Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1U7L8

Protein Details
Accession A0A1Y1U7L8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
88-107SSDEQPKRARGRPKKSTGVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-102KRARGRPKK
194-210REKRRRKSSAGVSAKKP
Subcellular Location(s) cyto 8.5cyto_nucl 8.5, nucl 7.5, mito 5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MSVPPSDVYLQPDFDGSSLKVAQLRGILLQHDISLPPSAKKADLVAAFESQVQARASELNQSAKPSSKGIVRVKDGKQVEGTTESEASSDEQPKRARGRPKKSTGVSVEIPVPRRTRRTESMTPARTSPPDSPAVEAEEEEEPAIHISVEQTPRAKVKSDTEESKKPKTPRRSEDSGFSDYNPFQSGGEEGSDREKRRRKSSAGVSAKKPTQPRYSEPAPRSDTPSLKRVGPSKDSLKTPPRDQTDSVGKTPSKTPSKIAKPSIATRPAPPAGAPPVDNRPPLIAIPLTMLFLILMSSITGWQKASQEIGFCDTGSSTNNLLLARTAAIEAANSCIARRTAQALDDPSAPRVECDVSALPLLPFIPRPSTCAPCPQHAACANGRFYGCKHEYVYSENPLGEVFSALNGMPFFGPRAFPPTCRPDTVRKRLIGTLAKEMEKDLARGRGAIVCAGYGAEDGRRGPGERFGLEESKLKARYFNRRDPKFTPEQFSEIYDAALADLVEHDDVIESIDADGRSWYTSARPEFNLSCKIKLAVFSLFRKWRSQLIGSGIVLVIISYLRSTLRHRRAEKYQAEELVQVVLKRLQDQESLHYTDPVTTPNPFIPPTQLRDLVLPPKGSSNSRTRLWQRVQDLVEANANVSVREQEVKGEIWKTWEWAGVGEQRRVSFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.15
4 0.17
5 0.17
6 0.18
7 0.2
8 0.2
9 0.22
10 0.21
11 0.22
12 0.2
13 0.21
14 0.2
15 0.19
16 0.19
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.14
21 0.18
22 0.18
23 0.18
24 0.21
25 0.23
26 0.22
27 0.23
28 0.24
29 0.25
30 0.26
31 0.28
32 0.26
33 0.26
34 0.26
35 0.25
36 0.24
37 0.18
38 0.19
39 0.16
40 0.13
41 0.13
42 0.15
43 0.15
44 0.21
45 0.24
46 0.26
47 0.27
48 0.31
49 0.33
50 0.35
51 0.36
52 0.31
53 0.31
54 0.31
55 0.38
56 0.43
57 0.48
58 0.5
59 0.57
60 0.58
61 0.63
62 0.59
63 0.53
64 0.49
65 0.42
66 0.38
67 0.33
68 0.32
69 0.26
70 0.25
71 0.21
72 0.18
73 0.17
74 0.17
75 0.18
76 0.25
77 0.24
78 0.3
79 0.33
80 0.4
81 0.47
82 0.52
83 0.57
84 0.61
85 0.69
86 0.73
87 0.79
88 0.82
89 0.78
90 0.8
91 0.74
92 0.7
93 0.61
94 0.53
95 0.5
96 0.44
97 0.44
98 0.4
99 0.4
100 0.39
101 0.43
102 0.47
103 0.49
104 0.52
105 0.58
106 0.61
107 0.66
108 0.72
109 0.72
110 0.67
111 0.62
112 0.58
113 0.51
114 0.47
115 0.4
116 0.34
117 0.34
118 0.32
119 0.32
120 0.29
121 0.3
122 0.26
123 0.23
124 0.21
125 0.16
126 0.15
127 0.13
128 0.11
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.13
136 0.15
137 0.17
138 0.18
139 0.21
140 0.25
141 0.26
142 0.27
143 0.25
144 0.3
145 0.36
146 0.41
147 0.47
148 0.51
149 0.59
150 0.62
151 0.66
152 0.66
153 0.66
154 0.69
155 0.71
156 0.75
157 0.74
158 0.77
159 0.77
160 0.72
161 0.72
162 0.69
163 0.63
164 0.54
165 0.46
166 0.41
167 0.34
168 0.32
169 0.25
170 0.2
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.1
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.16
179 0.21
180 0.23
181 0.32
182 0.39
183 0.44
184 0.52
185 0.59
186 0.57
187 0.61
188 0.69
189 0.71
190 0.73
191 0.73
192 0.69
193 0.68
194 0.66
195 0.61
196 0.57
197 0.52
198 0.5
199 0.49
200 0.5
201 0.51
202 0.55
203 0.59
204 0.56
205 0.58
206 0.55
207 0.51
208 0.53
209 0.5
210 0.49
211 0.43
212 0.46
213 0.4
214 0.37
215 0.38
216 0.38
217 0.38
218 0.36
219 0.38
220 0.39
221 0.42
222 0.43
223 0.46
224 0.49
225 0.49
226 0.49
227 0.52
228 0.5
229 0.5
230 0.48
231 0.47
232 0.48
233 0.47
234 0.44
235 0.41
236 0.36
237 0.33
238 0.36
239 0.38
240 0.34
241 0.32
242 0.37
243 0.41
244 0.49
245 0.55
246 0.55
247 0.52
248 0.5
249 0.54
250 0.55
251 0.52
252 0.45
253 0.4
254 0.42
255 0.37
256 0.33
257 0.28
