Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1U8L7

Protein Details
Accession A0A1Y1U8L7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-217DTTTSRLKRVQRQMNDFIRRNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-121RDLRGKIHGNGQGNAHSRSKGKGKER
Subcellular Location(s) nucl 8, mito 7, cyto_nucl 7, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010989  SNARE  
IPR015260  Syntaxin-6_N  
IPR006012  Syntaxin/epimorphin_CS  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0031090  C:organelle membrane  
GO:0005802  C:trans-Golgi network  
GO:0005484  F:SNAP receptor activity  
GO:0048193  P:Golgi vesicle transport  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF05739  SNARE  
PF09177  Syntaxin-6_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00914  SYNTAXIN  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd21442  SNARE_NTD_STX6-like  
cd15851  SNARE_Syntaxin6  
Amino Acid Sequences MARDPYVDVKKEVEQNLRATHTLLESYDRLSDTSTSSTFAEAQEELRGTLALLEADLEDLEESVRVVEATGDRWGIEESEVKRRRGFVERVKAEVRDLRGKIHGNGQGNAHSRSKGKGKERGPYRDLPDDLEAGPEDDAEEARRWEMEEQQTLIRQQDDTLGFISGTLTTLASQAGLIGQEVGEQTEMLDDLGSRVDTTTSRLKRVQRQMNDFIRRNEETKSGWCICILIFVLIALLIAVIIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.47
3 0.5
4 0.49
5 0.44
6 0.39
7 0.34
8 0.28
9 0.25
10 0.21
11 0.2
12 0.17
13 0.18
14 0.19
15 0.18
16 0.17
17 0.17
18 0.17
19 0.16
20 0.19
21 0.17
22 0.17
23 0.17
24 0.18
25 0.17
26 0.16
27 0.16
28 0.13
29 0.13
30 0.14
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.12
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.06
56 0.07
57 0.08
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.13
65 0.14
66 0.25
67 0.3
68 0.31
69 0.32
70 0.33
71 0.36
72 0.38
73 0.44
74 0.42
75 0.49
76 0.49
77 0.52
78 0.52
79 0.48
80 0.43
81 0.39
82 0.33
83 0.29
84 0.28
85 0.26
86 0.28
87 0.29
88 0.28
89 0.31
90 0.32
91 0.27
92 0.28
93 0.27
94 0.28
95 0.29
96 0.3
97 0.25
98 0.22
99 0.21
100 0.22
101 0.27
102 0.29
103 0.32
104 0.38
105 0.41
106 0.47
107 0.54
108 0.58
109 0.55
110 0.53
111 0.52
112 0.48
113 0.45
114 0.39
115 0.33
116 0.27
117 0.23
118 0.19
119 0.15
120 0.1
121 0.09
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.14
134 0.16
135 0.17
136 0.19
137 0.2
138 0.22
139 0.22
140 0.22
141 0.17
142 0.13
143 0.12
144 0.15
145 0.15
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.12
186 0.21
187 0.23
188 0.28
189 0.34
190 0.42
191 0.51
192 0.61
193 0.67
194 0.66
195 0.71
196 0.76
197 0.8
198 0.83
199 0.78
200 0.72
201 0.69
202 0.63
203 0.56
204 0.5
205 0.44
206 0.38
207 0.37
208 0.41
209 0.36
210 0.33
211 0.32
212 0.29
213 0.25
214 0.26
215 0.22
216 0.15
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.05
223 0.04