Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1U6A3

Protein Details
Accession A0A1Y1U6A3    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-297KGLSGSGRRHKKPRRSSQRAAHLSDBasic
353-378PDPWTFEGSKARKRNKRPKAGSTGMNHydrophilic
446-468EEHVSECKAQKLRRRKDKGKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-289REGKGLSGSGRRHKKPRRSS
362-372KARKRNKRPKA
456-468KLRRRKDKGKAKA
Subcellular Location(s) nucl 9, cyto 8.5, cyto_mito 7.5, mito 5.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001719  AP_endonuc_2  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
IPR013022  Xyl_isomerase-like_TIM-brl  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016853  F:isomerase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01261  AP_endonuc_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51432  AP_NUCLEASE_F2_4  
Amino Acid Sequences MQQARDFGVRLLVFHLGNTGQVDAEEHERVVAATAKRIRKLLKKVPEVDLAVETMTDRCCGETSHSLDAIQRFITLVNMPGRVKFCMDLCHVYMQFDLAETEARGEFLRAVEGLGREAIAAVHLSDSLEKHGTRKDSHTNLDFGYIGSDAFREILRHPSFSRVPIILETPGYFCGNRDRDQGVPAQIGCLERARHELEIQLINRITDATDEEWAADWISIRKNHRKEKAQIETKIRNLVMRTGGTLRDTLLANRAAVNGKLCAVGRHWAREGKGLSGSGRRHKKPRRSSQRAAHLSDPISSIRETRAMTVSSRRRQELRERKEARANAAQRPSFREESWVRGSSLFSDHSPEPDPWTFEGSKARKRNKRPKAGSTGMNWPRRVDIRDSPASASGGCPVELSPVNLGHPSLYDTLNGDRQPSPGPSRLRRELPGEEERLGSDATAIEEHVSECKAQKLRRRKDKGKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.14
4 0.16
5 0.16
6 0.14
7 0.1
8 0.1
9 0.12
10 0.12
11 0.16
12 0.15
13 0.14
14 0.13
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.18
19 0.15
20 0.22
21 0.3
22 0.36
23 0.39
24 0.44
25 0.5
26 0.53
27 0.62
28 0.65
29 0.67
30 0.71
31 0.73
32 0.74
33 0.73
34 0.65
35 0.57
36 0.48
37 0.38
38 0.29
39 0.23
40 0.18
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.17
49 0.23
50 0.27
51 0.31
52 0.31
53 0.31
54 0.34
55 0.34
56 0.3
57 0.23
58 0.18
59 0.14
60 0.13
61 0.15
62 0.11
63 0.15
64 0.16
65 0.2
66 0.2
67 0.24
68 0.26
69 0.25
70 0.26
71 0.23
72 0.21
73 0.23
74 0.26
75 0.27
76 0.27
77 0.32
78 0.31
79 0.3
80 0.28
81 0.23
82 0.19
83 0.15
84 0.14
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.09
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.1
96 0.08
97 0.08
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.07
114 0.09
115 0.12
116 0.12
117 0.15
118 0.19
119 0.23
120 0.25
121 0.3
122 0.37
123 0.39
124 0.45
125 0.45
126 0.42
127 0.39
128 0.38
129 0.32
130 0.22
131 0.18
132 0.12
133 0.09
134 0.07
135 0.07
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.17
142 0.18
143 0.21
144 0.22
145 0.27
146 0.29
147 0.29
148 0.32
149 0.23
150 0.23
151 0.21
152 0.22
153 0.16
154 0.15
155 0.14
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.11
160 0.11
161 0.18
162 0.21
163 0.22
164 0.25
165 0.26
166 0.26
167 0.27
168 0.3
169 0.23
170 0.21
171 0.19
172 0.16
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.15
180 0.16
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.16
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.17
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.12
193 0.08
194 0.09
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.1
206 0.14
207 0.19
208 0.27
209 0.35
210 0.43
211 0.51
212 0.57
213 0.61
214 0.67
215 0.72
216 0.71
217 0.7
218 0.69
219 0.66
220 0.6
221 0.57
222 0.47
223 0.39
224 0.31
225 0.28
226 0.22
227 0.18
228 0.17
229 0.14
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.15
252 0.16
253 0.18
254 0.2
255 0.21
256 0.22
257 0.27
258 0.27
259 0.23
260 0.23
261 0.2
262 0.2
263 0.23
264 0.26
265 0.3
266 0.37
267 0.4
268 0.49
269 0.57
270 0.66
271 0.71
272 0.79
273 0.81
274 0.83
275 0.87
276 0.86
277 0.88
278 0.84
279 0.77
280 0.68
281 0.6
282 0.51
283 0.43
284 0.35
285 0.24
286 0.19
287 0.16
288 0.15
289 0.12
290 0.15
291 0.14
292 0.15
293 0.17
294 0.16
295 0.18
296 0.26
297 0.34
298 0.38
299 0.41
300 0.42
301 0.43
302 0.47
303 0.56
304 0.58
305 0.57
306 0.61
307 0.62
308 0.64
309 0.69
310 0.66
311 0.61
312 0.59
313 0.56
314 0.52
315 0.55
316 0.52
317 0.46
318 0.5
319 0.5
320 0.43
321 0.39
322 0.4
323 0.34
324 0.38
325 0.43
326 0.39
327 0.33
328 0.31
329 0.32
330 0.26
331 0.27
332 0.22
333 0.16
334 0.19
335 0.18
336 0.2
337 0.22
338 0.21
339 0.24
340 0.24
341 0.26
342 0.23
343 0.28
344 0.26
345 0.25
346 0.35
347 0.35
348 0.43
349 0.49
350 0.59
351 0.62
352 0.73
353 0.82
354 0.83
355 0.88
356 0.87
357 0.87
358 0.87
359 0.84
360 0.79
361 0.72
362 0.72
363 0.69
364 0.67
365 0.58
366 0.5
367 0.48
368 0.47
369 0.46
370 0.42
371 0.41
372 0.42
373 0.47
374 0.48
375 0.45
376 0.43
377 0.4
378 0.33
379 0.26
380 0.22
381 0.18
382 0.16
383 0.14
384 0.12
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.15
389 0.15
390 0.17
391 0.17
392 0.17
393 0.13
394 0.13
395 0.14
396 0.14
397 0.13
398 0.13
399 0.15
400 0.18
401 0.24
402 0.24
403 0.24
404 0.23
405 0.24
406 0.27
407 0.31
408 0.33
409 0.35
410 0.43
411 0.48
412 0.56
413 0.62
414 0.64
415 0.63
416 0.63
417 0.62
418 0.61
419 0.61
420 0.56
421 0.5
422 0.45
423 0.41
424 0.36
425 0.3
426 0.22
427 0.14
428 0.11
429 0.11
430 0.1
431 0.1
432 0.09
433 0.1
434 0.11
435 0.12
436 0.12
437 0.13
438 0.14
439 0.22
440 0.28
441 0.34
442 0.44
443 0.53
444 0.63
445 0.72
446 0.81
447 0.84
448 0.87