Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UBI4

Protein Details
Accession A0A1Y1UBI4    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
537-560DKSVAARLKKAQKKKDTQKGTLYLHydrophilic
642-667WVGANRKFKKIPRARVEKMRTEKSRSHydrophilic
676-698AGLLAKQDKRKSKIKAKGIDYEYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-20SSKKA
105-133KLKKKAAKAAEVGKEEAQKVGKAAGKKAK
163-170GAKKKAGK
191-198KKGKKAAK
268-290KGKKAKGDVEPASKRAKGAVKEA
295-322KEAAEPAVKKGKKTVAEAAESTAKKGKK
350-392TKKGKKAAADAKDAVEPAVKKAKKAAAEATEKAEPTVKKSKKA
422-430AKKGKKAAE
435-488SAKSTVSKGKKSAAKAVEEAKPVAAKGKKAAKDVASATEEKGKKAVKGAKSKAK
545-550KKAQKK
646-668NRKFKKIPRARVEKMRTEKSRSK
683-691DKRKSKIKA
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKKSQPPPGKASAPSSKKAKSSSSSSKSAATEAKSSNASVAKTEKGKAAPRPSTTLENIQETISSVVDVVKDAVEVAGDLVLDDPTHTPVAADQVLADHVDVPKLKKKAAKAAEVGKEEAQKVGKAAGKKAKEVGAAAEEKAAELETAVEEKLEEKGVDVKGAKKKAGKVVKGAEEAVQAVAEATEPAVKKGKKAAKAAVKETEEVVEELKDPESKKRKRAEDFMATAEGTARAVADKVGEVISTVVESFGAASGLAKDLGAETSAKGKKAKGDVEPASKRAKGAVKEAVEDIKEAAEPAVKKGKKTVAEAAESTAKKGKKAVEDAAEAVEPTIKKGKQAVAEAAETATKKGKKAAADAKDAVEPAVKKAKKAAAEATEKAEPTVKKSKKAAADAAETVETTVKKGKRAAAEALEDAEPVAKKGKKAAEDAVESAKSTVSKGKKSAAKAVEEAKPVAAKGKKAAKDVASATEEKGKKAVKGAKSKAKEVAEELGDEEMVDGFASSDEEDSSDDESEVGGEKEEVDLKSLPMVARDDKSVAARLKKAQKKKDTQKGTLYLGRVPHGFYEEQMKEYFSQFGDVTRVRLARNKKTGASKHFAYIEMSSQSVAEIVAETMNNYLLMGHLLKCQVIPPEDVHPKLWVGANRKFKKIPRARVEKMRTEKSRSKEEQDQANAGLLAKQDKRKSKIKAKGIDYEYEGHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.63
3 0.64
4 0.61
5 0.6
6 0.61
7 0.6
8 0.55
9 0.59
10 0.62
11 0.61
12 0.62
13 0.59
14 0.59
15 0.53
16 0.52
17 0.48
18 0.4
19 0.4
20 0.35
21 0.38
22 0.34
23 0.33
24 0.33
25 0.31
26 0.28
27 0.25
28 0.27
29 0.29
30 0.32
31 0.34
32 0.34
33 0.37
34 0.43
35 0.49
36 0.55
37 0.57
38 0.57
39 0.61
40 0.6
41 0.6
42 0.57
43 0.57
44 0.51
45 0.47
46 0.44
47 0.38
48 0.34
49 0.29
50 0.26
51 0.17
52 0.13
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.07
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.07
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.09
87 0.09
88 0.12
89 0.14
90 0.18
91 0.25
92 0.27
93 0.31
94 0.33
95 0.39
96 0.46
97 0.51
98 0.54
99 0.53
100 0.6
101 0.63
102 0.61
103 0.58
104 0.51
105 0.47
106 0.4
107 0.37
108 0.3
109 0.23
110 0.21
111 0.24
112 0.24
113 0.23
114 0.3
115 0.35
116 0.36
117 0.38
118 0.41
119 0.39
120 0.37
121 0.35
122 0.3
123 0.27
124 0.26
125 0.24
126 0.22
127 0.18
128 0.16
129 0.16
130 0.13
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.14
145 0.14
146 0.18
147 0.19
148 0.25
149 0.31
150 0.35
151 0.38
152 0.37
153 0.42
154 0.48
155 0.55
156 0.52
157 0.52
158 0.55
159 0.57
160 0.54
161 0.5
162 0.42
163 0.34
164 0.31
165 0.23
166 0.16
167 0.1
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.07
174 0.07
175 0.1
176 0.17
177 0.17
178 0.19
179 0.28
180 0.35
181 0.39
182 0.44
183 0.51
184 0.52
185 0.58
186 0.61
187 0.59
188 0.54
189 0.48
190 0.43
191 0.36
192 0.28
193 0.22
194 0.18
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.13
201 0.22
202 0.32
203 0.37
204 0.45
205 0.53
206 0.61
207 0.64
208 0.71
209 0.7
210 0.69
211 0.65
212 0.59
213 0.52
214 0.43
215 0.36
216 0.29
217 0.21
218 0.12
219 0.09
220 0.06
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.14
253 0.15
254 0.17
255 0.18
256 0.2
257 0.24
258 0.29
259 0.33
260 0.28
261 0.35
262 0.38
263 0.46
264 0.47
265 0.46
266 0.44
267 0.4
268 0.36
269 0.33
270 0.33
271 0.26
272 0.28
273 0.32
274 0.29
275 0.3
276 0.31
277 0.27
278 0.23
279 0.21
280 0.16
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.08
286 0.08
