538 0.29
539 0.37
540 0.41
541 0.44
542 0.48
543 0.52
544 0.58
545 0.6
546 0.61
547 0.62
548 0.62
549 0.6
550 0.57
551 0.52
552 0.45
553 0.38
554 0.29
555 0.2
556 0.15
557 0.14
558 0.14
559 0.11
560 0.13
561 0.16
562 0.18
563 0.17
564 0.18
565 0.18
566 0.19
567 0.21
568 0.2
569 0.16
570 0.15
571 0.16
572 0.15
573 0.14
574 0.11
575 0.09
576 0.1
577 0.11
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.11
583 0.11
584 0.09
585 0.07
586 0.08
587 0.08
588 0.1
589 0.12
590 0.17
591 0.21
592 0.23
593 0.26
594 0.28
595 0.29
596 0.3
597 0.31
598 0.28
599 0.26
600 0.27
601 0.27
602 0.28
603 0.28
604 0.33
605 0.35
606 0.35
607 0.37
608 0.35
609 0.38
610 0.39
611 0.43
612 0.38
613 0.42
614 0.42
615 0.39
616 0.44
617 0.4
618 0.36
619 0.37
620 0.36
621 0.29
622 0.28
623 0.27
624 0.2
625 0.19
626 0.17
627 0.1
628 0.09
629 0.07
630 0.06
631 0.05
632 0.06
633 0.1
634 0.12
635 0.13
636 0.14
637 0.15
638 0.15
639 0.15
640 0.18
641 0.15
642 0.15
643 0.16
644 0.17
645 0.23
646 0.26
647 0.29
648 0.28
649 0.26
650 0.27
651 0.26
652 0.29
653 0.28
654 0.3
655 0.36
656 0.38
657 0.41
658 0.4
659 0.45
660 0.44
661 0.38
662 0.36
663 0.3
664 0.31
665 0.3
666 0.29
667 0.23
668 0.23
669 0.22
670 0.19
671 0.16
672 0.12
673 0.09
674 0.09
675 0.1
676 0.08
677 0.08
678 0.09
679 0.09
680 0.1
681 0.12
682 0.12
683 0.12
684 0.13
685 0.15
686 0.15
687 0.16
688 0.14
689 0.12
690 0.13
691 0.13
692 0.13
693 0.11
694 0.1
695 0.1
696 0.11
697 0.11
698 0.1
699 0.09
700 0.07
701 0.08
702 0.08
703 0.06
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.06
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.05
713 0.04
714 0.04
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.04
719 0.06
720 0.07
721 0.08
722 0.08
723 0.09
724 0.09
725 0.1
726 0.09
727 0.08
728 0.08
729 0.08
730 0.07
731 0.07
732 0.08
733 0.09
734 0.12
735 0.13
736 0.15
737 0.15
738 0.19
739 0.2
740 0.24
741 0.24
742 0.23
743 0.25
744 0.31
745 0.4
746 0.44
747 0.44
748 0.41
749 0.47
750 0.49
751 0.46
752 0.43
753 0.37
754 0.36
755 0.35
756 0.33
757 0.28
758 0.26
759 0.27
760 0.22
761 0.18
762 0.12
763 0.12
764 0.13
765 0.13
766 0.11
767 0.09
768 0.1
769 0.1
770 0.11
771 0.11
772 0.1
773 0.15
774 0.15
775 0.16
776 0.18
777 0.18
778 0.17
779 0.17
780 0.17