Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UMP7

Protein Details
Accession A0A1Y1UMP7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-128GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
950-974LAVRYYFPRQKHKHRSVILRGYRPQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
990-1005GPGPDRRGGPGGNRGG
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSRKYPKIVSQVVEDTPAKVRDGDGEVVEVPIRYESANPNGFEVDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEIFKYTERVVNMARPRKVLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAADKEEERREAIKMFEAMGHPVSEETRNQKGWDTNAITPGTPFMDLLSNSLKYWISYKLTNDPGWKDLKVIISDSSVPGEGEHKIVDWIRRQRSYSDWDPNTSHVMYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFFQGSKGPQTCKNCGQPGHLAANCKSEKLLKDPNIVEKAKPVDPKPFIFLDISVLREYLAIELNVPGVPFPFDLELSIDDWIFMIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDALLKIWKAELPRMGGYLTNHGKVNMARAQVILEGVAKNEDEIFQRRKEDEDRQGEREKRRRIEDHRRQDMAQEAKANGHSEPGSMQLNGTEYVQVTPSATARGGPLHPSLPTRTGFDTVPTEAANGSKRMTADQREAAALRAGPDAISAMQGSNQEAIQSRKAVRIANMSAAERLKAELAGDLDSDEEETNPDGAAGDQPVTVEKTEDDEKEEMTLGDAEEALEEQAEDDGVDQTILPPAVEANGEEGEAIIDLPGDEPQNVVPPTDERTEGDEEQSVERTGAGRKRKAEEVEDDAADGAEEGSDIEAPPDEESNQVVSKKKLKVNPDGTVEGYEDDVRLWEPGYRERYYEKKFGVSLSDTAFVSEITRAYMEGLCWVLEYYYQGVPAWDWFYPYHYAPFAQDFQNVGALNITFETAAPFTPFAQLLGVFPAASRIHLPEPLQPLMTDEDSPIIDFYPDDFDIDMNGKKMAWQGVALLPFIDQTRLLAALASKVDQLTPDEQRRNRWGEARMFISDGHALFDAFCKLYTLKAGSSPMPIDSRLSQGTNGQVLADPLVVPNSALDSPLPSISECPDLTTNNSLAVRYYFPRQKHKHRSVILRGYRPQAAVLTESDRDWTRRGGPGPDRRGGPGGNRGGGRGGYSNGGPGMSHANHGGPRRDGYGGAGGPRDGQRYPSGSGAPYHAPPAPATGGPGYGGGYGGGGGYGGYGYGSSAPYAAGQGYPSHGRDRDYRGPPPQSAYGGYAPPPPSRNPYAPPPAPAHPYGGAPAPSYGGSYGTYGGNGGYPPQNGYGGYGGAAPSRGPPNGGGGSYGGQGGGHNPYAHSRAPPPPPPSRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.65
3 0.69
4 0.7
5 0.63
6 0.61
7 0.59
8 0.53
9 0.5
10 0.43
11 0.36
12 0.35
13 0.34
14 0.29
15 0.24
16 0.24
17 0.23
18 0.27
19 0.27
20 0.22
21 0.22
22 0.22
23 0.22
24 0.22
25 0.17
26 0.13
27 0.11
28 0.11
29 0.09
30 0.12
31 0.16
32 0.24
33 0.3
34 0.3
35 0.31
36 0.32
37 0.32
38 0.29
39 0.27
40 0.2
41 0.16
42 0.16
43 0.14
44 0.12
45 0.13
46 0.12
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.17
55 0.2
56 0.2
57 0.27
58 0.33
59 0.36
60 0.41
61 0.4
62 0.4
63 0.39
64 0.42
65 0.36
66 0.33
67 0.28
68 0.24
69 0.22
70 0.17
71 0.15
72 0.11
73 0.1
74 0.07
75 0.09
76 0.09
77 0.13
78 0.14
79 0.17
80 0.2
81 0.28
82 0.37
83 0.45
84 0.47
85 0.45
86 0.46
87 0.45
88 0.44
89 0.39
90 0.33
91 0.29
92 0.27
93 0.25
94 0.24
95 0.21
96 0.21
97 0.18
98 0.15
99 0.1
100 0.13
101 0.2
102 0.26
103 0.37
104 0.46
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.81
110 0.78
111 0.74
112 0.75
113 0.72
114 0.68
115 0.69
116 0.62
117 0.58
118 0.57
119 0.51
120 0.42
121 0.4
122 0.34
123 0.29
124 0.27
125 0.25
126 0.23
127 0.25
128 0.27
129 0.22
130 0.22
131 0.22
132 0.22
133 0.22
134 0.21
135 0.19
136 0.15
137 0.15
138 0.16
139 0.15
140 0.19
141 0.22
142 0.27
143 0.29
144 0.3
145 0.34
146 0.36
147 0.37
148 0.42