287 0.1
288 0.19
289 0.19
290 0.2
291 0.24
292 0.3
293 0.3
294 0.33
295 0.38
296 0.32
297 0.34
298 0.34
299 0.32
300 0.33
301 0.29
302 0.27
303 0.25
304 0.22
305 0.2
306 0.23
307 0.25
308 0.23
309 0.27
310 0.3
311 0.28
312 0.29
313 0.29
314 0.27
315 0.23
316 0.18
317 0.13
318 0.11
319 0.08
320 0.08
321 0.13
322 0.12
323 0.13
324 0.16
325 0.19
326 0.21
327 0.23
328 0.24
329 0.21
330 0.21
331 0.2
332 0.18
333 0.16
334 0.12
335 0.11
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.25
343 0.33
344 0.33
345 0.36
346 0.37
347 0.34
348 0.32
349 0.31
350 0.24
351 0.18
352 0.13
353 0.11
354 0.19
355 0.18
356 0.18
357 0.22
358 0.25
359 0.26
360 0.28
361 0.3
362 0.28
363 0.32
364 0.33
365 0.32
366 0.3
367 0.27
368 0.26
369 0.25
370 0.19
371 0.2
372 0.3
373 0.29
374 0.32
375 0.35
376 0.41
377 0.42
378 0.45
379 0.44
380 0.37
381 0.38
382 0.34
383 0.32
384 0.26
385 0.21
386 0.17
387 0.14
388 0.11
389 0.09
390 0.14
391 0.14
392 0.17
393 0.2
394 0.24
395 0.26
396 0.29
397 0.32
398 0.29
399 0.29
400 0.27
401 0.26
402 0.22
403 0.18
404 0.14
405 0.12
406 0.09
407 0.08
408 0.13
409 0.13
410 0.13
411 0.19
412 0.23
413 0.25
414 0.28
415 0.32
416 0.31
417 0.31
418 0.32
419 0.3
420 0.26
421 0.23
422 0.2
423 0.17
424 0.12
425 0.11
426 0.16
427 0.18
428 0.21
429 0.23
430 0.3
431 0.34
432 0.37
433 0.44
434 0.42
435 0.4
436 0.4
437 0.42
438 0.4
439 0.36
440 0.34
441 0.26
442 0.23
443 0.2
444 0.24
445 0.21
446 0.17
447 0.22
448 0.3
449 0.33
450 0.35
451 0.39
452 0.34
453 0.36
454 0.37
455 0.35
456 0.3
457 0.27
458 0.25
459 0.29
460 0.28
461 0.24
462 0.27
463 0.24
464 0.22
465 0.29
466 0.35
467 0.35
468 0.45
469 0.52
470 0.57
471 0.59
472 0.61
473 0.61
474 0.56
475 0.49
476 0.41
477 0.38
478 0.29
479 0.26
480 0.23
481 0.16
482 0.14
483 0.13
484 0.1
485 0.06
486 0.05
487 0.04
488 0.03
489 0.03
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.07
498 0.08
499 0.09
500 0.08
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.05
508 0.06
509 0.07
510 0.1
511 0.1
512 0.12
513 0.12
514 0.12
515 0.13
516 0.15
517 0.14
518 0.13
519 0.16
520 0.17
521 0.18
522 0.19
523 0.19
524 0.19
525 0.21
526 0.25
527 0.26
528 0.28
529 0.3
530 0.37
531 0.46
532 0.53
533 0.61
534 0.65
535 0.7
536 0.77
537 0.84
538 0.86
539 0.85
540 0.84
541 0.83
542 0.78
543 0.74
544 0.68
545 0.59
546 0.52
547 0.45
548 0.4
549 0.32
550 0.27
551 0.22
552 0.21
553 0.19
554 0.17
555 0.24
556 0.22
557 0.24
558 0.23
559 0.24
560 0.22
561 0.23
562 0.24
563 0.15
564 0.17
565 0.15
566 0.16
567 0.21
568 0.2
569 0.21
570 0.23
571 0.24
572 0.23
573 0.3
574 0.37
575 0.41
576 0.49
577 0.52
578 0.54
579 0.62
580 0.68
581 0.7
582 0.68
583 0.6
584 0.56
585 0.54
586 0.49
587 0.42
588 0.35
589 0.3
590 0.25
591 0.23
592 0.18
593 0.16
594 0.14
595 0.12
596 0.1
597 0.06
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.06
602 0.07
603 0.07
604 0.08
605 0.07
606 0.07
607 0.06
608 0.05
609 0.08
610 0.09
611 0.1
612 0.12
613 0.13
614 0.14
615 0.14
616 0.16
617 0.19
618 0.2
619 0.21
620 0.21
621 0.29
622 0.36
623 0.38
624 0.37
625 0.34
626 0.32
627 0.32
628 0.34
629 0.31
630 0.32
631 0.39
632 0.49
633 0.52
634 0.58
635 0.62
636 0.64
637 0.69
638 0.72
639 0.74
640 0.74
641 0.79
642 0.81
643 0.85
644 0.86
645 0.86
646 0.85
647 0.84
648 0.8
649 0.79
650 0.79
651 0.75
652 0.77
653 0.73
654 0.72
655 0.71
656 0.72
657 0.72
658 0.7
659 0.67
660 0.57
661 0.53
662 0.45
663 0.36
664 0.31
665 0.23
666 0.24
667 0.27
668 0.34
669 0.4
670 0.49
671 0.55
672 0.62
673 0.7
674 0.74
675 0.78
676 0.8
677 0.81
678 0.79
679 0.82
680 0.77
681 0.72
682 0.65