Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1U6X9

Protein Details
Accession A0A1Y1U6X9    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-46AAEENGEHRHHRRRSRKSLEANGHGDSBasic
155-175YYGHRRPSLFRSHRKWKKLLPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-36SHRRRAAEENGEHRHHRRRSRK
569-582PRRRRAAPAPPSKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, cyto 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MESESGEIHRHHHHSHRRRAAEENGEHRHHRRRSRKSLEANGHGDSSDPRGSLGVHVRVHTVEQFWNEIEAIVTIPENCNLAQLDNTLRMFVTFCAAYHDEYLPSPHEMHHVISLLLDCELFTYHYERMVGLIFDDAQENTNPHELYVLYHIILYYGHRRPSLFRSHRKWKKLLPTLGEVVGVDSDETFVSGLPPIESRVRLPATDLMYEVCRVQKLSSNELEQFDDAFIDRLFELVETTRDNQDERLNYAVIRLIVALNEQFMVATLPHKSKPTSPTSSATSPTSPQSADRLQLNGIPSRIHPEHQRQHQRRNTGPDPLGDAHEDAKMMNRVLMVLMKRLGSSKTFGENVIFMLNRAKNTPEDLCMQLLILKILYLLFTTPGTQEYFYTNDLKVLLDVFIRDLVDLPEECEALRHTYLRVLYPLLNHTQLRTEAYKRPQIKLVLHSLISNDHIRDIGPTTKRLVERCLEETPKFSRRHSASNVRQDSTCSTLSLDSVAAALPRPTHLTTSIYTSSDPVRLSSLNDVSKSLEAHEVQANLPSRHRAESSATSIGSNDGHLSDASTAGPPRRRRAAPAPPSKRGSATSTASLSSIGSTDARSRANSVVNSRAQTPQIPGVVVTPESEYPPGFHDLIDLGGKNVPPPIIEVNPVPAVPGWISFTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.71
3 0.77
4 0.76
5 0.75
6 0.76
7 0.75
8 0.74
9 0.72
10 0.7
11 0.68
12 0.66
13 0.67
14 0.67
15 0.68
16 0.67
17 0.69
18 0.71
19 0.74
20 0.81
21 0.86
22 0.89
23 0.89
24 0.91
25 0.9
26 0.87
27 0.8
28 0.71
29 0.62
30 0.51
31 0.42
32 0.33
33 0.29
34 0.23
35 0.19
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.22
40 0.28
41 0.29
42 0.29
43 0.3
44 0.31
45 0.31
46 0.33
47 0.29
48 0.24
49 0.21
50 0.21
51 0.22
52 0.21
53 0.22
54 0.2
55 0.17
56 0.15
57 0.12
58 0.1
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.16
72 0.2
73 0.2
74 0.18
75 0.18
76 0.17
77 0.17
78 0.15
79 0.15
80 0.11
81 0.1
82 0.17
83 0.18
84 0.19
85 0.21
86 0.21
87 0.19
88 0.19
89 0.22
90 0.17
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.2
98 0.19
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.13
103 0.11
104 0.1
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.11
111 0.12
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.1
119 0.1
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.12
128 0.15
129 0.15
130 0.14
131 0.15
132 0.13
133 0.14
134 0.17
135 0.16
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.12
141 0.13
142 0.16
143 0.2
144 0.23
145 0.24
146 0.25
147 0.29
148 0.35
149 0.44
150 0.46
151 0.51
152 0.58
153 0.68
154 0.76
155 0.8
156 0.8
157 0.77
158 0.78
159 0.78
160 0.76
161 0.69
162 0.65
163 0.6
164 0.54
165 0.46
166 0.35
167 0.25
168 0.18
169 0.13
170 0.08
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.09
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.18
187 0.19
188 0.19
189 0.21
190 0.23
191 0.23
192 0.23
193 0.22
194 0.17
195 0.17
196 0.17
197 0.16
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.16
203 0.19
204 0.24
205 0.27
206 0.29
207 0.31
208 0.32
209 0.32
210 0.26
211 0.23
212 0.17
213 0.14
214 0.11
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.08
225 0.09
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.14
230 0.15
231 0.19
232 0.19
233 0.2
234 0.2
235 0.18
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.12
240 0.11
241 0.09
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.04
253 0.05
254 0.08
255 0.1
256 0.12
257 0.14
258 0.15
