Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UM42

Protein Details
Accession A0A1Y1UM42    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-56TVGNTKKSKKDLEKEAEEKKRIBasic
375-394YSSRSRSRSHSRSRSPPPKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-161PRAMFKAPSPPPSAGPKPKGKR
331-336HKARSP
340-405ISPSPPPRSKRRQSPSGPRSPSPRRNESRHNRSESYSSRSRSRSHSRSRSPPPKKLSSREKWLKKV
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MSRRLDLSQFRGDDSDDEVPKKQLELTDLKRNVFTVGNTKKSKKDLEKEAEEKKRIEEEKAAALALAEFEDAFEKPGSSFGTSGVRGFIGGVRGGFVRAGGAGNATPYEPPRGPSMAQPPSGPSGPPKGPAAMGYARPTPRAMFKAPSPPPSAGPKPKGKRAMDSFLEEIKSNQAVREQRLGKKAKMEGSSVTALAAWEGTSGGRPIGEAESTNLFVGNLPSNVTEETLGLFFAKIGPVGTVKIMWPRGDIDSSIGGVVTSSRWAKPGLQGFVAYMKRKDAETAVNELDGLDWGGSVIRVGWSKPVPVPTRAIYDLGSSRGRSPEPSSSRHKARSPSYSISPSPPPRSKRRQSPSGPRSPSPRRNESRHNRSESYSSRSRSRSHSRSRSPPPKKLSSREKWLKKVPVETDKFIRAVAAKVRHHGKGFEQVLKTKEKDNEKFNFFFNSDLPDYHLYRSLLSSSYRIPTPPPDDFVDEGYASMYSSDSAEDSERERIGKTKVGKLARKRYEAMLRMMSGKRAEIGRAMEFAVKHAEAADEVADIICQSLRIDDTPVPRKIARLHLVSDILHNSASPLPNVWKYRLAFEQRLPKVFAHLSDVEKSLRAYSGIISADVFKTQVLTVLEIWDRWIVFTGEVSESLRELFLGDRTLNGAGKTDEAEHQEQQEKKAKDDSEGSRGGFKTSGFKSSFKPLSAVAAPAESTLEDGGNATAEQLDGEDMELDGEPMEEEDVDGEAMDEDLDGEAMEDLDGEAMGEDDVDGEPM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.29
4 0.31
5 0.32
6 0.33
7 0.32
8 0.32
9 0.29
10 0.24
11 0.26
12 0.33
13 0.38
14 0.46
15 0.5
16 0.5
17 0.49
18 0.46
19 0.43
20 0.36
21 0.32
22 0.32
23 0.36
24 0.44
25 0.5
26 0.54
27 0.58
28 0.62
29 0.69
30 0.69
31 0.7
32 0.71
33 0.74
34 0.79
35 0.8
36 0.84
37 0.83
38 0.77
39 0.7
40 0.63
41 0.63
42 0.55
43 0.52
44 0.48
45 0.42
46 0.44
47 0.43
48 0.39
49 0.3
50 0.27
51 0.23
52 0.16
53 0.13
54 0.07
55 0.05
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.13
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.21
69 0.21
70 0.21
71 0.2
72 0.17
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.17
96 0.16
97 0.18
98 0.21
99 0.24
100 0.24
101 0.3
102 0.38
103 0.38
104 0.39
105 0.38
106 0.37
107 0.38
108 0.38
109 0.32
110 0.26
111 0.27
112 0.28
113 0.3
114 0.29
115 0.26
116 0.25
117 0.25
118 0.27
119 0.24
120 0.25
121 0.26
122 0.3
123 0.3
124 0.31
125 0.31
126 0.28
127 0.3
128 0.31
129 0.31
130 0.29
131 0.33
132 0.42
133 0.45
134 0.49
135 0.47
136 0.44
137 0.44
138 0.48
139 0.52
140 0.51
141 0.54
142 0.59
143 0.61
144 0.68
145 0.74
146 0.69
147 0.69
148 0.67
149 0.68
150 0.61
151 0.59
152 0.53
153 0.46
154 0.45
155 0.36
156 0.29
157 0.24
158 0.24
159 0.19
160 0.17
161 0.21
162 0.24
163 0.27
164 0.36
165 0.38
166 0.42
167 0.5
168 0.54
169 0.5
170 0.53
171 0.54
172 0.52
173 0.48
174 0.45
175 0.38
176 0.37
177 0.36
178 0.29
179 0.24
180 0.17
181 0.14
182 0.12
183 0.1
184 0.05
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.08
197 0.1
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.08
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.13
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.18
236 0.18
237 0.18
238 0.15
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.1
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.05
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.13
253 0.19
254 0.24
255 0.24
256 0.23
257 0.23
258 0.22
259 0.28
260 0.3
261 0.26
262 0.21
263 0.2
264 0.21
265 0.21
266 0.21
267 0.17
268 0.19
269 0.2
270 0.24
271 0.22
272 0.21
273 0.21
274 0.19
275 0.17
276 0.11
277 0.09
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.14
292 0.21
293 0.22
294 0.24
295 0.27
296 0.25
297 0.28
298 0.28
299 0.27
300 0.2
301 0.19
302 0.18
303 0.19
304 0.18
305 0.15
306 0.15
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.19
311 0.25
312 0.28
313 0.32
314 0.39
315 0.43
316 0.49
317 0.52
318 0.52
319 0.5
320 0.51
321 0.53
322 0.52
323 0.49
324 0.47
325 0.46
326 0.43