149 0.41
150 0.37
151 0.41
152 0.41
153 0.36
154 0.32
155 0.3
156 0.22
157 0.17
158 0.15
159 0.1
160 0.13
161 0.13
162 0.16
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.21
167 0.2
168 0.16
169 0.19
170 0.21
171 0.2
172 0.23
173 0.27
174 0.33
175 0.38
176 0.41
177 0.44
178 0.41
179 0.42
180 0.42
181 0.39
182 0.32
183 0.3
184 0.31
185 0.27
186 0.25
187 0.22
188 0.21
189 0.22
190 0.21
191 0.19
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.12
201 0.15
202 0.2
203 0.26
204 0.35
205 0.41
206 0.46
207 0.47
208 0.47
209 0.5
210 0.53
211 0.54
212 0.55
213 0.5
214 0.5
215 0.5
216 0.49
217 0.48
218 0.4
219 0.31
220 0.22
221 0.2
222 0.15
223 0.15
224 0.13
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.14
240 0.17
241 0.16
242 0.2
243 0.23
244 0.27
245 0.28
246 0.29
247 0.26
248 0.28
249 0.27
250 0.23
251 0.25
252 0.21
253 0.23
254 0.24
255 0.26
256 0.29
257 0.36
258 0.41
259 0.44
260 0.51
261 0.52
262 0.51
263 0.53
264 0.51
265 0.5
266 0.51
267 0.46
268 0.42
269 0.38
270 0.44
271 0.4
272 0.34
273 0.3
274 0.27
275 0.28
276 0.31
277 0.39
278 0.35
279 0.42
280 0.44
281 0.51
282 0.54
283 0.53
284 0.46
285 0.42
286 0.41
287 0.39
288 0.41
289 0.36
290 0.37
291 0.4
292 0.42
293 0.4
294 0.37
295 0.34
296 0.29
297 0.27
298 0.23
299 0.21
300 0.21
301 0.17
302 0.16
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.09
307 0.09
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.07
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.08
362 0.09
363 0.12
364 0.14
365 0.17
366 0.18
367 0.19
368 0.19
369 0.19
370 0.19
371 0.24
372 0.24
373 0.22
374 0.22
375 0.21
376 0.23
377 0.21
378 0.26
379 0.21
380 0.2
381 0.18
382 0.18
383 0.18
384 0.16
385 0.16
386 0.11
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.15
397 0.19
398 0.2
399 0.24
400 0.24
401 0.28
402 0.32
403 0.37
404 0.41
405 0.47
406 0.5
407 0.52
408 0.59
409 0.62
410 0.66
411 0.67
412 0.66
413 0.62
414 0.64
415 0.67
416 0.69
417 0.74
418 0.76
419 0.78
420 0.78
421 0.74
422 0.67
423 0.61
424 0.59
425 0.51
426 0.43
427 0.35
428 0.27
429 0.26
430 0.27
431 0.26
432 0.18
433 0.16
434 0.13
435 0.11
436 0.11
437 0.12
438 0.12
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.08
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.08
457 0.1
458 0.1
459 0.12
460 0.13
461 0.13
462 0.14
463 0.15
464 0.17
465 0.18
466 0.18
467 0.18
468 0.18
469 0.19
470 0.18
471 0.18
472 0.19
473 0.16
474 0.16
475 0.14
476 0.12
477 0.11
478 0.12
479 0.12
480 0.1
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.13
485 0.17
486 0.19
487 0.21
488 0.22
489 0.22
490 0.22
491 0.22
492 0.2
493 0.17
494 0.14
495 0.11
496 0.09
497 0.08
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.04
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.08
511 0.1
512 0.12
513 0.12
514 0.14
515 0.15
516 0.17
517 0.19
518 0.19
519 0.19
520 0.22
521 0.22
522 0.22
523 0.23
524 0.21
525 0.21
526 0.2
527 0.18
528 0.13
529 0.13
530 0.09
531 0.08
532 0.07
