Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UHU7

Protein Details
Accession A0A1Y1UHU7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-119GDRDRDRERDRERSSRRDDRDRSRSRSRERRHRDRDDDRHRSHRHRSYSRSRSRSPGRRHHRRHRSRSDSRSRSRSRDRDHRDRDGHSSRRHHRRISPPALHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-123RERDRERSSRRDDRDRSRSRSRERRHRDRDDDRHRSHRHRSYSRSRSRSPGRRHHRRHRSRSDSRSRSRSRDRDHRDRDGHSSRRHHRRISPPALHGRGR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MEDDREMRVDEAMIPENGDRDRDRERDRERSSRRDDRDRSRSRSRERRHRDRDDDRHRSHRHRSYSRSRSRSPGRRHHRRHRSRSDSRSRSRSRDRDHRDRDGHSSRRHHRRISPPALHGRGRYGAPRQDWEKSSGGPINAPQEEAEAHAKVSKRENRLYIGNLAYDCNYKDLKKYMEGAGGEVIFSEILVTPAGQSKGCGIVEFAREEDAKKAKVDLADKAFMGRSVFIREDREEQARFGVAPIPGKIGLAMGESRHFLGNAGPNLQNKNVFVGNLPLQASWQDLKDLMRQAGEVIRTDVGMHMDGRPKGNGTVVFVDPEGARNAIEMFHGFDWFGNILEVREDRFAGGPFRGRGGMGMRGGFGMGRGFAGGMRGGFRGGYGGGGYGMGGGGGYGMGMGRGGGGMGAGGGRNFSNDLYADYNGPEGGAANGNGAGGGGASREPAEPNQQILVRNLPWSTSNEDLVELFETVGSVVLAEILYEGTRSKGEGVVQFTETAEAQTAGEKFTGYMYGGRPLDVAFNPRWHDFSGSAAKGGQAAPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.21
4 0.2
5 0.22
6 0.2
7 0.21
8 0.28
9 0.35
10 0.41
11 0.47
12 0.55
13 0.61
14 0.68
15 0.74
16 0.75
17 0.78
18 0.81
19 0.82
20 0.83
21 0.83
22 0.84
23 0.84
24 0.87
25 0.86
26 0.85
27 0.85
28 0.86
29 0.86
30 0.88
31 0.88
32 0.88
33 0.89
34 0.92
35 0.92
36 0.93
37 0.93
38 0.93
39 0.93
40 0.93
41 0.93
42 0.89
43 0.89
44 0.87
45 0.85
46 0.84
47 0.83
48 0.82
49 0.81
50 0.83
51 0.84
52 0.86
53 0.88
54 0.86
55 0.82
56 0.81
57 0.82
58 0.83
59 0.82
60 0.82
61 0.82
62 0.85
63 0.91
64 0.92
65 0.93
66 0.94
67 0.95
68 0.95
69 0.94
70 0.94
71 0.94
72 0.94
73 0.93
74 0.91
75 0.91
76 0.87
77 0.86
78 0.86
79 0.85
80 0.84
81 0.84
82 0.85
83 0.85
84 0.86
85 0.87
86 0.82
87 0.76
88 0.76
89 0.74
90 0.73
91 0.71
92 0.72
93 0.72
94 0.77
95 0.8
96 0.77
97 0.77
98 0.79
99 0.82
100 0.82
101 0.79
102 0.75
103 0.78
104 0.76
105 0.7
106 0.6
107 0.53
108 0.46
109 0.41
110 0.38
111 0.35
112 0.35
113 0.35
114 0.4
115 0.4
116 0.43
117 0.43
118 0.43
119 0.39
120 0.34
121 0.35
122 0.33
123 0.29
124 0.25
125 0.25
126 0.27
127 0.25
128 0.24
129 0.19
130 0.17
131 0.17
132 0.18
133 0.18
134 0.12
135 0.12
136 0.15
137 0.16
138 0.18
139 0.27
140 0.31
141 0.35
142 0.4
143 0.43
144 0.44
145 0.46
146 0.46
147 0.42
148 0.36
149 0.31
150 0.26
151 0.24
152 0.21
153 0.19
154 0.16
155 0.14
156 0.15
157 0.14
158 0.17
159 0.21
160 0.23
161 0.24
162 0.27
163 0.26
164 0.28
165 0.28
166 0.25
167 0.22
168 0.19
169 0.16
170 0.13
171 0.11
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.1
189 0.13
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.18
197 0.18
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.21
203 0.22
204 0.23
205 0.24
206 0.24
207 0.23
208 0.23
209 0.21
210 0.18
211 0.16
212 0.12
213 0.09
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.16
218 0.17
219 0.21
220 0.22
221 0.26
222 0.23
223 0.22
224 0.22
225 0.19
226 0.17
227 0.14
228 0.14
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.13
249 0.13
250 0.15
251 0.17
252 0.18
253 0.2
254 0.2
255 0.19
256 0.14
257 0.16
258 0.13
259 0.11
260 0.1
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.12
269 0.09
270 0.09
271 0.07
272 0.08
273 0.09
274 0.13
275 0.14
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.15
296 0.15
297 0.15
298 0.16
299 0.15
300 0.13
301 0.15
302 0.14
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.12
307 0.13
308 0.11
309 0.08
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.13
337 0.15
338 0.15
339 0.16
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.15
344 0.17
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.13
349 0.14
350 0.12
351 0.1
352 0.06
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.02
379 0.02
380 0.02
381 0.02
382 0.02
383 0.02
384 0.02
385 0.02
386 0.02
387 0.02
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.02
393 0.02
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.08
403 0.08
404 0.11
405 0.13
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.14
410 0.12
411 0.12
412 0.09
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.05
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.05
429 0.06
430 0.08
431 0.1
432 0.18
433 0.19
434 0.21
435 0.24
436 0.26
437 0.28
438 0.28
439 0.32
440 0.26
441 0.27
442 0.25
443 0.22
444 0.22
445 0.23
446 0.26
447 0.23
448 0.24
449 0.22
450 0.22
451 0.21
452 0.2
453 0.18
454 0.13
455 0.11
456 0.09
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.1
475 0.12
476 0.16
477 0.2
478 0.24
479 0.26
480 0.27
481 0.27
482 0.25
483 0.25
484 0.21
485 0.17
486 0.13
487 0.11
488 0.1
489 0.13
490 0.14
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.12
495 0.12
496 0.13
497 0.1
498 0.14
499 0.15
500 0.22
501 0.22
502 0.22
503 0.22
504 0.21
505 0.25
506 0.23
507 0.26
508 0.22
509 0.28
510 0.32
511 0.34
512 0.36
513 0.32
514 0.34
515 0.3
516 0.33
517 0.37
518 0.34
519 0.33
520 0.31
521 0.29
522 0.28