Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3BBK7

Protein Details
Accession G3BBK7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-374FDEKLIAKLKRKPVVKKRKLDNGSSESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-366KLKRKPVVKKRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, nucl 13.5, cyto 11, cyto_mito 6.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004600  TFIIH_Tfb4/GTF2H3  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG cten:CANTEDRAFT_115027  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03850  Tfb4  
Amino Acid Sequences MDEISDNTFIEVHGSDVSNDDPSLLTIVLEVSPEGWFNIKDQTSIMDVVKSLLVFLNGHLSLNNSNQVAFVLSSPAGSKFLYPDTSKTYEEIPLNVTSEETVENSNKSEELSFVTKGMYRQFRVVDETVLSGLSQTMSDITHAQDDKVTGSSRLSGALSLALSYTNRMMKLDQSISTTTASAISSAANISNKESSTAGASSGTNANSYGTSRMKSRILVVTPNDNEDIKYISLMKAIFGAQKMKVAIDIAKLGRKDSSYLQQAADATNGVYLHIEKPLGLIQVLCTAYFIEPSIRPLMILPTNSNVNYKASCFITGKSVEIGYVCSVCLCIMSEIPDRMSCPTCNSHFDEKLIAKLKRKPVVKKRKLDNGSSESSTPAPEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.14
4 0.15
5 0.14
6 0.14
7 0.13
8 0.11
9 0.11
10 0.12
11 0.1
12 0.09
13 0.08
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.07
19 0.07
20 0.08
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.18
26 0.18
27 0.18
28 0.18
29 0.2
30 0.21
31 0.23
32 0.22
33 0.15
34 0.15
35 0.16
36 0.16
37 0.14
38 0.12
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.1
43 0.15
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.15
48 0.17
49 0.19
50 0.22
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.13
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.11
65 0.12
66 0.11
67 0.14
68 0.18
69 0.19
70 0.21
71 0.26
72 0.3
73 0.3
74 0.29
75 0.28
76 0.29
77 0.29
78 0.27
79 0.23
80 0.2
81 0.21
82 0.2
83 0.18
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.12
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.13
95 0.12
96 0.1
97 0.12
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.16
103 0.17
104 0.23
105 0.25
106 0.23
107 0.26
108 0.28
109 0.28
110 0.31
111 0.31
112 0.25
113 0.2
114 0.19
115 0.16
116 0.14
117 0.12
118 0.07
119 0.07
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.15
158 0.17
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.18
163 0.18
164 0.16
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.1
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.13
199 0.16
200 0.17
201 0.17
202 0.2
203 0.2
204 0.2
205 0.24
206 0.24
207 0.28
208 0.27
209 0.28
210 0.27
211 0.22
212 0.21
213 0.17
214 0.18
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.14
227 0.12
228 0.14
229 0.15
230 0.13
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.14
236 0.13
237 0.17
238 0.17
239 0.17
240 0.18
241 0.17
242 0.18
243 0.18
244 0.24
245 0.26
246 0.27
247 0.27
248 0.27
249 0.27
250 0.26
251 0.22
252 0.15
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.14
270 0.15
271 0.13
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.1
278 0.1
279 0.13
280 0.16
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.19
285 0.19
286 0.2
287 0.19
288 0.2
289 0.23
290 0.24
291 0.25
292 0.22
293 0.21
294 0.21
295 0.2
296 0.21
297 0.19
298 0.22
299 0.22
300 0.21
301 0.25
302 0.24
303 0.24
304 0.22
305 0.21
306 0.18
307 0.16
308 0.17
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.13
320 0.18
321 0.19
322 0.21
323 0.22
324 0.22
325 0.25
326 0.27
327 0.24
328 0.25
329 0.3
330 0.32
331 0.36
332 0.42
333 0.47
334 0.46
335 0.46
336 0.48
337 0.43
338 0.48
339 0.51
340 0.49
341 0.48
342 0.54
343 0.62
344 0.62
345 0.69
346 0.72
347 0.74
348 0.81
349 0.84
350 0.86
351 0.86
352 0.89
353 0.87
354 0.84
355 0.82
356 0.78
357 0.74
358 0.68
359 0.59
360 0.5
361 0.45