Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UJN3

Protein Details
Accession A0A1Y1UJN3    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-43DADRHHDRDERKHEPRRSRSRSMSPRRDRGGRDBasic
249-270GAVKVNKQRTWRQYMNRRGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-50DERKHEPRRSRSRSMSPRRDRGGRDRERYNDR
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSGRRPSSPQDADRHHDRDERKHEPRRSRSRSMSPRRDRGGRDRERYNDRDRRDRDYPSPVRDRDRGDRDYRRHGREHDDRDRGVQDDYPSRGPRSGGGEGYRDGGNGYGNGNGSGRAGPNGDYYGRGGSRGGYGGGGGRGGGNFGYRGRATADEYMERDRPLDRRAIEEGRRRREEERARGTTQREEGNEEETQGGPSHASSHTNRKRLDGEEGEEEEEEDDGGFAAMMGFGGFGSTKGKEVAANADGAVKVNKQRTWRQYMNRRGGFNRPLDKMK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.6
3 0.59
4 0.58
5 0.59
6 0.62
7 0.65
8 0.67
9 0.73
10 0.78
11 0.81
12 0.87
13 0.88
14 0.87
15 0.86
16 0.85
17 0.86
18 0.88
19 0.89
20 0.89
21 0.88
22 0.88
23 0.86
24 0.84
25 0.8
26 0.79
27 0.79
28 0.78
29 0.75
30 0.73
31 0.74
32 0.75
33 0.75
34 0.75
35 0.72
36 0.69
37 0.72
38 0.68
39 0.69
40 0.66
41 0.66
42 0.61
43 0.64
44 0.64
45 0.62
46 0.67
47 0.63
48 0.63
49 0.61
50 0.62
51 0.61
52 0.61
53 0.59
54 0.59
55 0.64
56 0.64
57 0.7
58 0.72
59 0.68
60 0.66
61 0.63
62 0.63
63 0.64
64 0.68
65 0.66
66 0.64
67 0.59
68 0.57
69 0.55
70 0.46
71 0.38
72 0.31
73 0.24
74 0.23
75 0.26
76 0.28
77 0.28
78 0.28
79 0.28
80 0.26
81 0.25
82 0.26
83 0.26
84 0.23
85 0.23
86 0.23
87 0.22
88 0.24
89 0.21
90 0.15
91 0.12
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.12
139 0.14
140 0.16
141 0.15
142 0.17
143 0.19
144 0.19
145 0.18
146 0.17
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.2
151 0.18
152 0.2
153 0.25
154 0.3
155 0.35
156 0.42
157 0.49
158 0.52
159 0.55
160 0.54
161 0.52
162 0.56
163 0.58
164 0.59
165 0.6
166 0.57
167 0.57
168 0.59
169 0.6
170 0.54
171 0.49
172 0.43
173 0.34
174 0.33
175 0.3
176 0.3
177 0.27
178 0.23
179 0.21
180 0.17
181 0.17
182 0.13
183 0.12
184 0.08
185 0.08
186 0.1
187 0.1
188 0.14
189 0.16
190 0.27
191 0.35
192 0.42
193 0.43
194 0.44
195 0.47
196 0.46
197 0.51
198 0.43
199 0.4
200 0.38
201 0.39
202 0.36
203 0.31
204 0.29
205 0.21
206 0.17
207 0.12
208 0.07
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.18
231 0.17
232 0.17
233 0.16
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.17
238 0.15
239 0.2
240 0.26
241 0.29
242 0.34
243 0.44
244 0.51
245 0.59
246 0.65
247 0.7
248 0.75
249 0.82
250 0.86
251 0.82
252 0.79
253 0.74
254 0.74
255 0.71
256 0.7
257 0.67