Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1U9H2

Protein Details
Accession A0A1Y1U9H2    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-133AQQAKIPKFKKKARTGGNRASGGHydrophilic
149-180EHIEEERIRKKRRKEKKEKRRARTEREINEEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-125PKFKKKART
155-171RIRKKRRKEKKEKRRAR
208-219KKGTKVVRRKRK
474-480KLQKRAK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSSPGAGSHASDEELPETQALTETQAARYDDIFGGKDDSDLSDLDEDENEPVRQPARRAFPPREPEARAGGSSSPRRAAEKDAGDDDEDQDDEDDVDDADEGDAYVPGTAAQQAKIPKFKKKARTGGNRASGGGDDDEEEEARAGSGDEHIEEERIRKKRRKEKKEKRRARTEREINEEEDVEESGPVYDEATQRRMALEERIDNIGKKGTKVVRRKRKGDDEDIVDTYHDDVCARLYERMKQAADRDAASNAAKQPATAKLAMLDEVMGILRNVSLWQAIVDNRVLEGVREWLEPIHPSGALPAVGIQKAIFEVLPKMDLDTATLKECQLGPIVLFYSKTKRVSPAINRQADSLVSAWSRPLIKRPANYRSQQMDTGNADGILTPRGDGLADEMDIDGDDLPAPAPQPVKRKKFDALQAVQENRGRKGARVLINRDIQYTVAPVSRQTHHAEDIQHVSRIQMDNQKFNKFARKLQKRAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.12
7 0.11
8 0.12
9 0.16
10 0.17
11 0.18
12 0.23
13 0.24
14 0.24
15 0.24
16 0.25
17 0.21
18 0.22
19 0.21
20 0.18
21 0.19
22 0.18
23 0.18
24 0.15
25 0.15
26 0.14
27 0.13
28 0.14
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.12
34 0.13
35 0.16
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.18
40 0.21
41 0.24
42 0.3
43 0.35
44 0.44
45 0.52
46 0.57
47 0.63
48 0.68
49 0.71
50 0.71
51 0.66
52 0.61
53 0.59
54 0.53
55 0.44
56 0.38
57 0.35
58 0.35
59 0.37
60 0.37
61 0.35
62 0.34
63 0.37
64 0.37
65 0.4
66 0.4
67 0.39
68 0.4
69 0.38
70 0.38
71 0.36
72 0.35
73 0.3
74 0.24
75 0.18
76 0.15
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.13
100 0.19
101 0.23
102 0.32
103 0.35
104 0.41
105 0.5
106 0.58
107 0.65
108 0.69
109 0.75
110 0.76
111 0.84
112 0.84
113 0.84
114 0.84
115 0.75
116 0.65
117 0.56
118 0.46
119 0.36
120 0.27
121 0.18
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.14
141 0.2
142 0.28
143 0.36
144 0.42
145 0.52
146 0.62
147 0.72
148 0.8
149 0.84
150 0.87
151 0.9
152 0.95
153 0.95
154 0.95
155 0.95
156 0.93
157 0.91
158 0.91
159 0.89
160 0.84
161 0.82
162 0.75
163 0.65
164 0.56
165 0.47
166 0.36
167 0.27
168 0.2
169 0.11
170 0.09
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.1
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.14
185 0.15
186 0.17
187 0.17
188 0.18
189 0.2
190 0.21
191 0.2
192 0.2
193 0.2
194 0.17
195 0.15
196 0.2
197 0.23
198 0.31
199 0.41
200 0.51
201 0.58
202 0.65
203 0.72
204 0.74
205 0.78
206 0.76
207 0.73
208 0.68
209 0.62
210 0.57
211 0.51
212 0.43
213 0.32
214 0.26
215 0.19
216 0.14
217 0.09
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.11
224 0.12
225 0.16
226 0.19
227 0.23
228 0.23
229 0.23
230 0.24
231 0.26
232 0.26
233 0.22
234 0.2
235 0.17
236 0.18
237 0.16
238 0.16
239 0.12
240 0.14
241 0.12
242 0.11
243 0.13
244 0.14
245 0.16
246 0.15
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.12
252 0.08
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.1
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.07
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.14
313 0.13
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.11
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.17
326 0.22
327 0.24
328 0.25
329 0.28
330 0.32
331 0.4
332 0.47
333 0.52
334 0.57
335 0.6
336 0.58
337 0.55
338 0.52
339 0.43
340 0.35
341 0.25
342 0.18
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.13
347 0.16
348 0.15
349 0.22
350 0.28
351 0.33
352 0.4
353 0.48
354 0.53
355 0.58
356 0.61
357 0.62
358 0.59
359 0.58
360 0.55
361 0.49
362 0.46
363 0.4
364 0.38
365 0.3
366 0.24
367 0.2
368 0.16
369 0.15
370 0.11
371 0.09
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.08
393 0.12
394 0.17
395 0.27
396 0.37
397 0.46
398 0.5
399 0.55
400 0.59
401 0.63
402 0.67
403 0.67
404 0.62
405 0.63
406 0.66
407 0.64
408 0.63
409 0.58
410 0.53
411 0.44
412 0.46
413 0.38
414 0.31
415 0.37
416 0.41
417 0.46
418 0.51
419 0.55
420 0.57
421 0.63
422 0.62
423 0.55
424 0.48
425 0.39
426 0.31
427 0.27
428 0.22
429 0.17
430 0.17
431 0.18
432 0.22
433 0.25
434 0.28
435 0.31
436 0.33
437 0.33
438 0.37
439 0.36
440 0.37
441 0.41
442 0.4
443 0.37
444 0.33
445 0.3
446 0.32
447 0.32
448 0.33
449 0.35
450 0.37
451 0.44
452 0.5
453 0.55
454 0.52
455 0.55
456 0.6
457 0.54
458 0.59
459 0.6
460 0.65