FuNGI

A0A1Y1U7W7

Protein Details

Accession

A0A1Y1U7W7

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-28	DGGGLFLSRKRNRTRARPPPPNGSSS	Hydrophilic
640-660	SADPSRKKKKSGSSTPTPGPE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-19	KRNRTRAR
479-483	KDKDK
487-491	RARSR
627-633	NKRKPSP
639-649	GSADPSRKKKK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 9.5, mito 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSDGGGLFLSRKRNRTRARPPPPNGSSSHAPSPSLAGNPLRAGSSSSAGPSPRPVNAGSPSTSSDPSKIVEFKLLSSGLENDIRYNVMRMNSVRDVDPRSITRPILMNRKEPGPKAPPAFATNEQGKIIGRYVYDKHGKPVLDANGEQVIEKRDEKDLALVGGAPNQPPKRAGRRGVKEVYHQDIEVIRLRREEHMPWIIESQTPKDEKEAGAMPEHWVGRITEPASMPSVLLVNDGTMGMGFKVVPLGRSYRFEPERPFKVLDADSANKLYEHQTKFRMHDRWAHREGGPSSGPSSEVSSLRSAAAVLAQEQRARALESRLTQRAGVAPKVKREKFEDDYKREGRMLERGLEGGADEELDYDFKEEFQDDEENNTFYQDREEEEEAKLQEEQLKKEFKLANANVGDRPQIEEDEDDDDDDLFGDGLNQEGKRLRKMMRKRGVMEDEFGTSESDDSDTETVKSQPTDQKEKDKEGEKEKDKDKETDRARSREPSAAPSDRSSRPQSRGPHSRGTSSPTSRRPQLPNPGKASTAPPGSGSALLAQRAAGGGVSPRHSRQTSPVGRGQSPVEGSRAGSPAAGSREASPTPSASGGSGRKPGQHPIGQPQKRKTPVASQSPGPSPGSSSNKRKPSPTTSAGGSADPSRKKKKSGSSTPTPGPEDQFPNIITREEVINWFRNGRKSIVPMSEAISAFKDRIKSAGERQGDNQKVFLSIVQSLTTAEPDRKLKLRDGVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.74
3	0.81
4	0.82
5	0.88
6	0.9
7	0.89
8	0.89
9	0.84
10	0.78
11	0.7
12	0.66
13	0.61
14	0.57
15	0.57
16	0.48
17	0.44
18	0.4
19	0.4
20	0.35
21	0.3
22	0.28
23	0.23
24	0.24
25	0.25
26	0.25
27	0.22
28	0.2
29	0.21
30	0.19
31	0.19
32	0.17
33	0.18
34	0.2
35	0.2
36	0.21
37	0.25
38	0.26
39	0.25
40	0.27
41	0.26
42	0.29
43	0.33
44	0.36
45	0.31
46	0.31
47	0.32
48	0.33
49	0.35
50	0.31
51	0.28
52	0.26
53	0.25
54	0.28
55	0.27
56	0.25
57	0.28
58	0.27
59	0.26
60	0.29
61	0.28
62	0.23
63	0.22
64	0.22
65	0.2
66	0.22
67	0.22
68	0.18
69	0.19
70	0.2
71	0.19
72	0.18
73	0.18
74	0.16
75	0.21
76	0.21
77	0.27
78	0.29
79	0.3
80	0.31
81	0.32
82	0.35
83	0.34
84	0.37
85	0.33
86	0.34
87	0.36
88	0.34
89	0.33
90	0.36
91	0.39
92	0.44
93	0.45
94	0.47
95	0.46
96	0.54
97	0.56
98	0.51
99	0.53
100	0.49
101	0.52
102	0.5
103	0.5
104	0.46
105	0.44
106	0.47
107	0.42
108	0.42
109	0.39
110	0.37
111	0.34
112	0.31
113	0.29
114	0.25
115	0.23
116	0.18
117	0.15
118	0.17
119	0.19
120	0.26
121	0.34
122	0.33
123	0.36
124	0.39
125	0.38
126	0.36
127	0.4
128	0.37
129	0.34
130	0.33
131	0.32
132	0.3
133	0.3
134	0.28
135	0.23
136	0.2
137	0.19
138	0.2
139	0.19
140	0.19
141	0.2
142	0.2
143	0.21
144	0.2
145	0.17
146	0.15
147	0.14
148	0.12
149	0.15
150	0.16
151	0.14
152	0.2
153	0.21
154	0.22
155	0.24
156	0.31
157	0.36
158	0.43
159	0.51
160	0.55
161	0.62