258 0.23
259 0.2
260 0.2
261 0.19
262 0.16
263 0.21
264 0.24
265 0.24
266 0.21
267 0.19
268 0.19
269 0.18
270 0.17
271 0.11
272 0.08
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.08
277 0.08
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.09
292 0.11
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.13
297 0.12
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.08
305 0.08
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.05
321 0.05
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.11
327 0.11
328 0.12
329 0.15
330 0.15
331 0.16
332 0.18
333 0.18
334 0.15
335 0.15
336 0.14
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.08
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.1
353 0.1
354 0.15
355 0.19
356 0.22
357 0.23
358 0.32
359 0.33
360 0.32
361 0.37
362 0.32
363 0.34
364 0.33
365 0.35
366 0.29
367 0.31
368 0.29
369 0.26
370 0.26
371 0.21
372 0.19
373 0.24
374 0.23
375 0.21
376 0.22
377 0.22
378 0.23
379 0.28
380 0.31
381 0.25
382 0.25
383 0.23
384 0.21
385 0.18
386 0.17
387 0.11
388 0.08
389 0.05
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.05
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.14
403 0.14
404 0.16
405 0.22
406 0.28
407 0.31
408 0.33
409 0.36
410 0.41
411 0.5
412 0.58
413 0.59
414 0.53
415 0.54
416 0.53
417 0.55
418 0.51
419 0.43
420 0.41
421 0.37
422 0.36
423 0.33
424 0.31
425 0.29
426 0.23
427 0.22
428 0.17
429 0.18
430 0.17
431 0.18
432 0.18
433 0.17
434 0.16
435 0.16
436 0.13
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.07
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.08
447 0.09
448 0.1
449 0.11
450 0.16
451 0.18
452 0.18
453 0.2
454 0.22
455 0.23
456 0.23
457 0.26
458 0.24
459 0.27
460 0.3
461 0.27
462 0.31
463 0.35
464 0.44
465 0.49
466 0.56
467 0.6
468 0.64
469 0.7
470 0.67
471 0.69
472 0.68
473 0.64
474 0.61
475 0.53
476 0.51
477 0.45
478 0.43
479 0.38
480 0.28
481 0.23
482 0.17
483 0.14
484 0.1
485 0.09
486 0.07
487 0.04
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.08
504 0.09
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.17
509 0.2
510 0.24
511 0.25
512 0.29
513 0.32
514 0.36
515 0.43
516 0.39
517 0.37
518 0.34
519 0.34
520 0.3
521 0.29
522 0.27
523 0.24
524 0.28
525 0.29
526 0.37
527 0.41
528 0.43
529 0.44
530 0.44
531 0.43
532 0.43
533 0.43
534 0.39
535 0.39
536 0.41
537 0.37
538 0.36
539 0.3
540 0.24
541 0.2
542 0.15
543 0.09
544 0.04
545 0.04
546 0.03
547 0.04
548 0.05
549 0.08
550 0.15
551 0.25
552 0.35
553 0.45
554 0.5
555 0.57
556 0.65
557 0.73
558 0.74
559 0.7
560 0.67
561 0.6
562 0.57
563 0.5
564 0.41
565 0.34
566 0.29
567 0.21
568 0.17
569 0.17
570 0.17
571 0.18
572 0.21
573 0.2
574 0.24
575 0.25
576 0.3
577 0.32
578 0.36
579 0.34
580 0.33
581 0.31
582 0.29
583 0.28
584 0.25
585 0.22
586 0.19
587 0.21
588 0.22
589 0.25
590 0.23
591 0.24
592 0.29
593 0.32
594 0.36
595 0.4
596 0.4
597 0.37
598 0.39
599 0.43
600 0.42
601 0.41
602 0.37
603 0.32
604 0.35
605 0.38
606 0.38
607 0.39
608 0.41
609 0.42
610 0.44
611 0.52
612 0.53
613 0.59
614 0.64
615 0.66
616 0.61
617 0.63
618 0.62
619 0.58
620 0.54
621 0.47
622 0.43
623 0.35
624 0.3
625 0.24
626 0.23
627 0.17
628 0.16
629 0.15
630 0.12
631 0.16
632 0.15
633 0.16
634 0.18
635 0.21
636 0.24
637 0.25
638 0.24
639 0.26
640 0.27
641 0.27
642 0.26
643 0.27
644 0.23
645 0.22
646 0.26
647 0.3
648 0.34
649 0.36
650 0.38