533 0.06
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.06
541 0.05
542 0.04
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.08
561 0.11
562 0.11
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.13
567 0.14
568 0.1
569 0.08
570 0.08
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.02
583 0.02
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.03
589 0.04
590 0.05
591 0.05
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.04
606 0.02
607 0.02
608 0.02
609 0.03
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.05
615 0.09
616 0.09
617 0.09
618 0.09
619 0.1
620 0.13
621 0.14
622 0.15
623 0.11
624 0.15
625 0.18
626 0.18
627 0.18
628 0.16
629 0.16
630 0.16
631 0.16
632 0.12
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.11
637 0.16
638 0.22
639 0.25
640 0.29
641 0.32
642 0.36
643 0.37
644 0.37
645 0.35
646 0.35
647 0.33
648 0.29
649 0.26
650 0.22
651 0.19
652 0.15
653 0.11
654 0.05
655 0.02
656 0.02
657 0.02
658 0.02
659 0.03
660 0.03
661 0.03
662 0.03
663 0.04
664 0.04
665 0.05
666 0.05
667 0.06
668 0.06
669 0.08
670 0.1
671 0.12
672 0.14
673 0.17
674 0.23
675 0.29
676 0.34
677 0.37
678 0.41
679 0.49
680 0.53
681 0.55
682 0.52
683 0.48
684 0.43
685 0.39
686 0.34
687 0.24
688 0.18
689 0.13
690 0.09
691 0.07
692 0.07
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.07
697 0.08
698 0.14
699 0.2
700 0.2
701 0.21
702 0.25
703 0.33
704 0.36
705 0.4
706 0.35
707 0.33
708 0.33
709 0.32
710 0.32
711 0.25
712 0.22
713 0.18
714 0.19
715 0.16
716 0.15
717 0.15
718 0.11
719 0.1
720 0.09
721 0.07
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.07
726 0.08
727 0.07
728 0.08
729 0.08
730 0.07
731 0.07
732 0.07
733 0.06
734 0.05
735 0.06
736 0.08
737 0.08
738 0.08
739 0.08
740 0.08
741 0.08
742 0.09
743 0.1
744 0.08
745 0.1
746 0.09
747 0.12
748 0.15
749 0.15
750 0.16
751 0.14
752 0.15
753 0.14
754 0.18
755 0.17
756 0.16
757 0.16
758 0.15
759 0.15
760 0.18
761 0.17
762 0.13
763 0.12
764 0.1
765 0.09
766 0.08
767 0.08
768 0.05
769 0.05
770 0.06
771 0.05
772 0.06
773 0.06
774 0.07
775 0.07
776 0.09
777 0.09
778 0.08
779 0.08
780 0.08
781 0.08
782 0.09
783 0.09
784 0.07
785 0.07
786 0.1
787 0.1
788 0.1
789 0.1
790 0.11
791 0.13
792 0.15
793 0.17
794 0.18
795 0.23
796 0.23
797 0.23
798 0.2
799 0.21
800 0.21
801 0.21
802 0.16
803 0.11
804 0.12
805 0.12
806 0.12
807 0.1
808 0.08
809 0.07
810 0.06
811 0.07
812 0.1
813 0.1
814 0.1
815 0.1
816 0.1
817 0.11
818 0.13
819 0.13
820 0.1
821 0.1
822 0.09
823 0.1
824 0.13
825 0.13
826 0.11
827 0.11
828 0.12
829 0.15
830 0.16
831 0.15
832 0.12
833 0.1
834 0.11
835 0.11
836 0.1
837 0.06
838 0.06
839 0.07
840 0.07
841 0.07
842 0.07
843 0.07
844 0.09
845 0.09
846 0.09
847 0.09
848 0.09
849 0.09
850 0.09
851 0.12
852 0.14
853 0.21
854 0.27
855 0.35
856 0.37
857 0.43
858 0.49
859 0.52
860 0.51
861 0.5
862 0.5
863 0.48
864 0.5
865 0.47
866 0.41
867 0.37
868 0.33
869 0.29
870 0.25
871 0.18
872 0.15
873 0.12
874 0.11
