Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IWU8

Protein Details
Accession A0A1Y2IWU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-48MNPPAAPPPAKKRKTNPHQQRQGGPGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-36PPPAKKRKT
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9, cyto 7.5, pero 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MRPIISYDDIVPSESATPKPAMNPPAAPPPAKKRKTNPHQQRQGGPGNGRGHPPMQHWDDPGNQDPQMPYDDVPAGAAGTTNGTNGTNEGAGEDYYEEEEEEEESRELTHDEIWDDSALIEAWNSATAEYERFHGKGKSWKDQPVKKSPLWYNVPPETTSKPKASTSTANGATGHKANGAATAADSAPLNFDTFVPTHDPSLAAAAAASAMAAPAADGAAMLGTGAEAANVSQDEAFSRAMQAMYWSGYWTAVYHCRRNQTQQNDSAAGAMEEQQEDAAEEDEAEDEDMLPAQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.19
5 0.19
6 0.23
7 0.29
8 0.29
9 0.3
10 0.32
11 0.33
12 0.41
13 0.43
14 0.41
15 0.41
16 0.49
17 0.56
18 0.6
19 0.64
20 0.64
21 0.73
22 0.8
23 0.85
24 0.86
25 0.86
26 0.9
27 0.88
28 0.85
29 0.81
30 0.79
31 0.74
32 0.65
33 0.62
34 0.56
35 0.51
36 0.47
37 0.42
38 0.35
39 0.32
40 0.33
41 0.33
42 0.34
43 0.35
44 0.34
45 0.36
46 0.38
47 0.39
48 0.4
49 0.35
50 0.29
51 0.28
52 0.26
53 0.25
54 0.23
55 0.19
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.14
61 0.12
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.07
116 0.07
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.13
122 0.15
123 0.22
124 0.27
125 0.33
126 0.36
127 0.44
128 0.5
129 0.55
130 0.59
131 0.62
132 0.62
133 0.55
134 0.58
135 0.53
136 0.52
137 0.51
138 0.47
139 0.43
140 0.4
141 0.41
142 0.34
143 0.34
144 0.3
145 0.3
146 0.3
147 0.26
148 0.26
149 0.26
150 0.27
151 0.28
152 0.28
153 0.27
154 0.3
155 0.29
156 0.28
157 0.27
158 0.26
159 0.25
160 0.21
161 0.17
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.07
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.12
188 0.13
189 0.12
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.13
239 0.2
240 0.26
241 0.33
242 0.37
243 0.45
244 0.49
245 0.58
246 0.64
247 0.65
248 0.67
249 0.67
250 0.69
251 0.62
252 0.58
253 0.49
254 0.4
255 0.3
256 0.22
257 0.17
258 0.13
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.09
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.07