Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2I5I4

Protein Details
Accession A0A1Y2I5I4    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
438-461SHVARGRPGRKTRASKKRMSIRTSHydrophilic
493-512SARAGLPSGKRKRRFFQSIAHydrophilic
533-560VEARMVNGGRRRDRRRAKERIPEQSEEMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
442-455RGRPGRKTRASKKR
502-505KRKR
540-552GGRRRDRRRAKER
Subcellular Location(s) cyto 11, mito 8, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000286  His_deacetylse  
IPR003084  His_deacetylse_1  
IPR023801  His_deacetylse_dom  
IPR037138  His_deacetylse_dom_sf  
IPR023696  Ureohydrolase_dom_sf  
Gene Ontology GO:0004407  F:histone deacetylase activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00850  Hist_deacetyl  
Amino Acid Sequences MSKRRVAYYYDPDVGSYTYGLTHAMKPQRMRITHELVSAYDMLPKMHVLRAKRATAETMTRFHTDEYIDFLSKVTPENARRLTYQGTRFLVGDDNPPFEGVFEFSSISAGGSIAAAKRLMEGQADIAINWAGGLHHAKKREASGFCYINDIVLGILEMLRYVPRVLYIDIDCHHGDGVEEAFYTTDRVMTCSFHKYGDFFPGTGQIEDRGRGPGRGYALNVPLKDGITDEAYKSIFEPVIDKILDVYRPSAVVLQCGADSLSGDKLGGLNLTMEGHAHCVQYMRSKNIPLMLLGGGGYTVKNVARAWTYETACALGIEKDIDPNLPWNEYFEWFGPRYRLEVLESNLEDLNVRDGSLDRNRATILQFLSELQPAPSVEMQDVPREGLAEHLGLPGVRAQGPLDDMDEKLAQHARFVYDMQKDSDGSQTESEAESDASSHVARGRPGRKTRASKKRMSIRTSQYFDVPRLPSDYEDGDEDLGCGHEHEEDAWASARAGLPSGKRKRRFFQSIAEWNPVKKVATERERAGVQPGVEARMVNGGRRRDRRRAKERIPEQSEEMDVDGDVEDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.3
3 0.22
4 0.15
5 0.1
6 0.11
7 0.12
8 0.13
9 0.16
10 0.23
11 0.3
12 0.35
13 0.38
14 0.47
15 0.54
16 0.54
17 0.59
18 0.59
19 0.59
20 0.57
21 0.57
22 0.5
23 0.41
24 0.41
25 0.34
26 0.26
27 0.23
28 0.2
29 0.16
30 0.15
31 0.16
32 0.16
33 0.19
34 0.23
35 0.23
36 0.32
37 0.39
38 0.43
39 0.44
40 0.44
41 0.44
42 0.45
43 0.49
44 0.43
45 0.4
46 0.4
47 0.38
48 0.37
49 0.34
50 0.32
51 0.25
52 0.22
53 0.24
54 0.24
55 0.23
56 0.22
57 0.21
58 0.2
59 0.19
60 0.2
61 0.17
62 0.21
63 0.24
64 0.33
65 0.37
66 0.38
67 0.39
68 0.41
69 0.44
70 0.44
71 0.46
72 0.45
73 0.43
74 0.41
75 0.4
76 0.38
77 0.35
78 0.28
79 0.29
80 0.24
81 0.24
82 0.23
83 0.23
84 0.22
85 0.18
86 0.18
87 0.13
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.04
119 0.06
120 0.11
121 0.15
122 0.19
123 0.22
124 0.24
125 0.26
126 0.31
127 0.37
128 0.35
129 0.35
130 0.39
131 0.38
132 0.37
133 0.38
134 0.34
135 0.26
136 0.23
137 0.18
138 0.1
139 0.08
140 0.07
141 0.03
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.07
151 0.09
152 0.09
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.16
157 0.2
158 0.18
159 0.17
160 0.16
161 0.12
162 0.12
163 0.1
164 0.1
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.1
176 0.12
177 0.15
178 0.19
179 0.2
180 0.19
181 0.19
182 0.19
183 0.2
184 0.25
185 0.24
186 0.19
187 0.18
188 0.22
189 0.23
190 0.21
191 0.2
192 0.15
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.18
202 0.18
203 0.19
204 0.18
205 0.23
206 0.25
207 0.24
208 0.23
209 0.21
210 0.19
211 0.18
212 0.15
213 0.11
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.09
223 0.08
224 0.1
225 0.09
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.12
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.07
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.16
269 0.19
270 0.2
271 0.2
272 0.21
273 0.22
274 0.24
275 0.23
276 0.17
277 0.16
278 0.12
279 0.1
280 0.09
281 0.08
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.13
294 0.17
295 0.18
296 0.17
297 0.18
298 0.17
299 0.16
300 0.15
301 0.12
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.16
318 0.13
319 0.16
320 0.16
321 0.18
322 0.17
323 0.16
324 0.17
325 0.17
326 0.17
327 0.15
328 0.18
329 0.18
330 0.22
331 0.21
332 0.21
333 0.19
334 0.18
335 0.16
336 0.12
337 0.13
338 0.08
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.12
343 0.17
344 0.21
345 0.19
346 0.2
347 0.2
348 0.21
349 0.22
350 0.21
351 0.17
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.1
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.13
366 0.14
367 0.15
368 0.15
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.1
374 0.1
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.12
393 0.12
394 0.11
395 0.13
396 0.18
397 0.15
398 0.16
399 0.17
400 0.16
401 0.17
402 0.18
403 0.22
404 0.22
405 0.24
406 0.24
407 0.25
408 0.24
409 0.24
410 0.28
411 0.23
412 0.2
413 0.19
414 0.17
415 0.17
416 0.17
417 0.16
418 0.12
419 0.1
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.11
427 0.13
428 0.16
429 0.24
430 0.31
431 0.39
432 0.46
433 0.54
434 0.61
435 0.69
436 0.77
437 0.8
438 0.81
439 0.81
440 0.83
441 0.85
442 0.84
443 0.79
444 0.78
445 0.76
446 0.78
447 0.73
448 0.65
449 0.61
450 0.55
451 0.51
452 0.49
453 0.41
454 0.32
455 0.32
456 0.31
457 0.26
458 0.27
459 0.26
460 0.2
461 0.2
462 0.2
463 0.17
464 0.15
465 0.14
466 0.11
467 0.1
468 0.08
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.08
474 0.1
475 0.09
476 0.11
477 0.12
478 0.12
479 0.11
480 0.13
481 0.14
482 0.12
483 0.13
484 0.15
485 0.2
486 0.3
487 0.41
488 0.49
489 0.56
490 0.64
491 0.71
492 0.78
493 0.81
494 0.75
495 0.75
496 0.75
497 0.77
498 0.75
499 0.74
500 0.65
501 0.56
502 0.54
503 0.47
504 0.37
505 0.3
506 0.32
507 0.35
508 0.42
509 0.47
510 0.47
511 0.5
512 0.51
513 0.49
514 0.46
515 0.39
516 0.31
517 0.29
518 0.28
519 0.25
520 0.24
521 0.23
522 0.19
523 0.24
524 0.24
525 0.24
526 0.29
527 0.36
528 0.45
529 0.55
530 0.63
531 0.65
532 0.76
533 0.82
534 0.86
535 0.88
536 0.89
537 0.9
538 0.91
539 0.91
540 0.87
541 0.81
542 0.75
543 0.67
544 0.59
545 0.48
546 0.4
547 0.29
548 0.21
549 0.18
550 0.13