Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y1UQ29

Protein Details
Accession A0A1Y1UQ29    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-315TDAFKCSRCQQRKCTYYQMQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-89KRKRKRED
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035100  TF_IIS-typ  
IPR003617  TFIIS/CRSP70_N_sub  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PF01096  TFIIS_C  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS51319  TFIIS_N  
PS51133  ZF_TFIIS_2  
CDD cd13749  Zn-ribbon_TFIIS  
Amino Acid Sequences MDSKALSDAVKELNEANTAGKTEDVTRLLEKLRKDVQPTEELLRSSKAGVAIGKLRNHSTPGVSTLAKEIVKLWKDAIEESKRKRKREDGDKDDAVKRVKGEGSSAAASPAAASPSGASPDRKPRTEAVKSEVKTEASGSSPPRRPPLSTIDSSRKDPRTAASDGVEKTLRAEEAEGEDVRDKCVVMMYNALAGDSTADKKILTERARGIEKAAYDLVRNTGNEYRAKMRSLFLNLKDKQNPALRNEIVLGYIEAAKVAAMSKEEMASESVRALNEKLASDNLFKAKAVGETQAETDAFKCSRCQQRKCTYYQMQTRSADEPMTTFVTYVFFTHDCFVC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.17
4 0.15
5 0.16
6 0.15
7 0.14
8 0.14
9 0.15
10 0.2
11 0.19
12 0.21
13 0.21
14 0.24
15 0.29
16 0.31
17 0.3
18 0.33
19 0.38
20 0.4
21 0.44
22 0.47
23 0.48
24 0.49
25 0.51
26 0.49
27 0.45
28 0.42
29 0.38
30 0.34
31 0.29
32 0.24
33 0.23
34 0.18
35 0.17
36 0.16
37 0.18
38 0.23
39 0.28
40 0.31
41 0.31
42 0.33
43 0.32
44 0.34
45 0.33
46 0.28
47 0.25
48 0.24
49 0.25
50 0.23
51 0.22
52 0.21
53 0.24
54 0.22
55 0.2
56 0.19
57 0.24
58 0.25
59 0.25
60 0.23
61 0.22
62 0.23
63 0.25
64 0.31
65 0.32
66 0.39
67 0.46
68 0.56
69 0.59
70 0.63
71 0.68
72 0.69
73 0.7
74 0.74
75 0.77
76 0.74
77 0.77
78 0.77
79 0.75
80 0.68
81 0.63
82 0.54
83 0.44
84 0.36
85 0.31
86 0.28
87 0.23
88 0.22
89 0.19
90 0.2
91 0.2
92 0.19
93 0.16
94 0.14
95 0.13
96 0.11
97 0.09
98 0.07
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.09
104 0.1
105 0.12
106 0.15
107 0.26
108 0.31
109 0.32
110 0.34
111 0.36
112 0.44
113 0.49
114 0.47
115 0.42
116 0.45
117 0.44
118 0.45
119 0.42
120 0.33
121 0.27
122 0.25
123 0.21
124 0.14
125 0.17
126 0.17
127 0.23
128 0.27
129 0.29
130 0.33
131 0.34
132 0.33
133 0.34
134 0.38
135 0.36
136 0.34
137 0.38
138 0.41
139 0.42
140 0.45
141 0.48
142 0.42
143 0.38
144 0.36
145 0.32
146 0.29
147 0.28
148 0.26
149 0.21
150 0.22
151 0.22
152 0.23
153 0.21
154 0.16
155 0.15
156 0.14
157 0.12
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.08
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.12
169 0.1
170 0.08
171 0.1
172 0.1
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.06
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.11
189 0.18
190 0.19
191 0.22
192 0.24
193 0.29
194 0.32
195 0.31
196 0.3
197 0.24
198 0.22
199 0.2
200 0.19
201 0.15
202 0.13
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.17
209 0.2
210 0.21
211 0.23
212 0.27
213 0.27
214 0.29
215 0.27
216 0.25
217 0.26
218 0.31
219 0.34
220 0.34
221 0.41
222 0.42
223 0.48
224 0.5
225 0.48
226 0.47
227 0.48
228 0.47
229 0.4
230 0.46
231 0.39
232 0.36
233 0.36
234 0.3
235 0.23
236 0.2
237 0.16
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.16
263 0.16
264 0.16
265 0.17
266 0.19
267 0.2
268 0.23
269 0.23
270 0.22
271 0.21
272 0.2
273 0.19
274 0.2
275 0.19
276 0.19
277 0.18
278 0.18
279 0.19
280 0.21
281 0.19
282 0.17
283 0.16
284 0.18
285 0.16
286 0.16
287 0.19
288 0.25
289 0.36
290 0.45
291 0.53
292 0.59
293 0.69
294 0.75
295 0.78
296 0.8
297 0.79
298 0.79
299 0.8
300 0.76
301 0.74
302 0.69
303 0.66
304 0.59
305 0.51
306 0.42
307 0.33
308 0.27
309 0.23
310 0.23
311 0.2
312 0.17
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.15
317 0.16
318 0.13
319 0.15