259 0.19
260 0.25
261 0.31
262 0.35
263 0.36
264 0.38
265 0.41
266 0.42
267 0.39
268 0.35
269 0.29
270 0.25
271 0.22
272 0.21
273 0.16
274 0.15
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.17
279 0.17
280 0.16
281 0.17
282 0.18
283 0.16
284 0.15
285 0.13
286 0.12
287 0.18
288 0.18
289 0.18
290 0.22
291 0.29
292 0.36
293 0.45
294 0.56
295 0.56
296 0.65
297 0.68
298 0.7
299 0.65
300 0.66
301 0.59
302 0.55
303 0.5
304 0.41
305 0.4
306 0.34
307 0.3
308 0.22
309 0.2
310 0.14
311 0.13
312 0.12
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.1
322 0.08
323 0.08
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.1
330 0.12
331 0.12
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.1
340 0.08
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.15
346 0.13
347 0.17
348 0.17
349 0.14
350 0.16
351 0.16
352 0.16
353 0.14
354 0.14
355 0.12
356 0.11
357 0.09
358 0.07
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.1
374 0.12
375 0.13
376 0.16
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.12
382 0.1
383 0.09
384 0.06
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.08
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.13
405 0.14
406 0.15
407 0.15
408 0.14
409 0.14
410 0.15
411 0.18
412 0.17
413 0.19
414 0.18
415 0.18
416 0.19
417 0.19
418 0.2
419 0.21
420 0.23
421 0.27
422 0.33
423 0.4
424 0.41
425 0.42
426 0.44
427 0.46
428 0.45
429 0.43
430 0.44
431 0.39
432 0.36
433 0.34
434 0.29
435 0.25
436 0.24
437 0.21
438 0.14
439 0.12
440 0.12
441 0.11
442 0.12
443 0.14
444 0.18
445 0.18
446 0.2
447 0.22
448 0.27
449 0.3
450 0.3
451 0.31
452 0.28
453 0.31
454 0.34
455 0.37
456 0.37
457 0.35
458 0.37
459 0.39
460 0.43
461 0.41
462 0.38
463 0.41
464 0.4
465 0.47
466 0.51
467 0.56
468 0.58
469 0.66
470 0.69
471 0.62
472 0.59
473 0.53
474 0.48
475 0.41
476 0.33
477 0.22
478 0.19
479 0.17
480 0.17
481 0.16
482 0.13
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.11
492 0.12
493 0.14
494 0.15
495 0.18
496 0.18
497 0.24
498 0.25
499 0.22
500 0.22
501 0.22
502 0.22
503 0.22
504 0.21
505 0.16
506 0.16
507 0.16
508 0.18
509 0.22
510 0.26
511 0.26
512 0.26
513 0.26
514 0.25
515 0.26
516 0.25
517 0.21
518 0.2
519 0.17
520 0.19
521 0.21
522 0.2
523 0.19
524 0.25
525 0.27
526 0.24
527 0.25
528 0.28
529 0.27
530 0.29
531 0.3
532 0.27
533 0.28
534 0.32
535 0.36
536 0.35
537 0.33
538 0.3
539 0.29
540 0.28
541 0.22
542 0.17
543 0.12
544 0.09
545 0.09
546 0.09
547 0.1
548 0.09
549 0.09
550 0.09
551 0.11
552 0.13
553 0.18
554 0.26
555 0.31
556 0.38
557 0.46
558 0.47
559 0.53
560 0.6
561 0.65
562 0.68
563 0.74
564 0.76
565 0.75
566 0.77
567 0.72
568 0.64
569 0.57
570 0.52
571 0.47
572 0.42
573 0.39
574 0.36
575 0.35
576 0.32
577 0.29
578 0.23
579 0.17
580 0.13
581 0.1
582 0.09
583 0.1
584 0.14
585 0.17
586 0.19
587 0.2
588 0.23
589 0.25
590 0.31
591 0.33
592 0.34
593 0.39
594 0.41
595 0.42
596 0.42
597 0.42
598 0.38
599 0.37
600 0.36
601 0.33
602 0.3
603 0.29
604 0.26
605 0.24
606 0.24
607 0.22
608 0.18
609 0.16
610 0.15
611 0.17
612 0.18
613 0.17
614 0.15
615 0.18
616 0.22
617 0.19
618 0.18
619 0.17
620 0.16
621 0.18
622 0.2
623 0.17
624 0.14
625 0.17
626 0.17
627 0.16
628 0.18
629 0.16
630 0.13
631 0.17
632 0.21
633 0.21
634 0.23
635 0.24
636 0.26
637 0.28
638 0.27
639 0.25
640 0.19
641 0.19
642 0.17
643 0.17