162	0.69
163	0.73
164	0.69
165	0.67
166	0.65
167	0.62
168	0.53
169	0.44
170	0.37
171	0.31
172	0.31
173	0.3
174	0.27
175	0.22
176	0.22
177	0.24
178	0.26
179	0.28
180	0.28
181	0.28
182	0.31
183	0.31
184	0.31
185	0.31
186	0.28
187	0.27
188	0.26
189	0.23
190	0.23
191	0.23
192	0.22
193	0.23
194	0.24
195	0.22
196	0.24
197	0.24
198	0.2
199	0.21
200	0.21
201	0.2
202	0.22
203	0.22
204	0.18
205	0.15
206	0.14
207	0.13
208	0.16
209	0.15
210	0.14
211	0.15
212	0.16
213	0.17
214	0.16
215	0.15
216	0.11
217	0.12
218	0.09
219	0.09
220	0.07
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.03
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.09
235	0.13
236	0.14
237	0.18
238	0.2
239	0.26
240	0.29
241	0.32
242	0.38
243	0.42
244	0.45
245	0.45
246	0.45
247	0.37
248	0.38
249	0.35
250	0.3
251	0.28
252	0.25
253	0.23
254	0.22
255	0.22
256	0.17
257	0.17
258	0.19
259	0.22
260	0.24
261	0.26
262	0.31
263	0.35
264	0.39
265	0.45
266	0.45
267	0.39
268	0.45
269	0.48
270	0.51
271	0.51
272	0.5
273	0.43
274	0.45
275	0.43
276	0.38
277	0.32
278	0.24
279	0.22
280	0.19
281	0.19
282	0.13
283	0.14
284	0.12
285	0.12
286	0.13
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.12
291	0.1
292	0.08
293	0.08
294	0.06
295	0.07
296	0.09
297	0.1
298	0.11
299	0.11
300	0.12
301	0.11
302	0.12
303	0.12
304	0.11
305	0.14
306	0.17
307	0.22
308	0.24
309	0.24
310	0.23
311	0.22
312	0.24
313	0.23
314	0.24
315	0.25
316	0.25
317	0.32
318	0.41
319	0.41
320	0.4
321	0.43
322	0.46
323	0.45
324	0.53
325	0.55
326	0.51
327	0.57
328	0.56
329	0.52
330	0.46
331	0.42
332	0.33
333	0.29
334	0.25
335	0.2
336	0.18
337	0.17
338	0.16
339	0.15
340	0.13
341	0.08
342	0.06
343	0.04
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.07
356	0.1
357	0.09
358	0.13
359	0.13
360	0.14
361	0.13
362	0.14
363	0.12
364	0.09
365	0.11
366	0.08
367	0.08
368	0.12
369	0.14
370	0.15
371	0.15
372	0.18
373	0.17
374	0.17
375	0.16
376	0.12
377	0.15
378	0.15
379	0.17
380	0.19
381	0.22
382	0.22
383	0.28
384	0.3
385	0.27
386	0.34
387	0.33
388	0.35
389	0.33
390	0.34
391	0.29
392	0.27
393	0.26
394	0.17
395	0.18
396	0.12
397	0.11
398	0.1
399	0.09
400	0.1
401	0.12
402	0.12
403	0.1
404	0.09
405	0.09
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.04
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.04
414	0.06
415	0.05
416	0.07
417	0.11
418	0.13
419	0.15
420	0.2
421	0.25
422	0.33
423	0.43
424	0.52
425	0.58
426	0.63
427	0.64
428	0.67
429	0.68
430	0.6
431	0.52
432	0.42
433	0.34
434	0.28
435	0.25
436	0.17
437	0.11
438	0.1
439	0.08
440	0.07
441	0.06
