Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2IXG4

Protein Details
Accession A0A1Y2IXG4    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MPAFRNVRRSRRLSRQPPRDPGSDEHydrophilic
78-103ILPGQRTSHSRKKKPGHIPRPPNAFMHydrophilic
162-187QYKYSPIYRREKPAKRKPKQDYADKIHydrophilic
231-261KPPRQPSKKVSARSHPRRSRRSKMKDEDEYABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-96SRKKKPGHIP
170-180RREKPAKRKPK
231-254KPPRQPSKKVSARSHPRRSRRSKM
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MPAFRNVRRSRRLSRQPPRDPGSDEYDIYDLELLYPDEVASSSAVTTPEVHLPPADETGEPEIDPDSPLLSPSPKPSILPGQRTSHSRKKKPGHIPRPPNAFMIFRSELWSKEKIKSTVERDHRQISRIAGNLWNQLNDKEREPYKRRAEEAKVEHARLYPQYKYSPIYRREKPAKRKPKQDYADKIQRCHTVAQLIQQGFEGDDLKKELDKRARRGFVEDEHDETPSHIKPPRQPSKKVSARSHPRRSRRSKMKDEDEYAPSHHEDTPIRDSFIKDESESPALRLPSLCPPDLVDTFIPTSDIPPLDLGESCLDEEVKFTNPFASASASASESRSPASFMGGPLSPDHCSLSDEFLAATAEEPKLRSSPPLEDFTGLFAPGSSFDSVDAATFSPTLPYDNPYYAPEYYPGGLSSEVDFSEWMRYEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.89
3 0.9
4 0.91
5 0.88
6 0.82
7 0.76
8 0.69
9 0.67
10 0.59
11 0.5
12 0.42
13 0.37
14 0.31
15 0.26
16 0.22
17 0.14
18 0.11
19 0.11
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.08
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.09
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.13
35 0.19
36 0.19
37 0.2
38 0.18
39 0.2
40 0.21
41 0.22
42 0.21
43 0.14
44 0.16
45 0.19
46 0.2
47 0.17
48 0.16
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.12
53 0.09
54 0.08
55 0.09
56 0.11
57 0.13
58 0.15
59 0.19
60 0.24
61 0.23
62 0.24
63 0.28
64 0.37
65 0.41
66 0.47
67 0.48
68 0.48
69 0.51
70 0.56
71 0.61
72 0.61
73 0.64
74 0.65
75 0.69
76 0.73
77 0.8
78 0.85
79 0.88
80 0.88
81 0.89
82 0.9
83 0.89
84 0.88
85 0.8
86 0.71
87 0.62
88 0.53
89 0.43
90 0.41
91 0.34
92 0.26
93 0.28
94 0.27
95 0.26
96 0.29
97 0.34
98 0.29
99 0.33
100 0.4
101 0.38
102 0.42
103 0.47
104 0.51
105 0.54
106 0.6
107 0.6
108 0.57
109 0.63
110 0.6
111 0.54
112 0.49
113 0.43
114 0.39
115 0.34
116 0.32
117 0.28
118 0.28
119 0.31
120 0.29
121 0.28
122 0.24
123 0.24
124 0.28
125 0.26
126 0.25
127 0.26
128 0.3
129 0.37
130 0.42
131 0.5
132 0.54
133 0.58
134 0.6
135 0.61
136 0.62
137 0.61
138 0.61
139 0.61
140 0.55
141 0.5
142 0.48
143 0.41
144 0.38
145 0.33
146 0.31
147 0.23
148 0.22
149 0.23
150 0.25
151 0.26
152 0.32
153 0.36
154 0.4
155 0.46
156 0.48
157 0.55
158 0.64
159 0.71
160 0.74
161 0.77
162 0.8
163 0.8
164 0.86
165 0.84
166 0.85
167 0.82
168 0.81
169 0.79
170 0.77
171 0.79
172 0.71
173 0.65
174 0.59
175 0.54
176 0.46
177 0.39
178 0.31
179 0.25
180 0.23
181 0.25
182 0.27
183 0.23
184 0.22
185 0.2
186 0.19
187 0.15
188 0.15
189 0.12
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.16
197 0.23
198 0.29
199 0.36
200 0.43
201 0.47
202 0.46
203 0.49
204 0.46
205 0.41
206 0.41
207 0.35
208 0.31
209 0.27
210 0.27
211 0.23
212 0.21
213 0.19
214 0.14
215 0.16
216 0.16
217 0.18
218 0.24
219 0.35
220 0.45
221 0.49
222 0.54
223 0.57
224 0.65
225 0.69
226 0.71
227 0.66
228 0.66
229 0.71
230 0.75
231 0.81
232 0.79
233 0.81
234 0.83
235 0.86
236 0.86
237 0.86
238 0.85
239 0.85
240 0.86
241 0.85
242 0.81
243 0.77
244 0.71
245 0.63
246 0.54
247 0.44
248 0.37
249 0.29
250 0.24
251 0.2
252 0.18
253 0.16
254 0.2
255 0.26
256 0.24
257 0.25
258 0.24
259 0.24
260 0.24
261 0.25
262 0.22
263 0.16
264 0.17
265 0.19
266 0.21
267 0.21
268 0.2
269 0.2
270 0.19
271 0.18
272 0.17
273 0.16
274 0.2
275 0.24
276 0.23
277 0.2
278 0.21
279 0.25
280 0.25
281 0.26
282 0.18
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.15
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.14
312 0.16
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.16
319 0.16
320 0.13
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.12
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.17
329 0.16
330 0.17
331 0.17
332 0.19
333 0.17
334 0.16
335 0.18
336 0.15
337 0.16
338 0.17
339 0.19
340 0.17
341 0.16
342 0.15
343 0.14
344 0.14
345 0.12
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.14
352 0.15
353 0.16
354 0.2
355 0.21
356 0.27
357 0.31
358 0.35
359 0.35
360 0.34
361 0.34
362 0.34
363 0.31
364 0.23
365 0.18
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.14
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.13
384 0.13
385 0.16
386 0.2
387 0.22
388 0.24
389 0.25
390 0.29
391 0.27
392 0.27
393 0.26
394 0.25
395 0.23
396 0.22
397 0.2
398 0.18
399 0.17
400 0.16
401 0.16
402 0.15
403 0.14
404 0.14
405 0.13
406 0.12
407 0.18