Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1U8Q1

Protein Details
Accession A0A1Y1U8Q1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-408NDLTSMVKRKPKKAPVPANGSMNKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-396KPK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, nucl 12.5, cyto 10.5, mito 1, extr 1, pero 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MADTTQPNEADTTHGSTEVPAADTADLQSQAEKLIAEGKKAIALKQWEEGVAKYADALDLRRQLVGEFDPSMAPLLLSYGKALYELAFSQAGVMGKEEVEKQAGGETIRAEEGGSGNFVFSADPVSDDDEVEGDGQGNGVEESGPSATRPTEVESEGDAEVGINGAGEEAEEVDEPEDDYNAAWEVLDVARTIYSKMVQGREGSDAREDRLNLAECYLALGDVSCETENFTQAVQDYTSALEIKSALLPSSARSLASVHYQLATVLEFTPNRRADALKHVESAVTGFKARLAELASDSEQSDEVKKLSEKEKEKEVEDVKALIGDLEVKIEELKAAPPAEDLVSESINHLLGSDALGSALGSMLNGSSSGSGGPSGSSVGDAPVNDLTSMVKRKPKKAPVPANGSMNKVEAEAEGVSENGTIAGVKRSAESDAQNGDADKKVKLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.19
4 0.21
5 0.19
6 0.17
7 0.12
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.12
15 0.13
16 0.12
17 0.13
18 0.13
19 0.11
20 0.09
21 0.17
22 0.17
23 0.18
24 0.2
25 0.2
26 0.24
27 0.25
28 0.26
29 0.24
30 0.28
31 0.29
32 0.31
33 0.32
34 0.29
35 0.29
36 0.28
37 0.26
38 0.21
39 0.18
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.13
44 0.15
45 0.16
46 0.21
47 0.22
48 0.22
49 0.22
50 0.21
51 0.23
52 0.23
53 0.2
54 0.16
55 0.16
56 0.15
57 0.15
58 0.17
59 0.13
60 0.11
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.12
78 0.12
79 0.1
80 0.11
81 0.09
82 0.09
83 0.11
84 0.12
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.13
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.09
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.07
109 0.05
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.11
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.03
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.1
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.17
188 0.21
189 0.21
190 0.18
191 0.19
192 0.18
193 0.18
194 0.19
195 0.17
196 0.14
197 0.17
198 0.17
199 0.14
200 0.14
201 0.12
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.06
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.04
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.06
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.14
244 0.14
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.07
252 0.06
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.18
257 0.18
258 0.19
259 0.19
260 0.2
261 0.2
262 0.29
263 0.35
264 0.28
265 0.29
266 0.28
267 0.27
268 0.26
269 0.25
270 0.16
271 0.11
272 0.09
273 0.08
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.12
292 0.13
293 0.17
294 0.23
295 0.31
296 0.35
297 0.38
298 0.46
299 0.46
300 0.46
301 0.5
302 0.46
303 0.4
304 0.35
305 0.32
306 0.23
307 0.21
308 0.19
309 0.12
310 0.09
311 0.08
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.06
320 0.07
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.12
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.08
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.05
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.11
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.17
376 0.22
377 0.26
378 0.33
379 0.39
380 0.48
381 0.58
382 0.67
383 0.71
384 0.77
385 0.83
386 0.84
387 0.86
388 0.83
389 0.81
390 0.74
391 0.67
392 0.57
393 0.47
394 0.38
395 0.29
396 0.24
397 0.15
398 0.15
399 0.12
400 0.11
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.09
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.06
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.17
416 0.21
417 0.23
418 0.25
419 0.26
420 0.27
421 0.28
422 0.27
423 0.28
424 0.29
425 0.28