Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IDB6

Protein Details
Accession A0A1Y2IDB6    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-137VAKPADQKDKEKKQRRPKRRTGRRGSKSVPGBasic
161-187ANGDAAKPKKKKKARKPKRKSAAATSEBasic
203-227EGTGEGKKPRQRKPRAPRPARPAGEBasic
262-286KVNSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
114-133KDKEKKQRRPKRRTGRRGSK
166-182AKPKKKKKARKPKRKSA
207-224EGKKPRQRKPRAPRPARP
269-280VRRRWGKPRKSK
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 12.833, nucl 10.5, mito_nucl 7.166, cyto_pero 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAPAAPVTENGVPPAAQESVVQEAPGFKVFAGNLAYSTTDEGLKAFFAPVQADVLSAQVIMRSGNRSAGYGFVSFTTAEAAQKAVELLDKKELDGRPVIVEVAKPADQKDKEKKQRRPKRRTGRRGSKSVPGEVSEAEANGEASTDANKAEGATSANGDAAKPKKKKKARKPKRKSAAATSEGEAPASGAEGATSGAEGTGEGKKPRQRKPRAPRPARPAGEDPQGEPSKNVLFVANLGFNIDDEGLAKLFTDAGIKVNSARIVRRRWGKPRKSKGYGFVDVGDEEEQKKAIEALQGKEVGGRAIAVKIAVNTPHEDGDASDNGANDAAPTEEKKEEEKAPEAAPEVAPVAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.19
4 0.17
5 0.16
6 0.19
7 0.15
8 0.12
9 0.12
10 0.14
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.18
18 0.16
19 0.1
20 0.13
21 0.13
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.15
26 0.15
27 0.16
28 0.14
29 0.15
30 0.13
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.08
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.08
54 0.11
55 0.11
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.16
60 0.18
61 0.18
62 0.15
63 0.15
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.06
77 0.09
78 0.1
79 0.12
80 0.18
81 0.18
82 0.18
83 0.25
84 0.25
85 0.24
86 0.25
87 0.24
88 0.18
89 0.19
90 0.19
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.22
99 0.24
100 0.32
101 0.41
102 0.49
103 0.58
104 0.68
105 0.76
106 0.8
107 0.88
108 0.91
109 0.92
110 0.92
111 0.92
112 0.94
113 0.95
114 0.95
115 0.95
116 0.92
117 0.89
118 0.82
119 0.79
120 0.71
121 0.63
122 0.53
123 0.43
124 0.36
125 0.28
126 0.26
127 0.17
128 0.14
129 0.1
130 0.09
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.11
152 0.15
153 0.23
154 0.28
155 0.35
156 0.45
157 0.54
158 0.65
159 0.72
160 0.79
161 0.82
162 0.87
163 0.91
164 0.92
165 0.93
166 0.92
167 0.84
168 0.82
169 0.79
170 0.72
171 0.63
172 0.53
173 0.46
174 0.36
175 0.32
176 0.22
177 0.13
178 0.09
179 0.07
180 0.06
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.07
193 0.09
194 0.1
195 0.15
196 0.2
197 0.29
198 0.38
199 0.47
200 0.55
201 0.65
202 0.75
203 0.82
204 0.88
205 0.89
206 0.88
207 0.86
208 0.87
209 0.78
210 0.72
211 0.65
212 0.58
213 0.55
214 0.47
215 0.39
216 0.37
217 0.37
218 0.32
219 0.27
220 0.25
221 0.2
222 0.2
223 0.19
224 0.11
225 0.1
226 0.11
227 0.12
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.12
251 0.15
252 0.16
253 0.21
254 0.25
255 0.3
256 0.38
257 0.46
258 0.53
259 0.61
260 0.7
261 0.76
262 0.8
263 0.86
264 0.89
265 0.87
266 0.84
267 0.82
268 0.8
269 0.74
270 0.64
271 0.55
272 0.46
273 0.38
274 0.34
275 0.26
276 0.19
277 0.15
278 0.14
279 0.13
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.15
285 0.19
286 0.21
287 0.25
288 0.26
289 0.26
290 0.27
291 0.25
292 0.19
293 0.15
294 0.13
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.17
305 0.19
306 0.19
307 0.18
308 0.18
309 0.16
310 0.19
311 0.18
312 0.18
313 0.17
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.14
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.11
323 0.15
324 0.17
325 0.2
326 0.23
327 0.27
328 0.32
329 0.35
330 0.38
331 0.37
332 0.36
333 0.37
334 0.36
335 0.33
336 0.27
337 0.23