875 0.1
876 0.11
877 0.11
878 0.09
879 0.09
880 0.09
881 0.09
882 0.1
883 0.13
884 0.14
885 0.13
886 0.16
887 0.18
888 0.18
889 0.2
890 0.2
891 0.19
892 0.19
893 0.19
894 0.19
895 0.17
896 0.2
897 0.2
898 0.2
899 0.18
900 0.19
901 0.21
902 0.2
903 0.19
904 0.15
905 0.13
906 0.13
907 0.13
908 0.1
909 0.08
910 0.06
911 0.07
912 0.07
913 0.06
914 0.06
915 0.08
916 0.07
917 0.08
918 0.08
919 0.09
920 0.1
921 0.11
922 0.12
923 0.09
924 0.11
925 0.12
926 0.16
927 0.14
928 0.16
929 0.18
930 0.18
931 0.21
932 0.24
933 0.22
934 0.22
935 0.23
936 0.2
937 0.19
938 0.19
939 0.19
940 0.18
941 0.26
942 0.28
943 0.33
944 0.44
945 0.52
946 0.61
947 0.69
948 0.77
949 0.79
950 0.8
951 0.85
952 0.84
953 0.86
954 0.83
955 0.8
956 0.75
957 0.69
958 0.64
959 0.54
960 0.45
961 0.36
962 0.29
963 0.23
964 0.21
965 0.2
966 0.18
967 0.18
968 0.19
969 0.2
970 0.2
971 0.2
972 0.22
973 0.22
974 0.27
975 0.3
976 0.36
977 0.43
978 0.51
979 0.56
980 0.58
981 0.55
982 0.52
983 0.52
984 0.45
985 0.41
986 0.4
987 0.37
988 0.36
989 0.35
990 0.33
991 0.31
992 0.3
993 0.26
994 0.19
995 0.16
996 0.14
997 0.14
998 0.14
999 0.13
1000 0.13
1001 0.11
1002 0.1
1003 0.15
1004 0.14
1005 0.15
1006 0.15
1007 0.17
1008 0.22
1009 0.27
1010 0.3
1011 0.26
1012 0.27
1013 0.29
1014 0.29
1015 0.27
1016 0.25
1017 0.27
1018 0.24
1019 0.23
1020 0.22
1021 0.19
1022 0.22
1023 0.23
1024 0.24
1025 0.18
1026 0.2
1027 0.22
1028 0.25
1029 0.27
1030 0.27
1031 0.27
1032 0.25
1033 0.26
1034 0.27
1035 0.26
1036 0.23
1037 0.24
1038 0.23
1039 0.22
1040 0.21
1041 0.23
1042 0.21
1043 0.18
1044 0.2
1045 0.17
1046 0.16
1047 0.15
1048 0.15
1049 0.12
1050 0.1
1051 0.1
1052 0.07
1053 0.06
1054 0.06
1055 0.05
1056 0.05
1057 0.04
1058 0.03
1059 0.03
1060 0.03
1061 0.03
1062 0.03
1063 0.03
1064 0.04
1065 0.05
1066 0.06
1067 0.06
1068 0.06
1069 0.07
1070 0.07
1071 0.08
1072 0.09
1073 0.08
1074 0.08
1075 0.09
1076 0.13
1077 0.17
1078 0.19
1079 0.24
1080 0.26
1081 0.28
1082 0.34
1083 0.42
1084 0.48
1085 0.51
1086 0.57
1087 0.59
1088 0.64
1089 0.63
1090 0.62
1091 0.57
1092 0.5
1093 0.45
1094 0.42
1095 0.36
1096 0.32
1097 0.31
1098 0.32
1099 0.31
1100 0.33
1101 0.34
1102 0.33
1103 0.37
1104 0.42
1105 0.45
1106 0.44
1107 0.51
1108 0.56
1109 0.56
1110 0.57
1111 0.55
1112 0.53
1113 0.53
1114 0.49
1115 0.45
1116 0.36
1117 0.34
1118 0.31
1119 0.3
1120 0.27
1121 0.23
1122 0.22
1123 0.19
1124 0.17
1125 0.17
1126 0.16
1127 0.12
1128 0.12
1129 0.12
1130 0.13
1131 0.12
1132 0.12
1133 0.11
1134 0.11
1135 0.11
1136 0.1
1137 0.12
1138 0.14
1139 0.15
1140 0.17
1141 0.18
1142 0.19
1143 0.18
1144 0.21
1145 0.19
1146 0.15
1147 0.15
1148 0.14
1149 0.12
1150 0.12
1151 0.12
1152 0.1
1153 0.14
1154 0.17
1155 0.18
1156 0.18
1157 0.18
1158 0.24
1159 0.26
1160 0.26
1161 0.23
1162 0.2
1163 0.21
1164 0.2
1165 0.19
1166 0.13
1167 0.1
1168 0.1
1169 0.12
1170 0.14
1171 0.15
1172 0.15
1173 0.16
1174 0.21
1175 0.24
1176 0.26
1177 0.28
1178 0.3
1179 0.36
1180 0.44
1181 0.51
1182 0.54
1183 0.61