327 0.4
328 0.42
329 0.39
330 0.41
331 0.44
332 0.45
333 0.5
334 0.59
335 0.63
336 0.67
337 0.7
338 0.72
339 0.74
340 0.8
341 0.79
342 0.79
343 0.76
344 0.67
345 0.68
346 0.67
347 0.68
348 0.64
349 0.65
350 0.61
351 0.63
352 0.71
353 0.73
354 0.74
355 0.73
356 0.72
357 0.64
358 0.6
359 0.6
360 0.53
361 0.49
362 0.45
363 0.4
364 0.39
365 0.4
366 0.41
367 0.42
368 0.48
369 0.5
370 0.55
371 0.62
372 0.63
373 0.69
374 0.77
375 0.8
376 0.78
377 0.78
378 0.74
379 0.74
380 0.73
381 0.73
382 0.73
383 0.68
384 0.72
385 0.73
386 0.73
387 0.7
388 0.72
389 0.7
390 0.62
391 0.62
392 0.57
393 0.57
394 0.53
395 0.49
396 0.45
397 0.39
398 0.37
399 0.3
400 0.25
401 0.16
402 0.15
403 0.18
404 0.22
405 0.21
406 0.25
407 0.29
408 0.3
409 0.3
410 0.3
411 0.26
412 0.29
413 0.31
414 0.32
415 0.3
416 0.31
417 0.33
418 0.36
419 0.35
420 0.3
421 0.33
422 0.37
423 0.4
424 0.44
425 0.48
426 0.49
427 0.49
428 0.45
429 0.42
430 0.34
431 0.31
432 0.23
433 0.22
434 0.18
435 0.17
436 0.19
437 0.18
438 0.19
439 0.19
440 0.22
441 0.17
442 0.17
443 0.18
444 0.16
445 0.14
446 0.14
447 0.15
448 0.13
449 0.15
450 0.15
451 0.15
452 0.15
453 0.19
454 0.23
455 0.23
456 0.24
457 0.24
458 0.26
459 0.27
460 0.27
461 0.23
462 0.17
463 0.16
464 0.13
465 0.11
466 0.08
467 0.08
468 0.06
469 0.04
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.09
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.16
482 0.17
483 0.22
484 0.24
485 0.28
486 0.34
487 0.41
488 0.48
489 0.54
490 0.62
491 0.64
492 0.65
493 0.6
494 0.59
495 0.6
496 0.57
497 0.52
498 0.44
499 0.37
500 0.38
501 0.37
502 0.33
503 0.26
504 0.22
505 0.2
506 0.17
507 0.17
508 0.15
509 0.17
510 0.16
511 0.16
512 0.17
513 0.16
514 0.15
515 0.16
516 0.16
517 0.13
518 0.12
519 0.11
520 0.1
521 0.08
522 0.09
523 0.08
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.05
534 0.06
535 0.07
536 0.1
537 0.13
538 0.21
539 0.29
540 0.31
541 0.33
542 0.33
543 0.35
544 0.37
545 0.42
546 0.4
547 0.36
548 0.36
549 0.36
550 0.37
551 0.35
552 0.32
553 0.25
554 0.2
555 0.16
556 0.14
557 0.12
558 0.14
559 0.14
560 0.12
561 0.13
562 0.16
563 0.22
564 0.25
565 0.26
566 0.3
567 0.3
568 0.34
569 0.39
570 0.43
571 0.41
572 0.44
573 0.52
574 0.5
575 0.52
576 0.51
577 0.43
578 0.41
579 0.38
580 0.33
581 0.28
582 0.28
583 0.27
584 0.27
585 0.29
586 0.24
587 0.24
588 0.23
589 0.18
590 0.16
591 0.13
592 0.12
593 0.11
594 0.14
595 0.14
596 0.13
597 0.13
598 0.14
599 0.14
600 0.13
601 0.13
602 0.08
603 0.09
604 0.08
605 0.12
606 0.11
607 0.13
608 0.13
609 0.16
610 0.17
611 0.16
612 0.17
613 0.15
614 0.14
615 0.12
616 0.14
617 0.11
618 0.11
619 0.12
620 0.13
621 0.12
622 0.13
623 0.14
624 0.13
625 0.12
626 0.12
627 0.11
628 0.08
629 0.08
630 0.08
631 0.09
632 0.11
633 0.11
634 0.11
635 0.13
636 0.15
637 0.16
638 0.15
639 0.15
640 0.13
641 0.14
642 0.15
643 0.15
644 0.16
645 0.2
646 0.24
647 0.24
648 0.28
649 0.34
650 0.35
651 0.4
652 0.46
653 0.42
654 0.41
655 0.47
656 0.43
657 0.4
658 0.47
659 0.46
660 0.44
661 0.46
662 0.44
663 0.43
664 0.42
665 0.39
666 0.32
667 0.28
668 0.28
669 0.27
670 0.33
671 0.3
672 0.32
673 0.34
674 0.43
675 0.46
676 0.39
677 0.39
678 0.32
679 0.36
680 0.35
681 0.33
682 0.24
683 0.2
684 0.19
685 0.17
686 0.17
687 0.11
688 0.1
689 0.09
690 0.08
691 0.07
692 0.08
693 0.07
694 0.08
695 0.08
696 0.07
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.05
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.07
707 0.07
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.06
712 0.06
713 0.06
714 0.05
715 0.05
716 0.06
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.04
729 0.05
730 0.05
731 0.05
732 0.05
733 0.05
734 0.05
735 0.05
736 0.05
737 0.04
738 0.04
739 0.04
740 0.04
741 0.04
742 0.04
743 0.05