Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UPC4

Protein Details
Accession A0A1Y1UPC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
377-404GGPDLSHLRREKKKKREAERGGSKGRKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
385-404RREKKKKREAERGGSKGRKL
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025160  AATF  
IPR039223  AATF/Bfr2  
IPR012617  AATF_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF13339  AATF-Che1  
PF08164  TRAUB  
Amino Acid Sequences MSRPTLRDQLRALEDDDEASIDPENAYSSLDTVRIGQSNRDDYMDVGPSRLRGQLGDANQVLLGDKYAGTTVTRNKIFDDDEDEEQEGGGEDADSDDEEDESEDLRSEQDAEVEDHASGQRSGSEEDEGEDEESDGSNNDDEEEEEEDDDDDDEHDEDDPNSDPQPKASSSRLQASNSLDPVGALRAARAKDIERGRGIKRQKALFDGIVALRITFQKALAASNNILSTSPEHSQRKAEALDKLLALSDDLFELRKAILLPGTDTEEVADLGKRKRADASEDLLQASNDSLRLAEAQHSALVSILTKWYSKIQAATINVASKAAGSSKFLQSTKGQQSIVEVIQAGLSQAAGTTFMEHQEAGYRSLLREVIETRSVGGPDLSHLRREKKKKREAERGGSKGRKLRYTVHEKAQHFAVPVPLRDGWHEEQIDELFSSLLGGAGLQGAGTEGGVLSRDLGVDRGLTDLGGLRVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.29
3 0.26
4 0.19
5 0.14
6 0.13
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.1
12 0.09
13 0.1
14 0.09
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.13
20 0.16
21 0.19
22 0.2
23 0.24
24 0.29
25 0.33
26 0.34
27 0.34
28 0.31
29 0.28
30 0.31
31 0.32
32 0.26
33 0.23
34 0.22
35 0.22
36 0.24
37 0.25
38 0.21
39 0.15
40 0.2
41 0.25
42 0.26
43 0.31
44 0.3
45 0.28
46 0.27
47 0.26
48 0.22
49 0.15
50 0.13
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.13
58 0.2
59 0.28
60 0.31
61 0.31
62 0.32
63 0.35
64 0.35
65 0.33
66 0.33
67 0.29
68 0.29
69 0.31
70 0.3
71 0.26
72 0.24
73 0.22
74 0.14
75 0.1
76 0.08
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.11
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.08
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.11
149 0.13
150 0.13
151 0.14
152 0.17
153 0.17
154 0.2
155 0.23
156 0.27
157 0.27
158 0.35
159 0.37
160 0.35
161 0.37
162 0.38
163 0.37
164 0.33
165 0.3
166 0.22
167 0.18
168 0.17
169 0.14
170 0.1
171 0.07
172 0.07
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.19
179 0.22
180 0.26
181 0.25
182 0.3
183 0.32
184 0.38
185 0.41
186 0.39
187 0.42
188 0.41
189 0.39
190 0.39
191 0.39
192 0.31
193 0.28
194 0.25
195 0.19
196 0.17
197 0.15
198 0.11
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.18
219 0.2
220 0.21
221 0.23
222 0.23
223 0.24
224 0.24
225 0.25
226 0.2
227 0.21
228 0.21
229 0.19
230 0.18
231 0.15
232 0.13
233 0.1
234 0.07
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.14
260 0.15
261 0.15
262 0.18
263 0.19
264 0.24
265 0.25
266 0.28
267 0.28
268 0.29
269 0.29
270 0.26
271 0.24
272 0.19
273 0.15
274 0.11
275 0.06
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.11
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.17
300 0.21
301 0.22
302 0.24
303 0.23
304 0.22
305 0.21
306 0.19
307 0.17
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.11
313 0.14
314 0.18
315 0.23
316 0.23
317 0.25
318 0.25
319 0.34
320 0.38
321 0.39
322 0.36
323 0.31
324 0.33
325 0.34
326 0.31
327 0.23
328 0.16
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.09
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.14
347 0.15
348 0.16
349 0.17
350 0.17
351 0.17
352 0.2
353 0.21
354 0.15
355 0.17
356 0.16
357 0.18
358 0.2
359 0.19
360 0.19
361 0.2
362 0.2
363 0.17
364 0.16
365 0.12
366 0.12
367 0.21
368 0.2
369 0.24
370 0.29
371 0.37
372 0.46
373 0.57
374 0.65
375 0.68
376 0.77
377 0.82
378 0.87
379 0.9
380 0.9
381 0.9
382 0.91
383 0.88
384 0.88
385 0.83
386 0.79
387 0.74
388 0.69
389 0.64
390 0.57
391 0.58
392 0.57
393 0.62
394 0.63
395 0.67
396 0.69
397 0.65
398 0.64
399 0.58
400 0.51
401 0.42
402 0.36
403 0.35
404 0.3
405 0.3
406 0.31
407 0.3
408 0.28
409 0.29
410 0.35
411 0.29
412 0.33
413 0.33
414 0.28
415 0.29
416 0.29
417 0.28
418 0.21
419 0.18
420 0.1
421 0.09
422 0.1
423 0.07
424 0.06
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.09
452 0.11