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.09
447	0.1
448	0.11
449	0.11
450	0.15
451	0.19
452	0.25
453	0.34
454	0.36
455	0.45
456	0.48
457	0.53
458	0.54
459	0.56
460	0.55
461	0.55
462	0.61
463	0.57
464	0.6
465	0.61
466	0.63
467	0.58
468	0.59
469	0.54
470	0.54
471	0.53
472	0.56
473	0.57
474	0.55
475	0.56
476	0.55
477	0.54
478	0.51
479	0.47
480	0.42
481	0.42
482	0.41
483	0.39
484	0.37
485	0.39
486	0.36
487	0.39
488	0.41
489	0.41
490	0.42
491	0.47
492	0.51
493	0.55
494	0.62
495	0.62
496	0.64
497	0.59
498	0.59
499	0.53
500	0.52
501	0.51
502	0.47
503	0.5
504	0.49
505	0.52
506	0.53
507	0.59
508	0.59
509	0.6
510	0.64
511	0.66
512	0.66
513	0.67
514	0.63
515	0.57
516	0.52
517	0.47
518	0.41
519	0.34
520	0.26
521	0.21
522	0.21
523	0.21
524	0.2
525	0.16
526	0.15
527	0.14
528	0.14
529	0.13
530	0.11
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.06
535	0.04
536	0.07
537	0.09
538	0.13
539	0.15
540	0.17
541	0.23
542	0.24
543	0.25
544	0.29
545	0.37
546	0.41
547	0.44
548	0.48
549	0.47
550	0.47
551	0.48
552	0.43
553	0.36
554	0.31
555	0.27
556	0.23
557	0.19
558	0.19
559	0.2
560	0.2
561	0.16
562	0.14
563	0.13
564	0.15
565	0.17
566	0.17
567	0.15
568	0.16
569	0.19
570	0.2
571	0.21
572	0.19
573	0.17
574	0.17
575	0.17
576	0.16
577	0.13
578	0.18
579	0.2
580	0.22
581	0.27
582	0.27
583	0.32
584	0.34
585	0.4
586	0.41
587	0.43
588	0.44
589	0.48
590	0.58
591	0.59
592	0.65
593	0.66
594	0.68
595	0.68
596	0.68
597	0.63
598	0.62
599	0.64
600	0.66
601	0.62
602	0.57
603	0.57
604	0.56
605	0.55
606	0.46
607	0.37
608	0.31
609	0.35
610	0.4
611	0.42
612	0.49
613	0.55
614	0.63
615	0.65
616	0.67
617	0.67
618	0.67
619	0.67
620	0.63
621	0.58
622	0.51
623	0.53
624	0.49
625	0.42
626	0.35
627	0.32
628	0.34
629	0.37
630	0.42
631	0.47
632	0.5
633	0.56
634	0.63
635	0.68
636	0.71
637	0.75
638	0.76
639	0.77
640	0.81
641	0.8
642	0.78
643	0.71
644	0.62
645	0.55
646	0.52
647	0.47
648	0.41
649	0.38
650	0.32
651	0.32
652	0.31
653	0.28
654	0.22
655	0.18
656	0.19
657	0.17
658	0.22
659	0.23
660	0.27
661	0.29
662	0.33
663	0.36
664	0.4
665	0.42
666	0.4
667	0.41
668	0.41
669	0.47
670	0.46
671	0.44
672	0.39
673	0.39
674	0.41
675	0.35
676	0.31
677	0.27
678	0.23
679	0.22
680	0.24
681	0.24
682	0.19
683	0.22
684	0.25
685	0.28
686	0.35
687	0.43
688	0.45
689	0.45
690	0.5
691	0.57
692	0.59
693	0.54
694	0.48
695	0.39
696	0.36
697	0.33
698	0.3
699	0.23
700	0.19
701	0.19
702	0.18
703	0.17
704	0.17
705	0.18
706	0.19
707	0.19
708	0.19
709	0.24
710	0.27
711	0.33
712	0.38
713	0.41
714	0.44

A0A1Y1U7W7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer