Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2J3L7

Protein Details
Accession A0A1Y2J3L7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-30NVTVPFFKKKGRGRPATARKRSESPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-26KKKGRGRPATARKR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 12, mito_nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF14634  zf-RING_5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MSATDNVTVPFFKKKGRGRPATARKRSESPPATALQVPVPSSSKSEVVLPSRKSTANLLSAGTKRTASQRQQDDLDDEEPRRDGPDVKWTVDGSHVNAALEILEGDEAEELLAKRRRSEKKGEEDEEAPDDGMYHGQKGYQSHIKKNKEVPKAMRVGPQRSNNSTIRTVTIVDYQPDVCKDYKETGYCGFGDTCKFLHDRGTYLQGWQLDKLAANPKKQVDEESDTDSDDEDIPFACIICRKPYTDPVVTRCGHYFCSACAIKRFAKTPRCAACGAPTAGIFNRADKVIAKMRKKQEAEEAEAREQGEGASGDGGGVKIEGLAEAGSEDEDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.54
3 0.64
4 0.71
5 0.72
6 0.81
7 0.87
8 0.89
9 0.89
10 0.86
11 0.81
12 0.78
13 0.74
14 0.74
15 0.67
16 0.61
17 0.56
18 0.5
19 0.48
20 0.43
21 0.39
22 0.32
23 0.29
24 0.25
25 0.23
26 0.24
27 0.21
28 0.22
29 0.23
30 0.21
31 0.19
32 0.22
33 0.25
34 0.3
35 0.36
36 0.36
37 0.38
38 0.4
39 0.41
40 0.38
41 0.38
42 0.36
43 0.33
44 0.31
45 0.28
46 0.3
47 0.31
48 0.31
49 0.28
50 0.23
51 0.21
52 0.27
53 0.35
54 0.36
55 0.43
56 0.48
57 0.51
58 0.53
59 0.54
60 0.49
61 0.43
62 0.39
63 0.33
64 0.27
65 0.24
66 0.22
67 0.2
68 0.19
69 0.17
70 0.17
71 0.16
72 0.25
73 0.27
74 0.28
75 0.3
76 0.29
77 0.28
78 0.3
79 0.29
80 0.21
81 0.21
82 0.2
83 0.17
84 0.17
85 0.16
86 0.11
87 0.1
88 0.08
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.05
97 0.05
98 0.11
99 0.16
100 0.16
101 0.21
102 0.3
103 0.38
104 0.43
105 0.53
106 0.55
107 0.61
108 0.7
109 0.69
110 0.63
111 0.57
112 0.53
113 0.45
114 0.36
115 0.25
116 0.16
117 0.13
118 0.1
119 0.1
120 0.09
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.1
125 0.1
126 0.15
127 0.21
128 0.24
129 0.32
130 0.41
131 0.45
132 0.48
133 0.56
134 0.6
135 0.6
136 0.63
137 0.59
138 0.57
139 0.57
140 0.54
141 0.52
142 0.47
143 0.46
144 0.46
145 0.49
146 0.46
147 0.44
148 0.47
149 0.43
150 0.42
151 0.38
152 0.32
153 0.26
154 0.22
155 0.21
156 0.16
157 0.18
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.15
169 0.18
170 0.18
171 0.19
172 0.19
173 0.2
174 0.19
175 0.19
176 0.16
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.16
185 0.16
186 0.17
187 0.18
188 0.23
189 0.21
190 0.22
191 0.24
192 0.21
193 0.21
194 0.19
195 0.17
196 0.13
197 0.13
198 0.15
199 0.23
200 0.24
201 0.25
202 0.29
203 0.3
204 0.33
205 0.33
206 0.33
207 0.29
208 0.31
209 0.31
210 0.32
211 0.3
212 0.28
213 0.27
214 0.25
215 0.2
216 0.15
217 0.12
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.09
225 0.11
226 0.16
227 0.18
228 0.2
229 0.24
230 0.31
231 0.37
232 0.41
233 0.44
234 0.43
235 0.49
236 0.47
237 0.45
238 0.41
239 0.36
240 0.31
241 0.28
242 0.25
243 0.17
244 0.25
245 0.25
246 0.25
247 0.27
248 0.3
249 0.32
250 0.35
251 0.4
252 0.4
253 0.47
254 0.5
255 0.56
256 0.58
257 0.57
258 0.55
259 0.51
260 0.48
261 0.46
262 0.42
263 0.34
264 0.27
265 0.26
266 0.25
267 0.27
268 0.22
269 0.17
270 0.18
271 0.16
272 0.17
273 0.16
274 0.21
275 0.26
276 0.35
277 0.4
278 0.47
279 0.55
280 0.64
281 0.65
282 0.64
283 0.65
284 0.63
285 0.64
286 0.62
287 0.59
288 0.52
289 0.51
290 0.48
291 0.37
292 0.3
293 0.22
294 0.17
295 0.12
296 0.1
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05